More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_3594 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_0772  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  68.43 
 
 		 646 aa  919    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00540264  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3437  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  96.28 
 
 		 646 aa  1269    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.143807  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0366  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.48 
 
 		 643 aa  649    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0151066 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0792  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  68.27 
 
 		 651 aa  910    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3594  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  100 
 
 		 646 aa  1313    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2939  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.76 
 
 		 672 aa  591  1e-167  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6894  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.07 
 
 		 657 aa  588  1e-167  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.068141  normal  0.373533 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4309  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.81 
 
 		 659 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.226298 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4315  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.76 
 
 		 656 aa  566  1e-160  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4192  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.35 
 
 		 660 aa  550  1e-155  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0520721  normal  0.510764 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1684  methyl-accepting chemotaxis protein I  44.51 
 
 		 676 aa  546  1e-154  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4070  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.71 
 
 		 660 aa  547  1e-154  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3714  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.19 
 
 		 660 aa  547  1e-154  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4296  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.71 
 
 		 660 aa  547  1e-154  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3221  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.71 
 
 		 660 aa  547  1e-154  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.229974 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1080  methyl-accepting chemotaxis protein  43.75 
 
 		 687 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.469209  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0994  methyl-accepting chemotaxis protein  44.72 
 
 		 678 aa  522  1e-147  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.799426  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2308  methyl-accepting chemotaxis protein II  44.31 
 
 		 684 aa  520  1e-146  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0140  putative methyl-accepting chemotaxis protein  44.46 
 
 		 684 aa  504  1e-141  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0610174  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3412  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.17 
 
 		 662 aa  483  1e-135  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3066  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.09 
 
 		 662 aa  482  1e-135  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3136  putative methyl-accepting chemotaxis transmembrane protein  40.16 
 
 		 661 aa  469  1.0000000000000001e-131  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.598743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0507  methyl-accepting chemotaxis protein  41.39 
 
 		 630 aa  404  1e-111  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3084  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.93 
 
 		 719 aa  382  1e-105  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3481  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.5 
 
 		 674 aa  345  1e-93  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4123  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.31 
 
 		 674 aa  345  2e-93  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.162807  normal  0.87643 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4184  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.21 
 
 		 680 aa  326  6e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.12793  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0033  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.33 
 
 		 651 aa  298  2e-79  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.250878  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0045  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.16 
 
 		 651 aa  297  5e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0030  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.17 
 
 		 651 aa  282  1e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0695  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.4 
 
 		 561 aa  274  4.0000000000000004e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.305861  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2345  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.36 
 
 		 666 aa  266  1e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.60686 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2526  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.39 
 
 		 554 aa  263  6.999999999999999e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5515  chemotaxis sensory transducer  30.88 
 
 		 658 aa  262  1e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.501051  normal  0.584272 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2831  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.39 
 
 		 554 aa  262  1e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0117  methyl-accepting chemotaxis protein  31.7 
 
 		 658 aa  261  2e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0210  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.99 
 
 		 632 aa  261  3e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.248487  normal  0.150257 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0071  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  31.11 
 
 		 658 aa  261  3e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2154  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.13 
 
 		 569 aa  261  3e-68  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1806  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.77 
 
 		 652 aa  259  1e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1816  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.75 
 
 		 651 aa  258  3e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.700193  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1293  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.86 
 
 		 667 aa  257  4e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1243  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.46 
 
 		 667 aa  256  9e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0769  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.54 
 
 		 505 aa  256  1.0000000000000001e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0409416  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1313  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.46 
 
 		 667 aa  255  2.0000000000000002e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00146838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5868  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.37 
 
 		 541 aa  254  3e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3114  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.65 
 
 		 667 aa  254  3e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0104  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.45 
 
 		 622 aa  254  3e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4161  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.35 
 
 		 628 aa  254  5.000000000000001e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0727  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.63 
 
 		 559 aa  253  6e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0409  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.01 
 
 		 585 aa  253  7e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1044  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.55 
 
 		 584 aa  253  1e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3217  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  41.26 
 
 		 584 aa  253  1e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.480757 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0335  methyl-accepting chemotaxis protein I  43.33 
 
 		 394 aa  253  1e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.809135  normal  0.684623 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1322  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.57 
 
 		 667 aa  251  2e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2167  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.53 
 
 		 585 aa  251  2e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.38945  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04782  methyl-accepting chemotaxis transducer transmembrane protein  45.6 
 
 		 543 aa  251  4e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2663  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.89 
 
 		 520 aa  251  4e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0198398  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4443  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.36 
 
 		 630 aa  250  7e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3087  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.65 
 
 		 527 aa  249  7e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.823637 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0990  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.76 
 
 		 542 aa  249  8e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4122  methyl-accepting chemotaxis protein  45.11 
 
 		 649 aa  249  9e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0395  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.03 
 
 		 556 aa  249  9e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0034  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.11 
 
 		 649 aa  249  9e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.38678  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4354  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.77 
 
 		 555 aa  249  1e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1879  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.44 
 
 		 661 aa  249  1e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6699  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.56 
 
 		 575 aa  249  1e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.198234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0080  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.95 
 
 		 642 aa  249  1e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1620  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.09 
 
 		 559 aa  248  2e-64  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.439493  normal  0.532508 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1569  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.94 
 
 		 554 aa  248  2e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1385  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.56 
 
 		 683 aa  248  2e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3862  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.47 
 
 		 555 aa  248  2e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1951  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.2 
 
 		 508 aa  248  2e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.747742 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6319  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.79 
 
 		 549 aa  248  3e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.249944  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4301  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.09 
 
 		 587 aa  248  3e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2637  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.34 
 
 		 667 aa  248  3e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0295827  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3774  methyl-accepting chemotaxis protein  46.23 
 
 		 649 aa  248  3e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3443  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.97 
 
 		 511 aa  248  3e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.330959  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3600  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.65 
 
 		 510 aa  248  3e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4071  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.77 
 
 		 553 aa  247  4e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1752  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.2 
 
 		 523 aa  246  6.999999999999999e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1336  putative methyl-accepting chemotaxis protein (MCP)  31.07 
 
 		 740 aa  246  6.999999999999999e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000730785  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2095  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.32 
 
 		 520 aa  246  9e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.649492  normal  0.265934 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0071  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.43 
 
 		 630 aa  246  9e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0400  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.99 
 
 		 602 aa  245  9.999999999999999e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0817302 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1771  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.71 
 
 		 520 aa  245  1.9999999999999999e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.841752 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4072  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.34 
 
 		 540 aa  244  3e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3407  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.62 
 
 		 653 aa  244  3e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4172  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.21 
 
 		 653 aa  244  3e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4062  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.62 
 
 		 653 aa  244  3e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4454  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.9 
 
 		 653 aa  244  3e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.625525  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4084  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.92 
 
 		 555 aa  244  5e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4297  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.92 
 
 		 471 aa  244  5e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00689697  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3464  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.69 
 
 		 551 aa  243  6e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4355  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.59 
 
 		 540 aa  243  9e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.31766  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0264  methyl-accepting chemotaxis protein  40.5 
 
 		 580 aa  242  1e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0749  aerotaxis sensor receptor  43.57 
 
 		 669 aa  242  1e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1067  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.47 
 
 		 634 aa  242  1e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.318926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5306  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.77 
 
 		 565 aa  242  1e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00488588  normal  0.0415564 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4050  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.69 
 
 		 615 aa  243  1e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.996584  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>