More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0435 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0435  response regulator receiver protein  100 
 
 		 373 aa  758    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0149866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3023  response regulator receiver protein  37.84 
 
 		 367 aa  255  8e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.566048  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2956  response regulator receiver protein  36.99 
 
 		 365 aa  224  1e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3071  response regulator receiver protein  33.59 
 
 		 390 aa  179  7e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000442652 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1964  response regulator  32.72 
 
 		 568 aa  178  1e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.58831  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2342  response regulator receiver protein  34.78 
 
 		 561 aa  177  3e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00850448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3580  response regulator receiver protein  32.62 
 
 		 564 aa  176  8e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3451  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:stage II sporulation E  32.1 
 
 		 568 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.223622  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2157  response regulator receiver protein  31.37 
 
 		 577 aa  175  9.999999999999999e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34360  Response regulator  32.22 
 
 		 575 aa  173  3.9999999999999995e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.328347  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2179  flagellar basal-body rod protein FlgC  32.29 
 
 		 575 aa  172  1e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1784  putative two-component response regulator  31.48 
 
 		 571 aa  171  2e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20780  putative two-component response regulator  31.54 
 
 		 571 aa  171  2e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.283191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1991  response regulator receiver protein  33.02 
 
 		 574 aa  170  3e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3534  response regulator receiver protein  30.5 
 
 		 393 aa  169  5e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1542  response regulator receiver domain-containing protein  31.2 
 
 		 567 aa  169  5e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.3365  normal  0.98827 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2819  response regulator receiver protein  31.64 
 
 		 562 aa  168  2e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0360472 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3688  response regulator receiver protein  31.29 
 
 		 564 aa  160  5e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1504  response regulator receiver protein  31.9 
 
 		 563 aa  159  7e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.709749  normal  0.106415 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4363  response regulator receiver protein  31.9 
 
 		 563 aa  159  8e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.470941 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01717  putative response regulator  30.95 
 
 		 568 aa  157  3e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3924  response regulator receiver protein  31.29 
 
 		 563 aa  155  8e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1594  response regulator receiver protein  30.09 
 
 		 548 aa  144  4e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2528  response regulator receiver protein  30 
 
 		 378 aa  140  4.999999999999999e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.249668  normal  0.0734484 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3118  response regulator receiver domain-containing protein  29.13 
 
 		 563 aa  139  1e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3440  response regulator receiver protein  28.99 
 
 		 572 aa  137  4e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2226  response regulator receiver protein  25.32 
 
 		 383 aa  130  5.0000000000000004e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.916787 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2220  response regulator receiver protein  26.58 
 
 		 565 aa  120  6e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1726  putative PAS/PAC sensor protein  27.74 
 
 		 504 aa  117  1.9999999999999998e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0909206  normal  0.287685 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2095  response regulator receiver protein  27.2 
 
 		 567 aa  116  6.9999999999999995e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1879  response regulator receiver protein  27.2 
 
 		 567 aa  115  8.999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.686257 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0347  PAS  36 
 
 		 513 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000072068 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1039  response regulator receiver domain-containing protein  26.44 
 
 		 567 aa  113  5e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0157  response regulator  23.72 
 
 		 568 aa  110  5e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3297  response regulator receiver protein  25.15 
 
 		 550 aa  107  3e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2946  response regulator receiver modulated serine phosphatase  25.15 
 
 		 384 aa  102  8e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1878  two component transcriptional regulator  41.8 
 
 		 242 aa  100  5e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.559477 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1522  two component transcriptional regulator  42.5 
 
 		 227 aa  99.8  6e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0581  winged helix family two component transcriptional regulator  41.8 
 
 		 242 aa  99.8  8e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.296955  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2467  response regulator receiver modulated serine phosphatase  25.23 
 
 		 385 aa  99.4  9e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2353  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.8 
 
 		 243 aa  99  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0794558  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1562  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  38.41 
 
 		 369 aa  99  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.847548  normal  0.236297 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2302  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.8 
 
 		 243 aa  99  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3086  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.44 
 
 		 233 aa  98.2  2e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.151774  normal  0.916258 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1712  two component transcriptional regulator  40.3 
 
 		 248 aa  98.2  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2712  two component transcriptional regulator  38.41 
 
 		 224 aa  98.2  2e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00552555  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04836  two-component system regulatory protein  41.13 
 
 		 229 aa  97.4  4e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0109  two component transcriptional regulator  40.15 
 
 		 253 aa  97.1  4e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.427788  normal  0.468211 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0954  two component transcriptional regulator  40.98 
 
 		 243 aa  97.1  4e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0817018 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3391  two component transcriptional regulator  34.21 
 
 		 227 aa  97.1  5e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.141218  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4207  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.98 
 
 		 247 aa  97.1  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18111  two-component response regulator  41.46 
 
 		 248 aa  96.7  5e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2286  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.51 
 
 		 231 aa  96.7  6e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000188753  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1453  two component transcriptional regulator  41.8 
 
 		 244 aa  96.7  6e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.952418  normal  0.0249242 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3065  DNA-binding response regulator  42.52 
 
 		 237 aa  96.3  7e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00140102  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2366  response regulator receiver protein  24.19 
 
 		 577 aa  96.7  7e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.018295  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0238  multi-component transcriptional regulator  45.45 
 
 		 1629 aa  96.3  8e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18291  two-component response regulator  41.46 
 
 		 248 aa  96.3  8e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.276613  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3225  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.34 
 
 		 231 aa  96.3  9e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.202731  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0153  two component transcriptional regulator  39.42 
 
 		 253 aa  96.3  9e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.711737  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20711  two-component response regulator  41.94 
 
 		 246 aa  96.3  9e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2096  response regulator receiver protein  24.19 
 
 		 577 aa  95.9  9e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.856197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1196  two component transcriptional regulator  41.94 
 
 		 246 aa  95.9  1e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1115  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.98 
 
 		 243 aa  95.9  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0950226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3999  adenylate/guanylate cyclase  32.64 
 
 		 351 aa  95.5  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.558191 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0351  DNA-binding response regulator  38.12 
 
 		 230 aa  95.9  1e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1181  winged helix family two component transcriptional regulator  36.99 
 
 		 232 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.037877  normal  0.73042 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01531  two-component response regulator  38.4 
 
 		 248 aa  94.7  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2998  response regulator receiver protein  24.63 
 
 		 377 aa  94.7  2e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01481  two-component response regulator  36.64 
 
 		 248 aa  94.7  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3169  regulatory protein VanR  40.6 
 
 		 229 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.16404  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17451  two-component response regulator  38.41 
 
 		 269 aa  95.1  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1461  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.3 
 
 		 225 aa  94.7  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.616357  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3084  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  40.98 
 
 		 229 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.692731  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2692  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.43 
 
 		 229 aa  94.7  2e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1211  two component transcriptional regulator  36.49 
 
 		 232 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.676109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18081  two-component response regulator  41.8 
 
 		 248 aa  95.1  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1961  two component transcriptional regulator  40.8 
 
 		 240 aa  95.1  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.326957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2325  two component transcriptional regulator  42.15 
 
 		 238 aa  95.1  2e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0521181  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4235  two component transcriptional regulator  37.67 
 
 		 232 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.207223  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1714  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.74 
 
 		 234 aa  94.7  2e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.233786  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2443  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.96 
 
 		 224 aa  94.4  3e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00121019 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1792  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.83 
 
 		 249 aa  94.4  3e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.783202  normal  0.482984 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0599  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  43.33 
 
 		 313 aa  94.4  3e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.464892  normal  0.548622 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1673  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.06 
 
 		 233 aa  94  4e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4702  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  31.93 
 
 		 381 aa  94  4e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0901362  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1193  two component transcriptional regulator  37.16 
 
 		 232 aa  94  4e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0519929  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3133  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.71 
 
 		 231 aa  94  4e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0749  two component transcriptional regulator  38.06 
 
 		 234 aa  93.6  5e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.326027  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3210  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  36.76 
 
 		 337 aa  93.6  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.32327  normal  0.712325 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1892  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.68 
 
 		 228 aa  93.6  5e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000392  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2022  two component transcriptional regulator  41.32 
 
 		 238 aa  93.6  5e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.730555 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3569  two component transcriptional regulator  38.06 
 
 		 234 aa  93.6  5e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.401849  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0136  two component transcriptional regulator  38.17 
 
 		 248 aa  93.6  5e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3501  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.06 
 
 		 234 aa  93.6  5e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3690  two component transcriptional regulator  38.06 
 
 		 234 aa  93.6  5e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.038332  normal  0.0151663 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0119  DNA-binding response regulator  35.71 
 
 		 230 aa  93.6  5e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1456  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.67 
 
 		 223 aa  93.2  6e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000183373  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2384  two component transcriptional regulator  38.81 
 
 		 259 aa  93.2  6e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2526  DNA-binding response regulator  32.89 
 
 		 231 aa  93.2  6e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>