More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_3297 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_3297  response regulator receiver protein  100 
 
 		 550 aa  1133    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2220  response regulator receiver protein  32.26 
 
 		 565 aa  288  2e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2095  response regulator receiver protein  32.09 
 
 		 567 aa  286  8e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1879  response regulator receiver protein  32.16 
 
 		 567 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.686257 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2366  response regulator receiver protein  30.16 
 
 		 577 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.018295  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2096  response regulator receiver protein  29.81 
 
 		 577 aa  270  4e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.856197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2249  response regulator receiver protein  29.81 
 
 		 577 aa  267  2.9999999999999995e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.299733  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2119  response regulator  30.95 
 
 		 565 aa  260  4e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4363  response regulator receiver protein  26.64 
 
 		 563 aa  217  5e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.470941 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1504  response regulator receiver protein  26.78 
 
 		 563 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.709749  normal  0.106415 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3924  response regulator receiver protein  26.06 
 
 		 563 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3688  response regulator receiver protein  25.37 
 
 		 564 aa  208  2e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1594  response regulator receiver protein  26.48 
 
 		 548 aa  207  6e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01717  putative response regulator  28.13 
 
 		 568 aa  200  7e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1542  response regulator receiver domain-containing protein  25.96 
 
 		 567 aa  196  1e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.3365  normal  0.98827 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2110  stage II sporulation E family protein  33.15 
 
 		 369 aa  195  1e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2179  flagellar basal-body rod protein FlgC  26.06 
 
 		 575 aa  191  2e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3440  response regulator receiver protein  27.14 
 
 		 572 aa  190  5e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1964  response regulator  26.83 
 
 		 568 aa  187  4e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.58831  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3451  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:stage II sporulation E  26.14 
 
 		 568 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.223622  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1991  response regulator receiver protein  26.9 
 
 		 574 aa  184  4.0000000000000006e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2157  response regulator receiver protein  25 
 
 		 577 aa  177  3e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20780  putative two-component response regulator  25.18 
 
 		 571 aa  173  5.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.283191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2819  response regulator receiver protein  25.14 
 
 		 562 aa  171  3e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0360472 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1784  putative two-component response regulator  25 
 
 		 571 aa  170  6e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34360  Response regulator  22.88 
 
 		 575 aa  167  4e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.328347  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3580  response regulator receiver protein  24.78 
 
 		 564 aa  164  4.0000000000000004e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1039  response regulator receiver domain-containing protein  23.47 
 
 		 567 aa  159  1e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0157  response regulator  23.96 
 
 		 568 aa  157  7e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3118  response regulator receiver domain-containing protein  25.56 
 
 		 563 aa  152  2e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3534  response regulator receiver protein  28.53 
 
 		 393 aa  143  9e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2226  response regulator receiver protein  26.77 
 
 		 383 aa  126  8.000000000000001e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.916787 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2342  response regulator receiver protein  23.43 
 
 		 561 aa  121  3e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00850448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3071  response regulator receiver protein  30.7 
 
 		 390 aa  121  3.9999999999999996e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000442652 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0106  stage II sporulation E  26.04 
 
 		 415 aa  118  3.9999999999999997e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0347  PAS  30.96 
 
 		 513 aa  110  5e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000072068 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0435  response regulator receiver protein  25.15 
 
 		 373 aa  107  5e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0149866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2956  response regulator receiver protein  24.77 
 
 		 365 aa  102  1e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2528  response regulator receiver protein  25.65 
 
 		 378 aa  93.2  1e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.249668  normal  0.0734484 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3023  response regulator receiver protein  24.92 
 
 		 367 aa  87.4  6e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.566048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2943  response regulator receiver modulated serine phosphatase  24.4 
 
 		 470 aa  83.2  0.00000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1726  putative PAS/PAC sensor protein  28.64 
 
 		 504 aa  82  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0909206  normal  0.287685 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2108  response regulator receiver protein  25.79 
 
 		 224 aa  79.3  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1702  response regulator receiver modulated serine phosphatase  24.25 
 
 		 460 aa  73.9  0.000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2673  response regulator receiver modulated serine phosphatase  22.53 
 
 		 392 aa  72.8  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3848  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  33.33 
 
 		 703 aa  72.8  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.343403  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1088  response regulator  22.29 
 
 		 380 aa  72.4  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1035  response regulator  23.98 
 
 		 380 aa  72.4  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0905  response regulator receiver modulated serine phosphatase  22.39 
 
 		 380 aa  72  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3017  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 452 aa  71.6  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0144454 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2152  putative response regulator, putative serine phosphatase  24.32 
 
 		 434 aa  70.5  0.00000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0279  response regulator receiver modulated serine phosphatase  23.28 
 
 		 394 aa  70.5  0.00000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4268  response regulator  23.39 
 
 		 380 aa  69.7  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00568873 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0898  sigma factor sigB regulation protein  21.99 
 
 		 380 aa  68.6  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.503671  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0930  response regulator  21.99 
 
 		 380 aa  67.8  0.0000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0915  sigma factor sigB regulation protein  21.99 
 
 		 380 aa  67.8  0.0000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00116334  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0994  response regulator  21.99 
 
 		 380 aa  67.8  0.0000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1161  response regulator  21.99 
 
 		 380 aa  67.8  0.0000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1070  response regulator  21.99 
 
 		 358 aa  67.4  0.0000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.209800000000002e-41 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001287  DNA-binding response regulator KdpE  34.65 
 
 		 232 aa  67  0.0000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.297598  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2146  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.83 
 
 		 228 aa  65.9  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1977  DNA-binding response regulator  34.68 
 
 		 229 aa  65.9  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.166768  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3549  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.67 
 
 		 702 aa  65.5  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1824  two component transcriptional regulator  27.35 
 
 		 222 aa  65.1  0.000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04881  two-component system regulatory protein  32.71 
 
 		 466 aa  63.9  0.000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.476586  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1269  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  30.95 
 
 		 705 aa  64.3  0.000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2688  response regulator receiver modulated serine phosphatase  21.58 
 
 		 407 aa  63.9  0.000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2718  response regulator receiver protein  21.58 
 
 		 407 aa  63.9  0.000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.453118  normal  0.333299 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2732  response regulator receiver protein  21.58 
 
 		 407 aa  63.9  0.000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.276002  normal  0.519614 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1617  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  30.89 
 
 		 860 aa  63.5  0.000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3166  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  31.5 
 
 		 457 aa  63.2  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.521221  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2351  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.86 
 
 		 231 aa  63.2  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.274912  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2096  CheA signal transduction histidine kinases  31.45 
 
 		 2301 aa  63.2  0.00000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0362  two-component response regulator for zraP  29.37 
 
 		 436 aa  63.5  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.896207  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1181  winged helix family two component transcriptional regulator  32 
 
 		 232 aa  62  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.037877  normal  0.73042 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1211  two component transcriptional regulator  32 
 
 		 232 aa  62  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.676109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3211  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 696 aa  62.4  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.7085  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5630  histidine kinase  27.14 
 
 		 714 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.11737 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1672  PAS sensor protein  30.43 
 
 		 695 aa  62.8  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.487392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1558  response regulator receiver protein  22.51 
 
 		 566 aa  62.4  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1990  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.71 
 
 		 695 aa  62.4  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2946  response regulator receiver modulated serine phosphatase  18.67 
 
 		 384 aa  62.8  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1597  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  30.08 
 
 		 860 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.711633  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0386  two component transcriptional regulator  36.63 
 
 		 222 aa  62  0.00000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2250  two component transcriptional regulator  32.09 
 
 		 225 aa  61.6  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000295266  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3709  DNA-binding response regulator  31.85 
 
 		 225 aa  61.6  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000227696  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0071  response regulator receiver (CheY-like) modulated serine phosphatase  23.81 
 
 		 426 aa  62  0.00000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1606  DNA-binding response regulator  31.85 
 
 		 225 aa  61.6  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00543423  hitchhiker  0.0000000112462 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0142  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.47 
 
 		 221 aa  61.2  0.00000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.709604 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04992  positive response regulator for pho regulon  29.17 
 
 		 256 aa  61.6  0.00000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1126  response regulator receiver modulated serine phosphatase  22.69 
 
 		 451 aa  61.2  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3890  response regulator receiver protein  26.79 
 
 		 378 aa  61.6  0.00000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3620  DNA-binding response regulator  31.85 
 
 		 225 aa  61.2  0.00000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0597824  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3396  DNA-binding response regulator  31.85 
 
 		 225 aa  61.2  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000765328  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3358  transcriptional regulatory protein  31.85 
 
 		 225 aa  61.2  0.00000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000200566  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3308  transcriptional regulatory protein  31.85 
 
 		 225 aa  61.2  0.00000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000872353  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3612  DNA-binding response regulator  31.85 
 
 		 225 aa  61.2  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.20142e-22 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3763  two component transcriptional regulator  32.43 
 
 		 243 aa  61.2  0.00000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.225565 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3661  DNA-binding response regulator  31.85 
 
 		 225 aa  61.2  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000222084  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3627  DNA-binding response regulator  31.85 
 
 		 225 aa  61.2  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000456124  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>