More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_3017 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_3017  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 225 aa  431  1e-120  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3411  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.55 
 
 		 224 aa  234  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.591115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2318  two component transcriptional regulator  56.95 
 
 		 225 aa  228  5e-59  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.642935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1595  two component transcriptional regulator  53.81 
 
 		 227 aa  228  6e-59  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.526383  normal  0.570373 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1351  two component transcriptional regulator, winged helix family  55.8 
 
 		 225 aa  224  7e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00188361  unclonable  0.0000000206018 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2799  two component transcriptional regulator  54.82 
 
 		 236 aa  223  2e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000368356  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3286  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.46 
 
 		 228 aa  223  2e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.167791  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0615  two component transcriptional regulator  52.73 
 
 		 228 aa  222  4e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0841359  normal  0.719107 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2242  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.22 
 
 		 224 aa  222  4e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.415885 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2487  two component transcriptional regulator  56.25 
 
 		 224 aa  221  4.9999999999999996e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.431556  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2637  two component transcriptional regulator, winged helix family  55.16 
 
 		 227 aa  221  6e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2290  two component transcriptional regulator  56.25 
 
 		 224 aa  221  6e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1435  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.05 
 
 		 233 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1103  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.26 
 
 		 227 aa  220  1.9999999999999999e-56  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11051  two component system transcriptional regulator trcR  48.88 
 
 		 257 aa  218  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4657  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.22 
 
 		 240 aa  218  6e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4681  two component transcriptional regulator  53.12 
 
 		 230 aa  217  1e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.354926 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4301  two component transcriptional regulator  53.12 
 
 		 230 aa  217  1e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681825  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1887  two component transcriptional regulator  53.33 
 
 		 231 aa  217  1e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.882564  normal  0.344123 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04130  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  50.66 
 
 		 236 aa  217  1e-55  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.118973  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4387  two component transcriptional regulator  53.12 
 
 		 230 aa  217  1e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0316317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1505  response regulator receiver  47.95 
 
 		 219 aa  216  2e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.404603  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1476  two component transcriptional regulator  47.95 
 
 		 219 aa  216  2e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1098  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.82 
 
 		 228 aa  216  2.9999999999999998e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10999  two component response transcriptional regulatory protein MprA  52.65 
 
 		 230 aa  215  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000188235  normal  0.671639 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3686  response regulator receiver  52.91 
 
 		 233 aa  215  4e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0523  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.68 
 
 		 224 aa  214  5.9999999999999996e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6397  response regulator receiver protein  53.04 
 
 		 237 aa  214  9e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.680662  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4844  two component transcriptional regulator  52 
 
 		 231 aa  214  9e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.312171 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4064  two component transcriptional regulator  52.02 
 
 		 233 aa  213  9.999999999999999e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.98903  normal  0.0666639 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1478  two component transcriptional regulator  52.65 
 
 		 240 aa  213  1.9999999999999998e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000111909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2194  DNA-binding response regulator  49.78 
 
 		 227 aa  212  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00702475  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2632  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.33 
 
 		 229 aa  212  2.9999999999999995e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2937  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.21 
 
 		 243 aa  212  3.9999999999999995e-54  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2277  two component transcriptional regulator  49.11 
 
 		 248 aa  212  4.9999999999999996e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113906  normal  0.0109188 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3695  response regulator receiver  49.78 
 
 		 236 aa  212  4.9999999999999996e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.795948  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2056  DNA-binding response regulator  49.33 
 
 		 227 aa  211  5.999999999999999e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.413172  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2212  DNA-binding response regulator  49.33 
 
 		 227 aa  211  5.999999999999999e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2240  DNA-binding response regulator  49.33 
 
 		 227 aa  211  5.999999999999999e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.85177e-28 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2130  response regulator receiver  49.55 
 
 		 252 aa  211  7.999999999999999e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.539517  hitchhiker  0.00279069 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0280  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.3 
 
 		 225 aa  210  1e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0717  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.64 
 
 		 242 aa  210  1e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000387016 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8872  response regulator receiver protein  54.71 
 
 		 234 aa  211  1e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.347509  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0389  winged helix family two component transcriptional regulator  49.33 
 
 		 224 aa  211  1e-53  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.667669  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4519  response regulator receiver  54.63 
 
 		 234 aa  210  1e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.135212  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2296  two component transcriptional regulator  48.88 
 
 		 255 aa  209  3e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.398969  normal  0.240289 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0343  response regulator receiver  50.87 
 
 		 232 aa  209  4e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.86362  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0321  two component transcriptional regulator  51.97 
 
 		 406 aa  208  4e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2324  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.25 
 
 		 223 aa  207  9e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.237639  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3036  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.33 
 
 		 273 aa  207  9e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.106658  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2675  DNA-binding response regulator  47.53 
 
 		 224 aa  207  1e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0180828  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1228  two component transcriptional regulator  47.14 
 
 		 228 aa  207  1e-52  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000325236  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6588  two component transcriptional regulator  50.88 
 
 		 229 aa  205  4e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.13217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1873  two component transcriptional regulator  45.29 
 
 		 226 aa  205  6e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2673  DNA-binding response regulator  47.75 
 
 		 224 aa  204  6e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0379  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.25 
 
 		 233 aa  204  7e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.605912  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0759  two component transcriptional regulator  48.2 
 
 		 223 aa  204  9e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00128917  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1377  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.78 
 
 		 225 aa  204  9e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000301655 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0784  two component transcriptional regulator  49.12 
 
 		 239 aa  204  9e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0840  two component transcriptional regulator, winged helix family  50 
 
 		 241 aa  203  1e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.214337  normal  0.533835 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3620  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.33 
 
 		 239 aa  204  1e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0253056  normal  0.477246 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3055  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.98 
 
 		 227 aa  203  1e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.703147  hitchhiker  0.000223036 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2492  two component transcriptional regulator  47.09 
 
 		 224 aa  203  2e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.22217  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1131  two component transcriptional regulator  53.15 
 
 		 226 aa  203  2e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3276  winged helix family two component transcriptional regulator  49.57 
 
 		 234 aa  202  2e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.208422  normal  0.192837 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1398  DNA-binding response regulator  44.83 
 
 		 246 aa  203  2e-51  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000136334  hitchhiker  8.832960000000001e-24 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0227  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.88 
 
 		 224 aa  201  5e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0243  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.88 
 
 		 224 aa  202  5e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000226454  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2231  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.1 
 
 		 226 aa  201  6e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5311  two component transcriptional regulator  48.12 
 
 		 246 aa  201  6e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.554395  normal  0.310406 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3631  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.55 
 
 		 235 aa  201  6e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8879  response regulator receiver protein  49.34 
 
 		 235 aa  201  7e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103439  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1701  DNA-binding response regulator  47.37 
 
 		 230 aa  201  7e-51  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00672994  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1625  DNA-binding response regulator CsrR  46.93 
 
 		 229 aa  201  9.999999999999999e-51  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.137799  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10772  two component system response transcriptional positive regulator phoP  48.25 
 
 		 247 aa  200  9.999999999999999e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.864575 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0558  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.11 
 
 		 237 aa  200  9.999999999999999e-51  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0234  two component transcriptional regulator  50.45 
 
 		 242 aa  200  9.999999999999999e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.925989 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4293  two component transcriptional regulator  47.98 
 
 		 224 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000934276  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4973  two component transcriptional regulator  48.25 
 
 		 239 aa  200  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4590  two component transcriptional regulator  48.25 
 
 		 239 aa  200  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0187  two component transcriptional regulator  56.22 
 
 		 227 aa  199  1.9999999999999998e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4678  two component transcriptional regulator  48.25 
 
 		 239 aa  200  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.337028  normal  0.895878 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31480  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  48.28 
 
 		 239 aa  200  1.9999999999999998e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.00376265  normal  0.556858 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32700  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  47.98 
 
 		 271 aa  198  3.9999999999999996e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.442824  normal  0.485424 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5175  two component transcriptional regulator  47.81 
 
 		 236 aa  199  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0904  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.43 
 
 		 254 aa  197  7e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.936287  normal  0.32173 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0165  two component transcriptional regulator  47.14 
 
 		 243 aa  198  7e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0174  two component transcriptional regulator  47.14 
 
 		 243 aa  198  7e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.947413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1581  two component transcriptional regulator  46.49 
 
 		 238 aa  198  7e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0005  response regulator  46.12 
 
 		 243 aa  197  7.999999999999999e-50  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.201532  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0461  two component transcriptional regulator  48.23 
 
 		 248 aa  197  7.999999999999999e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.735267  normal  0.697364 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0155  two component transcriptional regulator  47.14 
 
 		 243 aa  197  7.999999999999999e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0636837 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0488  DNA-binding response regulator  46.61 
 
 		 228 aa  197  7.999999999999999e-50  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0274  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.56 
 
 		 232 aa  197  9e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.701823  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1056  DNA-binding response regulator  46.67 
 
 		 226 aa  197  9e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.775205  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0451  DNA-binding response regulator  47.09 
 
 		 224 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.313098  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1564  two component transcriptional regulator, winged helix family  57.47 
 
 		 223 aa  197  1.0000000000000001e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.194978  normal  0.692086 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20650  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  50.89 
 
 		 231 aa  197  2.0000000000000003e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0260682  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0191  two component transcriptional regulator  48.21 
 
 		 244 aa  196  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1771  two component transcriptional regulator  43.16 
 
 		 244 aa  196  3e-49  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>