More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2828 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_2828  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  100 
 
 		 550 aa  1091    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000014913 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2890  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.25 
 
 		 549 aa  553  1e-156  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.824592  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2845  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.24 
 
 		 549 aa  432  1e-120  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000597879  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0612  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.9 
 
 		 543 aa  414  1e-114  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2942  methyl-accepting chemotaxis protein  51.48 
 
 		 544 aa  409  1e-113  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3147  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.39 
 
 		 540 aa  410  1e-113  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0302394  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3719  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.1 
 
 		 540 aa  410  1e-113  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3311  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53 
 
 		 547 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.691655  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2326  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.81 
 
 		 547 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3611  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.91 
 
 		 540 aa  404  1e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1029  methyl-accepting chemotaxis protein  46.75 
 
 		 549 aa  401  9.999999999999999e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.392996  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1884  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.64 
 
 		 547 aa  395  1e-109  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.114501  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1030  methyl-accepting chemotaxis protein  57.68 
 
 		 549 aa  393  1e-108  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1391  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.93 
 
 		 557 aa  393  1e-108  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0821  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.11 
 
 		 545 aa  392  1e-108  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000877148  hitchhiker  0.00000558474 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0529  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.92 
 
 		 544 aa  382  1e-105  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0712  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.54 
 
 		 550 aa  384  1e-105  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0756  methyl-accepting chemotaxis protein  45.57 
 
 		 549 aa  380  1e-104  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1374  methyl-accepting chemotaxis protein  42.45 
 
 		 541 aa  380  1e-104  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3107  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.62 
 
 		 542 aa  375  1e-102  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0142  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.32 
 
 		 540 aa  373  1e-102  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0808523  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1221  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.21 
 
 		 544 aa  373  1e-102  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000143655  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1033  methyl-accepting chemotaxis protein  61.24 
 
 		 533 aa  372  1e-101  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3876  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.78 
 
 		 535 aa  365  1e-100  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.74566  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3345  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.59 
 
 		 542 aa  366  1e-100  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0226154 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0375  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.73 
 
 		 674 aa  368  1e-100  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.129925  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1041  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.56 
 
 		 661 aa  361  2e-98  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0400  methyl-accepting chemotaxis protein  52.48 
 
 		 549 aa  360  3e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.431065  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3964  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.22 
 
 		 535 aa  355  1e-96  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000408371 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1032  methyl-accepting chemotaxis protein  45.35 
 
 		 645 aa  355  2e-96  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0798  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.97 
 
 		 541 aa  355  2e-96  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0401  methyl-accepting chemotaxis protein, putative  46.83 
 
 		 539 aa  351  2e-95  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.395676  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0724  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.58 
 
 		 539 aa  348  1e-94  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0935  methyl-accepting chemotaxis protein, putative  56.51 
 
 		 528 aa  347  3e-94  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.220244  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1286  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  56.07 
 
 		 538 aa  346  8e-94  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2579  methyl-accepting chemotaxis protein  45.4 
 
 		 543 aa  344  2e-93  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2776  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.83 
 
 		 544 aa  343  2.9999999999999997e-93  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.839191  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1041  methyl-accepting chemotaxis protein  54.25 
 
 		 541 aa  342  1e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.893443  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2825  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.45 
 
 		 570 aa  340  4e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000443347 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0042  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  55.06 
 
 		 565 aa  337  5e-91  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.121118  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3063  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.24 
 
 		 533 aa  336  7.999999999999999e-91  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.378908  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2857  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.28 
 
 		 392 aa  335  1e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0205381  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0365  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.82 
 
 		 700 aa  335  1e-90  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0784998 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0383  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.19 
 
 		 700 aa  334  2e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.424843  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2961  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.47 
 
 		 542 aa  333  4e-90  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3045  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.83 
 
 		 563 aa  333  5e-90  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000317109  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0750  methyl-accepting chemotaxis protein, putative  54.6 
 
 		 539 aa  332  1e-89  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0889  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.43 
 
 		 540 aa  332  2e-89  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0525  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  50.68 
 
 		 632 aa  330  4e-89  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0799  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  55.26 
 
 		 388 aa  329  8e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1357  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.99 
 
 		 392 aa  328  1.0000000000000001e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.9116599999999996e-27 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0149  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.08 
 
 		 533 aa  322  7e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2652  methyl-accepting chemotaxis protein  50.72 
 
 		 392 aa  319  1e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1891  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.6 
 
 		 509 aa  317  4e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.745334  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0728  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.52 
 
 		 537 aa  315  9.999999999999999e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3312  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.67 
 
 		 533 aa  315  1.9999999999999998e-84  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0461  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.45 
 
 		 569 aa  311  2.9999999999999997e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1021  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.57 
 
 		 518 aa  310  5.9999999999999995e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1035  methyl-accepting chemotaxis protein  56.41 
 
 		 549 aa  309  1.0000000000000001e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.640997  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3058  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.83 
 
 		 518 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0960  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.02 
 
 		 666 aa  297  3e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000181378  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0809  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.1 
 
 		 532 aa  296  7e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.826751  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0771  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.15 
 
 		 822 aa  295  1e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3453  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.94 
 
 		 532 aa  295  2e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0235494 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0039  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.01 
 
 		 515 aa  294  3e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0381098 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3709  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  52.09 
 
 		 546 aa  293  5e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0633  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.12 
 
 		 552 aa  293  6e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3979  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.12 
 
 		 552 aa  293  6e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.594367  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0040  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.6 
 
 		 515 aa  290  5.0000000000000004e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3600  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.45 
 
 		 546 aa  290  6e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3525  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.41 
 
 		 658 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0882  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.58 
 
 		 540 aa  274  3e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.566239  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1674  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.21 
 
 		 543 aa  273  6e-72  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1249  methyl-accepting chemotaxis protein  33.27 
 
 		 596 aa  270  7e-71  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000483868  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2998  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.62 
 
 		 549 aa  258  2e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1007  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.85 
 
 		 573 aa  258  2e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.02936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0922  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.03 
 
 		 572 aa  253  5.000000000000001e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.981358 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0900  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.68 
 
 		 573 aa  240  5e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.476047  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1937  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.42 
 
 		 541 aa  239  6.999999999999999e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.158854  normal  0.960341 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1006  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.23 
 
 		 573 aa  236  8e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2177  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.72 
 
 		 628 aa  235  2.0000000000000002e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2782  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.81 
 
 		 601 aa  234  4.0000000000000004e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.163256  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2152  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.28 
 
 		 474 aa  232  1e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000647381  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0443  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.85 
 
 		 541 aa  226  7e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1098  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.33 
 
 		 637 aa  220  5e-56  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0167241  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0916  methyl-accepting chemotaxis protein  38.24 
 
 		 394 aa  219  7e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00484593  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2492  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.18 
 
 		 572 aa  219  8.999999999999998e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1624  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.86 
 
 		 626 aa  219  1e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.835429  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2870  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.18 
 
 		 636 aa  217  4e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0167  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.71 
 
 		 540 aa  216  8e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3465  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.6 
 
 		 423 aa  216  8e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1124  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.84 
 
 		 547 aa  215  9.999999999999999e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00163985  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0071  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  38.97 
 
 		 658 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1714  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.09 
 
 		 673 aa  215  1.9999999999999998e-54  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.712235  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1221  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.19 
 
 		 564 aa  215  1.9999999999999998e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000139892  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4745  methyl-accepting chemotaxis protein  35.58 
 
 		 658 aa  213  5.999999999999999e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2834  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  39.04 
 
 		 671 aa  213  5.999999999999999e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.188903  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2500  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.98 
 
 		 557 aa  213  5.999999999999999e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0117  methyl-accepting chemotaxis protein  38.97 
 
 		 658 aa  213  7e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0582  methyl-accepting chemotaxis protein  38.35 
 
 		 696 aa  211  3e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>