More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_3575 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_4623  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  71.15 
 
 		 770 aa  908    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.408638  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1575  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  75.99 
 
 		 749 aa  1040    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.114033 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0671  putative twitching motility transmembrane protein  58.68 
 
 		 743 aa  673    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.357708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3351  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  72.31 
 
 		 759 aa  1021    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.335724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3575  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  100 
 
 		 754 aa  1481    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.946853  normal  0.162427 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3018  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  76.75 
 
 		 767 aa  1132    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.238689  normal  0.701163 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3968  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  65.61 
 
 		 777 aa  838    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0103685 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2620  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.58 
 
 		 733 aa  665    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0615  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  58.4 
 
 		 745 aa  683    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.685399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3187  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  72.22 
 
 		 745 aa  889    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.484204  normal  0.234759 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1374  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  74.03 
 
 		 759 aa  1013    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.43954  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1139  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  78.7 
 
 		 692 aa  1024    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.534971 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2898  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  99.47 
 
 		 754 aa  1472    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0204496  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0672  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  56.5 
 
 		 733 aa  638    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.371682  normal  0.522662 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0563  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  58.4 
 
 		 745 aa  682    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0904  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  87.27 
 
 		 745 aa  1290    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.405383 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3896  chemotaxis sensory transducer  50.54 
 
 		 706 aa  532  1e-150  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2549  chemotaxis sensory transducer  44.05 
 
 		 707 aa  458  1e-127  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0511  twitching motility protein PilJ  38.13 
 
 		 682 aa  393  1e-108  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05360  twitching motility protein PilJ  37.98 
 
 		 682 aa  391  1e-107  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1245  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  57.03 
 
 		 543 aa  377  1e-103  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.403133  normal  0.310409 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5039  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.99 
 
 		 686 aa  373  1e-102  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.468878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0406  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37 
 
 		 678 aa  375  1e-102  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5305  chemotaxis sensory transducer  36.31 
 
 		 686 aa  373  1e-102  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.115158  normal  0.281343 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0475  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.01 
 
 		 686 aa  373  1e-102  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.178091  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4989  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.83 
 
 		 686 aa  371  1e-101  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.289293  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5031  type IV pilus biogenesis protein PilJ  37.76 
 
 		 680 aa  371  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0491  chemotaxis sensory transducer  37.66 
 
 		 680 aa  369  1e-101  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4863  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.99 
 
 		 686 aa  372  1e-101  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0070905 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3770  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.15 
 
 		 691 aa  369  1e-101  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3691  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  61.99 
 
 		 704 aa  367  1e-100  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.02239  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3631  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.53 
 
 		 731 aa  362  1e-98  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.455048  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2901  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.06 
 
 		 700 aa  355  2e-96  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.726182  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01605  pilus biogenesis protein  37.26 
 
 		 678 aa  350  7e-95  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.128934  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0128  chemotaxis sensory transducer  56.06 
 
 		 537 aa  341  2.9999999999999998e-92  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2397  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.05 
 
 		 686 aa  338  2.9999999999999997e-91  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.688228 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3086  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.83 
 
 		 678 aa  337  5.999999999999999e-91  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.12197 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2098  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.82 
 
 		 473 aa  330  8e-89  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1019  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.44 
 
 		 680 aa  328  2.0000000000000001e-88  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.58121  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0895  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.92 
 
 		 680 aa  323  9.000000000000001e-87  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1815  putative chemotaxis sensory transducer  48.87 
 
 		 475 aa  322  9.999999999999999e-87  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0517  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.07 
 
 		 671 aa  318  2e-85  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.104858  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2156  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.24 
 
 		 575 aa  318  2e-85  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0358  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.8 
 
 		 560 aa  303  1e-80  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0237962  normal  0.734928 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3339  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with GAF sensor  37.87 
 
 		 1153 aa  213  9e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2778  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with GAF sensor  37.87 
 
 		 1153 aa  213  9e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.970502 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1015  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.12 
 
 		 839 aa  207  6e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0741142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3745  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.32 
 
 		 852 aa  207  8e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2782  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with GAF sensor  36.44 
 
 		 902 aa  206  2e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4746  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.33 
 
 		 503 aa  201  3e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000363987 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0506  chemotaxis sensory transducer  36.65 
 
 		 982 aa  197  7e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.202983  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3002  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.16 
 
 		 915 aa  196  2e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0720  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.25 
 
 		 880 aa  194  4e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0749  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.25 
 
 		 880 aa  194  4e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0858  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with phytochrome sensor  36.25 
 
 		 1406 aa  193  8e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0185965  normal  0.079214 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4950  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.24 
 
 		 975 aa  193  1e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1064  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with GAF sensor  37.04 
 
 		 879 aa  190  7e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.698769  hitchhiker  0.00000570114 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1425  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.44 
 
 		 787 aa  189  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.68627  normal  0.569737 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1426  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.86 
 
 		 768 aa  187  6e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.541717  normal  0.185322 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3107  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.66 
 
 		 542 aa  187  9e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0343  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.69 
 
 		 1079 aa  186  2.0000000000000003e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0520  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.88 
 
 		 711 aa  184  4.0000000000000006e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2845  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.5 
 
 		 549 aa  182  2e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000597879  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4287  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.76 
 
 		 854 aa  178  3e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3465  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.11 
 
 		 423 aa  178  3e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4347  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.76 
 
 		 854 aa  178  4e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2828  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.22 
 
 		 550 aa  177  9e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000014913 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2793  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.91 
 
 		 778 aa  176  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1029  methyl-accepting chemotaxis protein  35.6 
 
 		 549 aa  174  3.9999999999999995e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.392996  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3246  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.04 
 
 		 1105 aa  175  3.9999999999999995e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.610597  normal  0.482443 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0061  chemotaxis sensory transducer  35.96 
 
 		 752 aa  173  1e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.691552  normal  0.30416 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2776  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.09 
 
 		 544 aa  172  2e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.839191  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0142  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.56 
 
 		 540 aa  171  4e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0808523  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2857  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.91 
 
 		 520 aa  169  2e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000607785  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2776  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with GAF sensor  31.61 
 
 		 1142 aa  168  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.380177 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3341  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with GAF sensor  31.61 
 
 		 1142 aa  167  5e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2942  methyl-accepting chemotaxis protein  34.67 
 
 		 544 aa  167  5.9999999999999996e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1033  methyl-accepting chemotaxis protein  34.77 
 
 		 533 aa  167  8e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1391  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.71 
 
 		 557 aa  167  8e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0529  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.77 
 
 		 544 aa  167  9e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0612  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.44 
 
 		 543 aa  166  2.0000000000000002e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4401  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.6 
 
 		 695 aa  166  2.0000000000000002e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.896591  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2782  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.54 
 
 		 601 aa  166  2.0000000000000002e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.163256  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2825  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.08 
 
 		 570 aa  164  4.0000000000000004e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000443347 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0476  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.21 
 
 		 830 aa  164  7e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1624  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.16 
 
 		 626 aa  163  1e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.835429  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1286  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.97 
 
 		 538 aa  162  2e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1041  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.78 
 
 		 661 aa  162  2e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1937  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.14 
 
 		 541 aa  162  2e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.158854  normal  0.960341 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2177  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.99 
 
 		 628 aa  162  2e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3611  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.56 
 
 		 540 aa  161  3e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3778  chemotaxis sensory transducer, phytochrome sensor  33.54 
 
 		 1100 aa  161  3e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.275371 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2870  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.16 
 
 		 636 aa  161  4e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3805  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.22 
 
 		 422 aa  161  4e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000721713  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0167  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.46 
 
 		 540 aa  160  6e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0400  methyl-accepting chemotaxis protein  34.98 
 
 		 549 aa  160  7e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.431065  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0798  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.23 
 
 		 541 aa  160  7e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1714  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.74 
 
 		 673 aa  160  8e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.712235  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0889  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.77 
 
 		 540 aa  160  9e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0756  methyl-accepting chemotaxis protein  36.7 
 
 		 549 aa  160  1e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>