More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_1726 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_1726  putative PAS/PAC sensor protein  100 
 
 		 504 aa  1035    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0909206  normal  0.287685 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0347  PAS  29.92 
 
 		 513 aa  222  9.999999999999999e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000072068 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3534  response regulator receiver protein  37.76 
 
 		 393 aa  174  3.9999999999999995e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2342  response regulator receiver protein  35.51 
 
 		 561 aa  157  6e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00850448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3071  response regulator receiver protein  36.25 
 
 		 390 aa  151  3e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000442652 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1784  putative two-component response regulator  33.59 
 
 		 571 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2956  response regulator receiver protein  33.9 
 
 		 365 aa  139  1e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1991  response regulator receiver protein  30.79 
 
 		 574 aa  138  2e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2528  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 378 aa  139  2e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.249668  normal  0.0734484 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20780  putative two-component response regulator  32.43 
 
 		 571 aa  138  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.283191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2179  flagellar basal-body rod protein FlgC  31.8 
 
 		 575 aa  137  4e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2819  response regulator receiver protein  33.47 
 
 		 562 aa  134  3e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0360472 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3580  response regulator receiver protein  33.47 
 
 		 564 aa  132  2.0000000000000002e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34360  Response regulator  33.6 
 
 		 575 aa  131  3e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.328347  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2157  response regulator receiver protein  31.01 
 
 		 577 aa  130  6e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3440  response regulator receiver protein  31.46 
 
 		 572 aa  130  8.000000000000001e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2825  PAS:GGDEF  30.53 
 
 		 548 aa  124  5e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.067576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3118  response regulator receiver domain-containing protein  29.32 
 
 		 563 aa  123  9.999999999999999e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1524  putative PAS/PAC sensor protein  27.86 
 
 		 409 aa  120  4.9999999999999996e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0435  response regulator receiver protein  27.74 
 
 		 373 aa  117  3e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0149866  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1964  response regulator  29.64 
 
 		 568 aa  114  5e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.58831  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3451  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:stage II sporulation E  28.19 
 
 		 568 aa  114  5e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.223622  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1710  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  28.85 
 
 		 720 aa  113  6e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.425295  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3688  response regulator receiver protein  29.72 
 
 		 564 aa  114  6e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1832  putative PAS/PAC sensor protein  24.82 
 
 		 543 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2542  putative PAS/PAC sensor protein  27.44 
 
 		 637 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4363  response regulator receiver protein  30.86 
 
 		 563 aa  111  3e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.470941 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3924  response regulator receiver protein  29.46 
 
 		 563 aa  110  5e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1038  sensory box histidine kinase/response regulator  33.33 
 
 		 513 aa  109  1e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1504  response regulator receiver protein  30.45 
 
 		 563 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.709749  normal  0.106415 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1542  response regulator receiver domain-containing protein  28.63 
 
 		 567 aa  108  3e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.3365  normal  0.98827 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01717  putative response regulator  27.39 
 
 		 568 aa  107  4e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4328  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.31 
 
 		 612 aa  106  1e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1269  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  30.23 
 
 		 705 aa  106  1e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1931  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.36 
 
 		 1385 aa  105  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3954  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.98 
 
 		 1370 aa  105  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.364846  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1834  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.22 
 
 		 681 aa  105  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3023  response regulator receiver protein  31.1 
 
 		 367 aa  104  3e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.566048  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1833  putative PAS/PAC sensor protein  23.53 
 
 		 560 aa  103  5e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0157  response regulator  31.19 
 
 		 568 aa  103  7e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1004  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.32 
 
 		 921 aa  102  1e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.627886  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2394  putative PAS/PAC sensor protein  27.95 
 
 		 642 aa  102  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0339768  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1360  putative PAS/PAC sensor protein  23.62 
 
 		 536 aa  100  4e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3081  sensory box protein/response regulator  29.89 
 
 		 710 aa  100  6e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.789878  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1622  putative PAS/PAC sensor protein  25.59 
 
 		 775 aa  99.8  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0914545  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0700  sensory box/response regulator  25.6 
 
 		 637 aa  97.8  4e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1594  response regulator receiver protein  29.71 
 
 		 548 aa  97.8  4e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2818  putative PAS/PAC sensor protein  27.7 
 
 		 649 aa  97.8  5e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2096  CheA signal transduction histidine kinases  42.4 
 
 		 2301 aa  96.7  9e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0408  CheA signal transduction histidine kinase  44.25 
 
 		 2423 aa  95.9  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3848  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  33.94 
 
 		 703 aa  95.5  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.343403  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2788  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  39.53 
 
 		 715 aa  95.5  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.941936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2205  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.37 
 
 		 887 aa  95.5  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.188088 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1831  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.1 
 
 		 685 aa  94.7  3e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4529  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.78 
 
 		 989 aa  94.4  4e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3271  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.22 
 
 		 1691 aa  94.7  4e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3542  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  38.69 
 
 		 590 aa  94.7  4e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2226  response regulator receiver protein  26.8 
 
 		 383 aa  94  5e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.916787 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4776  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.13 
 
 		 1248 aa  94  6e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1475  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  40.65 
 
 		 311 aa  93.6  7e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1502  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  40.65 
 
 		 311 aa  93.6  7e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2096  response regulator receiver protein  26.18 
 
 		 577 aa  93.6  7e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.856197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4423  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.82 
 
 		 1361 aa  93.6  8e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.498632 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0367  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.51 
 
 		 503 aa  93.2  9e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0540164 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1825  putative PAS/PAC sensor protein  26.8 
 
 		 642 aa  93.2  9e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000986123 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1988  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  31.2 
 
 		 435 aa  92.8  1e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3009  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.77 
 
 		 236 aa  93.2  1e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.333093 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2418  two component transcriptional regulator  40.8 
 
 		 237 aa  92.8  1e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3533  putative PAS/PAC sensor protein  25.06 
 
 		 410 aa  92  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2119  response regulator  28.33 
 
 		 565 aa  92.4  2e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2841  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  36.24 
 
 		 308 aa  92.4  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.585847 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1430  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.05 
 
 		 737 aa  92  2e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.224344 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1813  putative hybrid two-component sensor and regulatory protein  41.54 
 
 		 2284 aa  92.4  2e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.409027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0339  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.48 
 
 		 1390 aa  92.4  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.726297  normal  0.77171 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0350  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.48 
 
 		 1390 aa  92.4  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0937102  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0360  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.48 
 
 		 1390 aa  92.4  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.592677 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5030  sensor histidine kinase/response regulator  43.36 
 
 		 1987 aa  90.9  4e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1039  response regulator receiver domain-containing protein  26.38 
 
 		 567 aa  90.9  4e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3772  CheA signal transduction histidine kinase  44.34 
 
 		 2539 aa  91.3  4e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0008  sensory box histidine kinase/response regulator  34.01 
 
 		 516 aa  90.9  5e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0492  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  43.36 
 
 		 1992 aa  90.9  6e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1055  two component signal transduction response regulator  38.84 
 
 		 734 aa  90.5  6e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0148851  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0719  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.64 
 
 		 531 aa  90.9  6e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2366  response regulator receiver protein  27.8 
 
 		 577 aa  90.5  7e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.018295  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0166  response regulator receiver/GGDEF/EAL domain-containing protein  32.09 
 
 		 697 aa  90.1  9e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2249  response regulator receiver protein  26.55 
 
 		 577 aa  89.4  1e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.299733  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1111  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  43.41 
 
 		 245 aa  89.7  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.53214 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2286  response regulator receiver protein  41.32 
 
 		 263 aa  89.7  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000997036 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0513  response regulator  40.77 
 
 		 2458 aa  89.7  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03422  hypothetical protein  34.59 
 
 		 1128 aa  89.4  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1235  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.78 
 
 		 989 aa  89.4  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.172784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05390  ChpA  40.77 
 
 		 2476 aa  89.7  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.812783  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0135  DNA-binding response regulator  35.88 
 
 		 230 aa  88.6  2e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2975  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.44 
 
 		 663 aa  89  2e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.658614  normal  0.178476 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2575  chitin degradation sensor protein  34.03 
 
 		 1127 aa  88.6  2e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0207  protein phosphatase 2C-like, stage II sporulation E  23.93 
 
 		 684 aa  89  2e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.543577  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002587  chitin catabolic cascade sensor histidine kinase ChiS  34.59 
 
 		 1111 aa  88.6  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0810  putative PAS/PAC sensor protein  24.11 
 
 		 840 aa  88.6  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.643579  normal  0.828908 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0076  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.51 
 
 		 675 aa  88.6  3e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3328  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  38.14 
 
 		 711 aa  88.2  3e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>