More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcer98_0503 on replicon NC_009674
Organism: Bacillus cytotoxicus NVH 391-98



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009674  Bcer98_0503  two component transcriptional regulator  100 
 
 
223 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0650  DNA-binding response regulator  88.34 
 
 
223 aa  425  1e-118  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0496  response regulator  88.34 
 
 
223 aa  424  1e-118  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0498  response regulator  88.34 
 
 
223 aa  424  1e-118  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0711  DNA-binding response regulator  88.34 
 
 
223 aa  425  1e-118  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0641  DNA-binding response regulator  88.34 
 
 
223 aa  424  1e-118  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0554  DNA-binding response regulator  87.89 
 
 
223 aa  421  1e-117  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0585  DNA-binding response regulator  87.89 
 
 
223 aa  421  1e-117  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4716  DNA-binding response regulator  87.44 
 
 
223 aa  421  1e-117  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0623  DNA-binding response regulator  87.44 
 
 
223 aa  421  1e-117  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0499  two component transcriptional regulator  87.89 
 
 
223 aa  420  1e-117  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0708  DNA-binding response regulator  61.36 
 
 
225 aa  298  3e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.675964 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0563  response regulator  61.36 
 
 
225 aa  298  5e-80  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0618  DNA-binding response regulator  60.91 
 
 
225 aa  298  6e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0651  DNA-binding response regulator  60.91 
 
 
225 aa  298  6e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0780  DNA-binding response regulator  61.36 
 
 
225 aa  297  8e-80  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0719  DNA-binding response regulator  61.36 
 
 
225 aa  296  1e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0565  two component transcriptional regulator  60.45 
 
 
225 aa  294  7e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0562  response regulator  60.91 
 
 
225 aa  294  8e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4651  DNA-binding response regulator  60.91 
 
 
225 aa  293  1e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00217543  unclonable  3.82242e-26 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0687  DNA-binding response regulator  59.55 
 
 
225 aa  291  7e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.037102  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0547  two component transcriptional regulator  57.73 
 
 
224 aa  285  4e-76  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2522  two component transcriptional regulator, winged helix family  55.61 
 
 
226 aa  273  1.0000000000000001e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0213  DNA-binding response regulator  58.74 
 
 
227 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0254  DNA-binding response regulator  58.74 
 
 
227 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000466037 
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C61  DNA-binding response regulator  54.3 
 
 
222 aa  250  1e-65  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2981  two component transcriptional regulator  44.89 
 
 
229 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000201285  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3739  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.67 
 
 
230 aa  196  2.0000000000000003e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000466515  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2915  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.99 
 
 
225 aa  189  2e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.892207  normal  0.300351 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1413  DNA-binding response regulator  43.24 
 
 
223 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3993  DNA-binding response regulator  43.24 
 
 
223 aa  182  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.910988 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1191  response regulator  43.24 
 
 
223 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1351  DNA-binding response regulator  43.24 
 
 
223 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1453  DNA-binding response regulator  43.24 
 
 
223 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1193  response regulator  42.79 
 
 
223 aa  182  3e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1389  DNA-binding response regulator  42.79 
 
 
223 aa  182  3e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1213  DNA-binding response regulator  42.79 
 
 
223 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.203275  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1312  DNA-binding response regulator  42.79 
 
 
223 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1897  two component transcriptional regulator  39.73 
 
 
227 aa  181  5.0000000000000004e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.151466  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1656  response regulator receiver protein  60.74 
 
 
166 aa  181  5.0000000000000004e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1028  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.37 
 
 
237 aa  181  6e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2855  two component transcriptional regulator  40.81 
 
 
224 aa  181  8.000000000000001e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000952101  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1903  two component transcriptional regulator  39.74 
 
 
230 aa  179  2e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1155  two component transcriptional regulator  41.33 
 
 
231 aa  179  2.9999999999999997e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000430064  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1215  two component transcriptional regulator  42.99 
 
 
223 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.533573  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0274  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.26 
 
 
224 aa  179  4e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0644  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.45 
 
 
236 aa  178  5.999999999999999e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0766  two component transcriptional regulator  40.89 
 
 
231 aa  178  7e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.585906  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1021  two component transcriptional regulator  41.44 
 
 
223 aa  177  1e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2286  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.92 
 
 
231 aa  177  2e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000188753  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1924  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.64 
 
 
225 aa  176  2e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1456  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.95 
 
 
223 aa  176  2e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000183373  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3620  DNA-binding response regulator  40.18 
 
 
225 aa  176  3e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0597824  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3709  DNA-binding response regulator  40.18 
 
 
225 aa  176  3e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000227696  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3396  DNA-binding response regulator  40.18 
 
 
225 aa  176  3e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000765328  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3358  transcriptional regulatory protein  40.18 
 
 
225 aa  176  3e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000200566  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3308  transcriptional regulatory protein  40.18 
 
 
225 aa  176  3e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000872353  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1606  DNA-binding response regulator  40.18 
 
 
225 aa  176  3e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00543423  hitchhiker  0.0000000112462 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3612  DNA-binding response regulator  40.18 
 
 
225 aa  176  3e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.20142e-22 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3661  DNA-binding response regulator  40.18 
 
 
225 aa  176  3e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000222084  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3627  DNA-binding response regulator  40.18 
 
 
225 aa  176  3e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000456124  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1487  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.36 
 
 
232 aa  176  3e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.487145  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1367  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.47 
 
 
230 aa  176  4e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000177207  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3288  two component transcriptional regulator  40.18 
 
 
225 aa  176  4e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0366247  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1237  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.09 
 
 
234 aa  176  4e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.178035  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1728  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.38 
 
 
233 aa  175  4e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1892  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.22 
 
 
228 aa  175  5e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000392  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2866  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.89 
 
 
231 aa  175  5e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1288  two component transcriptional regulator  37.5 
 
 
228 aa  175  6e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000128008  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0827  two component transcriptional regulator  39.56 
 
 
256 aa  174  8e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00211389  normal  0.244563 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0802  two component transcriptional regulator  41.55 
 
 
220 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2216  two component transcriptional regulator  41.07 
 
 
224 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03750  PhoP-like protein  38.77 
 
 
226 aa  174  9.999999999999999e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.181369  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2228  two component transcriptional regulator  38.81 
 
 
222 aa  174  9.999999999999999e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00319429  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5905  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.38 
 
 
237 aa  173  1.9999999999999998e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1954  two component transcriptional regulator  41.67 
 
 
229 aa  172  1.9999999999999998e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000155813  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2564  DNA-binding response regulator  39.91 
 
 
231 aa  172  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0589521  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2617  DNA-binding response regulator  39.91 
 
 
231 aa  172  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.993672  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5471  two component transcriptional regulator  43.38 
 
 
221 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00800002  hitchhiker  0.0013378 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2385  DNA-binding response regulator  39.91 
 
 
231 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.534853  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2341  DNA-binding response regulator  39.91 
 
 
231 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000166477  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2302  DNA-binding response regulator  39.91 
 
 
231 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2561  DNA-binding response regulator  39.91 
 
 
231 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.630654  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2574  DNA-binding response regulator  39.91 
 
 
231 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000040017 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1815  two component transcriptional regulator  40.61 
 
 
232 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.101184  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2219  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.39 
 
 
240 aa  171  5.999999999999999e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3061  two component transcriptional regulator  40.81 
 
 
227 aa  171  5.999999999999999e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.799336  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02200  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  36.89 
 
 
231 aa  171  5.999999999999999e-42  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4932  DNA-binding response regulator  39.74 
 
 
229 aa  171  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4707  DNA-binding response regulator  39.74 
 
 
229 aa  171  6.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5068  DNA-binding response regulator  39.74 
 
 
229 aa  171  6.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  38.39 
 
 
229 aa  171  6.999999999999999e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0488  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.91 
 
 
235 aa  171  7.999999999999999e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00220414 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2868  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  36.53 
 
 
227 aa  171  7.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0808147  normal  0.133304 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2563  transcriptional regulatory protein ResD  42.01 
 
 
221 aa  171  9e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00803163 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2424  two component transcriptional regulator  42.01 
 
 
221 aa  170  1e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0245011  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4151  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.94 
 
 
230 aa  170  1e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4801  response regulator protein  40.09 
 
 
234 aa  171  1e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000584394  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1696  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.61 
 
 
224 aa  171  1e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4198  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.67 
 
 
226 aa  170  1e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>