More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_5515 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_0117  methyl-accepting chemotaxis protein  79.33 
 
 		 658 aa  1064    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0210  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  73.56 
 
 		 632 aa  946    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.248487  normal  0.150257 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0071  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  78.27 
 
 		 658 aa  1048    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5515  chemotaxis sensory transducer  100 
 
 		 658 aa  1320    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.501051  normal  0.584272 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1385  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.01 
 
 		 683 aa  298  3e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2345  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.7 
 
 		 666 aa  293  6e-78  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.60686 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2990  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.89 
 
 		 667 aa  291  3e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.413203  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2976  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.64 
 
 		 667 aa  291  4e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000241408  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1387  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.74 
 
 		 667 aa  290  5.0000000000000004e-77  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3134  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.89 
 
 		 667 aa  290  7e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0135223  normal  0.80442 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1293  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.92 
 
 		 667 aa  287  5e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1243  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.92 
 
 		 667 aa  286  9e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1313  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.92 
 
 		 667 aa  285  2.0000000000000002e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00146838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1568  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.19 
 
 		 667 aa  283  7.000000000000001e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3114  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.67 
 
 		 667 aa  280  7e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1146  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.87 
 
 		 668 aa  278  2e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.970933  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0366  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.59 
 
 		 643 aa  273  6e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0151066 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2637  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.91 
 
 		 667 aa  273  9e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0295827  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0772  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.72 
 
 		 646 aa  271  2e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00540264  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1322  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.12 
 
 		 667 aa  268  2.9999999999999995e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1310  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.35 
 
 		 667 aa  265  1e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002906  methyl-accepting chemotaxis protein  30.34 
 
 		 678 aa  265  3e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.816112  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3437  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.59 
 
 		 646 aa  263  8.999999999999999e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.143807  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3282  methyl-accepting chemotaxis protein  29.29 
 
 		 667 aa  263  1e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3594  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.88 
 
 		 646 aa  262  2e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6894  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.73 
 
 		 657 aa  259  9e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.068141  normal  0.373533 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4309  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.16 
 
 		 659 aa  259  1e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.226298 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0792  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.19 
 
 		 651 aa  258  2e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0045  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.46 
 
 		 651 aa  255  2.0000000000000002e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3136  putative methyl-accepting chemotaxis transmembrane protein  32.85 
 
 		 661 aa  254  3e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.598743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2939  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.15 
 
 		 672 aa  254  4.0000000000000004e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0033  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.27 
 
 		 651 aa  251  2e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.250878  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4315  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.27 
 
 		 656 aa  251  3e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0030  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.47 
 
 		 651 aa  250  7e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0631  chemotaxis sensory transducer  31.75 
 
 		 656 aa  248  2e-64  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00821954  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4192  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.53 
 
 		 660 aa  247  4e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0520721  normal  0.510764 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3714  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.38 
 
 		 660 aa  244  3e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3221  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.9 
 
 		 660 aa  244  3.9999999999999997e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.229974 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4070  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.16 
 
 		 660 aa  243  7.999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4296  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.16 
 
 		 660 aa  243  7.999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0994  methyl-accepting chemotaxis protein  31.87 
 
 		 678 aa  237  7e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.799426  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1684  methyl-accepting chemotaxis protein I  31.64 
 
 		 676 aa  236  1.0000000000000001e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2308  methyl-accepting chemotaxis protein II  31.72 
 
 		 684 aa  234  3e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1080  methyl-accepting chemotaxis protein  31.4 
 
 		 687 aa  234  4.0000000000000004e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.469209  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3084  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.74 
 
 		 719 aa  231  3e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3481  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.76 
 
 		 674 aa  227  4e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4123  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.06 
 
 		 674 aa  226  1e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.162807  normal  0.87643 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4184  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.41 
 
 		 680 aa  226  1e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.12793  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01222  methyl-accepting chemotaxis protein  31.89 
 
 		 580 aa  225  2e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.566871  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0837  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  29.97 
 
 		 680 aa  223  9e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0272085 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0026  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.83 
 
 		 686 aa  221  3e-56  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0140  putative methyl-accepting chemotaxis protein  31.5 
 
 		 684 aa  215  2.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0610174  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0921  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.76 
 
 		 677 aa  214  4.9999999999999996e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.787316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30820  putative methyl-accepting chemotaxis transducer  38.9 
 
 		 535 aa  207  4e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0142633  hitchhiker  0.0000000000042709 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2825  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.36 
 
 		 570 aa  207  7e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000443347 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3345  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.06 
 
 		 542 aa  203  7e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0226154 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1039  protease htpx  29.05 
 
 		 656 aa  203  9e-51  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0758551  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0525  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  33.78 
 
 		 632 aa  201  5e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3719  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.47 
 
 		 540 aa  200  7e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2942  methyl-accepting chemotaxis protein  38.89 
 
 		 544 aa  199  1.0000000000000001e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1030  methyl-accepting chemotaxis protein  37.24 
 
 		 549 aa  198  3e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2961  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.94 
 
 		 542 aa  198  3e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0882  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.13 
 
 		 630 aa  198  3e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3611  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.59 
 
 		 540 aa  197  4.0000000000000005e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0375  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.15 
 
 		 674 aa  197  4.0000000000000005e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.129925  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3603  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.84 
 
 		 630 aa  196  9e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.840663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3405  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  35.84 
 
 		 630 aa  196  1e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3480  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.84 
 
 		 630 aa  196  1e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3147  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.83 
 
 		 540 aa  194  5e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0302394  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1056  methyl-accepting chemotaxis protein  36.02 
 
 		 630 aa  193  9e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1988  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.6 
 
 		 674 aa  192  1e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.588025  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1383  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.9 
 
 		 636 aa  192  2e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00353653  normal  0.775857 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0895  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.68 
 
 		 630 aa  192  2e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.174985 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1221  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.21 
 
 		 544 aa  192  2e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000143655  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0969  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.16 
 
 		 631 aa  191  5e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3964  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.08 
 
 		 535 aa  190  5.999999999999999e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000408371 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3042  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.18 
 
 		 630 aa  190  7e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.397129 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0443  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.41 
 
 		 541 aa  190  9e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1032  methyl-accepting chemotaxis protein  38.03 
 
 		 645 aa  189  1e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1033  methyl-accepting chemotaxis protein  38.95 
 
 		 533 aa  189  2e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0507  methyl-accepting chemotaxis protein  29.92 
 
 		 630 aa  189  2e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0930  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.93 
 
 		 630 aa  189  2e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.257402 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3876  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.13 
 
 		 535 aa  188  3e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.74566  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0400  methyl-accepting chemotaxis protein  37.86 
 
 		 549 aa  187  5e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.431065  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2471  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.74 
 
 		 425 aa  187  8e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.817651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2650  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.97 
 
 		 568 aa  186  8e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3017  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.22 
 
 		 630 aa  186  9e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3311  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.97 
 
 		 547 aa  186  9e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.691655  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001273  methyl-accepting chemotaxis protein  31.49 
 
 		 638 aa  186  1.0000000000000001e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0106  methyl-accepting chemotaxis protein  35.44 
 
 		 546 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.827543  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1714  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.26 
 
 		 673 aa  186  2.0000000000000003e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.712235  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0935  methyl-accepting chemotaxis protein, putative  37.08 
 
 		 528 aa  185  2.0000000000000003e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.220244  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1041  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.69 
 
 		 661 aa  185  2.0000000000000003e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3063  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.41 
 
 		 533 aa  185  3e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.378908  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0461  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.39 
 
 		 569 aa  185  3e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2782  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.08 
 
 		 601 aa  184  4.0000000000000006e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.163256  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3114  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  33.16 
 
 		 541 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.860602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1286  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.19 
 
 		 538 aa  184  4.0000000000000006e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3279  methyl-accepting chemotaxis protein  34.18 
 
 		 541 aa  184  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.149652  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0142  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.83 
 
 		 540 aa  184  6e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0808523  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>