More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_2240 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007005  Psyr_2240  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  100 
 
 
537 aa  1062    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.942924 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2100  chemotaxis sensory transducer  75.98 
 
 
537 aa  781    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.517374  normal  0.435335 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30820  putative methyl-accepting chemotaxis transducer  42.27 
 
 
535 aa  383  1e-105  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0142633  hitchhiker  0.0000000000042709 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2728  chemotaxis sensory transducer  43.47 
 
 
544 aa  229  1e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00837045  normal  0.306222 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2644  chemotaxis transducer  45 
 
 
280 aa  219  7e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.120039  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3147  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.22 
 
 
540 aa  213  7e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0302394  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3107  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.1 
 
 
542 aa  207  4e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1391  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.46 
 
 
557 aa  206  6e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2188  histidine kinase  38.52 
 
 
540 aa  203  5e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.035953  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3611  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.3 
 
 
540 aa  203  6e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3719  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.3 
 
 
540 aa  201  3e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0529  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.05 
 
 
544 aa  199  9e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2326  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.67 
 
 
547 aa  198  2.0000000000000003e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0889  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.21 
 
 
540 aa  196  6e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0686  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.04 
 
 
551 aa  196  1e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1374  methyl-accepting chemotaxis protein  32.75 
 
 
541 aa  195  2e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2942  methyl-accepting chemotaxis protein  33.41 
 
 
544 aa  194  5e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1988  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42 
 
 
674 aa  191  2e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.588025  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0712  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.53 
 
 
624 aa  190  5.999999999999999e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1884  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.15 
 
 
547 aa  189  1e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.114501  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2825  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.31 
 
 
570 aa  189  1e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000443347 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3311  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.77 
 
 
547 aa  188  2e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.691655  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0724  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.21 
 
 
539 aa  188  2e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0821  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.33 
 
 
545 aa  186  6e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000877148  hitchhiker  0.00000558474 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1098  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.61 
 
 
637 aa  186  8e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0167241  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1124  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.31 
 
 
547 aa  186  9e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00163985  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2782  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.24 
 
 
601 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.163256  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0157  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.18 
 
 
646 aa  186  1.0000000000000001e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.805637  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3582  methyl-accepting chemotaxis protein  35.59 
 
 
541 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0476  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.8 
 
 
830 aa  186  1.0000000000000001e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1357  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.08 
 
 
392 aa  185  2.0000000000000003e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.9116599999999996e-27 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2579  methyl-accepting chemotaxis protein  34.44 
 
 
543 aa  185  2.0000000000000003e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2652  methyl-accepting chemotaxis protein  36.47 
 
 
392 aa  185  2.0000000000000003e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0674  PAS  40.64 
 
 
544 aa  185  2.0000000000000003e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1030  methyl-accepting chemotaxis protein  36.75 
 
 
549 aa  184  3e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2834  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  38.9 
 
 
671 aa  184  3e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.188903  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1674  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.69 
 
 
543 aa  184  4.0000000000000006e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2857  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.8 
 
 
392 aa  183  6e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0205381  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2907  chemotaxis sensory transducer  31.52 
 
 
541 aa  182  1e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.300582 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0712  chemotaxis sensory transducer  35.82 
 
 
541 aa  182  1e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000566108  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2845  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.64 
 
 
549 aa  181  2e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000597879  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0876  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35 
 
 
674 aa  180  4.999999999999999e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1672  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.39 
 
 
544 aa  180  7e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0798  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.96 
 
 
541 aa  180  7e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0612  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.55 
 
 
543 aa  180  7e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2177  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.07 
 
 
628 aa  179  8e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0808  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.4 
 
 
541 aa  179  1e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3322  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.33 
 
 
539 aa  179  1e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.910778 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0461  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.28 
 
 
569 aa  178  2e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2776  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.97 
 
 
544 aa  178  2e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.839191  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1041  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.09 
 
 
661 aa  178  3e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1221  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.95 
 
 
544 aa  177  3e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000143655  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1363  PAS  40.74 
 
 
544 aa  178  3e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000284571 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3424  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.28 
 
 
674 aa  177  3e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.560716  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3173  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.39 
 
 
541 aa  177  4e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0131988  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0117  methyl-accepting chemotaxis protein  36.21 
 
 
658 aa  177  5e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3705  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.24 
 
 
541 aa  177  6e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0963791  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1020  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.91 
 
 
541 aa  177  6e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00762848  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0071  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  36.57 
 
 
658 aa  176  7e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1029  methyl-accepting chemotaxis protein  28.52 
 
 
549 aa  176  8e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.392996  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0466  methyl-accepting chemotaxis protein  33.42 
 
 
541 aa  176  8e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3076  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.33 
 
 
541 aa  176  8e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000214454  normal  0.805143 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2995  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.33 
 
 
541 aa  176  8e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00226615  normal  0.196783 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1701  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.77 
 
 
650 aa  176  9e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.076135 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5361  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.62 
 
 
508 aa  176  9.999999999999999e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0142  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.97 
 
 
540 aa  176  9.999999999999999e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0808523  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0897  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.57 
 
 
541 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3114  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  33.59 
 
 
541 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.860602  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2607  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.25 
 
 
541 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00122932  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0447  chemotaxis sensory transducer  33.01 
 
 
541 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3045  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.34 
 
 
563 aa  175  1.9999999999999998e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000317109  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2354  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.64 
 
 
554 aa  175  1.9999999999999998e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.547249  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2961  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.41 
 
 
542 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0931  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.07 
 
 
541 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.476721 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1630  chemotaxis sensory transducer  30.56 
 
 
541 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0250136 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1324  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  34.94 
 
 
523 aa  174  2.9999999999999996e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.587106  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0712  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.09 
 
 
550 aa  174  3.9999999999999995e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3441  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.36 
 
 
541 aa  174  5e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0921  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.77 
 
 
541 aa  174  5e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5515  chemotaxis sensory transducer  36.11 
 
 
658 aa  174  5e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.501051  normal  0.584272 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1371  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  36.98 
 
 
544 aa  173  6.999999999999999e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.116754  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2933  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  34.73 
 
 
540 aa  173  6.999999999999999e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  1.3489100000000001e-18  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4833  chemotaxis sensory transducer  35.24 
 
 
541 aa  173  6.999999999999999e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000956827  normal  0.082646 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2954  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.88 
 
 
620 aa  173  7.999999999999999e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000679912  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1516  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.78 
 
 
660 aa  172  1e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1041  methyl-accepting chemotaxis protein  36.39 
 
 
541 aa  172  1e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.893443  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3580  methyl-accepting chemotaxis protein  32.13 
 
 
546 aa  172  1e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2507  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.95 
 
 
589 aa  172  1e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.197123  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1221  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.82 
 
 
564 aa  172  1e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000139892  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3274  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.05 
 
 
541 aa  172  1e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0175031  normal  0.083895 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1084  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.87 
 
 
541 aa  172  2e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000100295  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0109  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.04 
 
 
528 aa  171  4e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.268294  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3351  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  31.7 
 
 
570 aa  171  4e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0540062  normal  0.0241334 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4706  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  35.22 
 
 
541 aa  171  4e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0586  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.08 
 
 
584 aa  170  5e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3465  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.15 
 
 
423 aa  170  5e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0042  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.17 
 
 
565 aa  170  6e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.121118  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03417  methyl-accepting chemotaxis protein  34.23 
 
 
674 aa  170  6e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.617562  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1033  methyl-accepting chemotaxis protein  40.86 
 
 
533 aa  170  7e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1015  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.87 
 
 
541 aa  170  7e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000434326  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>