More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_3534 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_3534  response regulator receiver protein  100 
 
 		 393 aa  817    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2342  response regulator receiver protein  35.84 
 
 		 561 aa  265  8.999999999999999e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00850448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3071  response regulator receiver protein  34.19 
 
 		 390 aa  236  6e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000442652 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2819  response regulator receiver protein  33.94 
 
 		 562 aa  225  9e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0360472 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34360  Response regulator  34.63 
 
 		 575 aa  222  8e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.328347  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2956  response regulator receiver protein  33.25 
 
 		 365 aa  216  4e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2157  response regulator receiver protein  32.22 
 
 		 577 aa  216  5.9999999999999996e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20780  putative two-component response regulator  32.3 
 
 		 571 aa  216  8e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.283191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3688  response regulator receiver protein  31.78 
 
 		 564 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1784  putative two-component response regulator  32.56 
 
 		 571 aa  213  5.999999999999999e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1964  response regulator  32.56 
 
 		 568 aa  210  3e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.58831  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1504  response regulator receiver protein  33.25 
 
 		 563 aa  209  6e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.709749  normal  0.106415 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4363  response regulator receiver protein  33.25 
 
 		 563 aa  209  1e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.470941 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1542  response regulator receiver domain-containing protein  31.7 
 
 		 567 aa  208  2e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.3365  normal  0.98827 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3924  response regulator receiver protein  32.21 
 
 		 563 aa  207  3e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3451  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:stage II sporulation E  31.52 
 
 		 568 aa  204  2e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.223622  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3580  response regulator receiver protein  29.61 
 
 		 564 aa  202  7e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1991  response regulator receiver protein  31.32 
 
 		 574 aa  200  3e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2528  response regulator receiver protein  33.07 
 
 		 378 aa  199  7e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.249668  normal  0.0734484 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2179  flagellar basal-body rod protein FlgC  28.01 
 
 		 575 aa  191  2e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3440  response regulator receiver protein  29.11 
 
 		 572 aa  182  1e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3023  response regulator receiver protein  30.31 
 
 		 367 aa  177  3e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.566048  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1726  putative PAS/PAC sensor protein  37.76 
 
 		 504 aa  174  2.9999999999999996e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0909206  normal  0.287685 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3118  response regulator receiver domain-containing protein  26.49 
 
 		 563 aa  174  2.9999999999999996e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01717  putative response regulator  28.31 
 
 		 568 aa  172  1e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0157  response regulator  27.11 
 
 		 568 aa  172  1e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1594  response regulator receiver protein  29.16 
 
 		 548 aa  170  5e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0435  response regulator receiver protein  30.5 
 
 		 373 aa  169  5e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0149866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1039  response regulator receiver domain-containing protein  26.3 
 
 		 567 aa  157  4e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3297  response regulator receiver protein  28.53 
 
 		 550 aa  143  6e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2226  response regulator receiver protein  23.76 
 
 		 383 aa  137  4e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.916787 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3485  response regulator  24.75 
 
 		 422 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1030  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  40.12 
 
 		 330 aa  130  3e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.33399 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2096  response regulator receiver protein  25.31 
 
 		 577 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.856197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2220  response regulator receiver protein  26.48 
 
 		 565 aa  127  3e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2366  response regulator receiver protein  25.8 
 
 		 577 aa  127  3e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.018295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2946  response regulator receiver modulated serine phosphatase  24.93 
 
 		 384 aa  127  4.0000000000000003e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2119  response regulator  27.25 
 
 		 565 aa  124  2e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2095  response regulator receiver protein  25.49 
 
 		 567 aa  124  2e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2249  response regulator receiver protein  25.55 
 
 		 577 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.299733  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1879  response regulator receiver protein  25.49 
 
 		 567 aa  124  3e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.686257 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2841  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  35.03 
 
 		 308 aa  122  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.585847 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2998  response regulator receiver protein  25.3 
 
 		 377 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2467  response regulator receiver modulated serine phosphatase  23.51 
 
 		 385 aa  113  5e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0302  response regulator receiver modulated serine phosphatase  22.83 
 
 		 400 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0347  PAS  29.67 
 
 		 513 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000072068 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2870  response regulator receiver protein  24.69 
 
 		 418 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0329  putative response regulator  24.56 
 
 		 415 aa  111  2.0000000000000002e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05599  response regulator receiver  22.98 
 
 		 560 aa  110  4.0000000000000004e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1566  response regulator receiver (CheY) modulated Serine phosphatase  22.9 
 
 		 396 aa  110  6e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.244929 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000007  serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit  22.72 
 
 		 397 aa  109  8.000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.441967  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1055  two component signal transduction response regulator  38.13 
 
 		 734 aa  109  8.000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0148851  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2647  response regulator receiver protein  25.37 
 
 		 418 aa  109  9.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0228439  normal  0.825958 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2205  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.63 
 
 		 887 aa  109  9.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.188088 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1210  response regulator receiver protein  24.56 
 
 		 400 aa  109  1e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0544929  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2673  response regulator receiver modulated serine phosphatase  26.22 
 
 		 392 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4005  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  34.78 
 
 		 696 aa  108  2e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0279  response regulator receiver modulated serine phosphatase  26.98 
 
 		 394 aa  108  2e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2013  response regulator receiver modulated serine phosphatase  24.21 
 
 		 411 aa  106  6e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.155477  normal  0.0155604 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2710  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  34.31 
 
 		 704 aa  106  7e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00325078 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1502  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  43.75 
 
 		 311 aa  106  9e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4328  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.23 
 
 		 612 aa  106  9e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1475  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  43.75 
 
 		 311 aa  106  9e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1506  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  34.31 
 
 		 704 aa  105  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3170  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  33 
 
 		 344 aa  104  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.103544 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1844  response regulator receiver modulated serine phosphatase  22.56 
 
 		 379 aa  104  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3848  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  35.54 
 
 		 703 aa  104  3e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.343403  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1440  response regulator  25.21 
 
 		 391 aa  103  4e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0677305  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0205  response regulator receiver protein  25 
 
 		 395 aa  103  4e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1271  hybrid signal transduction histidine kinase and diguanylate cyclase/phosphodiesterase  35.48 
 
 		 1499 aa  103  4e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.422796  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1870  response regulator receiver modulated serine phosphatase  22.56 
 
 		 379 aa  103  4e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.177859  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2078  response regulator receiver modulated serine phosphatase  24.1 
 
 		 379 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.61197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0905  response regulator receiver modulated serine phosphatase  23.51 
 
 		 380 aa  102  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0589  response regulator receiver modulated serine phosphatase  23.38 
 
 		 371 aa  102  1e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.420228  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6548  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  31.72 
 
 		 397 aa  102  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.543575 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0731  response regulator receiver modulated serine phosphatase  26.13 
 
 		 396 aa  101  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0898  sigma factor sigB regulation protein  23.02 
 
 		 380 aa  101  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.503671  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0605  adenylate/guanylate cyclase  37.14 
 
 		 355 aa  102  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.657653  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2360  response regulator receiver protein  42.98 
 
 		 523 aa  102  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0106  stage II sporulation E  29.24 
 
 		 415 aa  101  3e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1710  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  39.82 
 
 		 720 aa  100  3e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.425295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0495  response regulator receiver protein  24.75 
 
 		 423 aa  100  5e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0915  sigma factor sigB regulation protein  23.02 
 
 		 380 aa  100  6e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00116334  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1088  response regulator  22.41 
 
 		 380 aa  99.8  7e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0930  response regulator  23.02 
 
 		 380 aa  100  7e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0994  response regulator  23.02 
 
 		 380 aa  100  7e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2943  response regulator receiver modulated serine phosphatase  23.08 
 
 		 470 aa  99.8  8e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1161  response regulator  22.7 
 
 		 380 aa  99.8  8e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1070  response regulator  22.7 
 
 		 358 aa  99.4  9e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.209800000000002e-41 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0176  response regulator receiver modulated serine phosphatase  23.91 
 
 		 378 aa  99.4  1e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3723  response regulator receiver (CheY) modulated Serine phosphatase  22.89 
 
 		 378 aa  98.6  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0976167  normal  0.601311 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1761  two component LuxR family transcriptional regulator  29.22 
 
 		 311 aa  98.6  2e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4268  response regulator  22.41 
 
 		 380 aa  97.8  3e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00568873 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1038  sensory box histidine kinase/response regulator  35.25 
 
 		 513 aa  97.4  4e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1035  response regulator  22.41 
 
 		 380 aa  97.4  4e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0166  response regulator receiver/GGDEF/EAL domain-containing protein  33.33 
 
 		 697 aa  97.4  4e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1269  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  30.4 
 
 		 705 aa  97.1  5e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2507  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  30.99 
 
 		 488 aa  97.1  5e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.182398 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2673  response regulator receiver modulated serine phosphatase  23.56 
 
 		 389 aa  96.7  7e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1587  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.51 
 
 		 292 aa  95.9  1e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.522901  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>