More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_3114 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_3114  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  100 
 
 		 667 aa  1355    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3282  methyl-accepting chemotaxis protein  65.52 
 
 		 667 aa  860    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1568  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  80.51 
 
 		 667 aa  1078    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3134  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  66.12 
 
 		 667 aa  906    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0135223  normal  0.80442 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2976  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  65.67 
 
 		 667 aa  901    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000241408  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2345  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  57.21 
 
 		 666 aa  752    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.60686 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1387  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  66.12 
 
 		 667 aa  905    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2990  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  66.12 
 
 		 667 aa  906    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.413203  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1243  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  66.12 
 
 		 667 aa  879    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1310  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  73.31 
 
 		 667 aa  966    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1313  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  66.12 
 
 		 667 aa  877    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00146838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1322  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  68.37 
 
 		 667 aa  921    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1146  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  56.84 
 
 		 668 aa  764    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.970933  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2637  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  63.57 
 
 		 667 aa  872    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0295827  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1293  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  65.97 
 
 		 667 aa  874    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1385  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.28 
 
 		 683 aa  365  1e-99  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002906  methyl-accepting chemotaxis protein  32.79 
 
 		 678 aa  346  7e-94  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.816112  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5515  chemotaxis sensory transducer  30.84 
 
 		 658 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.501051  normal  0.584272 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0117  methyl-accepting chemotaxis protein  30.19 
 
 		 658 aa  280  5e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0071  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  30.19 
 
 		 658 aa  279  9e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0210  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.92 
 
 		 632 aa  276  8e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.248487  normal  0.150257 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0792  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.57 
 
 		 651 aa  263  4.999999999999999e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0772  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.52 
 
 		 646 aa  258  2e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00540264  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3594  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.22 
 
 		 646 aa  255  2.0000000000000002e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0631  chemotaxis sensory transducer  33.39 
 
 		 656 aa  255  2.0000000000000002e-66  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00821954  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3437  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.07 
 
 		 646 aa  254  4.0000000000000004e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.143807  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6894  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.95 
 
 		 657 aa  251  4e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.068141  normal  0.373533 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3066  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.71 
 
 		 662 aa  249  1e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2939  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.08 
 
 		 672 aa  247  4e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3412  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.71 
 
 		 662 aa  247  4.9999999999999997e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4309  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.92 
 
 		 659 aa  247  6e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.226298 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4192  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.38 
 
 		 660 aa  241  2e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0520721  normal  0.510764 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3714  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.54 
 
 		 660 aa  242  2e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3221  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.5 
 
 		 660 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.229974 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4070  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.5 
 
 		 660 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4296  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.5 
 
 		 660 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3136  putative methyl-accepting chemotaxis transmembrane protein  29.5 
 
 		 661 aa  241  4e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.598743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0922  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.24 
 
 		 674 aa  238  2e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0030  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.18 
 
 		 651 aa  236  1.0000000000000001e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4315  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.75 
 
 		 656 aa  233  7.000000000000001e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0045  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.33 
 
 		 651 aa  231  5e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0033  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.71 
 
 		 651 aa  230  6e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.250878  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0994  methyl-accepting chemotaxis protein  29.98 
 
 		 678 aa  228  3e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.799426  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2308  methyl-accepting chemotaxis protein II  29.67 
 
 		 684 aa  225  2e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1080  methyl-accepting chemotaxis protein  29.74 
 
 		 687 aa  225  2e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.469209  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0366  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.79 
 
 		 643 aa  224  4.9999999999999996e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0151066 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4184  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.76 
 
 		 680 aa  223  9e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.12793  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1684  methyl-accepting chemotaxis protein I  29.26 
 
 		 676 aa  219  1e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01222  methyl-accepting chemotaxis protein  30.91 
 
 		 580 aa  219  2e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.566871  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0921  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.27 
 
 		 677 aa  218  2e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.787316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1039  protease htpx  29.04 
 
 		 656 aa  216  9e-55  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0758551  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3084  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.75 
 
 		 719 aa  215  1.9999999999999998e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0837  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  28.15 
 
 		 680 aa  215  2.9999999999999995e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0272085 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3481  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.46 
 
 		 674 aa  212  2e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4123  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.12 
 
 		 674 aa  210  6e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.162807  normal  0.87643 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0140  putative methyl-accepting chemotaxis protein  29.2 
 
 		 684 aa  203  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0610174  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1586  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.72 
 
 		 626 aa  201  5e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3405  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  30.16 
 
 		 630 aa  196  1e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3603  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.24 
 
 		 630 aa  196  1e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.840663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0882  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.24 
 
 		 630 aa  196  1e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3480  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.16 
 
 		 630 aa  196  1e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0930  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.17 
 
 		 630 aa  194  5e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.257402 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2364  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.92 
 
 		 622 aa  193  8e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.493821  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3725  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.93 
 
 		 620 aa  193  9e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.403145  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1056  methyl-accepting chemotaxis protein  28.83 
 
 		 630 aa  193  1e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2609  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.16 
 
 		 621 aa  192  1e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.206567  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3042  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.99 
 
 		 630 aa  192  2e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.397129 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0895  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.38 
 
 		 630 aa  192  2e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.174985 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0026  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.92 
 
 		 686 aa  191  4e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2954  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.77 
 
 		 620 aa  188  2e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000679912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3742  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.69 
 
 		 620 aa  189  2e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.35347 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0691  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.69 
 
 		 620 aa  189  2e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3551  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.69 
 
 		 620 aa  189  2e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00183884 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1629  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  30.5 
 
 		 623 aa  188  3e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.438395  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4403  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.84 
 
 		 670 aa  188  4e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.604884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4029  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.49 
 
 		 630 aa  186  9e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0106  methyl-accepting chemotaxis protein  34.55 
 
 		 546 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.827543  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3169  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.64 
 
 		 620 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.225635  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001822  methyl-accepting chemotaxis protein  35.29 
 
 		 557 aa  186  1.0000000000000001e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000124429  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0525  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  30.56 
 
 		 632 aa  184  5.0000000000000004e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3619  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.39 
 
 		 620 aa  184  6e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01884  hypothetical protein  31.24 
 
 		 627 aa  183  9.000000000000001e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0685  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.72 
 
 		 620 aa  182  1e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1091  chemotaxis sensory transducer  35.38 
 
 		 620 aa  183  1e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0174472  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3617  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.32 
 
 		 554 aa  182  1e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.964358 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0870  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.67 
 
 		 554 aa  183  1e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0571565  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1254  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.42 
 
 		 639 aa  182  2e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.523103  normal  0.0331864 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3502  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.24 
 
 		 620 aa  182  2e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.666992  normal  0.2901 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3752  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.12 
 
 		 623 aa  182  2e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0507  methyl-accepting chemotaxis protein  26.91 
 
 		 630 aa  182  2e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3825  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.1 
 
 		 623 aa  182  2e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000055  methyl-accepting chemotaxis protein  35.46 
 
 		 543 aa  181  2.9999999999999997e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000458726  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3491  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  30.18 
 
 		 626 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00119  methyl-accepting chemotaxis protein  29.96 
 
 		 626 aa  181  2.9999999999999997e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2116  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.22 
 
 		 545 aa  181  4e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0905  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  32.87 
 
 		 640 aa  181  4e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.746842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0316  methyl-accepting chemotaxis protein  33.82 
 
 		 652 aa  181  4.999999999999999e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0868  methyl-accepting chemotaxis protein  31.93 
 
 		 536 aa  180  7e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000231989  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3321  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.08 
 
 		 702 aa  180  8e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.105528  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0252  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  29.55 
 
 		 623 aa  180  8e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.866394  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>