More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_2345 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_1568  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  56.76 
 
 		 667 aa  738    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1310  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  56.22 
 
 		 667 aa  726    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2976  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  59.16 
 
 		 667 aa  775    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000241408  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1293  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  59.31 
 
 		 667 aa  766    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3282  methyl-accepting chemotaxis protein  56.61 
 
 		 667 aa  715    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2637  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  56.16 
 
 		 667 aa  741    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0295827  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2990  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  59.31 
 
 		 667 aa  778    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.413203  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3114  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  57.21 
 
 		 667 aa  738    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2345  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  100 
 
 		 666 aa  1359    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.60686 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1387  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  59.46 
 
 		 667 aa  778    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1243  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  59.46 
 
 		 667 aa  765    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1313  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  59.46 
 
 		 667 aa  764    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00146838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1322  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  56.76 
 
 		 667 aa  728    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3134  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  59.16 
 
 		 667 aa  775    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0135223  normal  0.80442 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1146  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.53 
 
 		 668 aa  661    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.970933  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1385  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.67 
 
 		 683 aa  338  1.9999999999999998e-91  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002906  methyl-accepting chemotaxis protein  31.29 
 
 		 678 aa  338  1.9999999999999998e-91  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.816112  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5515  chemotaxis sensory transducer  31.7 
 
 		 658 aa  293  6e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.501051  normal  0.584272 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0210  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.94 
 
 		 632 aa  291  3e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.248487  normal  0.150257 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0117  methyl-accepting chemotaxis protein  31.47 
 
 		 658 aa  290  9e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0071  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  31.47 
 
 		 658 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3437  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.36 
 
 		 646 aa  269  1e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.143807  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3594  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.36 
 
 		 646 aa  266  1e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0772  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.56 
 
 		 646 aa  261  3e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00540264  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0792  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.66 
 
 		 651 aa  253  8.000000000000001e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3066  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.49 
 
 		 662 aa  243  9e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3412  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.49 
 
 		 662 aa  243  1e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3136  putative methyl-accepting chemotaxis transmembrane protein  28.63 
 
 		 661 aa  235  3e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.598743  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4309  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.18 
 
 		 659 aa  231  4e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.226298 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0631  chemotaxis sensory transducer  29.58 
 
 		 656 aa  229  1e-58  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00821954  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2939  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.62 
 
 		 672 aa  228  4e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3714  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.4 
 
 		 660 aa  224  4.9999999999999996e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4192  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.55 
 
 		 660 aa  223  7e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0520721  normal  0.510764 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6894  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.67 
 
 		 657 aa  221  3.9999999999999997e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.068141  normal  0.373533 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3221  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.29 
 
 		 660 aa  219  2e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.229974 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0366  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.85 
 
 		 643 aa  218  4e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0151066 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3084  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.12 
 
 		 719 aa  217  5.9999999999999996e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0922  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29 
 
 		 674 aa  216  7e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4296  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.92 
 
 		 660 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4070  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.92 
 
 		 660 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4184  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.8 
 
 		 680 aa  214  3.9999999999999995e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.12793  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1039  protease htpx  29.56 
 
 		 656 aa  207  6e-52  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0758551  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4315  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.73 
 
 		 656 aa  206  8e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1684  methyl-accepting chemotaxis protein I  27.19 
 
 		 676 aa  204  4e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2308  methyl-accepting chemotaxis protein II  27.38 
 
 		 684 aa  203  7e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1080  methyl-accepting chemotaxis protein  26.09 
 
 		 687 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.469209  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0994  methyl-accepting chemotaxis protein  26.89 
 
 		 678 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.799426  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0837  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  27.69 
 
 		 680 aa  202  1.9999999999999998e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0272085 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01222  methyl-accepting chemotaxis protein  30.59 
 
 		 580 aa  197  5.000000000000001e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.566871  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1254  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.29 
 
 		 639 aa  197  6e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.523103  normal  0.0331864 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0921  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.72 
 
 		 677 aa  196  1e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.787316  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3481  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.45 
 
 		 674 aa  192  2e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3139  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.41 
 
 		 640 aa  192  2e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.753261  normal  0.0120166 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4123  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.28 
 
 		 674 aa  191  4e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.162807  normal  0.87643 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0030  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.41 
 
 		 651 aa  189  1e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0931  methyl-accepting chemotaxis protein  36.24 
 
 		 543 aa  188  3e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0045  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.39 
 
 		 651 aa  188  3e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0596  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.17 
 
 		 640 aa  187  6e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.270432 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0033  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.57 
 
 		 651 aa  186  8e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.250878  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4372  methyl-accepting chemotaxis protein  41.24 
 
 		 619 aa  186  1.0000000000000001e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2301  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.36 
 
 		 632 aa  186  1.0000000000000001e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3236  methyl-accepting chemotaxis protein  33.61 
 
 		 544 aa  186  2.0000000000000003e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0712  chemotaxis sensory transducer  34.52 
 
 		 541 aa  183  9.000000000000001e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000566108  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2239  chemotaxis sensory transducer  29.85 
 
 		 648 aa  182  1e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1939  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.62 
 
 		 638 aa  183  1e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.573171  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3551  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.38 
 
 		 620 aa  182  2e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00183884 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0085  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.14 
 
 		 638 aa  182  2e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0647334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0691  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.38 
 
 		 620 aa  182  2e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3705  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.15 
 
 		 541 aa  182  2.9999999999999997e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0963791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0026  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.23 
 
 		 686 aa  181  2.9999999999999997e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2607  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.97 
 
 		 541 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00122932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3742  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.38 
 
 		 620 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.35347 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2609  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.42 
 
 		 621 aa  181  4e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.206567  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0847  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.64 
 
 		 620 aa  181  4.999999999999999e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.566037  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2119  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.29 
 
 		 548 aa  181  5.999999999999999e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0343  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.14 
 
 		 645 aa  180  5.999999999999999e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.675969  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0861  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.05 
 
 		 542 aa  180  7e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67010  putative chemotaxis transducer  35.91 
 
 		 647 aa  179  1e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000055  methyl-accepting chemotaxis protein  35.63 
 
 		 543 aa  179  1e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000458726  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0140  putative methyl-accepting chemotaxis protein  26.86 
 
 		 684 aa  179  1e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0610174  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3002  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.9 
 
 		 705 aa  179  1e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.568622  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0320  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.72 
 
 		 645 aa  179  2e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000409011 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3725  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.61 
 
 		 620 aa  179  2e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.403145  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0450  chemotaxis sensory transducer  32.72 
 
 		 645 aa  178  2e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0619  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.87 
 
 		 634 aa  178  2e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1066  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.86 
 
 		 705 aa  179  2e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0342  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.72 
 
 		 645 aa  178  3e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.860801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0868  methyl-accepting chemotaxis protein  33.33 
 
 		 536 aa  178  4e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000231989  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0099  chemotaxis sensory transducer  28.9 
 
 		 639 aa  177  4e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000152719  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2315  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  35.94 
 
 		 653 aa  177  7e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.967368  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2634  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  34.15 
 
 		 542 aa  177  7e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.917034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1220  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.94 
 
 		 706 aa  176  8e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.46231 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1187  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.94 
 
 		 706 aa  176  8e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0911  chemotaxis sensory transducer  34.97 
 
 		 705 aa  176  9e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000403524  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0732  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.31 
 
 		 555 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.177926 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3619  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.76 
 
 		 620 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3170  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.94 
 
 		 706 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.942476 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3856  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.17 
 
 		 640 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.825575 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0734  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.3 
 
 		 643 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.770301  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1937  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.34 
 
 		 541 aa  176  9.999999999999999e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.158854  normal  0.960341 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>