More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_4064 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011004  Rpal_4064  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  100 
 
 
651 aa  1283    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1977  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  72.35 
 
 
651 aa  869    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.064764  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3475  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  58.99 
 
 
649 aa  688    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3476  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  58.01 
 
 
641 aa  681    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.640734  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3409  chemotaxis sensory transducer  71.27 
 
 
651 aa  852    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.304746  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7375  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.51 
 
 
655 aa  466  9.999999999999999e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1030  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.46 
 
 
653 aa  380  1e-104  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5094  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.66 
 
 
659 aa  342  1e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.298675 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2025  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.79 
 
 
688 aa  332  1e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0110809  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0065  chemotaxis sensory transducer  50.13 
 
 
688 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0714339 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3545  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.73 
 
 
689 aa  327  3e-88  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.457552  normal  0.598514 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0969  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.44 
 
 
562 aa  326  7e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.956339  normal  0.570918 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1918  chemotaxis sensory transducer  51.09 
 
 
688 aa  321  3e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.537222 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4280  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.75 
 
 
563 aa  317  6e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0192  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.46 
 
 
688 aa  316  7e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3547  chemotaxis sensory transducer  50.79 
 
 
566 aa  315  9.999999999999999e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6483  methyl-accepting chemotaxis protein  47.2 
 
 
565 aa  314  2.9999999999999996e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.877741  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0994  chemotaxis sensory transducer  50 
 
 
656 aa  314  3.9999999999999997e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.357708  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3380  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.86 
 
 
567 aa  313  9e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.689596 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1840  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.47 
 
 
561 aa  308  2.0000000000000002e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.745103 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6635  methyl-accepting chemotaxis protein  51.26 
 
 
565 aa  308  2.0000000000000002e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.459746  normal  0.104137 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3563  chemotaxis sensory transducer  48.79 
 
 
563 aa  307  4.0000000000000004e-82  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2901  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.24 
 
 
674 aa  307  4.0000000000000004e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.14772  normal  0.22504 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0995  chemotaxis sensory transducer  49.18 
 
 
656 aa  307  4.0000000000000004e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.880627  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2744  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.29 
 
 
572 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.696609  normal  0.585687 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4406  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.98 
 
 
566 aa  306  1.0000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.341232 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3804  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.52 
 
 
655 aa  304  4.0000000000000003e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.772812  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4464  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.98 
 
 
573 aa  303  5.000000000000001e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.610641  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4407  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.33 
 
 
566 aa  303  5.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.365939 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4941  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.14 
 
 
563 aa  302  1e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.396774  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2149  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.99 
 
 
675 aa  301  3e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0391093 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4118  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.42 
 
 
567 aa  297  4e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4104  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.74 
 
 
586 aa  297  4e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.783692  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2358  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.47 
 
 
673 aa  296  8e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.207811 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3379  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.6 
 
 
587 aa  295  2e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.787169  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1830  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.82 
 
 
563 aa  294  4e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1293  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.58 
 
 
562 aa  293  7e-78  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00511002  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3107  chemotaxis sensory transducer  48.67 
 
 
674 aa  293  7e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0664997 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1388  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.28 
 
 
656 aa  291  2e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0527529  normal  0.207734 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4271  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.99 
 
 
567 aa  291  2e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3904  chemotaxis sensory transducer  47.35 
 
 
566 aa  291  3e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5172  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.68 
 
 
656 aa  291  3e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0330  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer  45.39 
 
 
676 aa  290  6e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0869057 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3824  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.58 
 
 
561 aa  290  7e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2904  putative methyl-accepting chemotaxis protein  50.99 
 
 
568 aa  290  8e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.481458  normal  0.283558 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1795  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.86 
 
 
561 aa  289  1e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.432423  normal  0.0230577 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2368  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer precursor  50.71 
 
 
561 aa  289  1e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.280114 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3147  chemotaxis sensory transducer  46.64 
 
 
561 aa  288  2e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0908078  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2250  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.68 
 
 
670 aa  288  2e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4580  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.94 
 
 
563 aa  288  2e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.174371  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3471  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.64 
 
 
561 aa  288  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.130295  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1253  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.74 
 
 
567 aa  288  2.9999999999999996e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.010155 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0820  chemotaxis sensory transducer  50.28 
 
 
608 aa  286  5.999999999999999e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.254614  normal  0.216431 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3598  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.99 
 
 
672 aa  286  7e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1317  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.73 
 
 
560 aa  286  8e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.14669 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2757  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.14 
 
 
561 aa  286  8e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0630329  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2905  putative methyl-accepting chemotaxis protein  48.36 
 
 
542 aa  284  3.0000000000000004e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.234112  normal  0.211145 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2742  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.67 
 
 
560 aa  284  3.0000000000000004e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.429688 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3161  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.23 
 
 
731 aa  285  3.0000000000000004e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.072786  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5110  hypothetical protein  49.47 
 
 
688 aa  284  4.0000000000000003e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.791751 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2363  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.89 
 
 
695 aa  284  4.0000000000000003e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2465  chemotaxis sensory transducer  49.73 
 
 
561 aa  284  4.0000000000000003e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.5909  normal  0.697276 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5120  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.07 
 
 
563 aa  283  5.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4787  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.52 
 
 
561 aa  283  6.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.708956  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4783  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.24 
 
 
730 aa  283  7.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4286  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.1 
 
 
563 aa  283  9e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4269  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer protein  47.91 
 
 
691 aa  283  1e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.35374 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3424  chemotaxis sensory transducer  51.86 
 
 
558 aa  282  1e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.574813 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1843  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.44 
 
 
568 aa  283  1e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.618754 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2708  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.38 
 
 
696 aa  282  2e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.674681  normal  0.192785 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3377  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.33 
 
 
563 aa  281  2e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.528008  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2846  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.81 
 
 
565 aa  281  3e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.430745  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3733  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.58 
 
 
558 aa  281  3e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.152196  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5119  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.92 
 
 
563 aa  281  3e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2346  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.29 
 
 
556 aa  280  4e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.395485 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1025  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.75 
 
 
681 aa  281  4e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1709  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.56 
 
 
568 aa  280  5e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.55655  normal  0.12205 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2903  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.73 
 
 
568 aa  280  7e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.335645  normal  0.0996392 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0581  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.85 
 
 
562 aa  279  9e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0281709  decreased coverage  0.00474558 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2072  chemotaxis sensory transducer  51 
 
 
556 aa  279  1e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.68132  normal  0.341201 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0885  putative methyl-accepting chemotaxis protein  42.42 
 
 
691 aa  278  2e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.493714  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0914  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.8 
 
 
689 aa  278  2e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.497103 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3378  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.83 
 
 
563 aa  278  2e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.104618  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1080  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.04 
 
 
698 aa  278  3e-73  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0139762  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1321  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.25 
 
 
730 aa  278  3e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0177086  normal  0.260794 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2983  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.18 
 
 
561 aa  278  3e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0323515 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7508  putative methyl-accepting chemotaxis protein (with a HAMP region)  48.19 
 
 
552 aa  277  4e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.692825  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0779  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  49.72 
 
 
558 aa  277  5e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0546434  normal  0.151916 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5144  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.31 
 
 
686 aa  276  6e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1857  chemotaxis sensory transducer  47.45 
 
 
563 aa  276  6e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0497  chemotaxis sensory transducer  48.15 
 
 
577 aa  276  8e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5403  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.35 
 
 
538 aa  276  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0153  chemotaxis sensory transducer  46.44 
 
 
602 aa  276  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0718  chemotaxis sensory transducer  48.38 
 
 
669 aa  275  2.0000000000000002e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.845917  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4788  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.93 
 
 
561 aa  275  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1710  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  55.12 
 
 
449 aa  274  3e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.140977  normal  0.0321459 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3581  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.74 
 
 
567 aa  274  5.000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0981346  normal  0.985512 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2996  methyl-accepting chemotaxis protein  48.22 
 
 
698 aa  272  1e-71  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1408  chemotaxis sensory transducer  49.14 
 
 
568 aa  272  1e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.591131  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1316  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.18 
 
 
561 aa  272  1e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.234166 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>