134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_3764 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_3764  putative GAF sensor protein  100 
 
 
217 aa  451  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0939497 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3204  sensor protein  62.03 
 
 
179 aa  207  1e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0532438 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4301  signal transduction histidine kinase  41.61 
 
 
2693 aa  139  3e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0828  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with GAF sensor  40.79 
 
 
734 aa  130  1.0000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.84548  normal  0.140102 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1457  diguanylate cyclase with PAS/PAC and GAF sensors  41.3 
 
 
624 aa  125  7e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.659998  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1431  diguanylate cyclase with PAS/PAC and GAF sensors  41.3 
 
 
625 aa  124  8.000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3735  signal transduction histidine kinase  38 
 
 
1183 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.709518  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3673  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with GAF sensor  40.74 
 
 
1262 aa  119  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5298  signal transduction histidine kinase  36.94 
 
 
732 aa  115  5e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4421  GAF sensor signal transduction histidine kinase  38.06 
 
 
457 aa  112  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.45422 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1855  GAF sensor hybrid histidine kinase  36.13 
 
 
1285 aa  112  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2781  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with GAF sensor  36.23 
 
 
934 aa  112  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2674  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.95 
 
 
1305 aa  111  9e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2776  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with GAF sensor  36.24 
 
 
1142 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.380177 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0203  GAF sensor signal transduction histidine kinase  36.84 
 
 
928 aa  110  1.0000000000000001e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3341  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with GAF sensor  36.24 
 
 
1142 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4210  GAF sensor signal transduction histidine kinase  36.81 
 
 
612 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0674  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.65 
 
 
1021 aa  109  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4345  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  32.97 
 
 
890 aa  109  3e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.5665  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3613  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.92 
 
 
1808 aa  107  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.643019 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3457  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.46 
 
 
1070 aa  106  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0366  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  32.89 
 
 
1081 aa  106  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3763  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.16 
 
 
1255 aa  105  6e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0715  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with GAF sensor  32.74 
 
 
1313 aa  104  8e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0403272  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3771  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.9 
 
 
1391 aa  102  6e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2659  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.78 
 
 
1070 aa  102  6e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.337944  normal  0.276356 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0320  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.24 
 
 
838 aa  101  7e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.88782 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1113  signal transduction histidine kinase  30.46 
 
 
723 aa  101  9e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2782  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with GAF sensor  34.13 
 
 
902 aa  100  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2534  diguanylate cyclase with GAF sensor  34.21 
 
 
421 aa  99.4  3e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.657544  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1805  diguanylate cyclase with PAS/PAC and GAF sensors  35.53 
 
 
960 aa  98.6  6e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0790  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.62 
 
 
566 aa  98.6  6e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.391268  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1390  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.77 
 
 
1977 aa  97.4  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1210  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  34.38 
 
 
1036 aa  95.9  4e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4093  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.23 
 
 
937 aa  95.9  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3771  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 
714 aa  95.5  6e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.756709  normal  0.201817 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2524  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  31.72 
 
 
751 aa  94.4  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.45421 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4701  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.55 
 
 
1274 aa  94.4  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0613664  normal  0.609464 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0858  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with phytochrome sensor  34.97 
 
 
1406 aa  94.4  1e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0185965  normal  0.079214 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3596  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  31.37 
 
 
2017 aa  93.6  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.107255 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1740  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.19 
 
 
1319 aa  92.8  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1716  putative PAS/PAC sensor protein  34.19 
 
 
1099 aa  93.2  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1370  signal transduction histidine kinase  34.51 
 
 
1560 aa  93.2  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.71177  normal  0.70667 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3004  Signal transduction histidine kinase  34.08 
 
 
941 aa  92.4  5e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1064  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with GAF sensor  32.28 
 
 
879 aa  91.7  8e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.698769  hitchhiker  0.00000570114 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4417  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.61 
 
 
1548 aa  87.8  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.409401 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0064  Signal transduction histidine kinase  30.56 
 
 
1714 aa  86.3  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.274411 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0521  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  27.74 
 
 
1072 aa  84.7  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0288  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.14 
 
 
884 aa  83.2  0.000000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2096  diguanylate cyclase with GAF sensor  27.74 
 
 
664 aa  80.1  0.00000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.76184 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2778  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with GAF sensor  30.2 
 
 
1153 aa  79  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.970502 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3339  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with GAF sensor  30.2 
 
 
1153 aa  79  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0848  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.92 
 
 
844 aa  78.2  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0819  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.92 
 
 
844 aa  78.2  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3302  GAF sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 
763 aa  75.5  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2814  GAF sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 
763 aa  75.5  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.155467  normal  0.302046 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2901  GAF sensor hybrid histidine kinase  30.56 
 
 
733 aa  74.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.248575  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1168  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  27.59 
 
 
676 aa  73.9  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0561  GAF sensor signal transduction histidine kinase  26.26 
 
 
640 aa  72.8  0.000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.393536  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3778  chemotaxis sensory transducer, phytochrome sensor  25.14 
 
 
1100 aa  71.6  0.000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.275371 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4017  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with GAF sensor  28.29 
 
 
1781 aa  70.9  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4055  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with GAF sensor  28.29 
 
 
1781 aa  70.9  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5112  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.66 
 
 
1252 aa  68.9  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.758591 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1564  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.82 
 
 
1550 aa  66.6  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.047002  normal  0.324166 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4631  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.38 
 
 
1672 aa  64.3  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.659803  normal  0.0232391 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4267  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  23.28 
 
 
920 aa  63.2  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.427851  normal  0.366245 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5235  GAF sensor hybrid histidine kinase  28.19 
 
 
757 aa  62  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5069  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26 
 
 
748 aa  60.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.801669 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0099  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.49 
 
 
746 aa  60.1  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4127  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.45 
 
 
743 aa  60.1  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.313016  normal  0.0728263 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2352  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25 
 
 
760 aa  56.6  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1418  GAF sensor hybrid histidine kinase  29.73 
 
 
853 aa  56.6  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.237881  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0423  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.01 
 
 
799 aa  55.1  0.0000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.721204  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6244  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  25.79 
 
 
849 aa  54.7  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3479  GAF sensor signal transduction histidine kinase  24.11 
 
 
744 aa  52.8  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.209747 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1419  putative PAS/PAC sensor protein  25.15 
 
 
770 aa  52.8  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2624  GAF sensor signal transduction histidine kinase  24.11 
 
 
744 aa  52.8  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3496  bacteriophytochrome protein  24.39 
 
 
852 aa  52.4  0.000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.552776  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03310  GAF domain protein  25.56 
 
 
625 aa  51.6  0.000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0453757  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3458  putative PAS/PAC sensor protein  25.47 
 
 
760 aa  51.2  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0932578 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2818  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.89 
 
 
769 aa  51.2  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0945314 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0150  phytochrome sensor signal transduction histidine kinase  26.32 
 
 
752 aa  50.4  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1502  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  22.44 
 
 
311 aa  50.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01099  bacteriophytochrome protein  25.9 
 
 
822 aa  50.1  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.506628  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1475  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  22.44 
 
 
311 aa  50.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4749  multi-sensor signal transduction histidine kinase  22.92 
 
 
792 aa  49.7  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.157892  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4458  putative GAF sensor protein  26.45 
 
 
844 aa  50.1  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3080  bacteriophytochrome  26.51 
 
 
783 aa  49.7  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1003  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  23.53 
 
 
751 aa  48.9  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.972748  hitchhiker  0.000165551 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1484  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.64 
 
 
1002 aa  48.9  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4225  multi-sensor hybrid histidine kinase  21.31 
 
 
1322 aa  49.3  0.00005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1511  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.64 
 
 
1002 aa  48.9  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0035  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.22 
 
 
769 aa  48.9  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5067  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.19 
 
 
1002 aa  48.5  0.00007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3852  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  24.22 
 
 
765 aa  47.4  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4519  putative GAF sensor protein  21.74 
 
 
755 aa  47  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4450  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.15 
 
 
758 aa  46.6  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0383  multi-sensor signal transduction histidine kinase  22.89 
 
 
746 aa  46.2  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.269133 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2910  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.34 
 
 
783 aa  46.2  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0200681  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3185  multi-sensor signal transduction histidine kinase  22.52 
 
 
762 aa  45.8  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.97115  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>