More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_4401 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0582  methyl-accepting chemotaxis protein  54.03 
 
 		 696 aa  775    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4401  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  100 
 
 		 695 aa  1429    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.896591  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0484  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  65.9 
 
 		 693 aa  939    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000150879 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2939  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  55.04 
 
 		 696 aa  795    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000015868 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0467  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  66.04 
 
 		 693 aa  951    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.285916  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0385  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.13 
 
 		 698 aa  661    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0817491  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0932  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.91 
 
 		 707 aa  521  1e-146  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.1893  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0935  methyl-accepting chemotaxis protein, putative  42.69 
 
 		 528 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.220244  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1286  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.26 
 
 		 538 aa  324  4e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3097  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.12 
 
 		 602 aa  301  2e-80  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3326  chemotaxis sensory transducer  34.95 
 
 		 534 aa  293  5e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3480  methyl-accepting chemotaxis protein  34.25 
 
 		 533 aa  284  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0820031  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3261  chemotaxis sensory transducer  34.25 
 
 		 534 aa  284  5.000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55750  putative chemotaxis transducer  33.79 
 
 		 538 aa  282  2e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2723  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.94 
 
 		 522 aa  280  6e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.471128  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3042  methyl-accepting chemotaxis protein  37.86 
 
 		 527 aa  279  2e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1155  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.14 
 
 		 523 aa  278  2e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4367  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.92 
 
 		 524 aa  277  5e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4857  methyl-accepting chemotaxis protein  33.79 
 
 		 535 aa  277  5e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1226  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.01 
 
 		 523 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1156  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.01 
 
 		 523 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1808  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.66 
 
 		 514 aa  274  3e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1246  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.22 
 
 		 522 aa  273  5.000000000000001e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3064  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.22 
 
 		 522 aa  273  7e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000699577 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3399  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.6 
 
 		 526 aa  273  9e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1324  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.22 
 
 		 522 aa  272  1e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0159359 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1290  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35 
 
 		 522 aa  272  2e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2839  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.87 
 
 		 546 aa  268  2e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2241  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  33.03 
 
 		 598 aa  265  1e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.130389  normal  0.394001 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4961  methyl-accepting chemotaxis protein  34.89 
 
 		 527 aa  263  6e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2475  methyl-accepting chemotaxis protein  33.02 
 
 		 598 aa  260  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0390427  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1958  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.12 
 
 		 598 aa  253  6e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.57626  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03575  methyl-accepting chemotaxis protein  31.33 
 
 		 525 aa  253  6e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0561  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.26 
 
 		 505 aa  253  8.000000000000001e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1985  methyl-accepting chemotaxis protein (MCP)  31.64 
 
 		 715 aa  253  1e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1030  methyl-accepting chemotaxis protein  42.94 
 
 		 549 aa  246  9.999999999999999e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0041  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.27 
 
 		 573 aa  244  3.9999999999999997e-63  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1460  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.74 
 
 		 534 aa  236  9e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.695651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0443  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.51 
 
 		 541 aa  226  2e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2845  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.05 
 
 		 549 aa  218  2e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000597879  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0400  methyl-accepting chemotaxis protein  38.57 
 
 		 549 aa  218  2.9999999999999998e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.431065  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2825  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.39 
 
 		 570 aa  215  1.9999999999999998e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000443347 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1152  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.25 
 
 		 484 aa  213  7.999999999999999e-54  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.26629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3311  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.1 
 
 		 547 aa  213  1e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.691655  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3063  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.01 
 
 		 533 aa  212  2e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.378908  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0461  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.05 
 
 		 569 aa  212  2e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0821  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.36 
 
 		 545 aa  211  3e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000877148  hitchhiker  0.00000558474 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3600  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.1 
 
 		 546 aa  211  5e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3709  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  37.8 
 
 		 546 aa  210  8e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0085  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.24 
 
 		 638 aa  209  1e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0647334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1391  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.57 
 
 		 557 aa  209  1e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1884  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.54 
 
 		 547 aa  209  2e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.114501  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3107  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.26 
 
 		 542 aa  208  3e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0099  chemotaxis sensory transducer  36.24 
 
 		 639 aa  208  3e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000152719  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0612  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.72 
 
 		 543 aa  208  3e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0375  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.91 
 
 		 674 aa  208  3e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.129925  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2652  methyl-accepting chemotaxis protein  39.03 
 
 		 392 aa  207  5e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1937  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.26 
 
 		 541 aa  207  7e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.158854  normal  0.960341 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2326  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.12 
 
 		 547 aa  206  1e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0496  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.44 
 
 		 470 aa  205  2e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.453159 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0509  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.44 
 
 		 470 aa  205  2e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.856427  normal  0.10181 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0383  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.81 
 
 		 700 aa  204  3e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.424843  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1098  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.33 
 
 		 637 aa  205  3e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0167241  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0365  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.71 
 
 		 700 aa  204  4e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0784998 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1275  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.91 
 
 		 470 aa  204  4e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.233006 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0750  methyl-accepting chemotaxis protein, putative  36.49 
 
 		 539 aa  204  5e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4404  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.61 
 
 		 638 aa  203  9e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0156105 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2304  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.86 
 
 		 468 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.816033 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1891  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.54 
 
 		 509 aa  202  1.9999999999999998e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.745334  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1033  methyl-accepting chemotaxis protein  40.38 
 
 		 533 aa  202  1.9999999999999998e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1954  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.5 
 
 		 511 aa  201  3e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.249155  normal  0.44726 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0401  methyl-accepting chemotaxis protein, putative  35.58 
 
 		 539 aa  201  5e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.395676  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3345  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.87 
 
 		 542 aa  201  5e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0226154 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1041  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.86 
 
 		 661 aa  200  7e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0525  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  37.22 
 
 		 632 aa  199  1.0000000000000001e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0149  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.22 
 
 		 533 aa  198  2.0000000000000003e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0799  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.36 
 
 		 388 aa  198  3e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3394  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.39 
 
 		 664 aa  198  4.0000000000000005e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000171268  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3312  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.78 
 
 		 533 aa  197  5.000000000000001e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0889  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.53 
 
 		 540 aa  197  7e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3525  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.39 
 
 		 658 aa  197  8.000000000000001e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4795  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.18 
 
 		 638 aa  196  1e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.884167  hitchhiker  0.000462611 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0728  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.82 
 
 		 537 aa  196  1e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2828  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.59 
 
 		 550 aa  196  1e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000014913 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1032  methyl-accepting chemotaxis protein  36.72 
 
 		 645 aa  195  2e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4715  chemotaxis sensory transducer  36.26 
 
 		 713 aa  196  2e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.233277  normal  0.171171 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1554  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.69 
 
 		 495 aa  196  2e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0042  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.01 
 
 		 565 aa  195  2e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.121118  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1357  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.68 
 
 		 392 aa  195  3e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.9116599999999996e-27 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2857  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.44 
 
 		 392 aa  195  3e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0205381  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0157  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.51 
 
 		 646 aa  194  4e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.805637  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3964  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.06 
 
 		 535 aa  194  6e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000408371 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1029  methyl-accepting chemotaxis protein  40.84 
 
 		 549 aa  193  7e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.392996  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2942  methyl-accepting chemotaxis protein  34.71 
 
 		 544 aa  194  7e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0080  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.71 
 
 		 636 aa  193  7e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5279  putative chemotaxis transducer  35.98 
 
 		 712 aa  192  1e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0493383  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61300  putative chemotaxis transducer  35.98 
 
 		 712 aa  192  1e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.862971 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3557  methyl-accepting chemotaxis transducer  36.21 
 
 		 714 aa  192  2e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.386044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0712  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.31 
 
 		 550 aa  192  2e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2217  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.21 
 
 		 714 aa  192  2e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>