More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0582 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0582  methyl-accepting chemotaxis protein  100 
 
 		 696 aa  1413    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0467  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.5 
 
 		 693 aa  693    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.285916  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2939  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  70.55 
 
 		 696 aa  1011    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000015868 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0484  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.78 
 
 		 693 aa  690    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000150879 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4401  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.03 
 
 		 695 aa  775    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.896591  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0385  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.05 
 
 		 698 aa  627  1e-178  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0817491  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0932  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.77 
 
 		 707 aa  469  1.0000000000000001e-131  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.1893  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0935  methyl-accepting chemotaxis protein, putative  42.13 
 
 		 528 aa  404  1e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.220244  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3097  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.55 
 
 		 602 aa  314  3.9999999999999997e-84  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1286  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.14 
 
 		 538 aa  298  2e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3326  chemotaxis sensory transducer  36.93 
 
 		 534 aa  287  4e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3480  methyl-accepting chemotaxis protein  35.84 
 
 		 533 aa  281  4e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0820031  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4367  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.7 
 
 		 524 aa  278  2e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3261  chemotaxis sensory transducer  35.62 
 
 		 534 aa  277  4e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2241  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  33.46 
 
 		 598 aa  276  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.130389  normal  0.394001 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4857  methyl-accepting chemotaxis protein  37.5 
 
 		 535 aa  275  3e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55750  putative chemotaxis transducer  36.91 
 
 		 538 aa  273  7e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1958  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.88 
 
 		 598 aa  273  8.000000000000001e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.57626  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1155  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.97 
 
 		 523 aa  272  1e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1156  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.27 
 
 		 523 aa  268  2.9999999999999995e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1226  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.53 
 
 		 523 aa  267  4e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2723  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.41 
 
 		 522 aa  263  8e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.471128  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2475  methyl-accepting chemotaxis protein  32.82 
 
 		 598 aa  262  1e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0390427  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3399  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.43 
 
 		 526 aa  258  3e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0041  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.33 
 
 		 573 aa  256  9e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03575  methyl-accepting chemotaxis protein  36.72 
 
 		 525 aa  256  1.0000000000000001e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1246  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.19 
 
 		 522 aa  255  2.0000000000000002e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3064  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.19 
 
 		 522 aa  254  4.0000000000000004e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000699577 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1290  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.98 
 
 		 522 aa  254  5.000000000000001e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0561  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.41 
 
 		 505 aa  252  1e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1324  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.98 
 
 		 522 aa  252  2e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0159359 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1808  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.79 
 
 		 514 aa  251  3e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3042  methyl-accepting chemotaxis protein  34.16 
 
 		 527 aa  251  4e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2839  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.31 
 
 		 546 aa  237  5.0000000000000005e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4961  methyl-accepting chemotaxis protein  33.66 
 
 		 527 aa  236  1.0000000000000001e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1985  methyl-accepting chemotaxis protein (MCP)  28.94 
 
 		 715 aa  229  2e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1030  methyl-accepting chemotaxis protein  41 
 
 		 549 aa  227  6e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2825  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.44 
 
 		 570 aa  227  7e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000443347 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2845  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.4 
 
 		 549 aa  226  8e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000597879  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1460  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.25 
 
 		 534 aa  223  9.999999999999999e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.695651  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3345  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.32 
 
 		 542 aa  218  2e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0226154 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0612  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.23 
 
 		 543 aa  218  4e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2776  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.73 
 
 		 544 aa  217  7e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.839191  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0821  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.57 
 
 		 545 aa  216  9.999999999999999e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000877148  hitchhiker  0.00000558474 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1041  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.83 
 
 		 661 aa  216  1.9999999999999998e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0799  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.23 
 
 		 388 aa  215  2.9999999999999995e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0461  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.49 
 
 		 569 aa  215  2.9999999999999995e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0375  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.94 
 
 		 674 aa  214  3.9999999999999995e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.129925  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3311  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.88 
 
 		 547 aa  214  3.9999999999999995e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.691655  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1391  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.27 
 
 		 557 aa  213  7e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3107  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.54 
 
 		 542 aa  212  2e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3063  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.73 
 
 		 533 aa  212  2e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.378908  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0400  methyl-accepting chemotaxis protein  39.33 
 
 		 549 aa  211  4e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.431065  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2942  methyl-accepting chemotaxis protein  39.04 
 
 		 544 aa  209  1e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2828  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.46 
 
 		 550 aa  209  1e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000014913 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2652  methyl-accepting chemotaxis protein  38.75 
 
 		 392 aa  209  2e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0383  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.16 
 
 		 700 aa  209  2e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.424843  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2326  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.24 
 
 		 547 aa  208  2e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3805  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.9 
 
 		 422 aa  207  5e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000721713  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0525  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  41.11 
 
 		 632 aa  206  1e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0042  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.98 
 
 		 565 aa  206  1e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.121118  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0750  methyl-accepting chemotaxis protein, putative  38.76 
 
 		 539 aa  205  2e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0142  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.55 
 
 		 540 aa  205  2e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0808523  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0365  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.46 
 
 		 700 aa  206  2e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0784998 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1937  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.81 
 
 		 541 aa  205  3e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.158854  normal  0.960341 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3465  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.71 
 
 		 423 aa  205  3e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1029  methyl-accepting chemotaxis protein  41.48 
 
 		 549 aa  204  5e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.392996  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1041  methyl-accepting chemotaxis protein  38.92 
 
 		 541 aa  204  5e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.893443  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1884  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.85 
 
 		 547 aa  204  5e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.114501  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0889  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.28 
 
 		 540 aa  203  8e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3525  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.02 
 
 		 658 aa  202  9.999999999999999e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3709  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  38.69 
 
 		 546 aa  203  9.999999999999999e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1033  methyl-accepting chemotaxis protein  40.44 
 
 		 533 aa  200  6e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0071  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.5 
 
 		 525 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.603344  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0443  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.83 
 
 		 541 aa  199  1.0000000000000001e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0756  methyl-accepting chemotaxis protein  40.68 
 
 		 549 aa  199  2.0000000000000003e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0728  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.85 
 
 		 537 aa  199  2.0000000000000003e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2857  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.64 
 
 		 392 aa  199  2.0000000000000003e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0205381  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1357  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.91 
 
 		 392 aa  199  2.0000000000000003e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.9116599999999996e-27 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0798  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.58 
 
 		 541 aa  199  2.0000000000000003e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0529  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.77 
 
 		 544 aa  198  3e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3147  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.9 
 
 		 540 aa  198  3e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0302394  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1221  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.48 
 
 		 544 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000143655  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1275  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.55 
 
 		 470 aa  197  5.000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.233006 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1891  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.77 
 
 		 509 aa  196  1e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.745334  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1152  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.21 
 
 		 484 aa  196  1e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.26629  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3964  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.86 
 
 		 535 aa  196  1e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000408371 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2304  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.69 
 
 		 468 aa  195  2e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.816033 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3600  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.2 
 
 		 546 aa  195  2e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1374  methyl-accepting chemotaxis protein  39.39 
 
 		 541 aa  194  3e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3312  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.12 
 
 		 533 aa  194  3e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0771  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.05 
 
 		 822 aa  195  3e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0712  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.1 
 
 		 550 aa  194  5e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0149  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.99 
 
 		 533 aa  194  5e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5132  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31 
 
 		 468 aa  193  1e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.202601  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3719  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.41 
 
 		 540 aa  192  1e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0905  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  38.68 
 
 		 640 aa  192  2e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.746842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3236  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31 
 
 		 476 aa  192  2e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.315544  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3058  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.51 
 
 		 518 aa  192  2e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5149  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.82 
 
 		 468 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.853292  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>