More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1832 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008578  Acel_1832  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 245 aa  484  1e-136  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.366424  normal  0.561636 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2351  two component transcriptional regulator, winged helix family  59.91 
 
 		 231 aa  251  1e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.274912  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3871  two component transcriptional regulator, winged helix family  57.01 
 
 		 227 aa  237  1e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000000473157  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2815  two component transcriptional regulator, winged helix family  57.45 
 
 		 238 aa  237  1e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.180318  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1933  two component transcriptional regulator, winged helix family  58.3 
 
 		 241 aa  230  2e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.10381  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2570  response regulator receiver  62.16 
 
 		 236 aa  226  3e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.16396 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20650  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  54.75 
 
 		 231 aa  222  3e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0260682  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1073  putative response regulator  50.22 
 
 		 234 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0395  two component transcriptional regulator, winged helix family  56.6 
 
 		 240 aa  217  1e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2766  two component transcriptional regulator  61.26 
 
 		 224 aa  216  2.9999999999999998e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.327413  hitchhiker  0.000587872 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0019  two component transcriptional regulator  49.56 
 
 		 235 aa  213  2.9999999999999995e-54  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1950  DNA-binding response regulator  45.92 
 
 		 235 aa  211  7e-54  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.100456  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0295  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.71 
 
 		 227 aa  210  2e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00362669  normal  0.695564 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0080  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.93 
 
 		 230 aa  209  4e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2910  response regulator receiver  47.79 
 
 		 230 aa  208  5e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08590  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  49.34 
 
 		 239 aa  208  7e-53  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.857083 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2741  winged helix family two component transcriptional regulator  46.58 
 
 		 250 aa  208  8e-53  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0957275  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2496  response regulator receiver  50.23 
 
 		 225 aa  207  1e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.491467  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2443  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.32 
 
 		 224 aa  207  1e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00121019 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0105  DNA-binding response regulator  47.62 
 
 		 237 aa  207  1e-52  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2712  two component transcriptional regulator  49.32 
 
 		 224 aa  206  2e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00552555  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0088  two component transcriptional regulator  51.32 
 
 		 228 aa  206  2e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2333  two component transcriptional regulator  46.19 
 
 		 232 aa  206  2e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0499  winged helix family two component transcriptional regulator  48.89 
 
 		 229 aa  205  4e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1116  DNA-binding response regulator  45.69 
 
 		 235 aa  205  4e-52  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.310768  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3815  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.89 
 
 		 225 aa  205  4e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0278114  normal  0.0118387 
 
 
-
 
NC_002936  DET0135  DNA-binding response regulator  48.89 
 
 		 230 aa  205  5e-52  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0260  response regulator receiver protein  51.34 
 
 		 224 aa  205  5e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.820416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0235  two component transcriptional regulator  49.78 
 
 		 230 aa  205  6e-52  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0700  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.66 
 
 		 226 aa  205  6e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.768939  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5905  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.23 
 
 		 237 aa  205  7e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4043  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.33 
 
 		 225 aa  204  9e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.728877  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09340  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  50.45 
 
 		 223 aa  204  1e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.217912  normal  0.763127 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0793  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.9 
 
 		 225 aa  204  1e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_143  DNA-binding response regulator, two-component system, OmpR family  44.71 
 
 		 256 aa  204  1e-51  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3739  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.98 
 
 		 230 aa  203  2e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000466515  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1827  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.68 
 
 		 227 aa  203  2e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3409  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.25 
 
 		 236 aa  203  2e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1028  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.53 
 
 		 237 aa  203  2e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3538  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.9 
 
 		 237 aa  203  2e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4322  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.44 
 
 		 231 aa  203  2e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3369  two component transcriptional regulator  45.73 
 
 		 250 aa  202  4e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.881494  normal  0.845013 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3302  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.35 
 
 		 231 aa  201  7e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000343135 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3460  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.22 
 
 		 250 aa  201  8e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03700  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  46.64 
 
 		 226 aa  201  8e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.132847 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8215  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.33 
 
 		 226 aa  201  8e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2657  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.22 
 
 		 250 aa  201  8e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.350713 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6310  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.87 
 
 		 261 aa  201  8e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.534044  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09290  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  48.23 
 
 		 229 aa  201  9.999999999999999e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0580  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.98 
 
 		 226 aa  199  3e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2534  DNA-binding response regulator YycF  46.29 
 
 		 233 aa  199  3e-50  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0657  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.56 
 
 		 235 aa  199  3e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.118815  hitchhiker  0.000311431 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0961  response regulator receiver protein  47.11 
 
 		 229 aa  199  3e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0719  DNA-binding response regulator  43.78 
 
 		 236 aa  199  3.9999999999999996e-50  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0951718  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1136  two component transcriptional regulator  44.54 
 
 		 239 aa  199  3.9999999999999996e-50  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000652217  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03750  PhoP-like protein  47.09 
 
 		 226 aa  199  3.9999999999999996e-50  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.181369  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1174  two component transcriptional regulator  44.54 
 
 		 239 aa  199  3.9999999999999996e-50  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0181894  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0439  two component transcriptional regulator  43.11 
 
 		 225 aa  199  3.9999999999999996e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000223011  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4006  two component transcriptional regulator  46.46 
 
 		 235 aa  199  5e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.010356  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  45.13 
 
 		 229 aa  199  5e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0654  two component transcriptional regulator, winged helix family  50 
 
 		 229 aa  199  5e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.200991  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3394  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.5 
 
 		 230 aa  198  5e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.103692  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1237  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.56 
 
 		 232 aa  198  6e-50  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0064  DNA-binding response regulator  46.7 
 
 		 235 aa  198  6e-50  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.611294  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2566  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.81 
 
 		 229 aa  198  6e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000356007  hitchhiker  0.00345607 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5589  DNA-binding response regulator YycF  46.46 
 
 		 235 aa  198  7e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0469644  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5346  DNA-binding response regulator YycF  46.46 
 
 		 235 aa  198  7e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000234523  hitchhiker  0.00000000000323141 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0018  two component transcriptional regulator  45.37 
 
 		 233 aa  197  9e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.70243  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0018  response regulator receiver  45.37 
 
 		 233 aa  197  9e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0997  two component transcriptional regulator  47.75 
 
 		 230 aa  197  9e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.679101  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5615  DNA-binding response regulator YycF  46.46 
 
 		 235 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5319  DNA-binding response regulator YycF  46.46 
 
 		 235 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.169223  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5572  DNA-binding response regulator YycF  46.46 
 
 		 235 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.81316e-29 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5147  response regulator  46.46 
 
 		 235 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00168683  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5163  response regulator  46.46 
 
 		 235 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00196509  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5715  DNA-binding response regulator YycF  46.46 
 
 		 235 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.656882  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14770  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  50.23 
 
 		 226 aa  197  1.0000000000000001e-49  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.383411  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0042  response regulator  45.69 
 
 		 240 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.382747  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5650  DNA-binding response regulator YycF  46.46 
 
 		 235 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00563499  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4285  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.78 
 
 		 238 aa  196  2.0000000000000003e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.83647  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1288  two component transcriptional regulator  42.15 
 
 		 228 aa  197  2.0000000000000003e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000128008  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2782  two component transcriptional regulator  46.4 
 
 		 231 aa  196  3e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.92379  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4046  response regulator receiver  48.2 
 
 		 225 aa  196  3e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4602  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.98 
 
 		 226 aa  196  4.0000000000000005e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5259  two component transcriptional regulator  46.02 
 
 		 235 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000559572  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2108  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.21 
 
 		 243 aa  195  5.000000000000001e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2983  two component transcriptional regulator  46.67 
 
 		 228 aa  195  5.000000000000001e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6749  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.98 
 
 		 226 aa  195  6e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.290774  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1456  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.54 
 
 		 223 aa  195  7e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000183373  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0444  DNA-binding response regulator  47.14 
 
 		 233 aa  195  7e-49  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1892  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.49 
 
 		 228 aa  194  8.000000000000001e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000392  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3600  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.91 
 
 		 250 aa  194  9e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00284005 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6145  two component transcriptional regulator  46.7 
 
 		 228 aa  194  1e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.788201 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0392  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.35 
 
 		 253 aa  194  1e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.958031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3818  two component transcriptional regulator  48.66 
 
 		 230 aa  193  2e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.386967  normal  0.165932 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1838  two component transcriptional regulator  45.41 
 
 		 239 aa  193  2e-48  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000194698  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0804  two component transcriptional regulator  46.19 
 
 		 236 aa  194  2e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.324741  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3745  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.77 
 
 		 225 aa  193  2e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.5489  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0875  two component transcriptional regulator  45.45 
 
 		 242 aa  193  2e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.000486966  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1954  two component transcriptional regulator  43.56 
 
 		 229 aa  192  3e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000155813  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>