More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2177 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_2177  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  100 
 
 		 628 aa  1249    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1624  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.94 
 
 		 626 aa  270  7e-71  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.835429  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2870  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.18 
 
 		 636 aa  264  3e-69  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1041  methyl-accepting chemotaxis protein  46.63 
 
 		 541 aa  249  1e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.893443  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2782  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.73 
 
 		 601 aa  243  6e-63  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.163256  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2942  methyl-accepting chemotaxis protein  45.68 
 
 		 544 aa  241  2.9999999999999997e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1030  methyl-accepting chemotaxis protein  45.98 
 
 		 549 aa  239  1e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0529  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.06 
 
 		 544 aa  237  6e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3964  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.34 
 
 		 535 aa  236  8e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000408371 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0612  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.38 
 
 		 543 aa  236  1.0000000000000001e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3876  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.03 
 
 		 535 aa  236  1.0000000000000001e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.74566  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1033  methyl-accepting chemotaxis protein  44.24 
 
 		 533 aa  230  5e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2776  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.3 
 
 		 544 aa  229  8e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.839191  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2828  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.02 
 
 		 550 aa  229  9e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000014913 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2652  methyl-accepting chemotaxis protein  41.96 
 
 		 392 aa  229  2e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2326  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.25 
 
 		 547 aa  227  4e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0960  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.99 
 
 		 666 aa  225  2e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000181378  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0476  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.59 
 
 		 830 aa  224  2e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0809  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.34 
 
 		 532 aa  222  9.999999999999999e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.826751  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1391  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.04 
 
 		 557 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3063  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.41 
 
 		 533 aa  222  1.9999999999999999e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.378908  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1884  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.67 
 
 		 547 aa  221  3e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.114501  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2845  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.03 
 
 		 549 aa  221  3.9999999999999997e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000597879  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0525  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  40.38 
 
 		 632 aa  220  5e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0343  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.01 
 
 		 1079 aa  220  6e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3147  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.01 
 
 		 540 aa  219  1e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0302394  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0142  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.85 
 
 		 540 aa  219  1e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0808523  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1041  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.12 
 
 		 661 aa  218  2.9999999999999998e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1286  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.29 
 
 		 538 aa  216  9.999999999999999e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1032  methyl-accepting chemotaxis protein  43.2 
 
 		 645 aa  215  1.9999999999999998e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2890  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.48 
 
 		 549 aa  215  1.9999999999999998e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.824592  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0799  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.77 
 
 		 388 aa  215  1.9999999999999998e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0821  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.59 
 
 		 545 aa  215  1.9999999999999998e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000877148  hitchhiker  0.00000558474 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1029  methyl-accepting chemotaxis protein  44.95 
 
 		 549 aa  214  2.9999999999999995e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.392996  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2857  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.93 
 
 		 392 aa  214  3.9999999999999995e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0205381  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1221  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.16 
 
 		 544 aa  213  5.999999999999999e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000143655  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3345  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.12 
 
 		 542 aa  213  5.999999999999999e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0226154 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2825  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.99 
 
 		 570 aa  213  7e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000443347 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30820  putative methyl-accepting chemotaxis transducer  41.08 
 
 		 535 aa  213  7e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0142633  hitchhiker  0.0000000000042709 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3107  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.68 
 
 		 542 aa  213  1e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0042  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.3 
 
 		 565 aa  212  2e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.121118  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0712  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.17 
 
 		 550 aa  211  2e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3311  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.77 
 
 		 547 aa  212  2e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.691655  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3453  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.81 
 
 		 532 aa  212  2e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0235494 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3719  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.59 
 
 		 540 aa  211  3e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1357  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.96 
 
 		 392 aa  210  5e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.9116599999999996e-27 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3058  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.16 
 
 		 518 aa  210  7e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0750  methyl-accepting chemotaxis protein, putative  41.64 
 
 		 539 aa  209  9e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0400  methyl-accepting chemotaxis protein  44.59 
 
 		 549 aa  209  1e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.431065  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1374  methyl-accepting chemotaxis protein  43.95 
 
 		 541 aa  208  2e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3611  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.8 
 
 		 540 aa  209  2e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3465  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.45 
 
 		 423 aa  208  3e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3293  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.77 
 
 		 720 aa  207  5e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.601  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0798  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.55 
 
 		 541 aa  206  1e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0461  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.31 
 
 		 569 aa  205  2e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0756  methyl-accepting chemotaxis protein  40.98 
 
 		 549 aa  203  7e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0365  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.48 
 
 		 700 aa  203  7e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0784998 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3045  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.03 
 
 		 563 aa  202  9.999999999999999e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000317109  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0889  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.81 
 
 		 540 aa  202  9.999999999999999e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3491  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  38.34 
 
 		 626 aa  202  1.9999999999999998e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0383  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.77 
 
 		 700 aa  202  1.9999999999999998e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.424843  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0935  methyl-accepting chemotaxis protein, putative  41.8 
 
 		 528 aa  201  3e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.220244  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3745  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.53 
 
 		 852 aa  201  3e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1021  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.03 
 
 		 518 aa  200  5e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0375  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.79 
 
 		 674 aa  200  5e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.129925  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0401  methyl-accepting chemotaxis protein, putative  39.58 
 
 		 539 aa  200  6e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.395676  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3312  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.55 
 
 		 533 aa  200  6e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0149  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.84 
 
 		 533 aa  198  2.0000000000000003e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0358  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35 
 
 		 560 aa  198  2.0000000000000003e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0237962  normal  0.734928 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3112  chemotaxis sensory transducer  40.44 
 
 		 541 aa  198  3e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0771  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.58 
 
 		 822 aa  198  3e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1714  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.98 
 
 		 673 aa  197  4.0000000000000005e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.712235  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2961  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.18 
 
 		 542 aa  197  6e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1988  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.7 
 
 		 674 aa  196  1e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.588025  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3600  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.87 
 
 		 546 aa  195  2e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1891  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.48 
 
 		 509 aa  194  5e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.745334  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0724  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.82 
 
 		 539 aa  192  1e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2778  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with GAF sensor  35.57 
 
 		 1153 aa  192  1e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.970502 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0039  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.19 
 
 		 515 aa  192  1e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0381098 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3339  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with GAF sensor  35.57 
 
 		 1153 aa  192  1e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0040  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.19 
 
 		 515 aa  192  1e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3805  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.24 
 
 		 422 aa  192  2e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000721713  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2644  chemotaxis transducer  46.43 
 
 		 280 aa  192  2e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.120039  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1426  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.17 
 
 		 768 aa  192  2e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.541717  normal  0.185322 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0506  chemotaxis sensory transducer  34.01 
 
 		 982 aa  191  2.9999999999999997e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.202983  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3709  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  39.87 
 
 		 546 aa  191  2.9999999999999997e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3139  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.04 
 
 		 640 aa  191  5e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.753261  normal  0.0120166 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0905  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  38.27 
 
 		 640 aa  190  5.999999999999999e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.746842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3669  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.94 
 
 		 716 aa  190  5.999999999999999e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.170337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2793  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.89 
 
 		 778 aa  189  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0117  methyl-accepting chemotaxis protein  36.97 
 
 		 658 aa  189  2e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3394  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.45 
 
 		 664 aa  188  2e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000171268  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3073  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.05 
 
 		 677 aa  188  3e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3492  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  36.67 
 
 		 626 aa  188  3e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5305  chemotaxis sensory transducer  34.77 
 
 		 686 aa  187  3e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.115158  normal  0.281343 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0167  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.33 
 
 		 540 aa  187  4e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2492  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.96 
 
 		 572 aa  187  7e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2579  methyl-accepting chemotaxis protein  38.91 
 
 		 543 aa  186  8e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1035  methyl-accepting chemotaxis protein  41.18 
 
 		 549 aa  186  1.0000000000000001e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.640997  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0071  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  36.67 
 
 		 658 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>