More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_1275 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010622  Bphy_1275  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  100 
 
 		 470 aa  954    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.233006 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1954  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  76.17 
 
 		 511 aa  725    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.249155  normal  0.44726 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2304  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  76.65 
 
 		 468 aa  729    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.816033 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5149  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  65.74 
 
 		 468 aa  620  1e-176  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.853292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3236  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  66.38 
 
 		 476 aa  620  1e-176  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.315544  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5132  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  65.74 
 
 		 468 aa  620  1e-176  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.202601  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0496  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  57.4 
 
 		 470 aa  526  1e-148  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.453159 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0509  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  57.17 
 
 		 470 aa  518  1e-146  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.856427  normal  0.10181 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6912  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.41 
 
 		 475 aa  398  1e-109  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.18628  normal  0.2896 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1014  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.15 
 
 		 482 aa  391  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1152  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.71 
 
 		 484 aa  389  1e-107  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.26629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0535  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.12 
 
 		 487 aa  360  4e-98  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1554  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.98 
 
 		 495 aa  358  8e-98  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2227  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.41 
 
 		 481 aa  315  9e-85  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.237535  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1153  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.26 
 
 		 474 aa  298  1e-79  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3082  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.07 
 
 		 448 aa  296  7e-79  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.802467  normal  0.530433 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1623  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.74 
 
 		 454 aa  283  6.000000000000001e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00717627 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3980  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.59 
 
 		 468 aa  275  1.0000000000000001e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.330272 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3042  methyl-accepting chemotaxis protein  34.42 
 
 		 527 aa  243  7.999999999999999e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3326  chemotaxis sensory transducer  33.26 
 
 		 534 aa  239  1e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4367  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.57 
 
 		 524 aa  238  2e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1808  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.57 
 
 		 514 aa  236  6e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3261  chemotaxis sensory transducer  34.49 
 
 		 534 aa  236  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2839  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.12 
 
 		 546 aa  230  5e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3480  methyl-accepting chemotaxis protein  33.72 
 
 		 533 aa  228  2e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0820031  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55750  putative chemotaxis transducer  35.92 
 
 		 538 aa  226  7e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2723  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.57 
 
 		 522 aa  225  1e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.471128  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4857  methyl-accepting chemotaxis protein  35.95 
 
 		 535 aa  225  1e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03575  methyl-accepting chemotaxis protein  35.42 
 
 		 525 aa  224  3e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3399  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.7 
 
 		 526 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1246  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.81 
 
 		 522 aa  219  7.999999999999999e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0467  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.04 
 
 		 693 aa  218  2e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.285916  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3064  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.57 
 
 		 522 aa  218  2e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000699577 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1155  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.98 
 
 		 523 aa  218  2e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1290  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.81 
 
 		 522 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1324  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.33 
 
 		 522 aa  217  4e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0159359 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1156  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.81 
 
 		 523 aa  216  9.999999999999999e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1226  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.81 
 
 		 523 aa  215  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1460  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.78 
 
 		 534 aa  215  1.9999999999999998e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.695651  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0385  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.85 
 
 		 698 aa  211  3e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0817491  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0484  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.26 
 
 		 693 aa  208  2e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000150879 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2939  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.05 
 
 		 696 aa  207  3e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000015868 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4961  methyl-accepting chemotaxis protein  30.44 
 
 		 527 aa  206  6e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4401  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.91 
 
 		 695 aa  204  3e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.896591  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1641  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.85 
 
 		 480 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0715397  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0582  methyl-accepting chemotaxis protein  33.55 
 
 		 696 aa  197  3e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4172  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.12 
 
 		 584 aa  191  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4274  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.29 
 
 		 583 aa  190  5e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6117  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54 
 
 		 713 aa  188  2e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.140639  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1286  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.37 
 
 		 583 aa  188  2e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4808  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.12 
 
 		 584 aa  186  8e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6911  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.37 
 
 		 584 aa  182  8.000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.900499  normal  0.411338 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0534  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.03 
 
 		 439 aa  181  2.9999999999999997e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0932  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.4 
 
 		 707 aa  180  4.999999999999999e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.1893  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0561  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.45 
 
 		 505 aa  166  6.9999999999999995e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1985  methyl-accepting chemotaxis protein (MCP)  29.57 
 
 		 715 aa  163  8.000000000000001e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0041  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.85 
 
 		 573 aa  162  1e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3097  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.87 
 
 		 602 aa  157  5.0000000000000005e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2475  methyl-accepting chemotaxis protein  29.88 
 
 		 598 aa  155  1e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0390427  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2241  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  29.73 
 
 		 598 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.130389  normal  0.394001 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1958  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.6 
 
 		 598 aa  147  3e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.57626  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4170  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.56 
 
 		 578 aa  146  1e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1837  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.56 
 
 		 578 aa  139  1e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00718884 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0009  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.15 
 
 		 511 aa  139  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2381  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.91 
 
 		 578 aa  137  4e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0071  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.22 
 
 		 525 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.603344  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6192  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.88 
 
 		 573 aa  120  6e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.361355  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6711  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.48 
 
 		 568 aa  119  9e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02418  hypothetical protein  30.92 
 
 		 578 aa  101  3e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3200  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30 
 
 		 554 aa  99.4  1e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0987  methyl-accepting chemotaxis protein  33.18 
 
 		 554 aa  95.1  3e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3052  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.08 
 
 		 554 aa  93.2  9e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3491  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.66 
 
 		 554 aa  92.4  1e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4216  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.6 
 
 		 647 aa  92.8  1e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3299  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.33 
 
 		 554 aa  93.2  1e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1023  methyl-accepting chemotaxis protein  32.19 
 
 		 578 aa  92.8  1e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5144  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.98 
 
 		 686 aa  92  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0641  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.69 
 
 		 568 aa  92  2e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0824  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.5 
 
 		 554 aa  92  2e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00067966 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3323  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.66 
 
 		 554 aa  92.4  2e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0630  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.66 
 
 		 554 aa  92.4  2e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3199  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.33 
 
 		 554 aa  92  2e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.927661 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1098  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.17 
 
 		 637 aa  91.7  2e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0167241  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3601  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  29.69 
 
 		 554 aa  91.7  2e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0837  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.39 
 
 		 554 aa  91.3  3e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2000  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.15 
 
 		 560 aa  91.7  3e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0144557  normal  0.0324669 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3494  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.68 
 
 		 554 aa  91.3  3e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0870  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.68 
 
 		 554 aa  91.3  3e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0571565  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3666  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.69 
 
 		 554 aa  91.7  3e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3789  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.69 
 
 		 554 aa  90.9  4e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3532  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.34 
 
 		 555 aa  90.9  4e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3422  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  33 
 
 		 554 aa  90.9  5e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0914  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.88 
 
 		 689 aa  90.5  6e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.497103 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3617  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33 
 
 		 554 aa  90.5  6e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.964358 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2347  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.74 
 
 		 533 aa  89.7  9e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1029  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.71 
 
 		 819 aa  89.4  1e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.558162 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2990  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.88 
 
 		 667 aa  89.4  1e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.413203  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2483  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.06 
 
 		 464 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.132022 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0969  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.66 
 
 		 631 aa  89  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1387  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.88 
 
 		 667 aa  88.6  2e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>