More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_5235 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011726  PCC8801_3302  GAF sensor hybrid histidine kinase  49.87 
 
 		 763 aa  725    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5235  GAF sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 		 757 aa  1546    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2814  GAF sensor hybrid histidine kinase  49.61 
 
 		 763 aa  727    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.155467  normal  0.302046 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1418  GAF sensor hybrid histidine kinase  44.31 
 
 		 853 aa  479  1e-134  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.237881  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2901  GAF sensor hybrid histidine kinase  45.08 
 
 		 733 aa  443  1e-123  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.248575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1168  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  49.46 
 
 		 676 aa  429  1e-118  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0644  GAF sensor hybrid histidine kinase  39.93 
 
 		 754 aa  409  1e-113  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0561  GAF sensor signal transduction histidine kinase  39.91 
 
 		 640 aa  408  1.0000000000000001e-112  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.393536  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4701  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.52 
 
 		 1274 aa  251  5e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0613664  normal  0.609464 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2674  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.43 
 
 		 1305 aa  237  5.0000000000000005e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1390  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.33 
 
 		 1977 aa  224  4.9999999999999996e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1855  GAF sensor hybrid histidine kinase  27.47 
 
 		 1285 aa  216  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0819  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.6 
 
 		 844 aa  215  2.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0848  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.6 
 
 		 844 aa  215  2.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.61 
 
 		 1352 aa  212  2e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1564  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.79 
 
 		 1550 aa  209  1e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.047002  normal  0.324166 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4225  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.92 
 
 		 1322 aa  209  1e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3552  Cache sensor hybrid histidine kinase  33.25 
 
 		 970 aa  199  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1029  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.12 
 
 		 1820 aa  194  5e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.165868 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3155  adenylate/guanylate cyclase  26.7 
 
 		 1172 aa  194  7e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.386213  hitchhiker  0.00095291 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3795  histidine kinase  28.71 
 
 		 725 aa  194  7e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.421724 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3321  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.8 
 
 		 973 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2338  GAF sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  26.74 
 
 		 1180 aa  184  4.0000000000000006e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0263037  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4938  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.95 
 
 		 686 aa  183  1e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.269297 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1949  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.99 
 
 		 1397 aa  182  2.9999999999999997e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.539898  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2426  Hpt sensor hybrid histidine kinase  31.79 
 
 		 827 aa  180  8e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1093  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.51 
 
 		 1721 aa  179  1e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2145  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.53 
 
 		 1271 aa  179  1e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.152151  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4749  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.4 
 
 		 792 aa  180  1e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.157892  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4892  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.81 
 
 		 700 aa  179  2e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.434534  normal  0.941332 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2239  adenylate/guanylate cyclase  26.56 
 
 		 1156 aa  179  2e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.159061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5069  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.36 
 
 		 748 aa  179  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.801669 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1526  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.54 
 
 		 975 aa  179  2e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1796  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.08 
 
 		 1965 aa  179  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2711  Hpt sensor hybrid histidine kinase  36.64 
 
 		 818 aa  178  3e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0181892 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2208  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.07 
 
 		 823 aa  178  3e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.73393 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2304  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.59 
 
 		 870 aa  177  5e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4807  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.24 
 
 		 1287 aa  177  7e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00341781  normal  0.634217 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0210  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.3 
 
 		 708 aa  177  8e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.62826 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3699  histidine kinase  32.64 
 
 		 998 aa  176  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1052  sensory transduction histidine kinase  43.64 
 
 		 1046 aa  176  9.999999999999999e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0204  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  31.7 
 
 		 687 aa  176  9.999999999999999e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.478023 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3350  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  29.52 
 
 		 923 aa  175  1.9999999999999998e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.634179 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5419  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.11 
 
 		 713 aa  176  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4059  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.95 
 
 		 1326 aa  175  1.9999999999999998e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.129878 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2393  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.11 
 
 		 676 aa  176  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00822967 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3026  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.65 
 
 		 969 aa  175  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0213  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.13 
 
 		 974 aa  174  5e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0934932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4428  PAS sensor protein  30.29 
 
 		 693 aa  174  6.999999999999999e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.426756 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1968  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.25 
 
 		 846 aa  174  6.999999999999999e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3070  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 1166 aa  174  6.999999999999999e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109625 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2206  histidine kinase  31.25 
 
 		 556 aa  172  1e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4006  histidine kinase  32.09 
 
 		 736 aa  172  2e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.155316  hitchhiker  0.00128379 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1505  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.66 
 
 		 818 aa  172  2e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4802  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.03 
 
 		 910 aa  172  2e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.150201 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1797  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.63 
 
 		 1419 aa  172  3e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1722  histidine kinase  32 
 
 		 1361 aa  172  3e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.169999 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1628  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.81 
 
 		 1070 aa  172  3e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2453  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.82 
 
 		 969 aa  172  3e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.19952  normal  0.304956 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3876  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.24 
 
 		 1022 aa  171  4e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0258  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.88 
 
 		 1040 aa  171  4e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.119641 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0601  Signal transduction histidine kinase-like protein  26.57 
 
 		 1442 aa  171  4e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1441  PAS  28.88 
 
 		 794 aa  171  5e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.876573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0438  putative non-motile and phage-resistance protein  34.57 
 
 		 773 aa  171  6e-41  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3446  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.81 
 
 		 791 aa  171  6e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.285515  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0835  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.13 
 
 		 1165 aa  171  6e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3307  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.07 
 
 		 1003 aa  171  6e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.284418 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2831  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.74 
 
 		 1407 aa  170  7e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.160519  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0905  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.77 
 
 		 774 aa  170  7e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.226148  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0965  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  28.9 
 
 		 1331 aa  170  7e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1360  GAF sensor hybrid histidine kinase  29.71 
 
 		 974 aa  170  8e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0318  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.62 
 
 		 1223 aa  170  1e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.455432  normal  0.438074 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1949  two component hybrid histidine kinase/sensor response regulator  28.48 
 
 		 833 aa  170  1e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1816  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  27.92 
 
 		 977 aa  169  1e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.218789  normal  0.39116 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1027  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.14 
 
 		 473 aa  169  1e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2403  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.95 
 
 		 371 aa  170  1e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3275  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.25 
 
 		 919 aa  169  1e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2504  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.67 
 
 		 1132 aa  170  1e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1555  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.28 
 
 		 1172 aa  169  1e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0698206 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0617  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.64 
 
 		 1398 aa  169  2e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.536457  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3450  Hpt sensor hybrid histidine kinase  36.11 
 
 		 718 aa  169  2e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000325842 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1703  histidine kinase  34.66 
 
 		 1346 aa  169  2e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4784  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.6 
 
 		 1141 aa  169  2e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0662  adenylate/guanylate cyclase  31.31 
 
 		 1130 aa  169  2e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2202  histidine kinase  29.86 
 
 		 613 aa  168  2.9999999999999998e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.143763  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0950  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.44 
 
 		 911 aa  168  4e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.666627 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2205  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.67 
 
 		 887 aa  167  5e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.188088 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4481  sensor histidine kinase/response regulator  31.89 
 
 		 982 aa  167  5e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1931  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.58 
 
 		 1385 aa  167  5e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0116  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.3 
 
 		 1711 aa  167  5e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.257821  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6237  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  27.85 
 
 		 721 aa  167  5.9999999999999996e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.703753 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0974  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.59 
 
 		 916 aa  167  5.9999999999999996e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1611  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.24 
 
 		 442 aa  167  5.9999999999999996e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5151  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  35.64 
 
 		 1022 aa  167  5.9999999999999996e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1716  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.06 
 
 		 628 aa  167  6.9999999999999995e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.805197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3009  histidine kinase  29.18 
 
 		 603 aa  167  6.9999999999999995e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.176735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3270  histidine kinase  36.6 
 
 		 565 aa  167  8e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0047  histidine kinase  37.75 
 
 		 508 aa  167  8e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1586  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30 
 
 		 442 aa  167  8e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1616  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.36 
 
 		 1240 aa  167  8e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.98218  normal  0.696471 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>