More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_3852 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_0035  multi-sensor signal transduction histidine kinase  72.7 
 
 		 769 aa  1180    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1003  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  48.72 
 
 		 751 aa  714    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.972748  hitchhiker  0.000165551 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3852  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 765 aa  1582    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4111  multi-sensor signal transduction histidine kinase  73.79 
 
 		 760 aa  1152    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4151  multi-sensor signal transduction histidine kinase  73.79 
 
 		 760 aa  1152    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.193587 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2818  multi-sensor signal transduction histidine kinase  66.89 
 
 		 769 aa  1072    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0945314 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4415  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.65 
 
 		 749 aa  668    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.541129  normal  0.358425 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2352  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.9 
 
 		 760 aa  616  1e-175  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4451  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.62 
 
 		 775 aa  551  1e-155  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3780  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.76 
 
 		 779 aa  550  1e-155  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.689927  normal  0.970382 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2403  ATP-binding region, ATPase-like  37.67 
 
 		 776 aa  546  1e-154  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0308443 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3425  GAF sensor signal transduction histidine kinase  37.62 
 
 		 775 aa  535  1e-150  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0531418  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0539  GAF sensor signal transduction histidine kinase  36.68 
 
 		 751 aa  525  1e-147  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.802089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2206  GAF sensor signal transduction histidine kinase  36.6 
 
 		 762 aa  523  1e-147  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.15596  normal  0.128973 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4270  GAF sensor signal transduction histidine kinase  36.79 
 
 		 751 aa  507  9.999999999999999e-143  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.235212 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4021  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.1 
 
 		 1013 aa  494  9.999999999999999e-139  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.864375 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3424  GAF sensor signal transduction histidine kinase  35.87 
 
 		 758 aa  487  1e-136  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.25862  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4450  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.73 
 
 		 758 aa  481  1e-134  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5067  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.3 
 
 		 1002 aa  480  1e-134  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2402  ATP-binding region, ATPase-like  34.62 
 
 		 762 aa  476  1e-133  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0299776 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1284  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.16 
 
 		 791 aa  475  1e-132  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0336702 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1796  GAF sensor signal transduction histidine kinase  36.16 
 
 		 756 aa  475  1e-132  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.232536 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2356  phytochrome family protein, putative  35.91 
 
 		 755 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.634458 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2793  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.03 
 
 		 763 aa  468  9.999999999999999e-131  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.172208  normal  0.714834 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1956  GAF sensor signal transduction histidine kinase  36.64 
 
 		 748 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.727974  normal  0.121547 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0099  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.25 
 
 		 746 aa  468  9.999999999999999e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1484  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.06 
 
 		 1002 aa  463  1e-129  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3339  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.77 
 
 		 748 aa  462  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1511  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.8 
 
 		 1002 aa  460  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0383  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.08 
 
 		 746 aa  453  1.0000000000000001e-126  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.269133 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0423  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.04 
 
 		 799 aa  443  1e-123  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.721204  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3141  GAF sensor signal transduction histidine kinase  35.95 
 
 		 762 aa  433  1e-120  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.583701  normal  0.345899 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2377  ATP-binding region, ATPase-like  34.22 
 
 		 759 aa  432  1e-119  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.974028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3185  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.47 
 
 		 762 aa  430  1e-119  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.97115  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4127  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.13 
 
 		 743 aa  417  9.999999999999999e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.313016  normal  0.0728263 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1902  bacteriophytochrome histidine kinase  34.51 
 
 		 745 aa  412  1e-113  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.333534  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3504  GAF:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  34.47 
 
 		 745 aa  411  1e-113  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.280312  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2162  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  34.71 
 
 		 745 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.894867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0150  phytochrome sensor signal transduction histidine kinase  33.42 
 
 		 752 aa  402  9.999999999999999e-111  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4034  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.52 
 
 		 775 aa  397  1e-109  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3788  phytochrome  39.77 
 
 		 772 aa  397  1e-109  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0317187 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4724  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.11 
 
 		 774 aa  398  1e-109  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.960478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3820  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.02 
 
 		 755 aa  397  1e-109  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.869603  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3936  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.63 
 
 		 757 aa  392  1e-107  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0125  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.07 
 
 		 759 aa  383  1e-105  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.812946  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2020  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.75 
 
 		 771 aa  361  4e-98  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3080  bacteriophytochrome  36.48 
 
 		 783 aa  355  2e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2652  bacteriophytochrome, putative  32.21 
 
 		 993 aa  354  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.163581  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2385  phytochrome:GAF:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal:HWE histidine kinase  32.6 
 
 		 1003 aa  351  2e-95  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.460117  normal  0.215255 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3914  Phytochrome central region domain protein  37.52 
 
 		 509 aa  345  1e-93  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.218618 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1419  putative PAS/PAC sensor protein  35.98 
 
 		 770 aa  336  7.999999999999999e-91  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4519  putative GAF sensor protein  35.32 
 
 		 755 aa  335  2e-90  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3673  putative PAS/PAC sensor protein  36.81 
 
 		 738 aa  319  1e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.483009  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1309  putative PAS/PAC sensor protein  34.94 
 
 		 722 aa  317  4e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.543635 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3740  phytochrome  33.53 
 
 		 732 aa  316  9.999999999999999e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.103591  decreased coverage  0.000116427 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6244  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  34.18 
 
 		 849 aa  316  9.999999999999999e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3985  putative PAS/PAC sensor protein  33.93 
 
 		 732 aa  311  2.9999999999999997e-83  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.525883  normal  0.142655 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2910  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30 
 
 		 783 aa  308  2.0000000000000002e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0200681  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1726  putative PAS/PAC sensor protein  32.74 
 
 		 731 aa  308  3e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7207  putative PAS/PAC sensor protein  34.3 
 
 		 508 aa  306  7e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1986  putative GAF sensor protein  34.23 
 
 		 798 aa  305  2.0000000000000002e-81  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.932658  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3458  putative PAS/PAC sensor protein  32.94 
 
 		 760 aa  303  7.000000000000001e-81  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0932578 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1677  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.83 
 
 		 770 aa  301  3e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0790  multi-sensor signal transduction histidine kinase  58.8 
 
 		 566 aa  300  5e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.391268  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13140  bacteriophytochrome (light-regulated signal transduction histidine kinase)  33.58 
 
 		 772 aa  297  4e-79  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2330  putative bacteriophytochrome  33.01 
 
 		 842 aa  296  7e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.766617  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3034  putative PAS/PAC sensor protein  31.52 
 
 		 856 aa  294  4e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0858916  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3686  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.45 
 
 		 709 aa  292  1e-77  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.206553 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0975  putative bacteriophytochrome  29.27 
 
 		 728 aa  289  1e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6428  bacteriophytochrome  33.64 
 
 		 723 aa  289  1e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.688062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1703  PAS sensor, signal transduction histidine kinase  51.45 
 
 		 368 aa  288  2.9999999999999996e-76  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.301457  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3089  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.43 
 
 		 740 aa  281  4e-74  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.552133  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3289  putative PAS/PAC sensor protein  33.27 
 
 		 855 aa  280  6e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.363327  normal  0.145052 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4329  multi-sensor signal transduction histidine kinase  51.06 
 
 		 683 aa  280  1e-73  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.213628  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3017  multi-sensor signal transduction histidine kinase  51.7 
 
 		 1669 aa  278  3e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3496  bacteriophytochrome protein  33.14 
 
 		 852 aa  278  3e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.552776  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4221  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  58.52 
 
 		 380 aa  278  4e-73  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10700  putative bacteriophytochrome  28.57 
 
 		 728 aa  277  5e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1021  multi-sensor signal transduction histidine kinase  55.93 
 
 		 960 aa  275  2.0000000000000002e-72  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2586  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  33.21 
 
 		 847 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.251983 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1143  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  55.78 
 
 		 502 aa  274  5.000000000000001e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.36757  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3364  response regulator  33.65 
 
 		 847 aa  272  2e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.427552 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4345  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  48.38 
 
 		 890 aa  271  2.9999999999999997e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.5665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00897  GAF:ATP-binding region, ATPase-like:Histidine kinase A, N-terminal  27.2 
 
 		 884 aa  271  2.9999999999999997e-71  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.717501  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1007  sensory box histidine kinase  56.73 
 
 		 812 aa  271  2.9999999999999997e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.572876  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2394  putative GAF sensor protein  32.7 
 
 		 847 aa  271  4e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.25898  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0908  sensory box histidine kinase  54.72 
 
 		 723 aa  271  4e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0382  sensory box histidine kinase  54.72 
 
 		 723 aa  271  4e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1934  two-component sensor kinase protein  54.72 
 
 		 723 aa  271  4e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1844  sensory box histidine kinase  54.72 
 
 		 723 aa  271  4e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.167823  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2444  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.39 
 
 		 721 aa  271  5e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0911916  normal  0.976086 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0474  sensory box histidine kinase  54.72 
 
 		 821 aa  270  5e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0174  sensory box histidine kinase  54.72 
 
 		 821 aa  271  5e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1434  sensory box histidine kinase  54.72 
 
 		 821 aa  271  5e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1235  phytochrome-like protein  33.07 
 
 		 506 aa  266  8.999999999999999e-70  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1182  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  31.94 
 
 		 846 aa  266  1e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.75997  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2574  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  31.77 
 
 		 844 aa  265  3e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.969915 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0994  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  56.65 
 
 		 640 aa  263  8.999999999999999e-69  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.620121  normal  0.0418978 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2280  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  49.59 
 
 		 821 aa  263  1e-68  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4970  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  53.95 
 
 		 361 aa  262  2e-68  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.121387  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>