More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_4093 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_4093  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  100 
 
 
937 aa  1922    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0858  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with phytochrome sensor  38.23 
 
 
1406 aa  542  9.999999999999999e-153  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0185965  normal  0.079214 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0715  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with GAF sensor  34.3 
 
 
1313 aa  506  1e-141  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0403272  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1064  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with GAF sensor  36.32 
 
 
879 aa  426  1e-117  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.698769  hitchhiker  0.00000570114 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2782  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with GAF sensor  32.41 
 
 
902 aa  354  5.9999999999999994e-96  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1855  GAF sensor hybrid histidine kinase  34.91 
 
 
1285 aa  352  3e-95  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3778  chemotaxis sensory transducer, phytochrome sensor  29.4 
 
 
1100 aa  348  3e-94  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.275371 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2776  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with GAF sensor  34.1 
 
 
1142 aa  344  5e-93  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.380177 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3341  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with GAF sensor  33.9 
 
 
1142 aa  343  9e-93  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3339  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with GAF sensor  32.46 
 
 
1153 aa  338  2.9999999999999997e-91  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2778  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with GAF sensor  32.46 
 
 
1153 aa  338  2.9999999999999997e-91  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.970502 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0521  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  32.71 
 
 
1072 aa  313  1e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1740  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.26 
 
 
1319 aa  310  5.9999999999999995e-83  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1716  putative PAS/PAC sensor protein  34.87 
 
 
1099 aa  310  8e-83  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0203  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.26 
 
 
928 aa  305  4.0000000000000003e-81  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4055  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with GAF sensor  31.64 
 
 
1781 aa  293  9e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4017  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with GAF sensor  31.64 
 
 
1781 aa  293  1e-77  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1210  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  32.38 
 
 
1036 aa  271  4e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5298  signal transduction histidine kinase  34.75 
 
 
732 aa  232  2e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2781  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with GAF sensor  28.89 
 
 
934 aa  202  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4701  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.8 
 
 
1274 aa  201  7.999999999999999e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0613664  normal  0.609464 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3735  signal transduction histidine kinase  41.05 
 
 
1183 aa  197  9e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.709518  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1390  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.81 
 
 
1977 aa  184  7e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4345  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  49.39 
 
 
890 aa  172  2e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.5665  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0674  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.63 
 
 
1021 aa  166  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0828  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with GAF sensor  45.45 
 
 
734 aa  165  3e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.84548  normal  0.140102 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4210  GAF sensor signal transduction histidine kinase  39.05 
 
 
612 aa  163  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3457  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.96 
 
 
1070 aa  160  1e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4267  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  25.37 
 
 
920 aa  159  3e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.427851  normal  0.366245 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3004  Signal transduction histidine kinase  34.45 
 
 
941 aa  157  7e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2659  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.34 
 
 
1070 aa  155  2e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.337944  normal  0.276356 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3763  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.59 
 
 
1255 aa  154  5.9999999999999996e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1113  signal transduction histidine kinase  40.59 
 
 
723 aa  153  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2674  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.45 
 
 
1305 aa  152  3e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0064  Signal transduction histidine kinase  35.68 
 
 
1714 aa  152  3e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.274411 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1805  diguanylate cyclase with PAS/PAC and GAF sensors  41.95 
 
 
960 aa  150  8e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4421  GAF sensor signal transduction histidine kinase  45.09 
 
 
457 aa  150  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.45422 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3771  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.05 
 
 
714 aa  148  4.0000000000000006e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.756709  normal  0.201817 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3613  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.55 
 
 
1808 aa  144  6e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.643019 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0320  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.67 
 
 
838 aa  144  9e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.88782 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3596  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  31.41 
 
 
2017 aa  143  1.9999999999999998e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.107255 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2534  diguanylate cyclase with GAF sensor  42.68 
 
 
421 aa  141  6e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.657544  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3673  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with GAF sensor  42.07 
 
 
1262 aa  140  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3771  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.04 
 
 
1391 aa  139  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0366  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  34.45 
 
 
1081 aa  138  5e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4417  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.33 
 
 
1548 aa  137  9e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.409401 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1370  signal transduction histidine kinase  40 
 
 
1560 aa  136  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.71177  normal  0.70667 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4301  signal transduction histidine kinase  39.89 
 
 
2693 aa  135  5e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1564  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.49 
 
 
1550 aa  130  1.0000000000000001e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.047002  normal  0.324166 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0790  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.02 
 
 
566 aa  130  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.391268  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0288  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.01 
 
 
884 aa  129  2.0000000000000002e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0848  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.91 
 
 
844 aa  121  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0819  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.91 
 
 
844 aa  121  6e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2524  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  31.51 
 
 
751 aa  116  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.45421 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1457  diguanylate cyclase with PAS/PAC and GAF sensors  33.53 
 
 
624 aa  115  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.659998  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1431  diguanylate cyclase with PAS/PAC and GAF sensors  33.53 
 
 
625 aa  115  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5112  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.03 
 
 
1252 aa  110  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.758591 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2096  diguanylate cyclase with GAF sensor  37.04 
 
 
664 aa  106  2e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.76184 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3479  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.5 
 
 
744 aa  105  4e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.209747 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2624  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.5 
 
 
744 aa  105  4e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3302  GAF sensor hybrid histidine kinase  30.8 
 
 
763 aa  102  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2814  GAF sensor hybrid histidine kinase  30.8 
 
 
763 aa  102  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.155467  normal  0.302046 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5069  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.53 
 
 
748 aa  101  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.801669 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4225  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.69 
 
 
1322 aa  97.8  7e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0446  multi-sensor signal transduction histidine kinase  22.22 
 
 
1527 aa  97.1  1e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1168  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  26.15 
 
 
676 aa  96.7  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3764  putative GAF sensor protein  36.23 
 
 
217 aa  95.9  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0939497 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0447  multi-sensor signal transduction histidine kinase  21.52 
 
 
1527 aa  93.2  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.13903  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3204  sensor protein  34.56 
 
 
179 aa  92  4e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0532438 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0561  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27.68 
 
 
640 aa  90.1  2e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.393536  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4631  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.57 
 
 
1672 aa  89  4e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.659803  normal  0.0232391 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0418  multi-sensor signal transduction histidine kinase  21.03 
 
 
1527 aa  88.6  4e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1418  GAF sensor hybrid histidine kinase  31.47 
 
 
853 aa  86.7  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.237881  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4749  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.95 
 
 
792 aa  85.5  0.000000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.157892  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4151  multi-sensor signal transduction histidine kinase  22.79 
 
 
1519 aa  83.6  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0865128  normal  0.147126 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0644  GAF sensor hybrid histidine kinase  30.93 
 
 
754 aa  81.6  0.00000000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5235  GAF sensor hybrid histidine kinase  32.39 
 
 
757 aa  77.8  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5111  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  30.43 
 
 
479 aa  77.4  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1425  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  23.2 
 
 
787 aa  73.9  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.68627  normal  0.569737 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1426  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.07 
 
 
768 aa  73.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.541717  normal  0.185322 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2222  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  31.14 
 
 
732 aa  73.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.513474  normal  0.0596169 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2160  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  31.14 
 
 
732 aa  73.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2901  GAF sensor hybrid histidine kinase  32.65 
 
 
733 aa  71.6  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.248575  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2847  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27.52 
 
 
668 aa  69.3  0.0000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.29213  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1264  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor(s)  21.59 
 
 
584 aa  67.4  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2205  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.45 
 
 
887 aa  67.4  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.188088 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1295  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor(s)  23.28 
 
 
584 aa  65.9  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4452  multi-sensor signal transduction histidine kinase  22.11 
 
 
2153 aa  65.9  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.758306 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0061  chemotaxis sensory transducer  24.33 
 
 
752 aa  63.9  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.691552  normal  0.30416 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1029  multi-sensor hybrid histidine kinase  22.42 
 
 
1820 aa  63.9  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.165868 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4723  GAF sensor Signal transduction histidine kinase  26.6 
 
 
670 aa  62.4  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3155  adenylate/guanylate cyclase  31.31 
 
 
1172 aa  62.4  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.386213  hitchhiker  0.00095291 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1120  GAF sensor signal transduction histidine kinase  28.21 
 
 
577 aa  62  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0805  multi-sensor signal transduction histidine kinase  21.76 
 
 
2161 aa  61.2  0.00000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.354922 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2239  adenylate/guanylate cyclase  25.57 
 
 
1156 aa  60.1  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.159061  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0852  GAF sensor hybrid histidine kinase  19.81 
 
 
1055 aa  58.9  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1015  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  22.4 
 
 
839 aa  57.4  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0741142  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1502  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  26.7 
 
 
311 aa  57  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1475  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  26.7 
 
 
311 aa  57  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3852  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 
765 aa  56.2  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>