More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_2956 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_2956  response regulator receiver protein  100 
 
 
365 aa  753    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2342  response regulator receiver protein  39.19 
 
 
561 aa  270  2e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00850448  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2819  response regulator receiver protein  38.2 
 
 
562 aa  258  1e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0360472 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1784  putative two-component response regulator  38.03 
 
 
571 aa  256  4e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20780  putative two-component response regulator  37.33 
 
 
571 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.283191  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3580  response regulator receiver protein  37.14 
 
 
564 aa  244  1.9999999999999999e-63  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1542  response regulator receiver domain-containing protein  36.34 
 
 
567 aa  240  2e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.3365  normal  0.98827 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4363  response regulator receiver protein  37.07 
 
 
563 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.470941 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1504  response regulator receiver protein  37.07 
 
 
563 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.709749  normal  0.106415 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3071  response regulator receiver protein  37.84 
 
 
390 aa  240  2.9999999999999997e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000442652 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3688  response regulator receiver protein  37.23 
 
 
564 aa  240  4e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3451  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:stage II sporulation E  35.64 
 
 
568 aa  239  5e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.223622  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3023  response regulator receiver protein  40.65 
 
 
367 aa  239  5e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.566048  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3924  response regulator receiver protein  37.33 
 
 
563 aa  238  1e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34360  Response regulator  35.47 
 
 
575 aa  233  4.0000000000000004e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.328347  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1964  response regulator  35.64 
 
 
568 aa  233  5e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.58831  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0435  response regulator receiver protein  36.99 
 
 
373 aa  224  1e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0149866  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2157  response regulator receiver protein  34.38 
 
 
577 aa  219  3.9999999999999997e-56  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3534  response regulator receiver protein  33.25 
 
 
393 aa  216  2.9999999999999998e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2528  response regulator receiver protein  36.22 
 
 
378 aa  214  1.9999999999999998e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.249668  normal  0.0734484 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2179  flagellar basal-body rod protein FlgC  31.56 
 
 
575 aa  206  7e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1594  response regulator receiver protein  33.07 
 
 
548 aa  204  2e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1991  response regulator receiver protein  32.71 
 
 
574 aa  203  4e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3118  response regulator receiver domain-containing protein  32.19 
 
 
563 aa  195  1e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3440  response regulator receiver protein  34.63 
 
 
572 aa  189  9e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0157  response regulator  29.02 
 
 
568 aa  181  1e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01717  putative response regulator  32.3 
 
 
568 aa  177  3e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1039  response regulator receiver domain-containing protein  28.5 
 
 
567 aa  173  5e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2226  response regulator receiver protein  28.42 
 
 
383 aa  158  2e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.916787 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1726  putative PAS/PAC sensor protein  33.9 
 
 
504 aa  139  7e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0909206  normal  0.287685 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2946  response regulator receiver modulated serine phosphatase  29.1 
 
 
384 aa  135  9.999999999999999e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2249  response regulator receiver protein  23.99 
 
 
577 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.299733  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2366  response regulator receiver protein  23.99 
 
 
577 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.018295  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2096  response regulator receiver protein  23.74 
 
 
577 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.856197  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2095  response regulator receiver protein  26.03 
 
 
567 aa  117  3e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1879  response regulator receiver protein  26.51 
 
 
567 aa  116  6.9999999999999995e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.686257 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2467  response regulator receiver modulated serine phosphatase  24.47 
 
 
385 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2220  response regulator receiver protein  24.09 
 
 
565 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2119  response regulator  23.58 
 
 
565 aa  107  2e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1392  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  37.14 
 
 
584 aa  103  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.623748  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0589  response regulator receiver modulated serine phosphatase  28.92 
 
 
371 aa  102  7e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.420228  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3297  response regulator receiver protein  24.77 
 
 
550 aa  102  8e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0898  sigma factor sigB regulation protein  22.19 
 
 
380 aa  102  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.503671  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0921  response regulator receiver modulated serine phosphatase  23.81 
 
 
378 aa  102  1e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0106  stage II sporulation E  31.08 
 
 
415 aa  101  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1035  response regulator  22.42 
 
 
380 aa  101  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1088  response regulator  22.19 
 
 
380 aa  100  5e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4268  response regulator  22.42 
 
 
380 aa  100  5e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00568873 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0915  sigma factor sigB regulation protein  21.93 
 
 
380 aa  100  6e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00116334  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0302  response regulator receiver modulated serine phosphatase  23.86 
 
 
400 aa  99.8  6e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0347  PAS  32.74 
 
 
513 aa  99.8  7e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  unclonable  0.000000072068 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3017  two component transcriptional regulator  35.88 
 
 
225 aa  99.4  8e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1453  two component transcriptional regulator  43.44 
 
 
244 aa  99  1e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.952418  normal  0.0249242 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4207  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.8 
 
 
247 aa  97.8  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1016  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.15 
 
 
243 aa  98.2  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0329  putative response regulator  25.82 
 
 
415 aa  98.2  2e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2998  response regulator receiver protein  24.15 
 
 
377 aa  97.8  3e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0905  response regulator receiver modulated serine phosphatase  21.41 
 
 
380 aa  97.1  4e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2152  putative response regulator, putative serine phosphatase  26.45 
 
 
434 aa  97.1  4e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0930  response regulator  21.91 
 
 
380 aa  96.7  5e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0994  response regulator  21.91 
 
 
380 aa  96.7  5e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0444  DNA-binding response regulator  37.24 
 
 
233 aa  96.3  7e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2078  response regulator receiver modulated serine phosphatase  25.79 
 
 
379 aa  95.5  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.61197  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1115  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.8 
 
 
243 aa  95.5  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0950226  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2302  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.98 
 
 
243 aa  95.1  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1161  response regulator  21.15 
 
 
380 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1070  response regulator  22.42 
 
 
358 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.209800000000002e-41 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2353  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.98 
 
 
243 aa  95.1  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0794558  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0544  two component transcriptional regulator  37.06 
 
 
227 aa  94.7  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4036  two component transcriptional regulator  39.34 
 
 
248 aa  95.1  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1391  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  37.19 
 
 
373 aa  94.7  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.540189  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0581  winged helix family two component transcriptional regulator  40.16 
 
 
242 aa  94.7  2e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.296955  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0140  response regulator receiver protein  25.15 
 
 
371 aa  94.4  3e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0143  response regulator receiver protein  40.83 
 
 
206 aa  94  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0378  two component transcriptional regulator  36.23 
 
 
234 aa  94.4  3e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0720  response regulator receiver domain protein  44.63 
 
 
246 aa  94.4  3e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.351492 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0547  two component transcriptional regulator  40.16 
 
 
224 aa  94.4  3e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0926  response regulator PleD  40.83 
 
 
455 aa  94.4  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.773886 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0650  DNA-binding response regulator  41.09 
 
 
223 aa  94  4e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0711  DNA-binding response regulator  41.09 
 
 
223 aa  94  4e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0784  two component transcriptional regulator  41.43 
 
 
239 aa  93.6  4e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1887  adenylate/guanylate cyclase  41.32 
 
 
403 aa  93.6  5e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.522729 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0954  two component transcriptional regulator  40.16 
 
 
243 aa  93.6  5e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0817018 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1116  DNA-binding response regulator  40.8 
 
 
235 aa  93.6  5e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.310768  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0554  DNA-binding response regulator  40.31 
 
 
223 aa  93.2  6e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0496  response regulator  40.31 
 
 
223 aa  93.2  6e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0498  response regulator  40.31 
 
 
223 aa  93.2  6e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0641  DNA-binding response regulator  40.31 
 
 
223 aa  93.2  6e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0585  DNA-binding response regulator  40.31 
 
 
223 aa  93.2  6e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1878  two component transcriptional regulator  40.16 
 
 
242 aa  93.2  7e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.559477 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2673  response regulator receiver modulated serine phosphatase  23.38 
 
 
389 aa  92.8  7e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0499  two component transcriptional regulator  40.31 
 
 
223 aa  93.2  7e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05599  response regulator receiver  21.91 
 
 
560 aa  92.8  8e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0503  two component transcriptional regulator  36.43 
 
 
223 aa  92.8  8e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2262  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  41.18 
 
 
406 aa  92.8  8e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.146487 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2339  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.2 
 
 
239 aa  92.8  8e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2390  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.2 
 
 
239 aa  92.8  8e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4914  two component transcriptional regulator  38.57 
 
 
238 aa  92.8  9e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.095278 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4716  DNA-binding response regulator  39.53 
 
 
223 aa  92  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0623  DNA-binding response regulator  39.53 
 
 
223 aa  92  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>