More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_2818 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_1003  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  45.02 
 
 
751 aa  654    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.972748  hitchhiker  0.000165551 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3852  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  66.89 
 
 
765 aa  1064    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0035  multi-sensor signal transduction histidine kinase  66.41 
 
 
769 aa  1078    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4111  multi-sensor signal transduction histidine kinase  64.55 
 
 
760 aa  1025    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2818  multi-sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
769 aa  1599    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0945314 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4151  multi-sensor signal transduction histidine kinase  64.55 
 
 
760 aa  1025    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.193587 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4415  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.3 
 
 
749 aa  615  1e-175  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.541129  normal  0.358425 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2352  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.85 
 
 
760 aa  574  1.0000000000000001e-162  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3780  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.53 
 
 
779 aa  520  1e-146  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.689927  normal  0.970382 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2403  ATP-binding region, ATPase-like  36.64 
 
 
776 aa  520  1e-146  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0308443 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4451  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.67 
 
 
775 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3424  GAF sensor signal transduction histidine kinase  38.38 
 
 
758 aa  515  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.25862  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3425  GAF sensor signal transduction histidine kinase  36.64 
 
 
775 aa  509  1e-143  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0531418  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4450  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.74 
 
 
758 aa  495  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2402  ATP-binding region, ATPase-like  36.11 
 
 
762 aa  491  1e-137  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0299776 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2206  GAF sensor signal transduction histidine kinase  36.33 
 
 
762 aa  489  1e-137  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.15596  normal  0.128973 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0539  GAF sensor signal transduction histidine kinase  36.67 
 
 
751 aa  488  1e-136  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.802089  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4270  GAF sensor signal transduction histidine kinase  36.64 
 
 
751 aa  473  1e-132  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.235212 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2356  phytochrome family protein, putative  35.73 
 
 
755 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.634458 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0423  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.01 
 
 
799 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.721204  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1956  GAF sensor signal transduction histidine kinase  35.07 
 
 
748 aa  464  1e-129  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.727974  normal  0.121547 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3339  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.11 
 
 
748 aa  464  1e-129  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5067  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.68 
 
 
1002 aa  461  9.999999999999999e-129  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1284  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.6 
 
 
791 aa  459  1e-127  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0336702 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1484  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.49 
 
 
1002 aa  455  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1796  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.55 
 
 
756 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.232536 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1511  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.36 
 
 
1002 aa  454  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2793  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.29 
 
 
763 aa  440  9.999999999999999e-123  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.172208  normal  0.714834 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4021  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.2 
 
 
1013 aa  438  1e-121  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.864375 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0383  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.11 
 
 
746 aa  436  1e-121  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.269133 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0099  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.84 
 
 
746 aa  429  1e-118  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3185  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.29 
 
 
762 aa  426  1e-118  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.97115  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0150  phytochrome sensor signal transduction histidine kinase  33.47 
 
 
752 aa  414  1e-114  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2377  ATP-binding region, ATPase-like  33.64 
 
 
759 aa  404  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.974028  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4724  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.26 
 
 
774 aa  403  1e-111  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.960478  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4127  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.79 
 
 
743 aa  400  9.999999999999999e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.313016  normal  0.0728263 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3141  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.46 
 
 
762 aa  396  1e-109  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.583701  normal  0.345899 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2162  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  34.15 
 
 
745 aa  392  1e-107  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.894867  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3936  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.56 
 
 
757 aa  389  1e-106  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1902  bacteriophytochrome histidine kinase  33.15 
 
 
745 aa  381  1e-104  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.333534  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3504  GAF:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  32.57 
 
 
745 aa  373  1e-102  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.280312  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4034  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.96 
 
 
775 aa  366  1e-100  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3820  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.4 
 
 
755 aa  368  1e-100  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.869603  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3788  phytochrome  37.02 
 
 
772 aa  358  1.9999999999999998e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0317187 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3080  bacteriophytochrome  38.27 
 
 
783 aa  352  2e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2020  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.6 
 
 
771 aa  349  9e-95  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1419  putative PAS/PAC sensor protein  37.64 
 
 
770 aa  347  6e-94  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0125  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.15 
 
 
759 aa  347  7e-94  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.812946  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2652  bacteriophytochrome, putative  32.37 
 
 
993 aa  343  5e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.163581  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2385  phytochrome:GAF:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal:HWE histidine kinase  31.41 
 
 
1003 aa  339  9.999999999999999e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.460117  normal  0.215255 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3914  Phytochrome central region domain protein  36.63 
 
 
509 aa  329  1.0000000000000001e-88  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.218618 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2910  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.1 
 
 
783 aa  322  1.9999999999999998e-86  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0200681  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7207  putative PAS/PAC sensor protein  36.75 
 
 
508 aa  318  2e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3673  putative PAS/PAC sensor protein  37.07 
 
 
738 aa  318  3e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.483009  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4519  putative GAF sensor protein  35.01 
 
 
755 aa  313  1e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3740  phytochrome  34.63 
 
 
732 aa  311  2.9999999999999997e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.103591  decreased coverage  0.000116427 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6428  bacteriophytochrome  34.59 
 
 
723 aa  300  5e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.688062  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3985  putative PAS/PAC sensor protein  33.66 
 
 
732 aa  298  3e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.525883  normal  0.142655 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6244  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  33.27 
 
 
849 aa  297  4e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3458  putative PAS/PAC sensor protein  35.76 
 
 
760 aa  296  1e-78  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0932578 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1726  putative PAS/PAC sensor protein  32.77 
 
 
731 aa  295  2e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13140  bacteriophytochrome (light-regulated signal transduction histidine kinase)  35.48 
 
 
772 aa  293  8e-78  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1309  putative PAS/PAC sensor protein  34.24 
 
 
722 aa  291  2e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.543635 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0975  putative bacteriophytochrome  29.66 
 
 
728 aa  292  2e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00897  GAF:ATP-binding region, ATPase-like:Histidine kinase A, N-terminal  28.72 
 
 
884 aa  291  2e-77  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.717501  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10700  putative bacteriophytochrome  29.55 
 
 
728 aa  289  1e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0790  multi-sensor signal transduction histidine kinase  57.66 
 
 
566 aa  285  3.0000000000000004e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.391268  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3034  putative PAS/PAC sensor protein  32.56 
 
 
856 aa  281  5e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0858916  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1703  PAS sensor, signal transduction histidine kinase  51.04 
 
 
368 aa  280  6e-74  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.301457  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1986  putative GAF sensor protein  32.88 
 
 
798 aa  280  7e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.932658  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3289  putative PAS/PAC sensor protein  33.14 
 
 
855 aa  276  1.0000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.363327  normal  0.145052 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2586  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  32.37 
 
 
847 aa  272  2e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.251983 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2330  putative bacteriophytochrome  32.39 
 
 
842 aa  269  1e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.766617  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1677  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27.7 
 
 
770 aa  268  2.9999999999999995e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4562  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.73 
 
 
874 aa  268  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0865092  normal  0.846022 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1182  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  32.85 
 
 
846 aa  266  1e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.75997  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4449  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.23 
 
 
875 aa  265  2e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4081  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  30.23 
 
 
895 aa  265  2e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.628066  normal  0.498394 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2444  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.75 
 
 
721 aa  265  3e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0911916  normal  0.976086 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3089  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.25 
 
 
740 aa  264  4.999999999999999e-69  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.552133  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3364  response regulator  33.39 
 
 
847 aa  262  2e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.427552 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2394  putative GAF sensor protein  33.09 
 
 
847 aa  261  2e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.25898  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4221  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  54.15 
 
 
380 aa  261  3e-68  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1143  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  53.47 
 
 
502 aa  259  1e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.36757  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0908  sensory box histidine kinase  52.71 
 
 
723 aa  259  2e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0382  sensory box histidine kinase  52.71 
 
 
723 aa  259  2e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1235  phytochrome-like protein  31.53 
 
 
506 aa  259  2e-67  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0174  sensory box histidine kinase  52.71 
 
 
821 aa  258  2e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1934  two-component sensor kinase protein  52.71 
 
 
723 aa  259  2e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1844  sensory box histidine kinase  52.71 
 
 
723 aa  258  2e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.167823  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1434  sensory box histidine kinase  52.71 
 
 
821 aa  258  2e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0474  sensory box histidine kinase  52.71 
 
 
821 aa  258  3e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3496  bacteriophytochrome protein  31.61 
 
 
852 aa  258  3e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.552776  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4345  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  47.47 
 
 
890 aa  257  4e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.5665  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1577  multi-sensor signal transduction histidine kinase  50.64 
 
 
532 aa  258  4e-67  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.030472 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0994  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  54.08 
 
 
640 aa  257  5e-67  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.620121  normal  0.0418978 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3017  multi-sensor signal transduction histidine kinase  48.36 
 
 
1669 aa  256  1.0000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1021  multi-sensor signal transduction histidine kinase  51.9 
 
 
960 aa  254  4.0000000000000004e-66  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4329  multi-sensor signal transduction histidine kinase  51.85 
 
 
683 aa  253  1e-65  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.213628  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3723  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.07 
 
 
871 aa  252  2e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.086011 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>