More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_0808 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009997  Sbal195_3789  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  67.69 
 
 		 554 aa  714    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0837  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  71.48 
 
 		 554 aa  771    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3494  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  67.23 
 
 		 554 aa  716    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3759  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  70.94 
 
 		 554 aa  781    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0990388  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0987  methyl-accepting chemotaxis protein  68.66 
 
 		 554 aa  731    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0641  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  68.05 
 
 		 568 aa  719    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0808  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  100 
 
 		 554 aa  1129    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3601  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  68.41 
 
 		 554 aa  716    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0870  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  66.98 
 
 		 554 aa  718    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0571565  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3422  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  67.23 
 
 		 554 aa  717    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0824  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  68.16 
 
 		 554 aa  729    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00067966 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3323  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  68.59 
 
 		 554 aa  719    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3052  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  66.79 
 
 		 554 aa  707    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0630  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  68.41 
 
 		 554 aa  718    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3199  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  68.73 
 
 		 554 aa  731    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.927661 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3200  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  66.25 
 
 		 554 aa  721    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0581  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  62.27 
 
 		 554 aa  652    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3666  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  67.69 
 
 		 554 aa  712    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3617  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  67.42 
 
 		 554 aa  719    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.964358 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2880  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  66.79 
 
 		 558 aa  738    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3532  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  62.27 
 
 		 555 aa  669    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3299  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  69.1 
 
 		 554 aa  736    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3491  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  68.59 
 
 		 554 aa  719    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2596  methyl-accepting chemotaxis protein  41.44 
 
 		 564 aa  437  1e-121  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000057467  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001822  methyl-accepting chemotaxis protein  42.21 
 
 		 557 aa  415  9.999999999999999e-116  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000124429  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3379  methyl-accepting chemotaxis protein  38.46 
 
 		 559 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2346  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.85 
 
 		 564 aa  331  2e-89  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2548  putative chemotaxis transducer  37.61 
 
 		 561 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.271227  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29800  putative chemotaxis transducer  37.25 
 
 		 561 aa  326  7e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00431462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0339  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.14 
 
 		 558 aa  320  5e-86  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2000  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.49 
 
 		 560 aa  318  2e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0144557  normal  0.0324669 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000971  methyl-accepting chemotaxis protein  36.15 
 
 		 553 aa  310  5.9999999999999995e-83  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.370017  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2783  methyl-accepting chemotaxisprotein  38.96 
 
 		 690 aa  309  1.0000000000000001e-82  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.468562 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07022  histidine kinase  36.14 
 
 		 553 aa  307  3e-82  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3237  methyl-accepting chemotaxis protein  44.87 
 
 		 771 aa  307  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3768  chemotaxis sensory transducer  37.08 
 
 		 560 aa  300  4e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4964  methyl-accepting chemotaxis protein  36.22 
 
 		 545 aa  297  3e-79  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2828  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.62 
 
 		 544 aa  286  5e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2316  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.86 
 
 		 548 aa  283  4.0000000000000003e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0208981 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2861  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.43 
 
 		 544 aa  282  9e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.445183 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1498  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.12 
 
 		 687 aa  282  1e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000111484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2327  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.04 
 
 		 554 aa  279  1e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.644098  normal  0.637343 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2757  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.23 
 
 		 544 aa  278  1e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1030  methyl-accepting chemotaxis protein  34.43 
 
 		 549 aa  276  5e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0520  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.57 
 
 		 561 aa  274  3e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.859036  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2920  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.85 
 
 		 544 aa  273  5.000000000000001e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2119  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.22 
 
 		 548 aa  273  6e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2617  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.69 
 
 		 548 aa  273  9e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.224982  normal  0.210295 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1963  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.06 
 
 		 637 aa  270  5.9999999999999995e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.870205  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0237  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.56 
 
 		 632 aa  269  1e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.997473 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0756  methyl-accepting chemotaxis protein  33.45 
 
 		 558 aa  269  1e-70  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0851  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.65 
 
 		 674 aa  267  4e-70  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.244273  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0962  methyl-accepting chemotaxis protein  41.95 
 
 		 643 aa  267  4e-70  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000917898  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3924  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.56 
 
 		 527 aa  266  5.999999999999999e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1983  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.69 
 
 		 548 aa  265  1e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000213036  normal  0.437149 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2659  methyl-accepting chemotaxis protein  31.67 
 
 		 556 aa  264  3e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2554  chemotaxis sensory transducer  39.74 
 
 		 663 aa  264  3e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.486048 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0226  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.23 
 
 		 527 aa  261  3e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.16836 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4233  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.23 
 
 		 525 aa  260  4e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000524679 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2212  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.92 
 
 		 549 aa  260  4e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3600  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.24 
 
 		 546 aa  260  6e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3709  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  34.03 
 
 		 546 aa  259  7e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2650  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.44 
 
 		 568 aa  259  7e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0042  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.39 
 
 		 565 aa  259  1e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.121118  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0949  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.15 
 
 		 636 aa  257  4e-67  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0451727 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003896  methyl-accepting chemotaxis protein  42.58 
 
 		 545 aa  256  8e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000288698  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2240  methyl-accepting chemotaxis protein  32.55 
 
 		 545 aa  255  2.0000000000000002e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2000  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  34.88 
 
 		 545 aa  254  3e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000194984 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2358  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.88 
 
 		 545 aa  254  3e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1023  methyl-accepting chemotaxis protein  36.03 
 
 		 578 aa  254  3e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2347  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.67 
 
 		 545 aa  253  7e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4113  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.38 
 
 		 527 aa  253  7e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4216  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.95 
 
 		 647 aa  253  7e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2463  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.67 
 
 		 545 aa  253  7e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0650014  normal  0.35347 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2601  chemotaxis sensory transducer  32.5 
 
 		 569 aa  253  8.000000000000001e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.441915  normal  0.36116 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0122  methyl-accepting chemotaxis protein  34.12 
 
 		 553 aa  253  8.000000000000001e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3728  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.54 
 
 		 527 aa  252  1e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.436185 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1845  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.24 
 
 		 545 aa  251  2e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3799  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.54 
 
 		 527 aa  251  2e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1767  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.24 
 
 		 545 aa  251  3e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.381763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1098  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.6 
 
 		 637 aa  251  3e-65  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0167241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2174  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.46 
 
 		 544 aa  251  3e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00506259 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1776  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  33.54 
 
 		 543 aa  250  4e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.363817 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2116  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.43 
 
 		 545 aa  250  4e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0400  methyl-accepting chemotaxis protein  32.07 
 
 		 549 aa  250  5e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.431065  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3044  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.95 
 
 		 688 aa  250  5e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61300  putative chemotaxis transducer  42.78 
 
 		 712 aa  250  5e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.862971 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1939  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.67 
 
 		 638 aa  249  7e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.573171  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5279  putative chemotaxis transducer  43.06 
 
 		 712 aa  249  1e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0493383  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0584  methyl-accepting chemotaxis transducer  43.54 
 
 		 647 aa  247  3e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.77697  normal  0.644217 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0877  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.16 
 
 		 540 aa  248  3e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.11332 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3839  methyl-accepting chemotaxis protein  42.81 
 
 		 636 aa  246  4.9999999999999997e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.406017  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2825  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.84 
 
 		 570 aa  246  4.9999999999999997e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000443347 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2254  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.5 
 
 		 545 aa  246  8e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.492 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0623  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.26 
 
 		 647 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.494937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2544  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.62 
 
 		 633 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00517521  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4715  chemotaxis sensory transducer  42.37 
 
 		 713 aa  246  9.999999999999999e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.233277  normal  0.171171 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3669  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.24 
 
 		 716 aa  246  9.999999999999999e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.170337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0895  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.51 
 
 		 630 aa  244  3e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.174985 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0461  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.01 
 
 		 569 aa  244  3.9999999999999997e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>