More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_3778 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_3778  chemotaxis sensory transducer, phytochrome sensor  100 
 
 
1100 aa  2248    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.275371 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4055  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with GAF sensor  44.12 
 
 
1781 aa  853    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4017  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with GAF sensor  44.12 
 
 
1781 aa  854    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0715  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with GAF sensor  35.02 
 
 
1313 aa  599  1e-170  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0403272  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0858  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with phytochrome sensor  34.33 
 
 
1406 aa  592  1e-168  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0185965  normal  0.079214 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1855  GAF sensor hybrid histidine kinase  38 
 
 
1285 aa  546  1e-154  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1210  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  36.24 
 
 
1036 aa  521  1e-146  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3339  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with GAF sensor  45.39 
 
 
1153 aa  510  1e-143  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2778  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with GAF sensor  45.39 
 
 
1153 aa  510  1e-143  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.970502 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0521  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  35.92 
 
 
1072 aa  504  1e-141  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2782  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with GAF sensor  41.51 
 
 
902 aa  484  1e-135  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1716  putative PAS/PAC sensor protein  34.47 
 
 
1099 aa  461  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1740  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.34 
 
 
1319 aa  460  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1064  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with GAF sensor  38.57 
 
 
879 aa  447  1.0000000000000001e-124  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.698769  hitchhiker  0.00000570114 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2776  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with GAF sensor  39.65 
 
 
1142 aa  448  1.0000000000000001e-124  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.380177 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0203  GAF sensor signal transduction histidine kinase  37.16 
 
 
928 aa  449  1.0000000000000001e-124  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3341  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with GAF sensor  39.65 
 
 
1142 aa  446  1e-123  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4093  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.42 
 
 
937 aa  337  5e-91  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1426  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.3 
 
 
768 aa  300  8e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.541717  normal  0.185322 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5298  signal transduction histidine kinase  39.8 
 
 
732 aa  296  1e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1425  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.02 
 
 
787 aa  283  2e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.68627  normal  0.569737 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0506  chemotaxis sensory transducer  43.32 
 
 
982 aa  246  9.999999999999999e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.202983  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4746  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.47 
 
 
503 aa  244  6e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000363987 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4950  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.14 
 
 
975 aa  241  4e-62  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2781  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with GAF sensor  31.06 
 
 
934 aa  241  5e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3745  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.23 
 
 
852 aa  240  1e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3002  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.05 
 
 
915 aa  238  4e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1015  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.42 
 
 
839 aa  234  8.000000000000001e-60  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0741142  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0720  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.82 
 
 
880 aa  233  1e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0749  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.82 
 
 
880 aa  233  1e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0819  multi-sensor hybrid histidine kinase  53.77 
 
 
844 aa  227  1e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0848  multi-sensor hybrid histidine kinase  53.77 
 
 
844 aa  227  1e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2793  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.11 
 
 
778 aa  221  6e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3735  signal transduction histidine kinase  28.83 
 
 
1183 aa  216  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.709518  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4267  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  26.74 
 
 
920 aa  215  3.9999999999999995e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.427851  normal  0.366245 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0061  chemotaxis sensory transducer  42.77 
 
 
752 aa  214  7.999999999999999e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.691552  normal  0.30416 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3246  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.42 
 
 
1105 aa  214  9e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.610597  normal  0.482443 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0415  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.22 
 
 
750 aa  213  1e-53  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4287  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.14 
 
 
854 aa  209  3e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4701  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.23 
 
 
1274 aa  208  6e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0613664  normal  0.609464 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4347  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.14 
 
 
854 aa  208  6e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4603  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.05 
 
 
820 aa  202  3e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.452141 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4301  signal transduction histidine kinase  42.55 
 
 
2693 aa  201  5e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1370  signal transduction histidine kinase  47.83 
 
 
1560 aa  193  2e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.71177  normal  0.70667 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1390  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.39 
 
 
1977 aa  192  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2901  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.04 
 
 
700 aa  190  1e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.726182  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3631  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.94 
 
 
731 aa  189  2e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.455048  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0358  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.45 
 
 
560 aa  184  7e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0237962  normal  0.734928 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4863  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.76 
 
 
686 aa  183  2e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0070905 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5039  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.76 
 
 
686 aa  182  2e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.468878  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2397  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.88 
 
 
686 aa  182  2.9999999999999997e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.688228 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4989  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.76 
 
 
686 aa  182  4e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.289293  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5305  chemotaxis sensory transducer  37.06 
 
 
686 aa  182  4e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.115158  normal  0.281343 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0475  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.36 
 
 
686 aa  182  4e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.178091  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0406  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.4 
 
 
678 aa  180  1e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01605  pilus biogenesis protein  36.97 
 
 
678 aa  179  4e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.128934  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3770  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.85 
 
 
691 aa  178  5e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2549  chemotaxis sensory transducer  37.62 
 
 
707 aa  178  6e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0511  twitching motility protein PilJ  35.71 
 
 
682 aa  177  7e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05360  twitching motility protein PilJ  35.71 
 
 
682 aa  177  8e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0128  chemotaxis sensory transducer  35.89 
 
 
537 aa  177  9.999999999999999e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5031  type IV pilus biogenesis protein PilJ  34.23 
 
 
680 aa  176  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0491  chemotaxis sensory transducer  34.82 
 
 
680 aa  176  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2156  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.09 
 
 
575 aa  175  2.9999999999999996e-42  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2098  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.29 
 
 
473 aa  175  3.9999999999999995e-42  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1245  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.58 
 
 
543 aa  174  5.999999999999999e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.403133  normal  0.310409 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3351  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.44 
 
 
759 aa  174  1e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.335724  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1815  putative chemotaxis sensory transducer  34.98 
 
 
475 aa  174  1e-41  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1374  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.63 
 
 
759 aa  173  1e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.43954  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1139  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.71 
 
 
692 aa  172  3e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.534971 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0672  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.22 
 
 
733 aa  172  4e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.371682  normal  0.522662 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3896  chemotaxis sensory transducer  36.22 
 
 
706 aa  171  9e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3018  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.57 
 
 
767 aa  170  1e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.238689  normal  0.701163 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0895  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.09 
 
 
680 aa  169  2.9999999999999998e-40  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1019  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.09 
 
 
680 aa  167  8e-40  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.58121  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3086  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.08 
 
 
678 aa  167  1.0000000000000001e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.12197 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1575  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36 
 
 
749 aa  167  1.0000000000000001e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.114033 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0904  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.47 
 
 
745 aa  165  6e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.405383 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3691  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.63 
 
 
704 aa  164  7e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.02239  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4623  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.53 
 
 
770 aa  164  8.000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.408638  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2620  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.6 
 
 
733 aa  164  1e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2898  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.54 
 
 
754 aa  162  4e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0204496  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3575  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.54 
 
 
754 aa  162  4e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.946853  normal  0.162427 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0563  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.69 
 
 
745 aa  161  8e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0615  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.69 
 
 
745 aa  160  9e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.685399  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0671  putative twitching motility transmembrane protein  32.69 
 
 
743 aa  160  1e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.357708  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1805  diguanylate cyclase with PAS/PAC and GAF sensors  40.96 
 
 
960 aa  159  3e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0517  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.55 
 
 
671 aa  157  7e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.104858  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4726  methyl-accepting chemotaxis protein  31.86 
 
 
660 aa  157  1e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.520736  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3968  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.44 
 
 
777 aa  156  2e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0103685 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2825  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.37 
 
 
570 aa  157  2e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000443347 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1373  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.14 
 
 
571 aa  154  5.9999999999999996e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0489  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  31.86 
 
 
650 aa  154  8e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3187  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.15 
 
 
745 aa  154  8e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.484204  normal  0.234759 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0613  methyl-accepting chemotaxis protein  31.56 
 
 
660 aa  154  8.999999999999999e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3311  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.48 
 
 
547 aa  153  2e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.691655  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2177  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.56 
 
 
628 aa  152  3e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0935  methyl-accepting chemotaxis protein, putative  31.31 
 
 
528 aa  152  4e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.220244  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1286  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.92 
 
 
538 aa  152  4e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1030  methyl-accepting chemotaxis protein  31.65 
 
 
549 aa  150  9e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>