More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_4017 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_4055  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with GAF sensor  99.83 
 
 
1781 aa  3645    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3778  chemotaxis sensory transducer, phytochrome sensor  44.12 
 
 
1100 aa  879    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.275371 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0858  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with phytochrome sensor  31.86 
 
 
1406 aa  655    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0185965  normal  0.079214 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4017  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with GAF sensor  100 
 
 
1781 aa  3652    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0715  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with GAF sensor  33.41 
 
 
1313 aa  659    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0403272  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1210  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  37.94 
 
 
1036 aa  532  1e-149  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1716  putative PAS/PAC sensor protein  32.58 
 
 
1099 aa  528  1e-148  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1740  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.95 
 
 
1319 aa  527  1e-148  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1855  GAF sensor hybrid histidine kinase  35.25 
 
 
1285 aa  519  1.0000000000000001e-145  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2778  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with GAF sensor  40.9 
 
 
1153 aa  464  1e-129  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.970502 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3339  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with GAF sensor  40.9 
 
 
1153 aa  464  1e-129  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2782  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with GAF sensor  40.29 
 
 
902 aa  449  1.0000000000000001e-124  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0521  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  32.41 
 
 
1072 aa  447  1.0000000000000001e-124  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3341  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with GAF sensor  39.08 
 
 
1142 aa  431  1e-119  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2776  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with GAF sensor  39.14 
 
 
1142 aa  433  1e-119  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.380177 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0203  GAF sensor signal transduction histidine kinase  36.64 
 
 
928 aa  409  1.0000000000000001e-112  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1064  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with GAF sensor  35.02 
 
 
879 aa  377  1e-103  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.698769  hitchhiker  0.00000570114 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1426  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.87 
 
 
768 aa  314  1e-83  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.541717  normal  0.185322 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4093  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.89 
 
 
937 aa  308  4.0000000000000004e-82  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1425  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.14 
 
 
787 aa  288  9e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.68627  normal  0.569737 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3745  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.41 
 
 
852 aa  255  7e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0506  chemotaxis sensory transducer  44.41 
 
 
982 aa  250  2e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.202983  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2793  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.14 
 
 
778 aa  247  9.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4950  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.81 
 
 
975 aa  248  9.999999999999999e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0720  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.64 
 
 
880 aa  245  3.9999999999999997e-63  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0749  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.64 
 
 
880 aa  245  3.9999999999999997e-63  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1015  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.64 
 
 
839 aa  244  2e-62  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0741142  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3002  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.99 
 
 
915 aa  242  4e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4746  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.43 
 
 
503 aa  241  1e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000363987 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5298  signal transduction histidine kinase  32.82 
 
 
732 aa  241  1e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1370  signal transduction histidine kinase  28.79 
 
 
1560 aa  229  3e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.71177  normal  0.70667 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0061  chemotaxis sensory transducer  42.01 
 
 
752 aa  229  4e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.691552  normal  0.30416 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3246  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.67 
 
 
1105 aa  225  7e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.610597  normal  0.482443 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4267  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  27.38 
 
 
920 aa  223  1.9999999999999999e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.427851  normal  0.366245 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0415  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.05 
 
 
750 aa  222  6e-56  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2781  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with GAF sensor  33.53 
 
 
934 aa  219  2.9999999999999998e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4603  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.82 
 
 
820 aa  218  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.452141 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3735  signal transduction histidine kinase  26.77 
 
 
1183 aa  212  5e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.709518  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4347  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.43 
 
 
854 aa  212  5e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4287  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.43 
 
 
854 aa  212  5e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0475  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.47 
 
 
686 aa  195  7e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.178091  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1245  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.39 
 
 
543 aa  195  8e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.403133  normal  0.310409 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2397  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.1 
 
 
686 aa  192  4e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.688228 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5039  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.19 
 
 
686 aa  192  5.999999999999999e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.468878  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4863  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.19 
 
 
686 aa  191  7e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0070905 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3631  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.45 
 
 
731 aa  191  9e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.455048  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4989  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.19 
 
 
686 aa  191  1e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.289293  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2156  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.17 
 
 
575 aa  189  5e-46  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2901  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.42 
 
 
700 aa  188  7e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.726182  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5305  chemotaxis sensory transducer  33.91 
 
 
686 aa  187  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.115158  normal  0.281343 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1374  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.51 
 
 
759 aa  187  1.0000000000000001e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.43954  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0511  twitching motility protein PilJ  35.04 
 
 
682 aa  186  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05360  twitching motility protein PilJ  35.04 
 
 
682 aa  186  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0491  chemotaxis sensory transducer  33.9 
 
 
680 aa  185  6e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0406  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.47 
 
 
678 aa  185  8.000000000000001e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5031  type IV pilus biogenesis protein PilJ  33.62 
 
 
680 aa  184  1e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0128  chemotaxis sensory transducer  32.16 
 
 
537 aa  181  8e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2098  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.35 
 
 
473 aa  181  1e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1815  putative chemotaxis sensory transducer  35.17 
 
 
475 aa  179  3e-43  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1575  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.9 
 
 
749 aa  179  3e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.114033 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3770  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.94 
 
 
691 aa  179  5e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0358  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.52 
 
 
560 aa  178  9e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0237962  normal  0.734928 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3018  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.86 
 
 
767 aa  177  9.999999999999999e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.238689  normal  0.701163 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0904  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.93 
 
 
745 aa  178  9.999999999999999e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.405383 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0672  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.93 
 
 
733 aa  177  9.999999999999999e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.371682  normal  0.522662 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0563  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.53 
 
 
745 aa  177  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0615  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.53 
 
 
745 aa  177  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.685399  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3575  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.87 
 
 
754 aa  177  1.9999999999999998e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.946853  normal  0.162427 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2898  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.87 
 
 
754 aa  176  2.9999999999999996e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0204496  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3896  chemotaxis sensory transducer  35.45 
 
 
706 aa  176  2.9999999999999996e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1139  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.28 
 
 
692 aa  176  3.9999999999999995e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.534971 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4225  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.28 
 
 
1322 aa  175  6.999999999999999e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3351  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.62 
 
 
759 aa  174  2e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.335724  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4623  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.34 
 
 
770 aa  173  2e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.408638  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2549  chemotaxis sensory transducer  32.75 
 
 
707 aa  173  2e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0671  putative twitching motility transmembrane protein  32.93 
 
 
743 aa  172  4e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.357708  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01605  pilus biogenesis protein  34.05 
 
 
678 aa  172  4e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.128934  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2620  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.44 
 
 
733 aa  171  1e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0895  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.74 
 
 
680 aa  170  2e-40  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1019  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.74 
 
 
680 aa  169  5e-40  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.58121  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3187  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.53 
 
 
745 aa  167  1.0000000000000001e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.484204  normal  0.234759 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3691  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.36 
 
 
704 aa  167  2.0000000000000002e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.02239  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1805  diguanylate cyclase with PAS/PAC and GAF sensors  36.07 
 
 
960 aa  166  4.0000000000000004e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3968  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.43 
 
 
777 aa  164  2e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0103685 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0819  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.23 
 
 
844 aa  163  3e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0848  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.23 
 
 
844 aa  163  3e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1543  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.68 
 
 
947 aa  163  4e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.393804  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0517  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.35 
 
 
671 aa  162  5e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.104858  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3086  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.74 
 
 
678 aa  160  2e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.12197 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0489  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.66 
 
 
660 aa  159  6e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1390  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.25 
 
 
1977 aa  158  8e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4631  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.23 
 
 
1672 aa  158  8e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.659803  normal  0.0232391 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2825  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.96 
 
 
570 aa  157  1e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000443347 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2782  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.05 
 
 
601 aa  154  2e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.163256  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4301  signal transduction histidine kinase  34.77 
 
 
2693 aa  152  5e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00480  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.38 
 
 
676 aa  152  8e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1030  methyl-accepting chemotaxis protein  32.69 
 
 
549 aa  150  1.0000000000000001e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1373  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.57 
 
 
571 aa  151  1.0000000000000001e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1578  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.03 
 
 
663 aa  150  2.0000000000000003e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.365209  normal  0.192344 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0582  methyl-accepting chemotaxis protein  31.96 
 
 
696 aa  149  3e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>