More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_0210 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_0117  methyl-accepting chemotaxis protein  71.58 
 
 		 658 aa  941    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0210  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  100 
 
 		 632 aa  1264    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.248487  normal  0.150257 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0071  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  70.97 
 
 		 658 aa  936    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5515  chemotaxis sensory transducer  73.56 
 
 		 658 aa  965    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.501051  normal  0.584272 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1385  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.4 
 
 		 683 aa  301  2e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2345  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.09 
 
 		 666 aa  299  9e-80  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.60686 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1243  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.72 
 
 		 667 aa  298  2e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1313  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.58 
 
 		 667 aa  298  2e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00146838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1293  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.55 
 
 		 667 aa  298  3e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1146  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.6 
 
 		 668 aa  297  3e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.970933  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3134  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.99 
 
 		 667 aa  294  3e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0135223  normal  0.80442 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1387  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.99 
 
 		 667 aa  293  5e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2976  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.04 
 
 		 667 aa  293  6e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000241408  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2990  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.85 
 
 		 667 aa  292  1e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.413203  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6894  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.06 
 
 		 657 aa  291  3e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.068141  normal  0.373533 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2939  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.6 
 
 		 672 aa  287  4e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2637  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.67 
 
 		 667 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0295827  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3114  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.18 
 
 		 667 aa  277  4e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0772  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.28 
 
 		 646 aa  272  1e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00540264  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4309  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.94 
 
 		 659 aa  271  2.9999999999999997e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.226298 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3437  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.59 
 
 		 646 aa  270  4e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.143807  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3594  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.63 
 
 		 646 aa  271  4e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1568  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.81 
 
 		 667 aa  268  2.9999999999999995e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1310  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.42 
 
 		 667 aa  267  5e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3066  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.92 
 
 		 662 aa  266  1e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0366  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.47 
 
 		 643 aa  265  2e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0151066 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3282  methyl-accepting chemotaxis protein  32.26 
 
 		 667 aa  265  2e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1322  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.57 
 
 		 667 aa  263  6e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1684  methyl-accepting chemotaxis protein I  33.49 
 
 		 676 aa  261  3e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3136  putative methyl-accepting chemotaxis transmembrane protein  32.65 
 
 		 661 aa  261  4e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.598743  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4192  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.33 
 
 		 660 aa  261  4e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0520721  normal  0.510764 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3714  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.64 
 
 		 660 aa  259  9e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4315  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.68 
 
 		 656 aa  258  2e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0994  methyl-accepting chemotaxis protein  34.19 
 
 		 678 aa  258  2e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.799426  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1080  methyl-accepting chemotaxis protein  33.07 
 
 		 687 aa  256  7e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.469209  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2308  methyl-accepting chemotaxis protein II  33.84 
 
 		 684 aa  256  8e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0792  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.13 
 
 		 651 aa  255  2.0000000000000002e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4296  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.91 
 
 		 660 aa  252  1e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3221  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.23 
 
 		 660 aa  252  1e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.229974 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4070  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.91 
 
 		 660 aa  252  1e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002906  methyl-accepting chemotaxis protein  29.32 
 
 		 678 aa  251  3e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.816112  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0030  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.76 
 
 		 651 aa  246  6e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0045  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.27 
 
 		 651 aa  245  1.9999999999999999e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3063  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.21 
 
 		 533 aa  243  9e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.378908  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0033  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.27 
 
 		 651 aa  241  2.9999999999999997e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.250878  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3084  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.99 
 
 		 719 aa  240  5e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0140  putative methyl-accepting chemotaxis protein  33.79 
 
 		 684 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0610174  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4184  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.16 
 
 		 680 aa  232  2e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.12793  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01222  methyl-accepting chemotaxis protein  30.71 
 
 		 580 aa  226  1e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.566871  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4123  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.05 
 
 		 674 aa  217  7e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.162807  normal  0.87643 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2825  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.23 
 
 		 570 aa  216  9.999999999999999e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000443347 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0026  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.69 
 
 		 686 aa  212  2e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1561  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.56 
 
 		 528 aa  211  4e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0809  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.9 
 
 		 532 aa  211  4e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.826751  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0921  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.09 
 
 		 677 aa  206  9e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.787316  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1030  methyl-accepting chemotaxis protein  37.22 
 
 		 549 aa  206  1e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0837  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  29.34 
 
 		 680 aa  204  6e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0272085 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2016  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.39 
 
 		 519 aa  203  7e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.103091 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0400  methyl-accepting chemotaxis protein  36.66 
 
 		 549 aa  202  9.999999999999999e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.431065  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0507  methyl-accepting chemotaxis protein  32 
 
 		 630 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3719  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.66 
 
 		 540 aa  201  5e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3147  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.71 
 
 		 540 aa  200  6e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0302394  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30820  putative methyl-accepting chemotaxis transducer  35.94 
 
 		 535 aa  200  6e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0142633  hitchhiker  0.0000000000042709 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2942  methyl-accepting chemotaxis protein  40.86 
 
 		 544 aa  200  7e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3828  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.8 
 
 		 506 aa  199  9e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.188818  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1033  methyl-accepting chemotaxis protein  40.29 
 
 		 533 aa  199  2.0000000000000003e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0106  methyl-accepting chemotaxis protein  36.42 
 
 		 546 aa  198  3e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.827543  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3611  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.88 
 
 		 540 aa  198  3e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1056  methyl-accepting chemotaxis protein  34.22 
 
 		 630 aa  197  4.0000000000000005e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3405  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  34.45 
 
 		 630 aa  197  5.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3491  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  36.94 
 
 		 626 aa  197  5.000000000000001e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3480  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.45 
 
 		 630 aa  197  5.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0969  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.18 
 
 		 631 aa  196  9e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3603  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.29 
 
 		 630 aa  196  1e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.840663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0461  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.9 
 
 		 569 aa  196  1e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0882  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.21 
 
 		 630 aa  196  1e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3312  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.08 
 
 		 533 aa  196  1e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001273  methyl-accepting chemotaxis protein  30.65 
 
 		 638 aa  195  2e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0210  methyl-accepting chemotaxis protein  35.8 
 
 		 543 aa  195  2e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000824359  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0173  methyl-accepting chemotaxis protein  36.18 
 
 		 639 aa  194  3e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1988  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.79 
 
 		 674 aa  194  4e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.588025  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0525  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  37.94 
 
 		 632 aa  194  4e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0895  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.1 
 
 		 630 aa  194  4e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.174985 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1032  methyl-accepting chemotaxis protein  39.26 
 
 		 645 aa  193  9e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2782  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.22 
 
 		 601 aa  192  1e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.163256  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0149  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.39 
 
 		 533 aa  192  1e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0930  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.86 
 
 		 630 aa  192  1e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.257402 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4715  chemotaxis sensory transducer  34.08 
 
 		 713 aa  192  2e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.233277  normal  0.171171 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3042  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.86 
 
 		 630 aa  192  2e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.397129 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0612  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.99 
 
 		 543 aa  191  2.9999999999999997e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2961  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.62 
 
 		 542 aa  191  4e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3709  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  39.55 
 
 		 546 aa  191  5e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1102  methyl-accepting chemotaxis protein  31.55 
 
 		 638 aa  191  5e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3669  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.97 
 
 		 716 aa  190  7e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.170337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56010  chemotactic transducer PctB  32.37 
 
 		 629 aa  189  1e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61300  putative chemotaxis transducer  34.47 
 
 		 712 aa  189  1e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.862971 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4874  chemotactic transducer PctC  32.26 
 
 		 632 aa  188  2e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.153332  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4877  chemotactic transducer PctB  32.14 
 
 		 629 aa  189  2e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.164155  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2828  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.75 
 
 		 550 aa  188  2e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000014913 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0080  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.67 
 
 		 636 aa  188  2e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>