More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1197 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007643  Rru_A1197  chemotaxis sensory transducer  100 
 
 
688 aa  1357    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2799  putative receptor/sensory transducer  40.73 
 
 
707 aa  305  2.0000000000000002e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0655652  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4269  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer protein  39.67 
 
 
691 aa  305  2.0000000000000002e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.35374 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3563  chemotaxis sensory transducer  49.14 
 
 
563 aa  294  4e-78  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4147  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.14 
 
 
694 aa  291  2e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0885  putative methyl-accepting chemotaxis protein  35.05 
 
 
691 aa  290  7e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.493714  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7334  putative methyl-accepting chemotaxis protein  34.38 
 
 
685 aa  286  1.0000000000000001e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.382599  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6483  methyl-accepting chemotaxis protein  47.44 
 
 
565 aa  281  4e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.877741  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1840  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.43 
 
 
561 aa  280  9e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.745103 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2653  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.86 
 
 
691 aa  280  9e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00184965  normal  0.0777916 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0969  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.36 
 
 
562 aa  278  2e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.956339  normal  0.570918 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4464  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.2 
 
 
573 aa  276  7e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.610641  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1080  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34 
 
 
698 aa  273  8.000000000000001e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0139762  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2363  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.11 
 
 
695 aa  273  1e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2708  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.69 
 
 
696 aa  272  1e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.674681  normal  0.192785 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2250  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.47 
 
 
670 aa  272  2e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4406  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.47 
 
 
566 aa  271  2.9999999999999997e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.341232 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3380  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.22 
 
 
567 aa  270  8e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.689596 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2996  methyl-accepting chemotaxis protein  38.09 
 
 
698 aa  268  2e-70  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3904  chemotaxis sensory transducer  45.33 
 
 
566 aa  268  2e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5110  hypothetical protein  44.71 
 
 
688 aa  268  2.9999999999999995e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.791751 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4280  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.99 
 
 
563 aa  267  5e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1293  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.75 
 
 
562 aa  266  7e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00511002  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4787  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.83 
 
 
561 aa  266  8.999999999999999e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.708956  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2744  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.6 
 
 
572 aa  266  1e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.696609  normal  0.585687 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3147  chemotaxis sensory transducer  44.28 
 
 
561 aa  265  2e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0908078  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6635  methyl-accepting chemotaxis protein  46.63 
 
 
565 aa  264  3e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.459746  normal  0.104137 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3471  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.28 
 
 
561 aa  265  3e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.130295  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2149  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.86 
 
 
675 aa  265  3e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0391093 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0995  chemotaxis sensory transducer  45.78 
 
 
656 aa  264  4e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.880627  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2843  putative histidine kinase, HAMP region  43.07 
 
 
682 aa  263  6.999999999999999e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0153  chemotaxis sensory transducer  41.32 
 
 
602 aa  263  8.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0718  chemotaxis sensory transducer  48.14 
 
 
669 aa  263  1e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.845917  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4101  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.18 
 
 
698 aa  262  1e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0994  chemotaxis sensory transducer  45.53 
 
 
656 aa  261  4e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.357708  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4104  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.7 
 
 
586 aa  259  1e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.783692  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2900  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer (chemoreceptor)  44.27 
 
 
675 aa  259  2e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.142675  normal  0.173139 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0644  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer  47.74 
 
 
565 aa  258  2e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2484  chemotaxis sensory transducer  42.2 
 
 
563 aa  259  2e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.1562  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2025  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.38 
 
 
688 aa  258  2e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0110809  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0158  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.65 
 
 
561 aa  258  3e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2742  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.92 
 
 
560 aa  258  3e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.429688 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3476  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.47 
 
 
641 aa  258  3e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.640734  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4118  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.12 
 
 
567 aa  258  4e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5172  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.43 
 
 
656 aa  257  4e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4286  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.91 
 
 
563 aa  257  4e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4407  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.92 
 
 
566 aa  257  6e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.365939 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1830  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.09 
 
 
563 aa  256  7e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3804  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.09 
 
 
655 aa  256  8e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.772812  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1918  chemotaxis sensory transducer  46.51 
 
 
688 aa  256  8e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.537222 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1843  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.63 
 
 
568 aa  256  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.618754 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0065  chemotaxis sensory transducer  45.22 
 
 
688 aa  256  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0714339 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6717  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.61 
 
 
741 aa  254  3e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.447835  normal  0.587139 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3598  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.77 
 
 
672 aa  254  3e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4580  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.5 
 
 
563 aa  254  3e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.174371  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1408  chemotaxis sensory transducer  40.08 
 
 
568 aa  254  4.0000000000000004e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.591131  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1160  chemotaxis sensory transducer  45.65 
 
 
559 aa  254  5.000000000000001e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0820  chemotaxis sensory transducer  46.86 
 
 
608 aa  253  7e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.254614  normal  0.216431 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3547  chemotaxis sensory transducer  45.33 
 
 
566 aa  253  8.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0370  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.57 
 
 
560 aa  253  1e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.52335 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3378  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.95 
 
 
563 aa  252  1e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.104618  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0383  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.31 
 
 
559 aa  251  2e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.50218 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3107  chemotaxis sensory transducer  45.21 
 
 
674 aa  251  3e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0664997 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5119  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.86 
 
 
563 aa  251  5e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2076  chemotaxis sensory transducer  44.05 
 
 
561 aa  250  6e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.723039  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3824  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.56 
 
 
561 aa  250  6e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2554  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.27 
 
 
644 aa  250  7e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0186678  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2358  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.3 
 
 
673 aa  250  8e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.207811 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2983  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.78 
 
 
561 aa  249  8e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0323515 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3344  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.46 
 
 
561 aa  249  9e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.828703  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2905  putative methyl-accepting chemotaxis protein  44.44 
 
 
542 aa  249  1e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.234112  normal  0.211145 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0497  chemotaxis sensory transducer  44.59 
 
 
577 aa  249  1e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2465  chemotaxis sensory transducer  45.28 
 
 
561 aa  249  1e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.5909  normal  0.697276 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3545  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.62 
 
 
689 aa  248  2e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.457552  normal  0.598514 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1795  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.07 
 
 
561 aa  248  4e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.432423  normal  0.0230577 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4783  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.97 
 
 
730 aa  247  4.9999999999999997e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0192  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.07 
 
 
688 aa  246  8e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0840  chemotaxis sensory transducer  42.27 
 
 
712 aa  246  8e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.174635 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2546  chemotaxis sensory transducer  43.43 
 
 
690 aa  246  9e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7508  putative methyl-accepting chemotaxis protein (with a HAMP region)  45.71 
 
 
552 aa  246  9.999999999999999e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.692825  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1316  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.7 
 
 
561 aa  246  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.234166 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5120  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.26 
 
 
563 aa  246  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1729  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.43 
 
 
693 aa  245  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.686986  normal  0.0650814 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3379  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.39 
 
 
587 aa  245  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.787169  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2091  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.2 
 
 
562 aa  245  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0245477 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2078  chemotaxis sensory transducer  44.8 
 
 
561 aa  244  3e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.960991  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3907  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.24 
 
 
565 aa  244  3e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1857  chemotaxis sensory transducer  44.13 
 
 
563 aa  244  3e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0330  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer  42.44 
 
 
676 aa  244  3.9999999999999997e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0869057 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4271  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.2 
 
 
567 aa  244  5e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2757  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.54 
 
 
561 aa  243  6e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0630329  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0924  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.2 
 
 
712 aa  243  7e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.991242  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4941  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.88 
 
 
563 aa  243  7.999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.396774  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2368  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer precursor  48.79 
 
 
561 aa  243  7.999999999999999e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.280114 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2846  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.51 
 
 
565 aa  243  7.999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.430745  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0741  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.15 
 
 
558 aa  243  9e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.532986  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3161  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.36 
 
 
731 aa  243  9e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.072786  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2901  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.71 
 
 
674 aa  243  1e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.14772  normal  0.22504 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2961  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42 
 
 
563 aa  241  2e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4561  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.27 
 
 
711 aa  242  2e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>