More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_0563 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_0615  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  99.73 
 
 		 745 aa  1478    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.685399  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0563  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  100 
 
 		 745 aa  1481    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1575  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  55.06 
 
 		 749 aa  668    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.114033 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0671  putative twitching motility transmembrane protein  90.21 
 
 		 743 aa  1299    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.357708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3187  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  55.72 
 
 		 745 aa  653    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.484204  normal  0.234759 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3018  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.1 
 
 		 767 aa  690    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.238689  normal  0.701163 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0904  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  55.6 
 
 		 745 aa  688    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.405383 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2620  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  73.27 
 
 		 733 aa  1035    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3575  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  58.4 
 
 		 754 aa  682    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.946853  normal  0.162427 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1374  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  59.15 
 
 		 759 aa  656    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.43954  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1139  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  56.91 
 
 		 692 aa  652    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.534971 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2898  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  58.4 
 
 		 754 aa  681    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0204496  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0672  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  77.06 
 
 		 733 aa  1003    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.371682  normal  0.522662 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3351  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  57.57 
 
 		 759 aa  658    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.335724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3968  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.17 
 
 		 777 aa  629  1e-179  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0103685 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4623  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  56.32 
 
 		 770 aa  629  1e-179  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.408638  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3896  chemotaxis sensory transducer  52.11 
 
 		 706 aa  615  1e-175  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2549  chemotaxis sensory transducer  45.92 
 
 		 707 aa  505  1e-141  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0511  twitching motility protein PilJ  41.47 
 
 		 682 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05360  twitching motility protein PilJ  41.47 
 
 		 682 aa  439  1e-121  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3770  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.19 
 
 		 691 aa  433  1e-120  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0406  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.64 
 
 		 678 aa  427  1e-118  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0475  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.7 
 
 		 686 aa  422  1e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.178091  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2901  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.07 
 
 		 700 aa  413  1e-114  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.726182  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5305  chemotaxis sensory transducer  39.94 
 
 		 686 aa  414  1e-114  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.115158  normal  0.281343 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5039  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.46 
 
 		 686 aa  410  1e-113  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.468878  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4989  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.46 
 
 		 686 aa  410  1e-113  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.289293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4863  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.46 
 
 		 686 aa  410  1e-113  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0070905 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5031  type IV pilus biogenesis protein PilJ  40.83 
 
 		 680 aa  411  1e-113  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0491  chemotaxis sensory transducer  41.11 
 
 		 680 aa  411  1e-113  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3631  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.09 
 
 		 731 aa  394  1e-108  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.455048  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01605  pilus biogenesis protein  39.18 
 
 		 678 aa  389  1e-106  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.128934  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1245  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  63.96 
 
 		 543 aa  388  1e-106  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.403133  normal  0.310409 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3691  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  64.04 
 
 		 704 aa  380  1e-104  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.02239  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1019  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.21 
 
 		 680 aa  363  5.0000000000000005e-99  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.58121  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3086  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.58 
 
 		 678 aa  363  6e-99  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.12197 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0895  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.36 
 
 		 680 aa  361  2e-98  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2397  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.24 
 
 		 686 aa  355  2e-96  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.688228 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0128  chemotaxis sensory transducer  57.27 
 
 		 537 aa  346  1e-93  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0517  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.2 
 
 		 671 aa  345  1e-93  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.104858  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2098  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.96 
 
 		 473 aa  335  2e-90  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1815  putative chemotaxis sensory transducer  55.36 
 
 		 475 aa  332  2e-89  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2156  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  55.46 
 
 		 575 aa  329  1.0000000000000001e-88  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0358  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.74 
 
 		 560 aa  316  8e-85  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0237962  normal  0.734928 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1015  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.5 
 
 		 839 aa  223  8e-57  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0741142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3745  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.82 
 
 		 852 aa  214  4.9999999999999996e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0506  chemotaxis sensory transducer  35.64 
 
 		 982 aa  213  1e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.202983  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2778  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with GAF sensor  39.61 
 
 		 1153 aa  212  2e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.970502 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3339  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with GAF sensor  39.61 
 
 		 1153 aa  212  2e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2782  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with GAF sensor  38.97 
 
 		 902 aa  211  4e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4950  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.65 
 
 		 975 aa  211  4e-53  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3002  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.26 
 
 		 915 aa  206  1e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1064  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with GAF sensor  37.02 
 
 		 879 aa  204  6e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.698769  hitchhiker  0.00000570114 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0858  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with phytochrome sensor  37.39 
 
 		 1406 aa  203  7e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0185965  normal  0.079214 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4746  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.32 
 
 		 503 aa  203  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000363987 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0749  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.54 
 
 		 880 aa  199  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0720  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.54 
 
 		 880 aa  199  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2793  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.15 
 
 		 778 aa  195  2e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3107  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.1 
 
 		 542 aa  194  6e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1391  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.78 
 
 		 557 aa  192  2e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4287  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.43 
 
 		 854 aa  189  1e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4347  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.43 
 
 		 854 aa  189  1e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3246  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.07 
 
 		 1105 aa  187  5e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.610597  normal  0.482443 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1029  methyl-accepting chemotaxis protein  37 
 
 		 549 aa  186  1.0000000000000001e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.392996  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0343  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.78 
 
 		 1079 aa  183  8.000000000000001e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1030  methyl-accepting chemotaxis protein  36.59 
 
 		 549 aa  182  2e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1426  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.85 
 
 		 768 aa  181  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.541717  normal  0.185322 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2828  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.14 
 
 		 550 aa  182  2.9999999999999997e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000014913 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0712  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.51 
 
 		 550 aa  181  5.999999999999999e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1937  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.36 
 
 		 541 aa  179  2e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.158854  normal  0.960341 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1425  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.15 
 
 		 787 aa  179  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.68627  normal  0.569737 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1624  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.09 
 
 		 626 aa  178  3e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.835429  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4603  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.94 
 
 		 820 aa  177  7e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.452141 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1033  methyl-accepting chemotaxis protein  36.28 
 
 		 533 aa  175  1.9999999999999998e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2870  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.78 
 
 		 636 aa  176  1.9999999999999998e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1286  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.9 
 
 		 538 aa  176  1.9999999999999998e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0612  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.46 
 
 		 543 aa  175  1.9999999999999998e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0061  chemotaxis sensory transducer  37.11 
 
 		 752 aa  176  1.9999999999999998e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.691552  normal  0.30416 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2845  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.53 
 
 		 549 aa  176  1.9999999999999998e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000597879  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0476  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35 
 
 		 830 aa  175  2.9999999999999996e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2177  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.99 
 
 		 628 aa  174  5e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0520  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.24 
 
 		 711 aa  174  5e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2776  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with GAF sensor  33.33 
 
 		 1142 aa  173  1e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.380177 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1845  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.49 
 
 		 660 aa  173  1e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.655459  normal  0.855545 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3465  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.22 
 
 		 423 aa  173  1e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0400  methyl-accepting chemotaxis protein  37 
 
 		 549 aa  172  2e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.431065  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3341  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with GAF sensor  33.33 
 
 		 1142 aa  172  2e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30820  putative methyl-accepting chemotaxis transducer  34.78 
 
 		 535 aa  172  2e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0142633  hitchhiker  0.0000000000042709 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2782  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.16 
 
 		 601 aa  172  3e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.163256  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0529  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36 
 
 		 544 aa  171  4e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2728  chemotaxis sensory transducer  34.29 
 
 		 544 aa  171  7e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00837045  normal  0.306222 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0167  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.08 
 
 		 540 aa  171  7e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1714  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.36 
 
 		 673 aa  171  7e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.712235  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0909  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.35 
 
 		 754 aa  170  8e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0756  methyl-accepting chemotaxis protein  37 
 
 		 549 aa  169  1e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3312  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.06 
 
 		 533 aa  170  1e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0142  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.94 
 
 		 540 aa  169  1e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0808523  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2825  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.03 
 
 		 570 aa  170  1e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000443347 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0149  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.45 
 
 		 533 aa  169  2e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1041  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.19 
 
 		 661 aa  168  2.9999999999999998e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>