More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_0715 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011726  PCC8801_4017  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with GAF sensor  33.26 
 
 
1781 aa  644    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0858  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with phytochrome sensor  41.8 
 
 
1406 aa  1001    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0185965  normal  0.079214 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0715  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with GAF sensor  100 
 
 
1313 aa  2687    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0403272  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4055  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with GAF sensor  33.23 
 
 
1781 aa  641    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3778  chemotaxis sensory transducer, phytochrome sensor  34.68 
 
 
1100 aa  612  1e-173  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.275371 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1064  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with GAF sensor  42.19 
 
 
879 aa  566  1.0000000000000001e-159  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.698769  hitchhiker  0.00000570114 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2782  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with GAF sensor  40.89 
 
 
902 aa  520  1e-146  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3339  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with GAF sensor  40.56 
 
 
1153 aa  516  1e-144  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2778  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with GAF sensor  40.56 
 
 
1153 aa  516  1e-144  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.970502 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4093  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.3 
 
 
937 aa  509  9.999999999999999e-143  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2776  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with GAF sensor  39.79 
 
 
1142 aa  483  1e-135  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.380177 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3341  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with GAF sensor  39.79 
 
 
1142 aa  483  1e-134  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1855  GAF sensor hybrid histidine kinase  32.29 
 
 
1285 aa  404  1e-111  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1716  putative PAS/PAC sensor protein  27.74 
 
 
1099 aa  358  2.9999999999999997e-97  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1740  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.39 
 
 
1319 aa  358  3.9999999999999996e-97  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0521  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  30.22 
 
 
1072 aa  348  3e-94  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1210  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  30.25 
 
 
1036 aa  335  3e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0203  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.55 
 
 
928 aa  301  6e-80  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1426  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.13 
 
 
768 aa  281  6e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.541717  normal  0.185322 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1425  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.01 
 
 
787 aa  265  4.999999999999999e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.68627  normal  0.569737 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3745  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.49 
 
 
852 aa  249  2e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0415  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.52 
 
 
750 aa  246  9.999999999999999e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1015  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.44 
 
 
839 aa  244  6e-63  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0741142  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3735  signal transduction histidine kinase  31.01 
 
 
1183 aa  243  2e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.709518  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2781  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with GAF sensor  30.76 
 
 
934 aa  241  5e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0061  chemotaxis sensory transducer  44.2 
 
 
752 aa  241  5.999999999999999e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.691552  normal  0.30416 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5298  signal transduction histidine kinase  35.09 
 
 
732 aa  237  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2793  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.48 
 
 
778 aa  236  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4950  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.33 
 
 
975 aa  233  2e-59  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0506  chemotaxis sensory transducer  39.12 
 
 
982 aa  230  1e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.202983  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3002  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.61 
 
 
915 aa  230  1e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0749  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.83 
 
 
880 aa  228  9e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0720  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.83 
 
 
880 aa  228  9e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4746  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.56 
 
 
503 aa  227  1e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000363987 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4603  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.48 
 
 
820 aa  214  7e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.452141 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3246  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.31 
 
 
1105 aa  205  4e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.610597  normal  0.482443 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1815  putative chemotaxis sensory transducer  35.85 
 
 
475 aa  196  3e-48  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4701  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.37 
 
 
1274 aa  196  3e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0613664  normal  0.609464 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4287  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.36 
 
 
854 aa  194  7e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4347  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.36 
 
 
854 aa  194  7e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2098  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36 
 
 
473 aa  194  1e-47  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1390  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.9 
 
 
1977 aa  190  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01605  pilus biogenesis protein  35.6 
 
 
678 aa  189  4e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.128934  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2901  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.23 
 
 
700 aa  187  1.0000000000000001e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.726182  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5305  chemotaxis sensory transducer  34.2 
 
 
686 aa  183  1e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.115158  normal  0.281343 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0674  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.38 
 
 
1021 aa  184  1e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2156  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.56 
 
 
575 aa  182  2.9999999999999997e-44  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2397  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.85 
 
 
686 aa  182  2.9999999999999997e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.688228 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0511  twitching motility protein PilJ  33.78 
 
 
682 aa  182  4e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05360  twitching motility protein PilJ  33.78 
 
 
682 aa  182  4e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0406  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.16 
 
 
678 aa  181  9e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0358  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.01 
 
 
560 aa  180  1e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0237962  normal  0.734928 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1019  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.47 
 
 
680 aa  179  2e-43  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.58121  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5031  type IV pilus biogenesis protein PilJ  34.87 
 
 
680 aa  180  2e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3631  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.9 
 
 
731 aa  179  3e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.455048  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0895  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.14 
 
 
680 aa  179  4e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0475  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.05 
 
 
686 aa  178  5e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.178091  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3086  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.91 
 
 
678 aa  178  5e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.12197 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4210  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.08 
 
 
612 aa  178  6e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3770  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.23 
 
 
691 aa  178  6e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0491  chemotaxis sensory transducer  34.58 
 
 
680 aa  177  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3896  chemotaxis sensory transducer  34.48 
 
 
706 aa  177  9.999999999999999e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0128  chemotaxis sensory transducer  34.78 
 
 
537 aa  177  9.999999999999999e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4863  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.56 
 
 
686 aa  174  7.999999999999999e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0070905 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4989  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.56 
 
 
686 aa  174  1e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.289293  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5039  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.56 
 
 
686 aa  174  1e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.468878  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2549  chemotaxis sensory transducer  33.75 
 
 
707 aa  171  1e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1245  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.33 
 
 
543 aa  170  2e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.403133  normal  0.310409 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0904  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.19 
 
 
745 aa  167  9e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.405383 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3018  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.95 
 
 
767 aa  167  1.0000000000000001e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.238689  normal  0.701163 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2898  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.77 
 
 
754 aa  167  2.0000000000000002e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0204496  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3575  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.77 
 
 
754 aa  166  2.0000000000000002e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.946853  normal  0.162427 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1374  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.43 
 
 
759 aa  164  7e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.43954  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3457  multi-sensor hybrid histidine kinase  48.52 
 
 
1070 aa  164  1e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4623  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.51 
 
 
770 aa  163  2e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.408638  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2674  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.89 
 
 
1305 aa  162  3e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1805  diguanylate cyclase with PAS/PAC and GAF sensors  44.2 
 
 
960 aa  161  8e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2659  multi-sensor hybrid histidine kinase  47.93 
 
 
1070 aa  160  1e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.337944  normal  0.276356 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4345  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  43.48 
 
 
890 aa  160  2e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.5665  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4421  GAF sensor signal transduction histidine kinase  36.56 
 
 
457 aa  158  5.0000000000000005e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.45422 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1575  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.13 
 
 
749 aa  157  1e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.114033 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1139  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.89 
 
 
692 aa  157  1e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.534971 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3968  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.05 
 
 
777 aa  157  1e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0103685 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0517  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.45 
 
 
671 aa  156  2e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.104858  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0366  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  41.8 
 
 
1081 aa  156  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3691  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.33 
 
 
704 aa  154  1e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.02239  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3613  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.08 
 
 
1808 aa  154  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.643019 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3351  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.58 
 
 
759 aa  151  8e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.335724  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3187  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.17 
 
 
745 aa  150  1.0000000000000001e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.484204  normal  0.234759 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3673  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with GAF sensor  42.22 
 
 
1262 aa  150  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0671  putative twitching motility transmembrane protein  29.39 
 
 
743 aa  148  8.000000000000001e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.357708  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0563  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.11 
 
 
745 aa  147  2e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0615  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.11 
 
 
745 aa  147  2e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.685399  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3004  Signal transduction histidine kinase  38.94 
 
 
941 aa  146  3e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2620  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.3 
 
 
733 aa  145  4e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0828  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with GAF sensor  39.66 
 
 
734 aa  144  7e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.84548  normal  0.140102 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1113  signal transduction histidine kinase  40 
 
 
723 aa  144  8e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4301  signal transduction histidine kinase  42.86 
 
 
2693 aa  144  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0672  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.63 
 
 
733 aa  144  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.371682  normal  0.522662 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2177  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.68 
 
 
628 aa  142  4.999999999999999e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>