More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_3004 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_3004  Signal transduction histidine kinase  100 
 
 
941 aa  1927    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1370  signal transduction histidine kinase  42.73 
 
 
1560 aa  343  7e-93  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.71177  normal  0.70667 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1113  signal transduction histidine kinase  45.87 
 
 
723 aa  342  2.9999999999999998e-92  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4301  signal transduction histidine kinase  41.18 
 
 
2693 aa  337  7.999999999999999e-91  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5298  signal transduction histidine kinase  43.71 
 
 
732 aa  322  1.9999999999999998e-86  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1805  diguanylate cyclase with PAS/PAC and GAF sensors  31.57 
 
 
960 aa  228  3e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0064  Signal transduction histidine kinase  56.68 
 
 
1714 aa  211  6e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.274411 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3735  signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
1183 aa  204  6e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.709518  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2659  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.07 
 
 
1070 aa  204  7e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.337944  normal  0.276356 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1390  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.39 
 
 
1977 aa  201  5e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3457  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.72 
 
 
1070 aa  200  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2118  signal transduction histidine kinase  40.53 
 
 
572 aa  199  3e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0674  multi-sensor hybrid histidine kinase  47.11 
 
 
1021 aa  198  4.0000000000000005e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1729  signal transduction histidine kinase  39.13 
 
 
964 aa  193  1e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0370864  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3771  multi-sensor hybrid histidine kinase  46.19 
 
 
714 aa  193  1e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.756709  normal  0.201817 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3010  signal transduction histidine kinase  47.71 
 
 
488 aa  193  1e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0663481  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2234  signal transduction histidine kinase  43.3 
 
 
1676 aa  192  2e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.900765 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4563  signal transduction histidine kinase  47.85 
 
 
771 aa  191  5e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.633448 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2710  hypothetical protein  41.86 
 
 
744 aa  191  5.999999999999999e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2336  signal transduction histidine kinase  43.18 
 
 
3706 aa  191  7e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2674  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.68 
 
 
1305 aa  191  8e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4325  Signal transduction histidine kinase  42.67 
 
 
1654 aa  191  8e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4431  signal transduction histidine kinase  43.36 
 
 
767 aa  187  6e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.222195  normal  0.392293 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3009  hypothetical protein  42.13 
 
 
783 aa  185  4.0000000000000006e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5451  signal transduction histidine kinase  43.53 
 
 
547 aa  184  7e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.915879  normal  0.94618 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1008  signal transduction histidine kinase  43.46 
 
 
347 aa  182  4e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.681685  normal  0.906099 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3899  signal transduction histidine kinase  27.54 
 
 
613 aa  179  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.796516 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0440  signal transduction histidine kinase  41.74 
 
 
1093 aa  179  2e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.790224  normal  0.127185 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2150  signal transduction histidine kinase  43.05 
 
 
945 aa  179  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1812  signal transduction histidine kinase  25.99 
 
 
1390 aa  179  3e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.155927 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1806  signal transduction histidine kinase  42.59 
 
 
681 aa  179  3e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.286721 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0429  signal transduction histidine kinase  42.33 
 
 
1093 aa  178  4e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2687  signal transduction histidine kinase  41.59 
 
 
215 aa  177  7e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.693771  normal  0.196612 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2935  sensory transduction histidine kinase  26.66 
 
 
892 aa  177  9.999999999999999e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0108419  normal  0.0385268 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1972  signal transduction histidine kinase  44.61 
 
 
815 aa  177  9.999999999999999e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000691031  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4528  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  41.09 
 
 
1668 aa  176  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2638  signal transduction histidine kinase  38.5 
 
 
1246 aa  175  2.9999999999999996e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.406251  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0819  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.52 
 
 
844 aa  174  5.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0848  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.52 
 
 
844 aa  174  6.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0828  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with GAF sensor  48.7 
 
 
734 aa  173  1e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.84548  normal  0.140102 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4701  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.53 
 
 
1274 aa  173  1e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0613664  normal  0.609464 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1234  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  40.59 
 
 
1663 aa  173  1e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.745042  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3447  hypothetical protein  37.75 
 
 
1210 aa  172  2e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00320271  normal  0.0786508 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1364  signal transduction histidine kinase  42.66 
 
 
382 aa  172  2e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00521592 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0047  signal transduction histidine kinase  42.4 
 
 
980 aa  172  2e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1564  multi-sensor hybrid histidine kinase  51.88 
 
 
1550 aa  172  3e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.047002  normal  0.324166 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0299  two component sensor histidine kinase  41.1 
 
 
1239 aa  172  4e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.669336  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4345  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  40.8 
 
 
890 aa  170  1e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.5665  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0913  multisensor signal transduction histidine kinase  40.55 
 
 
991 aa  169  2e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.650855  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3613  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.59 
 
 
1808 aa  168  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.643019 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2286  multisensor signal transduction histidine kinase  40.18 
 
 
834 aa  167  5.9999999999999996e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.461732  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2629  signal transduction histidine kinase  38.77 
 
 
788 aa  167  1.0000000000000001e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3509  signal transduction histidine kinase  36.76 
 
 
439 aa  166  3e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.2468 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1002  signal transduction histidine kinase  39.63 
 
 
932 aa  165  4.0000000000000004e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.353608  normal  0.0662086 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1535  sensory transduction histidine kinase  37.99 
 
 
682 aa  164  7e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0936  signal transduction histidine kinase  36.68 
 
 
1177 aa  164  8.000000000000001e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.194621  normal  0.0190935 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0366  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  41.26 
 
 
1081 aa  162  3e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0079  signal transduction histidine kinase  23.87 
 
 
909 aa  161  6e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.130581 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4421  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.03 
 
 
457 aa  160  9e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.45422 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0842  multisensor signal transduction histidine kinase  40.39 
 
 
727 aa  160  1e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1001  signal transduction histidine kinase  38.99 
 
 
674 aa  160  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.58641  normal  0.0795268 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1723  signal transduction histidine kinase  38.71 
 
 
764 aa  158  5.0000000000000005e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4093  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.45 
 
 
937 aa  157  6e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3911  signal transduction histidine kinase  37.93 
 
 
1093 aa  157  6e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.25512  normal  0.0971599 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0896  signal transduction histidine kinase  36.96 
 
 
839 aa  157  9e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.335338  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2458  diguanylate cyclase  48.43 
 
 
343 aa  156  1e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.709604 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0404  hypothetical protein  38.6 
 
 
1182 aa  157  1e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.465468  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3771  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.73 
 
 
1391 aa  156  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1496  signal transduction histidine kinase  36.82 
 
 
1253 aa  157  1e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.172842 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1666  sensory transduction histidine kinase  36.14 
 
 
945 aa  156  2e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.515191  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4387  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.13 
 
 
946 aa  156  2e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3504  signal transduction histidine kinase  38.63 
 
 
585 aa  156  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0759377  normal  0.354882 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4851  signal transduction histidine kinase  38.22 
 
 
752 aa  156  2e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0114486 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0621  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.42 
 
 
1309 aa  155  2.9999999999999998e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.288255 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1643  diguanylate cyclase with GAF sensor  50.32 
 
 
506 aa  155  4e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.65001 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1392  putative sensory transduction histidine kinase  46.47 
 
 
401 aa  154  5e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2096  signal transduction histidine kinase  36.03 
 
 
526 aa  154  5e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0713574 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15351  GAF domain-containing protein  48.12 
 
 
238 aa  154  5e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.581628  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2362  hypothetical protein  35.15 
 
 
449 aa  154  7e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.514155  normal  0.0458949 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1359  signal transduction histidine kinase  25.42 
 
 
631 aa  154  8.999999999999999e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0321472 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2594  hypothetical protein  36.88 
 
 
657 aa  153  1e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0722689  normal  0.479427 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3538  hypothetical protein  38.67 
 
 
754 aa  153  1e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0655709  normal  0.940328 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15571  GAF domain-containing protein  47.5 
 
 
249 aa  153  1e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0414818  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2985  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  48.39 
 
 
321 aa  153  1e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.369432  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15721  GAF domain-containing protein  47.5 
 
 
249 aa  153  1e-35  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4210  GAF sensor signal transduction histidine kinase  37.35 
 
 
612 aa  152  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1466  GAF domain-containing protein  48.12 
 
 
249 aa  153  2e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.105134  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2782  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with GAF sensor  42.25 
 
 
902 aa  152  3e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1527  signal transduction histidine kinase  38.14 
 
 
1227 aa  151  4e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.823974 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0428  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.06 
 
 
943 aa  151  4e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.94781  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0815  hypothetical protein  35.48 
 
 
918 aa  150  9e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0596  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  34.09 
 
 
1471 aa  150  9e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4136  signal transduction histidine kinase  39.91 
 
 
790 aa  150  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1944  signal-transducing histidine kinase  34.48 
 
 
1248 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.318144  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3862  signal transduction histidine kinase  36.63 
 
 
532 aa  149  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2310  sensor histidine kinase/GAF domain-containing protein  44.87 
 
 
400 aa  149  2.0000000000000003e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.40578 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2636  signal transduction histidine kinase  34.88 
 
 
1051 aa  149  3e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1487  signal transduction histidine kinase  38.14 
 
 
924 aa  149  3e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.588746 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2691  hypothetical protein  25.84 
 
 
800 aa  148  5e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.337462  normal  0.0535481 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0986  signal transduction histidine kinase  40.54 
 
 
872 aa  148  5e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.544559  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>