More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_7334 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_7334  putative methyl-accepting chemotaxis protein  100 
 
 
685 aa  1340    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.382599  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0885  putative methyl-accepting chemotaxis protein  36.29 
 
 
691 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.493714  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2653  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.51 
 
 
691 aa  314  2.9999999999999996e-84  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00184965  normal  0.0777916 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4269  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer protein  36.13 
 
 
691 aa  300  8e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.35374 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1197  chemotaxis sensory transducer  34.38 
 
 
688 aa  293  5e-78  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2799  putative receptor/sensory transducer  35.63 
 
 
707 aa  284  4.0000000000000003e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0655652  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5110  hypothetical protein  33.24 
 
 
688 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.791751 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2996  methyl-accepting chemotaxis protein  32.95 
 
 
698 aa  275  2.0000000000000002e-72  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4147  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.81 
 
 
694 aa  269  2e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1293  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.35 
 
 
562 aa  266  8.999999999999999e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00511002  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3824  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.86 
 
 
561 aa  265  3e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1080  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.48 
 
 
698 aa  263  8e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0139762  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2363  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.37 
 
 
695 aa  261  2e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4101  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.74 
 
 
698 aa  261  2e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2025  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.4 
 
 
688 aa  260  7e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0110809  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0969  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.62 
 
 
562 aa  258  2e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.956339  normal  0.570918 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2149  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.58 
 
 
675 aa  254  4.0000000000000004e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0391093 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2250  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.47 
 
 
670 aa  249  9e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2708  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.75 
 
 
696 aa  249  1e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.674681  normal  0.192785 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1216  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.01 
 
 
562 aa  246  8e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.743011  normal  0.567814 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3904  chemotaxis sensory transducer  43.39 
 
 
566 aa  246  8e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1266  chemotaxis sensory transducer  43.9 
 
 
562 aa  246  9.999999999999999e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3380  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.15 
 
 
567 aa  246  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.689596 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2358  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.12 
 
 
673 aa  244  3e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.207811 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2368  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer precursor  45.3 
 
 
561 aa  244  3.9999999999999997e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.280114 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2904  putative methyl-accepting chemotaxis protein  42.2 
 
 
568 aa  244  3.9999999999999997e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.481458  normal  0.283558 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3598  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.6 
 
 
672 aa  244  6e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3563  chemotaxis sensory transducer  40.69 
 
 
563 aa  243  7e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1427  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.64 
 
 
562 aa  243  7e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.309452  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0820  chemotaxis sensory transducer  46.86 
 
 
608 aa  243  7e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.254614  normal  0.216431 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3665  chemotaxis sensory transducer  44.51 
 
 
567 aa  243  9e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7508  putative methyl-accepting chemotaxis protein (with a HAMP region)  45.33 
 
 
552 aa  243  1e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.692825  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1795  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.19 
 
 
561 aa  241  4e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.432423  normal  0.0230577 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0779  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  47.14 
 
 
558 aa  241  4e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0546434  normal  0.151916 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0718  chemotaxis sensory transducer  46.51 
 
 
669 aa  240  6.999999999999999e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.845917  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6993  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer  32.53 
 
 
697 aa  240  6.999999999999999e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1729  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.52 
 
 
693 aa  240  8e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.686986  normal  0.0650814 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1160  chemotaxis sensory transducer  43.88 
 
 
559 aa  239  1e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4464  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.41 
 
 
573 aa  239  1e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.610641  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0914  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.7 
 
 
689 aa  238  3e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.497103 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2905  putative methyl-accepting chemotaxis protein  42.19 
 
 
542 aa  238  3e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.234112  normal  0.211145 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0994  chemotaxis sensory transducer  41.05 
 
 
656 aa  238  4e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.357708  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0995  chemotaxis sensory transducer  41.69 
 
 
656 aa  238  4e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.880627  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0383  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.75 
 
 
559 aa  236  8e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.50218 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3547  chemotaxis sensory transducer  40.68 
 
 
566 aa  236  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2903  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.19 
 
 
568 aa  235  2.0000000000000002e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.335645  normal  0.0996392 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6635  methyl-accepting chemotaxis protein  43.12 
 
 
565 aa  235  2.0000000000000002e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.459746  normal  0.104137 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2742  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.38 
 
 
560 aa  235  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.429688 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2846  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.77 
 
 
565 aa  235  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.430745  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1918  chemotaxis sensory transducer  42.13 
 
 
688 aa  235  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.537222 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5144  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.21 
 
 
686 aa  234  3e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1025  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.88 
 
 
681 aa  234  3e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2554  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.81 
 
 
644 aa  234  4.0000000000000004e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0186678  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1857  chemotaxis sensory transducer  38.1 
 
 
563 aa  234  4.0000000000000004e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6483  methyl-accepting chemotaxis protein  39.75 
 
 
565 aa  234  5e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.877741  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0065  chemotaxis sensory transducer  41.33 
 
 
688 aa  234  5e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0714339 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1454  chemotaxis sensory transducer  32.66 
 
 
684 aa  233  6e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.416803  normal  0.262623 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3107  chemotaxis sensory transducer  42.63 
 
 
674 aa  234  6e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0664997 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2900  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer (chemoreceptor)  43.8 
 
 
675 aa  233  7.000000000000001e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.142675  normal  0.173139 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2744  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.11 
 
 
572 aa  233  9e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.696609  normal  0.585687 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1840  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.5 
 
 
561 aa  232  1e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.745103 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0153  chemotaxis sensory transducer  39.01 
 
 
602 aa  233  1e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0497  chemotaxis sensory transducer  43.16 
 
 
577 aa  233  1e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3907  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.05 
 
 
565 aa  232  2e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4118  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.58 
 
 
567 aa  231  2e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2843  putative histidine kinase, HAMP region  44.41 
 
 
682 aa  231  3e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1408  chemotaxis sensory transducer  47.01 
 
 
568 aa  231  3e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.591131  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4783  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.66 
 
 
730 aa  231  3e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2484  chemotaxis sensory transducer  40.44 
 
 
563 aa  231  3e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.1562  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2983  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.59 
 
 
561 aa  231  3e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0323515 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2757  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.7 
 
 
561 aa  231  3e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0630329  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7375  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.53 
 
 
655 aa  231  4e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1830  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.98 
 
 
563 aa  230  5e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1843  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.49 
 
 
568 aa  230  7e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.618754 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3378  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.81 
 
 
563 aa  230  7e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.104618  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2546  chemotaxis sensory transducer  40.92 
 
 
690 aa  229  9e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1317  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.55 
 
 
560 aa  229  9e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.14669 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3147  chemotaxis sensory transducer  40.66 
 
 
561 aa  229  2e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0908078  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3545  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.9 
 
 
689 aa  229  2e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.457552  normal  0.598514 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1253  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.34 
 
 
567 aa  229  2e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.010155 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3804  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.56 
 
 
655 aa  229  2e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.772812  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2241  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.86 
 
 
566 aa  228  3e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4406  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.3 
 
 
566 aa  228  3e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.341232 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4787  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.54 
 
 
561 aa  228  3e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.708956  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0330  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer  39.8 
 
 
676 aa  227  4e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0869057 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3344  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.07 
 
 
561 aa  227  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.828703  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3471  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.41 
 
 
561 aa  227  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.130295  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3161  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.91 
 
 
731 aa  227  5.0000000000000005e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.072786  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0741  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.99 
 
 
558 aa  227  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.532986  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5172  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.08 
 
 
656 aa  226  8e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1321  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42 
 
 
730 aa  226  9e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0177086  normal  0.260794 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6717  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.68 
 
 
741 aa  226  1e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.447835  normal  0.587139 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0889  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.9 
 
 
540 aa  225  2e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1388  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.63 
 
 
656 aa  225  2e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0527529  normal  0.207734 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2072  chemotaxis sensory transducer  43.67 
 
 
556 aa  225  2e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.68132  normal  0.341201 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3424  chemotaxis sensory transducer  42.51 
 
 
558 aa  224  3e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.574813 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1316  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.13 
 
 
561 aa  224  3e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.234166 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4286  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.48 
 
 
563 aa  224  3e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0840  chemotaxis sensory transducer  41.01 
 
 
712 aa  224  3e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.174635 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3610  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.18 
 
 
563 aa  224  4e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.735593  normal  0.400148 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>