More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_2194 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_2240  methyl-accepting chemotaxis protein  64.59 
 
 		 545 aa  717    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2463  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  64.4 
 
 		 545 aa  702    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0650014  normal  0.35347 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2347  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  64.4 
 
 		 545 aa  702    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1868  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  69.91 
 
 		 545 aa  733    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000255174 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2116  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  63.67 
 
 		 545 aa  691    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2358  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  64.4 
 
 		 545 aa  702    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2000  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  64.4 
 
 		 545 aa  702    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000194984 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1767  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  64.95 
 
 		 545 aa  718    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.381763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1997  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  67.71 
 
 		 546 aa  695    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.179465  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1845  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  64.95 
 
 		 545 aa  718    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2194  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  100 
 
 		 545 aa  1107    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00216283 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2412  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  75.96 
 
 		 545 aa  847    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.516535  hitchhiker  0.00000653474 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2254  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  64.95 
 
 		 545 aa  706    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.492 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1653  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  57.25 
 
 		 538 aa  592  1e-168  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1770  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.47 
 
 		 538 aa  504  1e-141  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1983  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.91 
 
 		 548 aa  306  7e-82  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000213036  normal  0.437149 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2119  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.18 
 
 		 548 aa  304  3.0000000000000004e-81  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2212  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.42 
 
 		 549 aa  299  1e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2617  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.52 
 
 		 548 aa  290  4e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.224982  normal  0.210295 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2327  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.01 
 
 		 554 aa  287  4e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.644098  normal  0.637343 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2659  methyl-accepting chemotaxis protein  33.66 
 
 		 556 aa  277  4e-73  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4964  methyl-accepting chemotaxis protein  34.8 
 
 		 545 aa  273  7e-72  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3200  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.69 
 
 		 554 aa  270  5e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2000  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.74 
 
 		 560 aa  266  5.999999999999999e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0144557  normal  0.0324669 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0870  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.16 
 
 		 554 aa  266  8e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0571565  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3299  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.93 
 
 		 554 aa  266  8e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3617  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.78 
 
 		 554 aa  266  8.999999999999999e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.964358 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3494  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.4 
 
 		 554 aa  265  2e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3422  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  34.4 
 
 		 554 aa  264  3e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0987  methyl-accepting chemotaxis protein  35.83 
 
 		 554 aa  263  4e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3199  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.49 
 
 		 554 aa  263  4e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.927661 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3052  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.14 
 
 		 554 aa  262  1e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1030  methyl-accepting chemotaxis protein  32.06 
 
 		 549 aa  261  2e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0824  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.83 
 
 		 554 aa  260  4e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00067966 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0581  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.6 
 
 		 554 aa  259  8e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3532  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.51 
 
 		 555 aa  256  6e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1776  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  33.03 
 
 		 543 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.363817 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3491  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.81 
 
 		 554 aa  254  3e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0443  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.87 
 
 		 541 aa  253  6e-66  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3323  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.62 
 
 		 554 aa  252  1e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2601  chemotaxis sensory transducer  31.98 
 
 		 569 aa  251  2e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.441915  normal  0.36116 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2316  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.97 
 
 		 548 aa  251  2e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0208981 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0630  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.41 
 
 		 554 aa  251  2e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3666  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.81 
 
 		 554 aa  251  3e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3379  methyl-accepting chemotaxis protein  37.11 
 
 		 559 aa  250  4e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1963  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.48 
 
 		 637 aa  250  5e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.870205  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2828  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.99 
 
 		 544 aa  249  7e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2757  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.37 
 
 		 544 aa  249  7e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0641  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.61 
 
 		 568 aa  249  8e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3601  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  34.61 
 
 		 554 aa  249  9e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3789  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.53 
 
 		 554 aa  249  1e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2920  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.62 
 
 		 544 aa  247  4e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2548  putative chemotaxis transducer  34.79 
 
 		 561 aa  246  6.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.271227  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0851  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.98 
 
 		 674 aa  246  9e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.244273  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2346  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.93 
 
 		 564 aa  244  1.9999999999999999e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29800  putative chemotaxis transducer  35.03 
 
 		 561 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00431462  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2861  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.62 
 
 		 544 aa  244  3e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.445183 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1937  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.87 
 
 		 541 aa  244  3e-63  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.158854  normal  0.960341 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2880  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.96 
 
 		 558 aa  244  3.9999999999999997e-63  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3759  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.75 
 
 		 554 aa  243  5e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0990388  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3600  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.44 
 
 		 546 aa  241  2e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0085  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.02 
 
 		 638 aa  241  2e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0647334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0837  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.61 
 
 		 554 aa  240  5e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4404  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.03 
 
 		 638 aa  240  5.999999999999999e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0156105 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000971  methyl-accepting chemotaxis protein  33.47 
 
 		 553 aa  239  1e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.370017  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0949  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.28 
 
 		 636 aa  237  3e-61  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0451727 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1098  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.29 
 
 		 637 aa  238  3e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0167241  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3709  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  31.03 
 
 		 546 aa  237  4e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0808  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.5 
 
 		 554 aa  237  5.0000000000000005e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2521  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.09 
 
 		 533 aa  236  7e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000172201 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03718  putative chemotaxis sensory protein  30.04 
 
 		 540 aa  234  3e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2596  methyl-accepting chemotaxis protein  32.29 
 
 		 564 aa  234  4.0000000000000004e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000057467  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3699  methyl-accepting chemotaxis protein  35.15 
 
 		 543 aa  233  5e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3768  chemotaxis sensory transducer  35.16 
 
 		 560 aa  233  6e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2174  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.12 
 
 		 544 aa  231  2e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00506259 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2530  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  32.78 
 
 		 533 aa  231  3e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.616311  hitchhiker  0.00580613 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1793  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.6 
 
 		 533 aa  230  5e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0175347  normal  0.776493 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5279  putative chemotaxis transducer  38.38 
 
 		 712 aa  230  6e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0493383  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0099  chemotaxis sensory transducer  34.23 
 
 		 639 aa  229  7e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000152719  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61300  putative chemotaxis transducer  40.59 
 
 		 712 aa  229  7e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.862971 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001822  methyl-accepting chemotaxis protein  34.3 
 
 		 557 aa  229  9e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000124429  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2347  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.4 
 
 		 533 aa  229  1e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4715  chemotaxis sensory transducer  35.88 
 
 		 713 aa  229  1e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.233277  normal  0.171171 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4795  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.36 
 
 		 638 aa  229  1e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.884167  hitchhiker  0.000462611 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0080  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.94 
 
 		 636 aa  228  2e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07022  histidine kinase  33.56 
 
 		 553 aa  228  3e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4454  methyl-accepting chemotaxis protein  35.2 
 
 		 642 aa  226  6e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0167  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.8 
 
 		 540 aa  226  7e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5070  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.59 
 
 		 638 aa  225  1e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3669  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.88 
 
 		 716 aa  225  1e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.170337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0130  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.02 
 
 		 671 aa  225  1e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0400  methyl-accepting chemotaxis protein  31.77 
 
 		 549 aa  225  2e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.431065  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4894  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.18 
 
 		 638 aa  224  3e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.291281  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0445  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.18 
 
 		 638 aa  224  3e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.455391  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5020  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.88 
 
 		 638 aa  223  9e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0734  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.45 
 
 		 643 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.770301  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0271  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.1 
 
 		 638 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.758035  hitchhiker  0.0000678809 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1672  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.36 
 
 		 544 aa  222  9.999999999999999e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0450  chemotaxis sensory transducer  34.96 
 
 		 645 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0272  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.9 
 
 		 638 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00090491  hitchhiker  0.000000349734 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>