More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_2644 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_2644  chemotaxis transducer  100 
 
 
280 aa  534  1e-151  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.120039  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30820  putative methyl-accepting chemotaxis transducer  94.64 
 
 
535 aa  511  1e-144  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0142633  hitchhiker  0.0000000000042709 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2100  chemotaxis sensory transducer  47.5 
 
 
537 aa  222  6e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.517374  normal  0.435335 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2240  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  45 
 
 
537 aa  219  3e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.942924 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2728  chemotaxis sensory transducer  48.39 
 
 
544 aa  208  9e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00837045  normal  0.306222 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2188  histidine kinase  43.57 
 
 
540 aa  202  6e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.035953  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2933  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  49.37 
 
 
540 aa  201  9.999999999999999e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  1.3489100000000001e-18  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2834  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  47.27 
 
 
671 aa  192  4e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.188903  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2177  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.43 
 
 
628 aa  192  5e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1988  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.82 
 
 
674 aa  187  1e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.588025  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0686  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.94 
 
 
551 aa  177  2e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1041  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.44 
 
 
661 aa  172  5e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0808  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.42 
 
 
541 aa  172  5.999999999999999e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3112  chemotaxis sensory transducer  39.78 
 
 
541 aa  171  9e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0724  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40 
 
 
539 aa  168  1e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2782  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.78 
 
 
601 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.163256  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2870  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.59 
 
 
636 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1624  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.59 
 
 
626 aa  166  5e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.835429  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1033  methyl-accepting chemotaxis protein  38.93 
 
 
533 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3611  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.86 
 
 
540 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0837  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  44.26 
 
 
680 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0272085 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2283  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.01 
 
 
1475 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3719  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.49 
 
 
540 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2819  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.01 
 
 
1474 aa  163  3e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02691  hypothetical protein  38.97 
 
 
535 aa  162  4.0000000000000004e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3107  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.93 
 
 
542 aa  160  2e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0612  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.21 
 
 
543 aa  160  3e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0117  methyl-accepting chemotaxis protein  37.99 
 
 
658 aa  159  4e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3876  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.93 
 
 
535 aa  159  4e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.74566  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1714  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.49 
 
 
673 aa  159  6e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.712235  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2776  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.31 
 
 
544 aa  159  7e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.839191  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5515  chemotaxis sensory transducer  38.71 
 
 
658 aa  159  7e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.501051  normal  0.584272 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2942  methyl-accepting chemotaxis protein  40.48 
 
 
544 aa  158  1e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0476  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.68 
 
 
830 aa  158  1e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0128  chemotaxis sensory transducer  38.96 
 
 
537 aa  158  1e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1391  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.38 
 
 
557 aa  157  1e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0821  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.15 
 
 
545 aa  158  1e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000877148  hitchhiker  0.00000558474 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2828  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.96 
 
 
550 aa  157  1e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000014913 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3964  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.93 
 
 
535 aa  157  1e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000408371 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0798  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.81 
 
 
541 aa  157  2e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01605  pilus biogenesis protein  35.71 
 
 
678 aa  157  2e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.128934  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0210  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.97 
 
 
632 aa  156  3e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.248487  normal  0.150257 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0071  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  37.63 
 
 
658 aa  156  3e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0750  methyl-accepting chemotaxis protein, putative  37.04 
 
 
539 aa  156  4e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3147  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.54 
 
 
540 aa  156  4e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0302394  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1221  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.62 
 
 
564 aa  155  6e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000139892  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2326  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.26 
 
 
547 aa  155  6e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3705  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.75 
 
 
541 aa  154  1e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0963791  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1030  methyl-accepting chemotaxis protein  39.69 
 
 
549 aa  154  2e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1041  methyl-accepting chemotaxis protein  39.76 
 
 
541 aa  154  2e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.893443  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0529  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.62 
 
 
544 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0563  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.36 
 
 
745 aa  153  4e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0615  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.36 
 
 
745 aa  153  4e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.685399  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2156  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.08 
 
 
575 aa  152  5e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0142  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.79 
 
 
540 aa  152  5e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0808523  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1884  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.15 
 
 
547 aa  152  5e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.114501  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0149  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.75 
 
 
533 aa  152  5e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3311  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.5 
 
 
547 aa  152  5.9999999999999996e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.691655  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0400  methyl-accepting chemotaxis protein  39.02 
 
 
549 aa  151  1e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.431065  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1029  methyl-accepting chemotaxis protein  40.15 
 
 
549 aa  150  2e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.392996  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3058  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.22 
 
 
518 aa  150  2e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1774  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.11 
 
 
671 aa  150  2e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0042  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.89 
 
 
565 aa  150  3e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.121118  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0671  putative twitching motility transmembrane protein  36.17 
 
 
743 aa  149  4e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.357708  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0365  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.46 
 
 
700 aa  149  4e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0784998 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0674  PAS  38.71 
 
 
544 aa  149  4e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3139  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.49 
 
 
640 aa  149  5e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.753261  normal  0.0120166 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1363  PAS  41.1 
 
 
544 aa  149  5e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000284571 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1021  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.41 
 
 
518 aa  149  6e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3582  methyl-accepting chemotaxis protein  37.55 
 
 
541 aa  149  7e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0525  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  36.79 
 
 
632 aa  149  7e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1221  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.24 
 
 
544 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000143655  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2652  methyl-accepting chemotaxis protein  35.71 
 
 
392 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0383  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.16 
 
 
700 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.424843  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0358  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.5 
 
 
560 aa  147  1.0000000000000001e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0237962  normal  0.734928 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0475  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.57 
 
 
686 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.178091  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1324  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  36.3 
 
 
523 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.587106  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0406  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.21 
 
 
678 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0511  twitching motility protein PilJ  34.75 
 
 
682 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05360  twitching motility protein PilJ  34.75 
 
 
682 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0935  methyl-accepting chemotaxis protein, putative  40.16 
 
 
528 aa  147  3e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.220244  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0157  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.2 
 
 
646 aa  146  3e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.805637  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4343  chemotaxis sensory transducer, Pas/Pac sensor  47.65 
 
 
439 aa  147  3e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0672  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.76 
 
 
733 aa  146  3e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.371682  normal  0.522662 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1374  methyl-accepting chemotaxis protein  39.48 
 
 
541 aa  146  4.0000000000000006e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3063  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.02 
 
 
533 aa  146  4.0000000000000006e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.378908  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1833  chemotaxis sensory transducer, Pas/Pac sensor  37.66 
 
 
521 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.884809  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26280  putative chemotaxis transducer  39.76 
 
 
545 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.917899 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2998  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.99 
 
 
549 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1098  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.65 
 
 
637 aa  146  4.0000000000000006e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0167241  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2825  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.31 
 
 
570 aa  145  5e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000443347 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1015  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.12 
 
 
839 aa  146  5e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0741142  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2845  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.84 
 
 
549 aa  145  5e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000597879  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2901  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.14 
 
 
700 aa  145  6e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.726182  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2966  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  39.22 
 
 
642 aa  145  6e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.249585  normal  0.113943 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1674  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.36 
 
 
543 aa  145  8.000000000000001e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2492  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.4 
 
 
572 aa  145  9e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3644  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.88 
 
 
378 aa  145  9e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0500  methyl-accepting chemotaxis protein  37.55 
 
 
543 aa  144  1e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0375  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.98 
 
 
674 aa  144  1e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.129925  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>