More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_1475 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_1502  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  100 
 
 		 311 aa  640    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1475  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  100 
 
 		 311 aa  640    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2841  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  45.21 
 
 		 308 aa  276  3e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.585847 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2205  multi-sensor hybrid histidine kinase  46.11 
 
 		 887 aa  172  6.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.188088 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0790  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.62 
 
 		 566 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.391268  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1030  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  44.97 
 
 		 330 aa  145  9e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.33399 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1271  hybrid signal transduction histidine kinase and diguanylate cyclase/phosphodiesterase  51.56 
 
 		 1499 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.422796  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2710  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  51.18 
 
 		 704 aa  138  1e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00325078 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1506  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  50.39 
 
 		 704 aa  135  6.0000000000000005e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3170  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  45.91 
 
 		 344 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.103544 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4328  multi-sensor signal transduction histidine kinase  49.59 
 
 		 612 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0902  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  41.96 
 
 		 718 aa  132  5e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.651526  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1038  sensory box histidine kinase/response regulator  44.88 
 
 		 513 aa  127  3e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1055  two component signal transduction response regulator  44.44 
 
 		 734 aa  127  3e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0148851  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4005  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  39.86 
 
 		 696 aa  125  8.000000000000001e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2857  sensory box/response regulator  42.75 
 
 		 754 aa  124  3e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.917485  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2717  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  43.2 
 
 		 720 aa  120  3e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00595541 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3328  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  39.86 
 
 		 711 aa  119  4.9999999999999996e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3542  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  29.76 
 
 		 590 aa  119  7e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0166  response regulator receiver/GGDEF/EAL domain-containing protein  45 
 
 		 697 aa  118  9.999999999999999e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1597  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  40.62 
 
 		 860 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.711633  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1617  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  40.62 
 
 		 860 aa  117  3e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1710  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  41.86 
 
 		 720 aa  115  8.999999999999998e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.425295  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3848  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  44.8 
 
 		 703 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.343403  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1037  sensory box/response regulator  38.64 
 
 		 799 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4417  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.25 
 
 		 1548 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.409401 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2788  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  42.19 
 
 		 715 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.941936  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2505  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  45.24 
 
 		 331 aa  108  1e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2820  response regulator  42.24 
 
 		 462 aa  107  2e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.229785  normal  0.330149 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1269  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  43.65 
 
 		 705 aa  108  2e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1713  two component LuxR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 361 aa  107  4e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.310925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3111  response regulator receiver protein  43.09 
 
 		 328 aa  106  6e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0637882 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3534  response regulator receiver protein  43.75 
 
 		 393 aa  106  7e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1761  two component LuxR family transcriptional regulator  39.2 
 
 		 311 aa  105  8e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3613  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.39 
 
 		 1808 aa  105  8e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.643019 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2977  response regulator receiver domain-containing protein  41.13 
 
 		 303 aa  105  1e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.13601 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1432  response regulator PleD  42.61 
 
 		 457 aa  103  3e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1777  metal dependent phosphohydrolase, HD region with response regulator receiver modulation  41.09 
 
 		 414 aa  103  3e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3524  two component LuxR family transcriptional regulator  40.31 
 
 		 353 aa  103  3e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.406085  normal  0.428998 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2099  response regulator receiver modulated diguanylate phosphodiesterase  39.1 
 
 		 402 aa  103  4e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.316821 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1083  two component LuxR family transcriptional regulator  40.5 
 
 		 316 aa  103  5e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01717  putative response regulator  37.66 
 
 		 568 aa  102  6e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2180  response regulator receiver  40.62 
 
 		 151 aa  102  8e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.269305  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1090  response regulator receiver protein  37.8 
 
 		 846 aa  100  2e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.874134  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4530  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  33.72 
 
 		 386 aa  101  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0702  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  38.89 
 
 		 331 aa  101  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.140022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2951  two component transcriptional regulator  40.5 
 
 		 236 aa  101  2e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3308  response regulator PleD  42.61 
 
 		 457 aa  100  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.268667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3038  response regulator PleD  41.74 
 
 		 457 aa  100  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.372566  normal  0.319547 
 
 
-
 
NC_002978  WD0221  response regulator PleD  42.61 
 
 		 460 aa  100  4e-20  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4080  DNA-binding response regulator, LuxR family  39.52 
 
 		 222 aa  100  4e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.542388  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2442  response regulator PleD  42.61 
 
 		 457 aa  100  4e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.696702  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2413  response regulator PleD  41.74 
 
 		 457 aa  99.8  5e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.592932  normal  0.173821 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3730  two component LuxR family transcriptional regulator  38.52 
 
 		 312 aa  99.8  5e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4638  two component LuxR family transcriptional regulator  38.52 
 
 		 312 aa  99.8  5e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1006  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  41.27 
 
 		 312 aa  99.8  6e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5666  two component LuxR family transcriptional regulator  38.52 
 
 		 312 aa  99.8  6e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.917296 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01756  Response regulator CheB (receptor modification enzyme, protein-glutamate methylesterase)  40.62 
 
 		 337 aa  99.4  7e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.844049  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0773  response regulator PleD  36.99 
 
 		 458 aa  99  8e-20  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1832  two component transcriptional regulator  37.1 
 
 		 245 aa  99  8e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.366424  normal  0.561636 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3541  response regulator PleD  43.48 
 
 		 457 aa  98.6  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0304  response regulator PleD  36.99 
 
 		 458 aa  98.6  1e-19  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0864091  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0809  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  38.19 
 
 		 367 aa  98.2  1e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0298  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  39.68 
 
 		 331 aa  98.6  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.7054  normal  0.177262 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2984  two component transcriptional regulator, LuxR family protein  42.22 
 
 		 295 aa  99  1e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.43543  normal  0.546259 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4179  response regulator receiver protein  35.14 
 
 		 309 aa  99  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.15819 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1496  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.23 
 
 		 679 aa  98.2  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.381542  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0932  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  35.9 
 
 		 374 aa  99  1e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1011  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.03 
 
 		 231 aa  99  1e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3604  putative PAS/PAC sensor protein  34.01 
 
 		 619 aa  97.8  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.562878 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3499  transcriptional regulator LuxR family  36.07 
 
 		 312 aa  97.8  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2157  response regulator receiver protein  28.48 
 
 		 577 aa  98.2  2e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0793  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.21 
 
 		 225 aa  97.8  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0792  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  41.32 
 
 		 331 aa  97.4  2e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3231  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  41.32 
 
 		 331 aa  97.4  2e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0366  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  25.42 
 
 		 1081 aa  97.8  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0627  response regulator receiver protein  39.5 
 
 		 163 aa  97.8  2e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.143116  hitchhiker  0.00307044 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1236  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.58 
 
 		 386 aa  97.4  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.493129  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04130  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  35.66 
 
 		 236 aa  97.1  3e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.118973  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4011  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.41 
 
 		 236 aa  96.7  4e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0268606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4746  response regulator PleD  41.59 
 
 		 466 aa  96.7  5e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0979514  normal  0.753316 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3814  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  41.59 
 
 		 1131 aa  96.3  6e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.257486 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1382  response regulator receiver protein  30.86 
 
 		 302 aa  96.3  6e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3131  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  38.4 
 
 		 464 aa  96.3  7e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.308445 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0979  response regulator receiver protein  37.6 
 
 		 336 aa  95.9  8e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1098  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.52 
 
 		 228 aa  95.9  8e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2401  phosphate regulon transcriptional regulatory protein phoB  33.33 
 
 		 229 aa  95.9  8e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1354  two component LuxR family transcriptional regulator  37.6 
 
 		 349 aa  95.9  8e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2815  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  35.82 
 
 		 457 aa  95.9  8e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.631579  normal  0.0857187 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3790  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  32.35 
 
 		 300 aa  95.9  8e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00878  two-component response regulator  38.52 
 
 		 298 aa  95.9  9e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3552  Cache sensor hybrid histidine kinase  45.63 
 
 		 970 aa  95.5  9e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1474  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  32.41 
 
 		 345 aa  95.9  9e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3637  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.37 
 
 		 246 aa  95.1  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0347  PAS  35.77 
 
 		 513 aa  95.5  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000072068 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1963  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.37 
 
 		 246 aa  95.1  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.470012 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1498  two component transcriptional regulator  39.37 
 
 		 247 aa  95.5  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.220919  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1936  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.37 
 
 		 246 aa  95.1  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0603  two component transcriptional regulator  40 
 
 		 233 aa  95.5  1e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0519325  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2297  putative PAS/PAC sensor protein  42.02 
 
 		 484 aa  95.5  1e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0617558  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>