More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_1964 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_4363  response regulator receiver protein  64.77 
 
 		 563 aa  724    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.470941 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2819  response regulator receiver protein  62.94 
 
 		 562 aa  673    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0360472 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1964  response regulator  100 
 
 		 568 aa  1155    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.58831  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3451  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:stage II sporulation E  88.2 
 
 		 568 aa  1028    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.223622  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1542  response regulator receiver domain-containing protein  69.91 
 
 		 567 aa  781    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.3365  normal  0.98827 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34360  Response regulator  64.18 
 
 		 575 aa  706    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.328347  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1504  response regulator receiver protein  65.12 
 
 		 563 aa  731    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.709749  normal  0.106415 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1784  putative two-component response regulator  65.18 
 
 		 571 aa  739    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3924  response regulator receiver protein  65.84 
 
 		 563 aa  741    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3688  response regulator receiver protein  63.57 
 
 		 564 aa  712    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20780  putative two-component response regulator  64.29 
 
 		 571 aa  729    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.283191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2179  flagellar basal-body rod protein FlgC  45.34 
 
 		 575 aa  499  1e-140  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1991  response regulator receiver protein  45.31 
 
 		 574 aa  495  1e-139  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3440  response regulator receiver protein  41.25 
 
 		 572 aa  427  1e-118  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3580  response regulator receiver protein  39.18 
 
 		 564 aa  423  1e-117  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2157  response regulator receiver protein  38.23 
 
 		 577 aa  351  2e-95  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3118  response regulator receiver domain-containing protein  34.04 
 
 		 563 aa  334  3e-90  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01717  putative response regulator  33.33 
 
 		 568 aa  300  6e-80  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1594  response regulator receiver protein  33.21 
 
 		 548 aa  299  1e-79  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1039  response regulator receiver domain-containing protein  30.97 
 
 		 567 aa  283  6.000000000000001e-75  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0157  response regulator  31.93 
 
 		 568 aa  279  1e-73  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2342  response regulator receiver protein  31.86 
 
 		 561 aa  253  8.000000000000001e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00850448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2956  response regulator receiver protein  35.64 
 
 		 365 aa  233  9e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3534  response regulator receiver protein  32.56 
 
 		 393 aa  210  5e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2095  response regulator receiver protein  27.26 
 
 		 567 aa  200  6e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1879  response regulator receiver protein  27.08 
 
 		 567 aa  197  3e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.686257 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3071  response regulator receiver protein  34.04 
 
 		 390 aa  196  1e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000442652 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2220  response regulator receiver protein  27.21 
 
 		 565 aa  195  2e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3297  response regulator receiver protein  26.83 
 
 		 550 aa  187  4e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2226  response regulator receiver protein  29.13 
 
 		 383 aa  184  4.0000000000000006e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.916787 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2119  response regulator  27.93 
 
 		 565 aa  182  1e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3023  response regulator receiver protein  33.16 
 
 		 367 aa  180  5.999999999999999e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.566048  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2096  response regulator receiver protein  27.32 
 
 		 577 aa  179  1e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.856197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0435  response regulator receiver protein  32.72 
 
 		 373 aa  178  2e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0149866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2366  response regulator receiver protein  27.53 
 
 		 577 aa  178  2e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.018295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2249  response regulator receiver protein  27.7 
 
 		 577 aa  179  2e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.299733  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2528  response regulator receiver protein  31.66 
 
 		 378 aa  171  4e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.249668  normal  0.0734484 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0347  PAS  29.89 
 
 		 513 aa  132  2.0000000000000002e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000072068 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2110  stage II sporulation E family protein  28.42 
 
 		 369 aa  130  8.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3485  response regulator  28.19 
 
 		 422 aa  123  7e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2998  response regulator receiver protein  29.06 
 
 		 377 aa  123  8e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3648  response regulator receiver modulated serine phosphatase  27.34 
 
 		 380 aa  118  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2946  response regulator receiver modulated serine phosphatase  25.71 
 
 		 384 aa  117  3.9999999999999997e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2870  response regulator receiver protein  30.77 
 
 		 418 aa  116  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0106  stage II sporulation E  28.8 
 
 		 415 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2467  response regulator receiver modulated serine phosphatase  27.49 
 
 		 385 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1726  putative PAS/PAC sensor protein  29.64 
 
 		 504 aa  114  5e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0909206  normal  0.287685 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1210  response regulator receiver protein  30.58 
 
 		 400 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0544929  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0495  response regulator receiver protein  26.89 
 
 		 423 aa  110  6e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2647  response regulator receiver protein  29.21 
 
 		 418 aa  109  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0228439  normal  0.825958 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2887  response regulator receiver modulated serine phosphatase  28 
 
 		 423 aa  107  7e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0205  response regulator receiver protein  27.65 
 
 		 395 aa  106  1e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05599  response regulator receiver  21.2 
 
 		 560 aa  105  2e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0279  response regulator receiver modulated serine phosphatase  28.57 
 
 		 394 aa  105  3e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4702  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  41.73 
 
 		 381 aa  103  8e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0901362  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0905  response regulator receiver modulated serine phosphatase  25.92 
 
 		 380 aa  103  8e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0898  sigma factor sigB regulation protein  25.28 
 
 		 380 aa  103  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.503671  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2383  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  42.37 
 
 		 434 aa  103  1e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00665942 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1035  response regulator  25 
 
 		 380 aa  102  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2943  response regulator receiver modulated serine phosphatase  24.87 
 
 		 470 aa  102  2e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05729  putative diguanylate cyclase  37.5 
 
 		 323 aa  102  2e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1088  response regulator  25.28 
 
 		 380 aa  101  3e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0915  sigma factor sigB regulation protein  25.63 
 
 		 380 aa  102  3e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00116334  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1070  response regulator  25.28 
 
 		 358 aa  101  3e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.209800000000002e-41 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0921  response regulator receiver modulated serine phosphatase  25 
 
 		 378 aa  102  3e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4268  response regulator  25 
 
 		 380 aa  101  3e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00568873 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1566  response regulator receiver (CheY) modulated Serine phosphatase  24.17 
 
 		 396 aa  100  6e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.244929 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2152  putative response regulator, putative serine phosphatase  26.59 
 
 		 434 aa  100  6e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0930  response regulator  25.35 
 
 		 380 aa  100  9e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0994  response regulator  25.35 
 
 		 380 aa  100  9e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0045  adenylate/guanylate cyclase  35.57 
 
 		 382 aa  99.8  1e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3391  two component transcriptional regulator  40.34 
 
 		 227 aa  99.8  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.141218  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3604  putative PAS/PAC sensor protein  38.81 
 
 		 619 aa  99  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.562878 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0329  putative response regulator  22.31 
 
 		 415 aa  99  2e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1161  response regulator  25.63 
 
 		 380 aa  99.4  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000007  serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit  21.12 
 
 		 397 aa  98.6  3e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.441967  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4555  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  35.67 
 
 		 406 aa  98.6  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.330139  normal  0.677797 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3723  response regulator receiver (CheY) modulated Serine phosphatase  24.93 
 
 		 378 aa  98.6  3e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0976167  normal  0.601311 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2303  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 227 aa  97.8  4e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3999  adenylate/guanylate cyclase  33.33 
 
 		 351 aa  97.1  8e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.558191 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0153  two component transcriptional regulator  40.83 
 
 		 253 aa  96.7  9e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.711737  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1038  sensory box histidine kinase/response regulator  39.26 
 
 		 513 aa  96.3  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4328  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.51 
 
 		 612 aa  96.3  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2078  response regulator receiver modulated serine phosphatase  26.1 
 
 		 379 aa  96.3  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.61197  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2673  response regulator receiver modulated serine phosphatase  25.59 
 
 		 392 aa  96.3  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0109  two component transcriptional regulator  40.83 
 
 		 253 aa  96.7  1e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.427788  normal  0.468211 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1712  two component transcriptional regulator  43.44 
 
 		 248 aa  96.3  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18081  two-component response regulator  44.26 
 
 		 248 aa  96.3  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000121  response regulator  35.1 
 
 		 319 aa  96.3  1e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0601608  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0176  response regulator receiver modulated serine phosphatase  25.84 
 
 		 378 aa  95.5  2e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1196  two component transcriptional regulator  42.37 
 
 		 246 aa  95.9  2e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3762  putative adenylate/guanylate cyclase  43.86 
 
 		 520 aa  96.3  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.978534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2192  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  36.36 
 
 		 303 aa  95.9  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0257  DNA-binding response regulator  40.98 
 
 		 232 aa  95.5  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0117449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18111  two-component response regulator  43.44 
 
 		 248 aa  95.9  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1432  response regulator receiver modulated serine phosphatase  23.33 
 
 		 407 aa  95.1  3e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3321  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.93 
 
 		 305 aa  95.1  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.536368 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20711  two-component response regulator  42.37 
 
 		 246 aa  95.5  3e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1277  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  37.5 
 
 		 454 aa  95.1  3e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.410696  normal  0.0388481 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18291  two-component response regulator  43.44 
 
 		 248 aa  94.7  4e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.276613  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>