More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_0539 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_4270  GAF sensor signal transduction histidine kinase  83.09 
 
 		 751 aa  1247    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.235212 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1796  GAF sensor signal transduction histidine kinase  47.52 
 
 		 756 aa  649    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.232536 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2356  phytochrome family protein, putative  47.98 
 
 		 755 aa  649    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.634458 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3339  multi-sensor signal transduction histidine kinase  48.18 
 
 		 748 aa  652    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1956  GAF sensor signal transduction histidine kinase  48.65 
 
 		 748 aa  655    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.727974  normal  0.121547 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0539  GAF sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 751 aa  1515    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.802089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2206  GAF sensor signal transduction histidine kinase  71.64 
 
 		 762 aa  1074    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.15596  normal  0.128973 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1284  multi-sensor signal transduction histidine kinase  47.4 
 
 		 791 aa  622  1e-177  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0336702 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1003  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  41.67 
 
 		 751 aa  581  1e-164  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.972748  hitchhiker  0.000165551 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4415  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.4 
 
 		 749 aa  553  1e-156  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.541129  normal  0.358425 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2793  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.39 
 
 		 763 aa  531  1e-149  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.172208  normal  0.714834 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3852  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  36.68 
 
 		 765 aa  526  1e-148  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3425  GAF sensor signal transduction histidine kinase  40.94 
 
 		 775 aa  525  1e-147  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0531418  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4451  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.06 
 
 		 775 aa  521  1e-146  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0035  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.55 
 
 		 769 aa  517  1.0000000000000001e-145  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3141  GAF sensor signal transduction histidine kinase  42.68 
 
 		 762 aa  516  1.0000000000000001e-145  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.583701  normal  0.345899 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4151  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.16 
 
 		 760 aa  507  9.999999999999999e-143  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.193587 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4111  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.16 
 
 		 760 aa  507  9.999999999999999e-143  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3780  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.24 
 
 		 779 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.689927  normal  0.970382 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2403  ATP-binding region, ATPase-like  40.37 
 
 		 776 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0308443 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2352  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.28 
 
 		 760 aa  491  1e-137  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2818  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.67 
 
 		 769 aa  488  1e-136  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0945314 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0383  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.34 
 
 		 746 aa  475  1e-132  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.269133 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3424  GAF sensor signal transduction histidine kinase  38.42 
 
 		 758 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.25862  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4450  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39 
 
 		 758 aa  467  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2402  ATP-binding region, ATPase-like  38.13 
 
 		 762 aa  468  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0299776 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0423  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.25 
 
 		 799 aa  457  1e-127  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.721204  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4724  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.95 
 
 		 774 aa  439  9.999999999999999e-123  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.960478  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0099  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.24 
 
 		 746 aa  439  9.999999999999999e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2377  ATP-binding region, ATPase-like  35.71 
 
 		 759 aa  412  1e-114  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.974028  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1902  bacteriophytochrome histidine kinase  35.63 
 
 		 745 aa  409  1e-113  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.333534  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3185  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.9 
 
 		 762 aa  411  1e-113  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.97115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3504  GAF:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  34.99 
 
 		 745 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.280312  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2162  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  37.08 
 
 		 745 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.894867  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2385  phytochrome:GAF:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal:HWE histidine kinase  34.38 
 
 		 1003 aa  392  1e-107  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.460117  normal  0.215255 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3936  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.81 
 
 		 757 aa  380  1e-104  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0150  phytochrome sensor signal transduction histidine kinase  30.97 
 
 		 752 aa  379  1e-103  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0125  GAF sensor signal transduction histidine kinase  36.51 
 
 		 759 aa  378  1e-103  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.812946  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4021  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.09 
 
 		 1013 aa  374  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.864375 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2652  bacteriophytochrome, putative  33.2 
 
 		 993 aa  374  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.163581  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3820  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.84 
 
 		 755 aa  375  1e-102  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.869603  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5067  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.99 
 
 		 1002 aa  371  1e-101  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1511  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.43 
 
 		 1002 aa  368  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1484  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.57 
 
 		 1002 aa  369  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4127  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.69 
 
 		 743 aa  361  3e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.313016  normal  0.0728263 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2020  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.72 
 
 		 771 aa  355  2e-96  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3788  phytochrome  34.35 
 
 		 772 aa  353  7e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0317187 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3080  bacteriophytochrome  32.95 
 
 		 783 aa  345  1e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4034  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.76 
 
 		 775 aa  340  4e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2910  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.55 
 
 		 783 aa  329  1.0000000000000001e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0200681  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6244  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  37.63 
 
 		 849 aa  324  5e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3034  putative PAS/PAC sensor protein  37.89 
 
 		 856 aa  314  2.9999999999999996e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0858916  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3673  putative PAS/PAC sensor protein  41.13 
 
 		 738 aa  311  2e-83  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.483009  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3289  putative PAS/PAC sensor protein  37.75 
 
 		 855 aa  312  2e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.363327  normal  0.145052 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2444  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.09 
 
 		 721 aa  309  1.0000000000000001e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0911916  normal  0.976086 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3914  Phytochrome central region domain protein  35.73 
 
 		 509 aa  307  5.0000000000000004e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.218618 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10700  putative bacteriophytochrome  33.38 
 
 		 728 aa  306  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3686  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.82 
 
 		 709 aa  305  3.0000000000000004e-81  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.206553 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2330  putative bacteriophytochrome  33.33 
 
 		 842 aa  303  1e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.766617  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3496  bacteriophytochrome protein  34.23 
 
 		 852 aa  301  4e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.552776  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0975  putative bacteriophytochrome  32.54 
 
 		 728 aa  299  2e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2574  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  35.21 
 
 		 844 aa  297  4e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.969915 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7207  putative PAS/PAC sensor protein  33.6 
 
 		 508 aa  297  5e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4562  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.14 
 
 		 874 aa  295  3e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0865092  normal  0.846022 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3458  putative PAS/PAC sensor protein  39.3 
 
 		 760 aa  293  6e-78  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0932578 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3723  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.38 
 
 		 871 aa  293  6e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.086011 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6428  bacteriophytochrome  33.62 
 
 		 723 aa  293  8e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.688062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2978  putative GAF sensor protein  37.29 
 
 		 567 aa  293  8e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.186  normal  0.0306937 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4449  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.78 
 
 		 875 aa  292  2e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2586  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  33.53 
 
 		 847 aa  291  2e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.251983 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4081  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  30.78 
 
 		 895 aa  291  3e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.628066  normal  0.498394 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3364  response regulator  37.28 
 
 		 847 aa  291  3e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.427552 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1986  putative GAF sensor protein  36.9 
 
 		 798 aa  291  3e-77  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.932658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1309  putative PAS/PAC sensor protein  33.77 
 
 		 722 aa  290  6e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.543635 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2394  putative GAF sensor protein  36.9 
 
 		 847 aa  290  1e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.25898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1726  putative PAS/PAC sensor protein  34.41 
 
 		 731 aa  287  5e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1419  putative PAS/PAC sensor protein  38.95 
 
 		 770 aa  285  2.0000000000000002e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3985  putative PAS/PAC sensor protein  33.96 
 
 		 732 aa  279  1e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.525883  normal  0.142655 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3192  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.03 
 
 		 864 aa  278  2e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0309229 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00897  GAF:ATP-binding region, ATPase-like:Histidine kinase A, N-terminal  27.39 
 
 		 884 aa  278  3e-73  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.717501  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1182  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  33.69 
 
 		 846 aa  276  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.75997  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4519  putative GAF sensor protein  36.14 
 
 		 755 aa  276  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3089  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.96 
 
 		 740 aa  276  1.0000000000000001e-72  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.552133  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3740  phytochrome  32.59 
 
 		 732 aa  275  3e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.103591  decreased coverage  0.000116427 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13140  bacteriophytochrome (light-regulated signal transduction histidine kinase)  35.2 
 
 		 772 aa  273  7e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03481  Multi-sensor Signal Transduction Histidine Kinase  27.61 
 
 		 908 aa  269  1e-70  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0652805  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1812  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  58.78 
 
 		 553 aa  267  5e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03310  GAF domain protein  34.91 
 
 		 625 aa  265  2e-69  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0453757  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9083  bacteriophytochrome protein  31.78 
 
 		 856 aa  263  6e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2169  putative GAF sensor protein  35.76 
 
 		 812 aa  264  6e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0312851 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1235  phytochrome-like protein  33.07 
 
 		 506 aa  259  2e-67  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1677  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.73 
 
 		 770 aa  256  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2235  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  33.98 
 
 		 865 aa  252  1e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0946  multi-sensor signal transduction histidine kinase  56.3 
 
 		 656 aa  252  2e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4458  putative GAF sensor protein  31.46 
 
 		 844 aa  251  4e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4279  diguanylate phosphodiesterase  35.17 
 
 		 936 aa  249  1e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4191  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with phytochrome (GAF) sensor  33.46 
 
 		 980 aa  245  1.9999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3744  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  50 
 
 		 479 aa  246  1.9999999999999999e-63  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0408317  normal  0.996792 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1141  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  55.46 
 
 		 520 aa  243  9e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4111  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with phytochrome (GAF) sensor  33.07 
 
 		 931 aa  243  1e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>