More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_3735 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_3735  signal transduction histidine kinase  100 
 
 
1183 aa  2412    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.709518  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0203  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27.67 
 
 
928 aa  270  1e-70  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1855  GAF sensor hybrid histidine kinase  31.64 
 
 
1285 aa  248  6.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1002  signal transduction histidine kinase  55.71 
 
 
932 aa  247  9e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.353608  normal  0.0662086 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0715  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with GAF sensor  31.01 
 
 
1313 aa  243  1e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0403272  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1001  signal transduction histidine kinase  55.36 
 
 
674 aa  242  2e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.58641  normal  0.0795268 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4301  signal transduction histidine kinase  41.13 
 
 
2693 aa  239  3e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1210  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  30.44 
 
 
1036 aa  237  1.0000000000000001e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1390  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.72 
 
 
1977 aa  235  4.0000000000000004e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5298  signal transduction histidine kinase  38.35 
 
 
732 aa  235  4.0000000000000004e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4136  signal transduction histidine kinase  51.43 
 
 
790 aa  230  9e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1805  diguanylate cyclase with PAS/PAC and GAF sensors  38.55 
 
 
960 aa  229  3e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3457  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.06 
 
 
1070 aa  227  1e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4210  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.58 
 
 
612 aa  224  8e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3504  signal transduction histidine kinase  53.12 
 
 
585 aa  223  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0759377  normal  0.354882 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1716  putative PAS/PAC sensor protein  30.65 
 
 
1099 aa  223  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1740  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.49 
 
 
1319 aa  222  3e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2659  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.42 
 
 
1070 aa  218  7e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.337944  normal  0.276356 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3778  chemotaxis sensory transducer, phytochrome sensor  29.08 
 
 
1100 aa  215  3.9999999999999995e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.275371 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4137  signal transduction histidine kinase  50.86 
 
 
912 aa  215  3.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0674  multi-sensor hybrid histidine kinase  51.64 
 
 
1021 aa  213  1e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4139  signal transduction histidine kinase  50.67 
 
 
913 aa  213  2e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.329059 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0521  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  27.36 
 
 
1072 aa  209  2e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3771  multi-sensor hybrid histidine kinase  52.33 
 
 
714 aa  210  2e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.756709  normal  0.201817 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4138  signal transduction histidine kinase  51.1 
 
 
1051 aa  204  6e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.35585 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3004  Signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
941 aa  204  8e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1370  signal transduction histidine kinase  32.13 
 
 
1560 aa  203  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.71177  normal  0.70667 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4017  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with GAF sensor  26.9 
 
 
1781 aa  199  3e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4055  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with GAF sensor  26.9 
 
 
1781 aa  198  5.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0828  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with GAF sensor  53.59 
 
 
734 aa  198  6e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.84548  normal  0.140102 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4325  Signal transduction histidine kinase  44.25 
 
 
1654 aa  197  9e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4093  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.05 
 
 
937 aa  197  9e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4345  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  51.34 
 
 
890 aa  194  6e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.5665  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3613  multi-sensor hybrid histidine kinase  47 
 
 
1808 aa  193  1e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.643019 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0440  signal transduction histidine kinase  45.62 
 
 
1093 aa  191  8e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.790224  normal  0.127185 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1113  signal transduction histidine kinase  52.33 
 
 
723 aa  191  9e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4417  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.71 
 
 
1548 aa  190  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.409401 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0429  signal transduction histidine kinase  45.58 
 
 
1093 aa  189  2e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0858  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with phytochrome sensor  27.81 
 
 
1406 aa  190  2e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0185965  normal  0.079214 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1064  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with GAF sensor  34.61 
 
 
879 aa  188  4e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.698769  hitchhiker  0.00000570114 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2674  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.9 
 
 
1305 aa  187  9e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0366  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  45.45 
 
 
1081 aa  187  9e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1431  diguanylate cyclase with PAS/PAC and GAF sensors  43.55 
 
 
625 aa  187  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1457  diguanylate cyclase with PAS/PAC and GAF sensors  43.55 
 
 
624 aa  187  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.659998  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0238  multi-component transcriptional regulator  45.79 
 
 
1629 aa  186  2.0000000000000003e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1729  signal transduction histidine kinase  45.16 
 
 
964 aa  183  2e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0370864  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3763  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.89 
 
 
1255 aa  182  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3771  multi-sensor hybrid histidine kinase  49.46 
 
 
1391 aa  181  7e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4421  GAF sensor signal transduction histidine kinase  46.67 
 
 
457 aa  180  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.45422 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3561  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  49.22 
 
 
1051 aa  179  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0205417  normal  0.226343 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2782  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with GAF sensor  41.44 
 
 
902 aa  179  3e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1972  signal transduction histidine kinase  42.01 
 
 
815 aa  178  5e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000691031  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4563  signal transduction histidine kinase  42.11 
 
 
771 aa  177  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.633448 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4701  multi-sensor hybrid histidine kinase  43 
 
 
1274 aa  176  1.9999999999999998e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0613664  normal  0.609464 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0064  Signal transduction histidine kinase  39.22 
 
 
1714 aa  176  2.9999999999999996e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.274411 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2234  signal transduction histidine kinase  40.94 
 
 
1676 aa  176  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.900765 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0848  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.44 
 
 
844 aa  174  7.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0819  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.44 
 
 
844 aa  174  9e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4631  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.7 
 
 
1672 aa  172  4e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.659803  normal  0.0232391 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0896  signal transduction histidine kinase  40.6 
 
 
839 aa  171  7e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.335338  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3010  signal transduction histidine kinase  39.53 
 
 
488 aa  171  1e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0663481  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4431  signal transduction histidine kinase  42.72 
 
 
767 aa  169  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.222195  normal  0.392293 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1158  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  42.93 
 
 
1047 aa  169  2.9999999999999998e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.122124  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2710  hypothetical protein  37.89 
 
 
744 aa  168  5e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3673  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with GAF sensor  49.42 
 
 
1262 aa  168  5.9999999999999996e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4528  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  44.08 
 
 
1668 aa  166  3e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0790  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.2 
 
 
566 aa  166  3e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.391268  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0913  multisensor signal transduction histidine kinase  40.55 
 
 
991 aa  165  4.0000000000000004e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.650855  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0288  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.2 
 
 
884 aa  164  1e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1234  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  42.34 
 
 
1663 aa  164  1e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.745042  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3009  hypothetical protein  35.62 
 
 
783 aa  164  1e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0320  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.99 
 
 
838 aa  163  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.88782 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1496  signal transduction histidine kinase  39.47 
 
 
1253 aa  163  2e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.172842 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1806  signal transduction histidine kinase  38.5 
 
 
681 aa  163  2e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.286721 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5074  signal transduction histidine kinase  37.34 
 
 
479 aa  162  3e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.473035 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3899  signal transduction histidine kinase  41.63 
 
 
613 aa  162  4e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.796516 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1666  sensory transduction histidine kinase  39.83 
 
 
945 aa  162  4e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.515191  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2336  signal transduction histidine kinase  42.41 
 
 
3706 aa  161  7e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2150  signal transduction histidine kinase  41.85 
 
 
945 aa  159  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2118  signal transduction histidine kinase  39.73 
 
 
572 aa  160  2e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1723  signal transduction histidine kinase  38.71 
 
 
764 aa  160  2e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0936  signal transduction histidine kinase  41.89 
 
 
1177 aa  159  4e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.194621  normal  0.0190935 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2534  diguanylate cyclase with GAF sensor  43.68 
 
 
421 aa  158  5.0000000000000005e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.657544  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2636  signal transduction histidine kinase  37.44 
 
 
1051 aa  158  6e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1005  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  31.79 
 
 
646 aa  156  2e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.442988  decreased coverage  0.0000217029 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1944  signal-transducing histidine kinase  36.18 
 
 
1248 aa  156  2.9999999999999998e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.318144  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3509  signal transduction histidine kinase  41.59 
 
 
439 aa  155  4e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.2468 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1812  signal transduction histidine kinase  41.71 
 
 
1390 aa  153  2e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.155927 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5451  signal transduction histidine kinase  39.29 
 
 
547 aa  152  3e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.915879  normal  0.94618 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1564  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.45 
 
 
1550 aa  152  3e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.047002  normal  0.324166 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0299  two component sensor histidine kinase  38.71 
 
 
1239 aa  152  3e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.669336  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3538  hypothetical protein  35.96 
 
 
754 aa  151  8e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0655709  normal  0.940328 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2776  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with GAF sensor  39.19 
 
 
1142 aa  151  9e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.380177 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3341  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with GAF sensor  40.72 
 
 
1142 aa  150  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0404  hypothetical protein  35.96 
 
 
1182 aa  150  1.0000000000000001e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.465468  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3596  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  40.57 
 
 
2017 aa  150  1.0000000000000001e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.107255 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3339  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with GAF sensor  43.09 
 
 
1153 aa  150  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2778  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with GAF sensor  43.09 
 
 
1153 aa  150  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.970502 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1082  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.35 
 
 
1068 aa  149  3e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.31862 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2935  sensory transduction histidine kinase  35.04 
 
 
892 aa  149  4.0000000000000006e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0108419  normal  0.0385268 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>