More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_1542 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_4363  response regulator receiver protein  67.85 
 
 		 563 aa  784    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.470941 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1964  response regulator  69.79 
 
 		 568 aa  803    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.58831  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3688  response regulator receiver protein  69.15 
 
 		 564 aa  795    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3451  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:stage II sporulation E  69.19 
 
 		 568 aa  796    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.223622  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3924  response regulator receiver protein  68.56 
 
 		 563 aa  794    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1542  response regulator receiver domain-containing protein  100 
 
 		 567 aa  1158    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.3365  normal  0.98827 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2819  response regulator receiver protein  68.38 
 
 		 562 aa  741    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0360472 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1784  putative two-component response regulator  68.69 
 
 		 571 aa  775    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34360  Response regulator  71.53 
 
 		 575 aa  790    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.328347  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1504  response regulator receiver protein  67.67 
 
 		 563 aa  786    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.709749  normal  0.106415 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20780  putative two-component response regulator  68.34 
 
 		 571 aa  776    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.283191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1991  response regulator receiver protein  47.79 
 
 		 574 aa  518  1.0000000000000001e-145  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2179  flagellar basal-body rod protein FlgC  45.53 
 
 		 575 aa  518  1.0000000000000001e-145  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3580  response regulator receiver protein  38.61 
 
 		 564 aa  432  1e-120  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3440  response regulator receiver protein  39.75 
 
 		 572 aa  424  1e-117  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2157  response regulator receiver protein  39.82 
 
 		 577 aa  379  1e-103  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3118  response regulator receiver domain-containing protein  33.04 
 
 		 563 aa  336  5.999999999999999e-91  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1594  response regulator receiver protein  33.27 
 
 		 548 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01717  putative response regulator  32.81 
 
 		 568 aa  294  4e-78  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1039  response regulator receiver domain-containing protein  30.51 
 
 		 567 aa  281  3e-74  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0157  response regulator  28.7 
 
 		 568 aa  264  3e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2342  response regulator receiver protein  30.81 
 
 		 561 aa  260  5.0000000000000005e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00850448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2956  response regulator receiver protein  36.34 
 
 		 365 aa  240  4e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2220  response regulator receiver protein  27.7 
 
 		 565 aa  211  2e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3534  response regulator receiver protein  31.7 
 
 		 393 aa  208  2e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2095  response regulator receiver protein  27.63 
 
 		 567 aa  206  8e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1879  response regulator receiver protein  27.63 
 
 		 567 aa  205  2e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.686257 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2119  response regulator  29.05 
 
 		 565 aa  199  9e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3297  response regulator receiver protein  25.96 
 
 		 550 aa  198  2.0000000000000003e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2366  response regulator receiver protein  27.16 
 
 		 577 aa  196  8.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.018295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2249  response regulator receiver protein  27.26 
 
 		 577 aa  192  1e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.299733  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2096  response regulator receiver protein  27.14 
 
 		 577 aa  188  3e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.856197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2226  response regulator receiver protein  27.59 
 
 		 383 aa  182  1e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.916787 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3071  response regulator receiver protein  31.77 
 
 		 390 aa  180  5.999999999999999e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000442652 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2528  response regulator receiver protein  32.02 
 
 		 378 aa  177  4e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.249668  normal  0.0734484 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0435  response regulator receiver protein  31.2 
 
 		 373 aa  170  8e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0149866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3023  response regulator receiver protein  31.77 
 
 		 367 aa  169  1e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.566048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2110  stage II sporulation E family protein  31.23 
 
 		 369 aa  147  6e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0347  PAS  29.37 
 
 		 513 aa  132  2.0000000000000002e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000072068 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2467  response regulator receiver modulated serine phosphatase  29.13 
 
 		 385 aa  125  2e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0106  stage II sporulation E  29.25 
 
 		 415 aa  124  6e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3485  response regulator  27.06 
 
 		 422 aa  116  1.0000000000000001e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3648  response regulator receiver modulated serine phosphatase  26.28 
 
 		 380 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2383  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  41.13 
 
 		 434 aa  113  8.000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00665942 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2946  response regulator receiver modulated serine phosphatase  24.55 
 
 		 384 aa  109  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1726  putative PAS/PAC sensor protein  28.63 
 
 		 504 aa  108  2e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0909206  normal  0.287685 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1440  response regulator  28.77 
 
 		 391 aa  108  4e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0677305  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1035  response regulator  23.46 
 
 		 380 aa  103  6e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2870  response regulator receiver protein  27.61 
 
 		 418 aa  103  7e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0495  response regulator receiver protein  25.94 
 
 		 423 aa  103  7e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4268  response regulator  23.7 
 
 		 380 aa  102  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00568873 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1777  metal dependent phosphohydrolase, HD region with response regulator receiver modulation  37.3 
 
 		 414 aa  102  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1088  response regulator  23.46 
 
 		 380 aa  101  4e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0915  sigma factor sigB regulation protein  23.86 
 
 		 380 aa  101  4e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00116334  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0898  sigma factor sigB regulation protein  23.6 
 
 		 380 aa  101  4e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.503671  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2998  response regulator receiver protein  26.52 
 
 		 377 aa  101  4e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2303  response regulator receiver protein  32.2 
 
 		 227 aa  101  5e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05599  response regulator receiver  22.88 
 
 		 560 aa  100  7e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1210  response regulator receiver protein  27.64 
 
 		 400 aa  100  7e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0544929  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1558  response regulator receiver protein  29.41 
 
 		 566 aa  100  9e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05729  putative diguanylate cyclase  37.5 
 
 		 323 aa  99  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4328  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.43 
 
 		 612 aa  98.6  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20650  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  41.22 
 
 		 231 aa  99  2e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0260682  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1161  response regulator  23.6 
 
 		 380 aa  99  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3604  putative PAS/PAC sensor protein  32.95 
 
 		 619 aa  98.2  4e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.562878 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000007  serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit  23.56 
 
 		 397 aa  98.2  4e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.441967  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0140  response regulator receiver protein  25.51 
 
 		 371 aa  97.4  6e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2192  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  38.64 
 
 		 303 aa  97.1  8e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0176  response regulator receiver modulated serine phosphatase  24.74 
 
 		 378 aa  97.1  9e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0930  response regulator  23.35 
 
 		 380 aa  96.3  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2575  chitin degradation sensor protein  38.02 
 
 		 1127 aa  96.7  1e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0994  response regulator  23.35 
 
 		 380 aa  96.3  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2647  response regulator receiver protein  27.93 
 
 		 418 aa  96.3  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0228439  normal  0.825958 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1070  response regulator  23.69 
 
 		 358 aa  96.7  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.209800000000002e-41 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0279  response regulator receiver modulated serine phosphatase  26.59 
 
 		 394 aa  96.7  1e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1277  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  39.67 
 
 		 454 aa  96.3  1e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.410696  normal  0.0388481 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1665  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  44.09 
 
 		 313 aa  95.1  3e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1432  response regulator PleD  37.82 
 
 		 457 aa  95.5  3e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0905  response regulator receiver modulated serine phosphatase  22.98 
 
 		 380 aa  94.7  4e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0150  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  37.59 
 
 		 1177 aa  94.7  4e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2442  response regulator PleD  38.66 
 
 		 457 aa  94.7  4e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.696702  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000121  response regulator  37.5 
 
 		 319 aa  94.4  5e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0601608  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0749  response regulator receiver protein  39.47 
 
 		 406 aa  94.4  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.893418  normal  0.0890519 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1597  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  37.21 
 
 		 313 aa  94  6e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1941  response regulator receiver domain-containing protein  35.59 
 
 		 156 aa  94  7e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2841  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  33.06 
 
 		 308 aa  93.6  9e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.585847 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1038  sensory box histidine kinase/response regulator  40.16 
 
 		 513 aa  93.2  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1577  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  33.86 
 
 		 314 aa  93.6  1e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1712  two component transcriptional regulator  40.8 
 
 		 248 aa  92.8  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3005  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  33.8 
 
 		 303 aa  93.2  1e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000288968 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3308  response regulator PleD  38.02 
 
 		 457 aa  92.8  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.268667  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1083  two component LuxR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 316 aa  92.8  1e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2887  response regulator receiver modulated serine phosphatase  23.44 
 
 		 423 aa  93.2  1e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2570  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  37.23 
 
 		 381 aa  93.2  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1805  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  38.02 
 
 		 310 aa  92.8  1e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0638722  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3066  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.98 
 
 		 305 aa  92.4  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0045  adenylate/guanylate cyclase  34.42 
 
 		 382 aa  92  2e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4702  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  30.96 
 
 		 381 aa  92.4  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0901362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0878  response regulator receiver  34.06 
 
 		 302 aa  92.4  2e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3038  response regulator PleD  38.66 
 
 		 457 aa  92.4  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.372566  normal  0.319547 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>