More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_01099 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_01099  bacteriophytochrome protein  100 
 
 		 822 aa  1683    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.506628  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2330  putative bacteriophytochrome  36.04 
 
 		 842 aa  493  9.999999999999999e-139  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.766617  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6244  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  33.29 
 
 		 849 aa  477  1e-133  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3034  putative PAS/PAC sensor protein  34.78 
 
 		 856 aa  473  1e-132  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0858916  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3289  putative PAS/PAC sensor protein  35.53 
 
 		 855 aa  471  1.0000000000000001e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.363327  normal  0.145052 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9083  bacteriophytochrome protein  32.72 
 
 		 856 aa  453  1.0000000000000001e-126  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2394  putative GAF sensor protein  34.06 
 
 		 847 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.25898  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3364  response regulator  33.94 
 
 		 847 aa  439  1e-121  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.427552 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3496  bacteriophytochrome protein  32.92 
 
 		 852 aa  436  1e-120  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.552776  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2586  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  34.27 
 
 		 847 aa  436  1e-120  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.251983 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4458  putative GAF sensor protein  32.85 
 
 		 844 aa  430  1e-119  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2574  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  32.93 
 
 		 844 aa  427  1e-118  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.969915 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1182  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  31.86 
 
 		 846 aa  421  1e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.75997  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3080  bacteriophytochrome  33.46 
 
 		 783 aa  272  2e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2020  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.56 
 
 		 771 aa  261  4e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4034  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.8 
 
 		 775 aa  245  3e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3788  phytochrome  34.53 
 
 		 772 aa  244  3.9999999999999997e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0317187 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1956  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.86 
 
 		 748 aa  244  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.727974  normal  0.121547 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0975  putative bacteriophytochrome  32.92 
 
 		 728 aa  241  5.999999999999999e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10700  putative bacteriophytochrome  33.62 
 
 		 728 aa  239  1e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1796  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.23 
 
 		 756 aa  234  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.232536 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1003  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  34.37 
 
 		 751 aa  233  9e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.972748  hitchhiker  0.000165551 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2356  phytochrome family protein, putative  29.03 
 
 		 755 aa  228  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.634458 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0035  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.83 
 
 		 769 aa  225  2e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3339  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.92 
 
 		 748 aa  226  2e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5067  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.76 
 
 		 1002 aa  225  2e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0099  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.95 
 
 		 746 aa  224  7e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3686  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.17 
 
 		 709 aa  222  1.9999999999999999e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.206553 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0539  GAF sensor signal transduction histidine kinase  28.67 
 
 		 751 aa  222  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.802089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4270  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.8 
 
 		 751 aa  222  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.235212 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3820  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.1 
 
 		 755 aa  222  1.9999999999999999e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.869603  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4021  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.41 
 
 		 1013 aa  221  3e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.864375 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0383  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.96 
 
 		 746 aa  219  1e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.269133 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3185  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.64 
 
 		 762 aa  219  2e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.97115  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4151  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.63 
 
 		 760 aa  218  4e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.193587 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4111  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.63 
 
 		 760 aa  218  4e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1902  bacteriophytochrome histidine kinase  29.55 
 
 		 745 aa  217  8e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.333534  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4415  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.47 
 
 		 749 aa  217  8e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.541129  normal  0.358425 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2444  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.39 
 
 		 721 aa  215  2.9999999999999995e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0911916  normal  0.976086 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3852  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  31.62 
 
 		 765 aa  213  2e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2206  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.49 
 
 		 762 aa  212  2e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.15596  normal  0.128973 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2162  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  30.21 
 
 		 745 aa  209  1e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.894867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1986  putative GAF sensor protein  35.59 
 
 		 798 aa  208  3e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.932658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3504  GAF:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  28.79 
 
 		 745 aa  206  1e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.280312  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1309  putative PAS/PAC sensor protein  30.16 
 
 		 722 aa  206  1e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.543635 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1484  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.28 
 
 		 1002 aa  204  6e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1511  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.28 
 
 		 1002 aa  203  9e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2818  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.41 
 
 		 769 aa  202  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0945314 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3458  putative PAS/PAC sensor protein  31.93 
 
 		 760 aa  201  3.9999999999999996e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0932578 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4519  putative GAF sensor protein  33.2 
 
 		 755 aa  201  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0150  phytochrome sensor signal transduction histidine kinase  28.72 
 
 		 752 aa  200  7.999999999999999e-50  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2978  putative GAF sensor protein  29.77 
 
 		 567 aa  199  1.0000000000000001e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.186  normal  0.0306937 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1677  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27.01 
 
 		 770 aa  199  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1235  phytochrome-like protein  28.95 
 
 		 506 aa  199  2.0000000000000003e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4562  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.25 
 
 		 874 aa  196  1e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0865092  normal  0.846022 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2910  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.94 
 
 		 783 aa  196  1e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0200681  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2352  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.28 
 
 		 760 aa  196  2e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3936  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.16 
 
 		 757 aa  195  3e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0423  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.14 
 
 		 799 aa  194  4e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.721204  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3673  putative PAS/PAC sensor protein  32.35 
 
 		 738 aa  194  4e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.483009  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2235  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  27.82 
 
 		 865 aa  194  7e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2377  ATP-binding region, ATPase-like  29.32 
 
 		 759 aa  194  7e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.974028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3740  phytochrome  27.8 
 
 		 732 aa  194  7e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.103591  decreased coverage  0.000116427 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4450  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.49 
 
 		 758 aa  193  1e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4081  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  26.75 
 
 		 895 aa  192  2e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.628066  normal  0.498394 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1284  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.74 
 
 		 791 aa  192  2e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0336702 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2652  bacteriophytochrome, putative  28.03 
 
 		 993 aa  192  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.163581  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4449  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.14 
 
 		 875 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4279  diguanylate phosphodiesterase  29.96 
 
 		 936 aa  190  7e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3723  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.78 
 
 		 871 aa  190  1e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.086011 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2385  phytochrome:GAF:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal:HWE histidine kinase  26.81 
 
 		 1003 aa  187  7e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.460117  normal  0.215255 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3985  putative PAS/PAC sensor protein  27.22 
 
 		 732 aa  187  8e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.525883  normal  0.142655 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2402  ATP-binding region, ATPase-like  27.95 
 
 		 762 aa  187  8e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0299776 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4111  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with phytochrome (GAF) sensor  28.97 
 
 		 931 aa  185  3e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6428  bacteriophytochrome  29.4 
 
 		 723 aa  185  3e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.688062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1419  putative PAS/PAC sensor protein  33.69 
 
 		 770 aa  184  4.0000000000000006e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2169  putative GAF sensor protein  29.03 
 
 		 812 aa  184  5.0000000000000004e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0312851 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4191  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with phytochrome (GAF) sensor  28.36 
 
 		 980 aa  184  9.000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13140  bacteriophytochrome (light-regulated signal transduction histidine kinase)  30.73 
 
 		 772 aa  182  2.9999999999999997e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4127  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.74 
 
 		 743 aa  181  4e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.313016  normal  0.0728263 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1726  putative PAS/PAC sensor protein  28.9 
 
 		 731 aa  181  4.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3424  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.95 
 
 		 758 aa  180  8e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.25862  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3914  Phytochrome central region domain protein  26.61 
 
 		 509 aa  180  8e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.218618 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7207  putative PAS/PAC sensor protein  28.78 
 
 		 508 aa  179  2e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3780  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.8 
 
 		 779 aa  179  2e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.689927  normal  0.970382 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0125  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.67 
 
 		 759 aa  178  3e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.812946  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3192  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.67 
 
 		 864 aa  176  9.999999999999999e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0309229 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4451  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.15 
 
 		 775 aa  175  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2403  ATP-binding region, ATPase-like  28.76 
 
 		 776 aa  173  1e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0308443 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3425  GAF sensor signal transduction histidine kinase  28.45 
 
 		 775 aa  172  2e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0531418  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1497  putative GAF sensor protein  29.3 
 
 		 689 aa  161  4e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5270  signal transduction histidine kinase  29.05 
 
 		 559 aa  160  7e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.909185 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03481  Multi-sensor Signal Transduction Histidine Kinase  28.95 
 
 		 908 aa  159  2e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0652805  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3089  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.31 
 
 		 740 aa  159  3e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.552133  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4724  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.23 
 
 		 774 aa  159  3e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.960478  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03310  GAF domain protein  30.25 
 
 		 625 aa  158  4e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0453757  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00897  GAF:ATP-binding region, ATPase-like:Histidine kinase A, N-terminal  23.59 
 
 		 884 aa  156  1e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.717501  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2793  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.97 
 
 		 763 aa  155  2e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.172208  normal  0.714834 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5055  signal transduction histidine kinase  28.9 
 
 		 1111 aa  154  5e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.372822  normal  1 
 
 
-
 
NC_006680  CNK03200  bacteriophytochrome histidine kinase, putative  31.25 
 
 		 1871 aa  146  1e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.796961  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>