More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_05599 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_05599  response regulator receiver  100 
 
 		 560 aa  1159    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000007  serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit  66.08 
 
 		 397 aa  543  1e-153  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.441967  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0329  putative response regulator  48.49 
 
 		 415 aa  394  1e-108  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0302  response regulator receiver modulated serine phosphatase  45.84 
 
 		 400 aa  363  4e-99  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1440  response regulator  36.44 
 
 		 391 aa  209  8e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0677305  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1566  response regulator receiver (CheY) modulated Serine phosphatase  32.61 
 
 		 396 aa  200  6e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.244929 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3648  response regulator receiver modulated serine phosphatase  30.52 
 
 		 380 aa  192  2e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2673  response regulator receiver modulated serine phosphatase  29.68 
 
 		 392 aa  189  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3485  response regulator  34.01 
 
 		 422 aa  188  2e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2887  response regulator receiver modulated serine phosphatase  32.18 
 
 		 423 aa  187  4e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1870  response regulator receiver modulated serine phosphatase  30.98 
 
 		 379 aa  186  8e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.177859  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1844  response regulator receiver modulated serine phosphatase  30.98 
 
 		 379 aa  186  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0176  response regulator receiver modulated serine phosphatase  31.17 
 
 		 378 aa  183  7e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1702  response regulator receiver modulated serine phosphatase  31.34 
 
 		 460 aa  183  8.000000000000001e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0071  response regulator receiver (CheY-like) modulated serine phosphatase  31.03 
 
 		 426 aa  182  2e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0921  response regulator receiver modulated serine phosphatase  31.98 
 
 		 378 aa  182  2e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2943  response regulator receiver modulated serine phosphatase  28.91 
 
 		 470 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2647  response regulator receiver protein  30.67 
 
 		 418 aa  178  3e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0228439  normal  0.825958 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2078  response regulator receiver modulated serine phosphatase  30.96 
 
 		 379 aa  177  3e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.61197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2870  response regulator receiver protein  31.28 
 
 		 418 aa  177  5e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1210  response regulator receiver protein  31.44 
 
 		 400 aa  174  5e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0544929  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0495  response regulator receiver protein  31.85 
 
 		 423 aa  168  2.9999999999999998e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2013  response regulator receiver modulated serine phosphatase  29.1 
 
 		 411 aa  167  4e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.155477  normal  0.0155604 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1432  response regulator receiver modulated serine phosphatase  27.3 
 
 		 407 aa  162  2e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3723  response regulator receiver (CheY) modulated Serine phosphatase  29.63 
 
 		 378 aa  159  2e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0976167  normal  0.601311 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0825  response regulator receiver modulated serine phosphatase  29.44 
 
 		 526 aa  156  1e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.126425  normal  0.339318 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2946  response regulator receiver modulated serine phosphatase  27.41 
 
 		 384 aa  145  1e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000008  putative anti-sigma F factor antagonist  48.3 
 
 		 165 aa  145  2e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.232541  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0205  response regulator receiver protein  27.66 
 
 		 395 aa  142  9.999999999999999e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0833  response regulator  26.49 
 
 		 389 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.106584  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2082  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  27.31 
 
 		 566 aa  137  4e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.806146 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2673  response regulator receiver modulated serine phosphatase  25.69 
 
 		 389 aa  133  7.999999999999999e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0905  response regulator receiver modulated serine phosphatase  26.5 
 
 		 380 aa  133  1.0000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0583  response regulator receiver protein  25.37 
 
 		 394 aa  132  1.0000000000000001e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0898  sigma factor sigB regulation protein  26.9 
 
 		 380 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.503671  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0915  sigma factor sigB regulation protein  26.63 
 
 		 380 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00116334  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1070  response regulator  26.63 
 
 		 358 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.209800000000002e-41 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1088  response regulator  26.63 
 
 		 380 aa  130  6e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4268  response regulator  26.5 
 
 		 380 aa  130  6e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00568873 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1161  response regulator  26.9 
 
 		 380 aa  130  6e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1035  response regulator  26.78 
 
 		 380 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0930  response regulator  26.63 
 
 		 380 aa  128  3e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0994  response regulator  26.63 
 
 		 380 aa  128  3e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0999  response regulator receiver modulated serine phosphatase  26.7 
 
 		 602 aa  128  3e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.118416  hitchhiker  0.00369461 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1706  response regulator receiver modulated serine phosphatase  25.87 
 
 		 393 aa  120  6e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000168842 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2165  response regulator  25.87 
 
 		 393 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0249002  normal  0.813701 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3577  response regulator receiver protein  25.87 
 
 		 393 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00266085  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3849  response regulator receiver (CheY) modulated Serine phosphatase  25.93 
 
 		 412 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.658628 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3580  response regulator receiver protein  24.43 
 
 		 564 aa  119  1.9999999999999998e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2998  response regulator receiver protein  25.26 
 
 		 377 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2359  putative two-component response regulator  27.59 
 
 		 394 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1682  response regulator receiver modulated serine phosphatase  26.04 
 
 		 412 aa  115  3e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27940  putative two-component response regulator  26.41 
 
 		 394 aa  115  3e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2152  putative response regulator, putative serine phosphatase  24.11 
 
 		 434 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0140  response regulator receiver protein  26.88 
 
 		 371 aa  114  5e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1912  response regulator receiver:stage II sporulation E  25.43 
 
 		 394 aa  114  6e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.432168  hitchhiker  0.00180426 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0731  response regulator receiver modulated serine phosphatase  23.4 
 
 		 396 aa  114  6e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2117  response regulator  25.43 
 
 		 394 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0129975  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3688  response regulator receiver protein  22.95 
 
 		 564 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0173  serine phosphatase  31 
 
 		 451 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.361934  normal  0.766765 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0679  response regulator receiver  45.9 
 
 		 337 aa  112  2.0000000000000002e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0836964  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1929  response regulator receiver protein  26.11 
 
 		 394 aa  111  3e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.310245 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0279  response regulator receiver modulated serine phosphatase  25.44 
 
 		 394 aa  111  3e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1524  putative PAS/PAC sensor protein  27.44 
 
 		 409 aa  111  4.0000000000000004e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3534  response regulator receiver protein  22.98 
 
 		 393 aa  110  7.000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2179  flagellar basal-body rod protein FlgC  23.13 
 
 		 575 aa  109  1e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0812  Stage II sporulation E family protein  31.08 
 
 		 422 aa  108  2e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3770  response regulator receiver protein  24.78 
 
 		 391 aa  108  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000112062 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2157  response regulator receiver protein  20.68 
 
 		 577 aa  108  3e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3118  response regulator receiver domain-containing protein  21.58 
 
 		 563 aa  107  4e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1964  response regulator  21.2 
 
 		 568 aa  105  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.58831  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3924  response regulator receiver protein  21.82 
 
 		 563 aa  105  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32720  Response regulator  25.06 
 
 		 394 aa  103  6e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4657  serine phosphatase  27.17 
 
 		 467 aa  103  7e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.767582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3451  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:stage II sporulation E  20.72 
 
 		 568 aa  103  8e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.223622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1784  putative two-component response regulator  22.96 
 
 		 571 aa  103  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1991  response regulator receiver protein  22.69 
 
 		 574 aa  102  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20780  putative two-component response regulator  22.28 
 
 		 571 aa  102  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.283191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1504  response regulator receiver protein  22.34 
 
 		 563 aa  102  3e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.709749  normal  0.106415 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0600  response regulator receiver protein  38.19 
 
 		 301 aa  101  4e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1846  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  36.09 
 
 		 314 aa  100  5e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2467  response regulator receiver modulated serine phosphatase  23.21 
 
 		 385 aa  100  6e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1594  response regulator receiver protein  24.57 
 
 		 548 aa  100  6e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2000  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  34.21 
 
 		 364 aa  100  7e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000423497  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0399  two component transcriptional regulator  40.5 
 
 		 272 aa  99.8  1e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.802217  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4363  response regulator receiver protein  21.69 
 
 		 563 aa  99  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.470941 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0378  two component transcriptional regulator  35 
 
 		 234 aa  99  2e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2192  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  39.42 
 
 		 303 aa  98.2  4e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01717  putative response regulator  22.25 
 
 		 568 aa  97.8  4e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2819  response regulator receiver protein  23.46 
 
 		 562 aa  97.1  8e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0360472 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1838  two component transcriptional regulator  35.14 
 
 		 239 aa  97.1  9e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000194698  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2749  putative PAS/PAC sensor protein  25.95 
 
 		 360 aa  96.7  1e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1542  response regulator receiver domain-containing protein  22.37 
 
 		 567 aa  96.3  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.3365  normal  0.98827 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1203  response regulator  36.3 
 
 		 634 aa  95.5  2e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2688  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  42.02 
 
 		 243 aa  95.5  2e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0901925  normal  0.494683 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2693  diguanylate cyclase  38.89 
 
 		 302 aa  95.1  3e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2313  response regulator  35.07 
 
 		 301 aa  94.7  4e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.483613  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1114  response regulator receiver modulated serine phosphatase  22.45 
 
 		 391 aa  94.7  4e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1723  response regulator receiver (CheY-like) modulated serine phosphatase  25.38 
 
 		 381 aa  94.7  4e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00833768  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2226  response regulator receiver protein  24.06 
 
 		 383 aa  94.4  5e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.916787 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>