More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0467 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0582  methyl-accepting chemotaxis protein  49.5 
 
 		 696 aa  693    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4401  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  66.04 
 
 		 695 aa  951    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.896591  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2939  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.79 
 
 		 696 aa  704    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000015868 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0467  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  100 
 
 		 693 aa  1428    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.285916  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0484  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  94.66 
 
 		 693 aa  1343    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000150879 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0385  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.15 
 
 		 698 aa  585  1e-166  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0817491  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0932  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.4 
 
 		 707 aa  490  1e-137  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.1893  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0935  methyl-accepting chemotaxis protein, putative  40.34 
 
 		 528 aa  381  1e-104  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.220244  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1286  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.25 
 
 		 538 aa  290  6e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3097  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.13 
 
 		 602 aa  284  5.000000000000001e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3261  chemotaxis sensory transducer  34.91 
 
 		 534 aa  279  1e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1958  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.64 
 
 		 598 aa  278  3e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.57626  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1808  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.29 
 
 		 514 aa  277  4e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3480  methyl-accepting chemotaxis protein  31.65 
 
 		 533 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0820031  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3326  chemotaxis sensory transducer  32.2 
 
 		 534 aa  271  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4857  methyl-accepting chemotaxis protein  36 
 
 		 535 aa  264  4e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55750  putative chemotaxis transducer  35.76 
 
 		 538 aa  264  4.999999999999999e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1155  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.21 
 
 		 523 aa  263  6.999999999999999e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3064  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.1 
 
 		 522 aa  261  3e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000699577 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1290  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.94 
 
 		 522 aa  261  4e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2723  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.49 
 
 		 522 aa  260  5.0000000000000005e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.471128  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1324  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.87 
 
 		 522 aa  260  6e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0159359 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4367  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.5 
 
 		 524 aa  260  7e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1246  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.94 
 
 		 522 aa  260  7e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1226  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.58 
 
 		 523 aa  258  2e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1156  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.58 
 
 		 523 aa  258  2e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3399  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.36 
 
 		 526 aa  258  3e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03575  methyl-accepting chemotaxis protein  36.68 
 
 		 525 aa  254  3e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2475  methyl-accepting chemotaxis protein  32.66 
 
 		 598 aa  254  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0390427  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1985  methyl-accepting chemotaxis protein (MCP)  31.23 
 
 		 715 aa  248  3e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3042  methyl-accepting chemotaxis protein  39.19 
 
 		 527 aa  247  4.9999999999999997e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2241  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  31.15 
 
 		 598 aa  247  6e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.130389  normal  0.394001 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0561  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.77 
 
 		 505 aa  239  1e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2839  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.4 
 
 		 546 aa  235  2.0000000000000002e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1030  methyl-accepting chemotaxis protein  38.94 
 
 		 549 aa  233  8.000000000000001e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0041  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.26 
 
 		 573 aa  233  8.000000000000001e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1460  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.06 
 
 		 534 aa  224  3e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.695651  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4961  methyl-accepting chemotaxis protein  35.21 
 
 		 527 aa  220  7e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1275  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.04 
 
 		 470 aa  218  2e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.233006 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2825  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.33 
 
 		 570 aa  216  9e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000443347 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1554  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.54 
 
 		 495 aa  216  9.999999999999999e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0509  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.33 
 
 		 470 aa  214  4.9999999999999996e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.856427  normal  0.10181 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0496  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.07 
 
 		 470 aa  213  7.999999999999999e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.453159 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0821  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.75 
 
 		 545 aa  213  1e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000877148  hitchhiker  0.00000558474 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0400  methyl-accepting chemotaxis protein  39.6 
 
 		 549 aa  212  2e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.431065  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0443  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.74 
 
 		 541 aa  210  7e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3709  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  40.18 
 
 		 546 aa  210  8e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0375  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.23 
 
 		 674 aa  209  1e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.129925  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0099  chemotaxis sensory transducer  35.63 
 
 		 639 aa  208  3e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000152719  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2845  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.47 
 
 		 549 aa  208  3e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000597879  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6912  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.9 
 
 		 475 aa  207  4e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.18628  normal  0.2896 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0365  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.97 
 
 		 700 aa  207  4e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0784998 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1152  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.75 
 
 		 484 aa  207  6e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.26629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1391  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.97 
 
 		 557 aa  207  7e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3600  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.16 
 
 		 546 aa  206  1e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0149  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.43 
 
 		 533 aa  206  1e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3311  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.15 
 
 		 547 aa  205  2e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.691655  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0750  methyl-accepting chemotaxis protein, putative  36.54 
 
 		 539 aa  205  3e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1937  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.56 
 
 		 541 aa  204  6e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.158854  normal  0.960341 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0612  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.12 
 
 		 543 aa  203  9e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3345  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.11 
 
 		 542 aa  202  9.999999999999999e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0226154 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3525  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.51 
 
 		 658 aa  203  9.999999999999999e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1033  methyl-accepting chemotaxis protein  40.06 
 
 		 533 aa  202  1.9999999999999998e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3063  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.78 
 
 		 533 aa  202  1.9999999999999998e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.378908  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3107  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.35 
 
 		 542 aa  201  3.9999999999999996e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3465  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.54 
 
 		 423 aa  201  5e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4404  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.41 
 
 		 638 aa  200  7.999999999999999e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0156105 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0461  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.65 
 
 		 569 aa  200  9e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0969  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.25 
 
 		 631 aa  199  1.0000000000000001e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0383  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.44 
 
 		 700 aa  199  2.0000000000000003e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.424843  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2304  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.53 
 
 		 468 aa  198  3e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.816033 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0085  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.87 
 
 		 638 aa  198  3e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0647334  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1884  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.99 
 
 		 547 aa  198  3e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.114501  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1041  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.63 
 
 		 661 aa  197  5.000000000000001e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1891  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.74 
 
 		 509 aa  197  8.000000000000001e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.745334  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0525  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  37.98 
 
 		 632 aa  196  1e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1954  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.58 
 
 		 511 aa  196  1e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.249155  normal  0.44726 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0535  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.75 
 
 		 487 aa  195  2e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1623  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.96 
 
 		 454 aa  194  4e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00717627 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2890  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.33 
 
 		 549 aa  194  4e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.824592  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0009  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.58 
 
 		 511 aa  194  4e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3805  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.05 
 
 		 422 aa  194  4e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000721713  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0080  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.86 
 
 		 636 aa  193  7e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3082  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.4 
 
 		 448 aa  193  9e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.802467  normal  0.530433 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2326  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.99 
 
 		 547 aa  192  1e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4715  chemotaxis sensory transducer  36.83 
 
 		 713 aa  193  1e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.233277  normal  0.171171 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4795  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.24 
 
 		 638 aa  192  1e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.884167  hitchhiker  0.000462611 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3750  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.41 
 
 		 638 aa  192  2e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.666265  normal  0.186245 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61300  putative chemotaxis transducer  36.18 
 
 		 712 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.862971 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0272  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.41 
 
 		 638 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00090491  hitchhiker  0.000000349734 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3312  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.29 
 
 		 533 aa  191  4e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0271  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.41 
 
 		 638 aa  191  5e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.758035  hitchhiker  0.0000678809 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5279  putative chemotaxis transducer  36.18 
 
 		 712 aa  190  7e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0493383  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5149  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.5 
 
 		 468 aa  189  1e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.853292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1714  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.39 
 
 		 673 aa  190  1e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.712235  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3236  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.5 
 
 		 476 aa  189  1e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.315544  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5132  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.5 
 
 		 468 aa  189  1e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.202601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2828  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.67 
 
 		 550 aa  189  2e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000014913 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0476  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.04 
 
 		 830 aa  189  2e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0959  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.81 
 
 		 543 aa  188  2e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.656726  normal  0.666936 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>