More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_0320 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_0320  multi-sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 
838 aa  1706    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.88782 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0225  multi-sensor hybrid histidine kinase  49.84 
 
 
1418 aa  612  9.999999999999999e-175  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.180068  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4343  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  49.62 
 
 
759 aa  613  9.999999999999999e-175  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.77937  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3043  multi-sensor hybrid histidine kinase  53.43 
 
 
1122 aa  589  1e-167  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000641159  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3579  multi-sensor hybrid histidine kinase  50.86 
 
 
1432 aa  588  1e-166  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.133683  normal  0.981214 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3771  multi-sensor hybrid histidine kinase  55.92 
 
 
714 aa  584  1.0000000000000001e-165  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.756709  normal  0.201817 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4753  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  55.86 
 
 
630 aa  565  1.0000000000000001e-159  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0198  multi-sensor hybrid histidine kinase  46.78 
 
 
1344 aa  561  1e-158  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.592297 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0366  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  46.68 
 
 
1081 aa  553  1e-156  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0788  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  54.44 
 
 
634 aa  551  1e-155  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2693  multi-sensor hybrid histidine kinase  52.22 
 
 
873 aa  543  1e-153  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0674  multi-sensor hybrid histidine kinase  51.66 
 
 
1021 aa  545  1e-153  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2234  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  52.51 
 
 
935 aa  539  9.999999999999999e-153  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1343  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  52.8 
 
 
576 aa  527  1e-148  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.413012  normal  0.0352192 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0435  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  46.78 
 
 
703 aa  501  1e-140  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3580  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.14 
 
 
1428 aa  484  1e-135  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.506123  normal  0.532587 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2659  multi-sensor hybrid histidine kinase  49.51 
 
 
1070 aa  482  1e-134  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.337944  normal  0.276356 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3457  multi-sensor hybrid histidine kinase  49.31 
 
 
1070 aa  480  1e-134  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4419  multi-sensor hybrid histidine kinase  51.24 
 
 
654 aa  471  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.386835 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3071  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.33 
 
 
1222 aa  461  9.999999999999999e-129  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0997499 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2408  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  46.14 
 
 
647 aa  432  1e-119  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.385618  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2816  multi-sensor hybrid histidine kinase  56.06 
 
 
682 aa  428  1e-118  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0864703 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1127  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  36.55 
 
 
989 aa  413  1e-114  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.476664 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0933  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.36 
 
 
760 aa  397  1e-109  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.964864  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3560  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.73 
 
 
712 aa  386  1e-106  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.348943  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0945  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.18 
 
 
926 aa  387  1e-106  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0386  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.75 
 
 
1342 aa  339  9.999999999999999e-92  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2865  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.4 
 
 
853 aa  314  3.9999999999999997e-84  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1351  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.61 
 
 
859 aa  313  1e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000388966 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1337  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.29 
 
 
822 aa  293  8e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.121372 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3272  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.34 
 
 
962 aa  292  2e-77  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4428  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.31 
 
 
622 aa  286  1.0000000000000001e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.724504 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0146  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.71 
 
 
1381 aa  283  1e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.436687 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2137  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.58 
 
 
1260 aa  282  2e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2079  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.29 
 
 
1260 aa  277  5e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.8885299999999995e-20 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0463  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.26 
 
 
642 aa  277  5e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.683271 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2401  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.27 
 
 
991 aa  277  7e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.986059 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1007  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.45 
 
 
557 aa  275  2.0000000000000002e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.607179  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4776  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.95 
 
 
1086 aa  275  3e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.108623  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3265  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.19 
 
 
1106 aa  272  2e-71  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0272  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.45 
 
 
1113 aa  271  2.9999999999999997e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4108  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.84 
 
 
1095 aa  271  4e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2373  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.15 
 
 
769 aa  271  4e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1139  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.17 
 
 
645 aa  269  1e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2173  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.83 
 
 
867 aa  268  2.9999999999999995e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00129243  normal  0.0294734 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6162  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.9 
 
 
673 aa  267  5.999999999999999e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.30079  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2707  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.78 
 
 
776 aa  267  5.999999999999999e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3083  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.7 
 
 
845 aa  265  2e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2406  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.31 
 
 
773 aa  265  3e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1961  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.84 
 
 
867 aa  265  3e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.126106 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2089  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.28 
 
 
802 aa  265  3e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0236176  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0257  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.3 
 
 
1108 aa  264  4e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000213837 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1812  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.2 
 
 
773 aa  263  6.999999999999999e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.021882 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2939  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.2 
 
 
1279 aa  263  1e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.111329  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1138  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.26 
 
 
983 aa  262  2e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4625  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.41 
 
 
1092 aa  262  2e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1398  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.41 
 
 
853 aa  261  5.0000000000000005e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1740  multi-sensor hybrid histidine kinase / cell cycle control histidine kinase CckA  37.64 
 
 
866 aa  261  5.0000000000000005e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0223971  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2463  two component sensor kinase  36.22 
 
 
872 aa  261  5.0000000000000005e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.899501  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1138  Signal transduction histidine kinase  37.88 
 
 
888 aa  260  6e-68  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.408537  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1283  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.45 
 
 
1322 aa  260  7e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000035266 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4259  PAS sensor protein  29.71 
 
 
1086 aa  260  8e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.127746 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0936  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.27 
 
 
803 aa  260  9e-68  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0173561 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0454  multisensor hybrid histidine kinase  39.29 
 
 
766 aa  259  1e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2226  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.07 
 
 
796 aa  259  1e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000698755  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2898  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.43 
 
 
849 aa  258  2e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.16474e-17 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3722  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.48 
 
 
845 aa  258  2e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2107  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.29 
 
 
770 aa  259  2e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4405  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.43 
 
 
880 aa  258  4e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0198095  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2943  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.19 
 
 
981 aa  258  5e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.677183 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1192  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.15 
 
 
912 aa  257  8e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.444 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1432  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.27 
 
 
810 aa  256  1.0000000000000001e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000530681 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1383  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.97 
 
 
819 aa  256  1.0000000000000001e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000597485  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5491  cell cycle control histidine kinase CckA  36.24 
 
 
892 aa  256  1.0000000000000001e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.606378  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0802  PAS sensor protein  29.45 
 
 
1065 aa  256  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3771  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.58 
 
 
874 aa  255  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0139218  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1700  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  29.58 
 
 
767 aa  256  2.0000000000000002e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3617  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.43 
 
 
845 aa  255  2.0000000000000002e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2521  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.55 
 
 
571 aa  255  2.0000000000000002e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0595753 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2852  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.84 
 
 
1057 aa  254  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3966  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.82 
 
 
677 aa  253  9.000000000000001e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000186378 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1701  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.37 
 
 
571 aa  253  1e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0239416  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0842  sensory box histidine kinase/response regulator  33.02 
 
 
787 aa  251  3e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.220519  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1039  sensory box histidine kinase/response regulator  37.83 
 
 
945 aa  251  3e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2743  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.69 
 
 
929 aa  251  3e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00773709  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2816  sensory box histidine kinase/response regulator  31.85 
 
 
882 aa  251  4e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3132  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.88 
 
 
743 aa  251  4e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.583735  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6946  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.11 
 
 
789 aa  250  7e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2598  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.46 
 
 
661 aa  250  8e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4271  histidine kinase  36.97 
 
 
525 aa  250  8e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4134  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.68 
 
 
711 aa  249  1e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.734876  normal  0.920735 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1524  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.87 
 
 
853 aa  249  1e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.334346 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3878  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.64 
 
 
673 aa  249  1e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1918  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.38 
 
 
650 aa  249  2e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.204421 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2001  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.67 
 
 
796 aa  248  2e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  7.77001e-34 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1985  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.47 
 
 
650 aa  248  2e-64  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2358  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  33.06 
 
 
916 aa  248  3e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1004  sensory box histidine kinase/response regulator  37.59 
 
 
945 aa  248  3e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2045  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.85 
 
 
812 aa  248  4e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000148537 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0672  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.55 
 
 
770 aa  248  4e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>