More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_3999 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_3999  adenylate/guanylate cyclase  100 
 
 
351 aa  723    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.558191 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0605  adenylate/guanylate cyclase  53.58 
 
 
355 aa  370  1e-101  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.657653  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3762  putative adenylate/guanylate cyclase  47.37 
 
 
520 aa  330  2e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.978534  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2803  adenylate/guanylate cyclase  49.42 
 
 
531 aa  322  6e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1901  adenylate/guanylate cyclase  45.92 
 
 
381 aa  303  4.0000000000000003e-81  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.500403  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6414  adenylate cyclase  43.72 
 
 
395 aa  292  6e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0293466  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2092  adenylate/guanylate cyclase  41.36 
 
 
395 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.498255  normal  0.305178 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3993  adenylate/guanylate cyclase  61.3 
 
 
1209 aa  276  3e-73  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.787867  normal  0.246996 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1528  adenylate/guanylate cyclase  41.76 
 
 
350 aa  269  7e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2417  adenylate/guanylate cyclase  59.81 
 
 
1207 aa  256  5e-67  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.239282 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0215  adenylate/guanylate cyclase  40.71 
 
 
351 aa  251  1e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.354021  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1562  adenylate/guanylate cyclase  50.64 
 
 
435 aa  231  1e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.165048 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11641  membrane-anchored adenylyl cyclase cya  49.33 
 
 
443 aa  228  9e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.512599 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1571  adenylate/guanylate cyclase  49.56 
 
 
426 aa  227  3e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.00000000352613  hitchhiker  0.00000380859 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3414  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  48.07 
 
 
431 aa  223  4e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.138432  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3576  putative adenylate/guanylate cyclase  47.56 
 
 
396 aa  220  3e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0204141 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3084  adenylate cyclase  44.44 
 
 
439 aa  210  3e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0535498  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3041  adenylate cyclase  44.44 
 
 
439 aa  210  3e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.14332  normal  0.182676 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3025  adenylate/guanylate cyclase  44.44 
 
 
439 aa  210  3e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1561  adenylate/guanylate cyclase  47.91 
 
 
417 aa  198  9e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.637281 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2839  putative adenylate/guanylate cyclase  47.6 
 
 
421 aa  190  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.344898  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2382  adenylate/guanylate cyclase  45.28 
 
 
407 aa  186  7e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0749  response regulator receiver protein  62.22 
 
 
406 aa  185  9e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.893418  normal  0.0890519 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2467  response regulator receiver modulated serine phosphatase  52.26 
 
 
385 aa  180  2.9999999999999997e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3136  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  62.12 
 
 
919 aa  179  9e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0156  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  40.28 
 
 
1075 aa  167  2e-40  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000640114  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0533  adenylate/guanylate cyclase  37.39 
 
 
422 aa  162  6e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.549362  normal  0.0209906 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1815  response regulator receiver domain-containing protein  50.37 
 
 
411 aa  160  2e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.800608  normal  0.49797 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3412  adenylate/guanylate cyclase  32.82 
 
 
1207 aa  157  3e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.210507 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2343  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  59.85 
 
 
921 aa  155  1e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.762005  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3309  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  48.08 
 
 
900 aa  154  2e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.269875  normal  0.342346 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0506  adenylate/guanylate cyclase  33.98 
 
 
380 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.149903  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4465  adenylate/guanylate cyclase  30.86 
 
 
561 aa  150  3e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.419976 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50428  predicted protein  39.58 
 
 
816 aa  146  6e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1887  adenylate/guanylate cyclase  30.49 
 
 
403 aa  144  3e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.522729 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_36270  predicted protein  39.09 
 
 
1987 aa  141  9.999999999999999e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47709  predicted protein  38.34 
 
 
1196 aa  141  9.999999999999999e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_38549  predicted protein  38.86 
 
 
1128 aa  140  3e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48375  predicted protein  39.58 
 
 
1169 aa  139  1e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12462  cyclase  34.5 
 
 
730 aa  137  4e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48678  predicted protein  40.53 
 
 
806 aa  136  6.0000000000000005e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.26048  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0225  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  31.46 
 
 
695 aa  135  7.000000000000001e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.590775  normal  0.132241 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48354  predicted protein  39.2 
 
 
868 aa  135  9.999999999999999e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.951648  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48350  predicted protein  36.46 
 
 
1773 aa  129  6e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0719027  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3155  adenylate/guanylate cyclase  29.34 
 
 
1172 aa  128  2.0000000000000002e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.386213  hitchhiker  0.00095291 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0045  adenylate/guanylate cyclase  28.97 
 
 
382 aa  126  7e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49555  predicted protein  32.89 
 
 
1198 aa  123  4e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_50497  predicted protein  34.72 
 
 
1165 aa  123  5e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2338  GAF sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  29.54 
 
 
1180 aa  123  6e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0263037  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43826  predicted protein  36.46 
 
 
1003 aa  122  9.999999999999999e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.911661  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1547  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  32.06 
 
 
758 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.592629  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2729  adenylate/guanylate cyclase  29.24 
 
 
1119 aa  121  1.9999999999999998e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0163544 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0662  adenylate/guanylate cyclase  26.57 
 
 
1130 aa  119  6e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0436  response regulator receiver protein  28.31 
 
 
370 aa  117  1.9999999999999998e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0661  adenylate/guanylate cyclase  26.14 
 
 
1133 aa  118  1.9999999999999998e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2239  adenylate/guanylate cyclase  26.92 
 
 
1156 aa  117  3e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.159061  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1077  adenylate cyclase  33.94 
 
 
513 aa  115  8.999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1110  adenylate/guanylate cyclase  28.45 
 
 
348 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0224811  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2188  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  43.84 
 
 
384 aa  112  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00677544 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2303  response regulator receiver protein  41.13 
 
 
227 aa  112  1.0000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2253  adenylate cyclase  34.31 
 
 
518 aa  111  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0171825 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0221  GAF sensor hybrid histidine kinase  38.95 
 
 
1651 aa  110  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1011  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.33 
 
 
231 aa  109  6e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3878  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  43.85 
 
 
892 aa  108  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5808  sensor histidine kinase  36.67 
 
 
1299 aa  108  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.284316  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1955  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.31 
 
 
236 aa  107  3e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.295041  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3274  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  38.51 
 
 
383 aa  107  3e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1638  putative adenylate/guanylate cyclase  32.64 
 
 
515 aa  107  3e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.739692  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0975  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  38.51 
 
 
383 aa  107  4e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1908  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor and FHA domain  31.45 
 
 
518 aa  107  4e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.136997  normal  0.266082 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3557  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  41.3 
 
 
322 aa  106  5e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.457648  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3625  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  41.3 
 
 
322 aa  106  5e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1976  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.58 
 
 
1383 aa  106  7e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.624185 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5021  adenylate/guanylate cyclase  28.73 
 
 
348 aa  106  7e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2099  response regulator receiver modulated diguanylate phosphodiesterase  35.15 
 
 
402 aa  105  9e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.316821 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0298  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  43.65 
 
 
331 aa  104  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.7054  normal  0.177262 
 
 
-
 
NC_002978  WD0221  response regulator PleD  40.29 
 
 
460 aa  104  2e-21  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1777  metal dependent phosphohydrolase, HD region with response regulator receiver modulation  42.28 
 
 
414 aa  104  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3072  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  38.51 
 
 
353 aa  105  2e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000480818 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3580  response regulator receiver protein  34.12 
 
 
564 aa  104  2e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3546  two component transcriptional regulator  39.84 
 
 
273 aa  103  3e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.376665  normal  0.686762 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2180  response regulator receiver  36.88 
 
 
151 aa  103  3e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.269305  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1991  response regulator receiver protein  35.29 
 
 
574 aa  103  5e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4225  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.68 
 
 
1322 aa  103  5e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3745  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  38.03 
 
 
1010 aa  103  5e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.412805  hitchhiker  0.00597184 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1432  response regulator PleD  42.06 
 
 
457 aa  103  6e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3473  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  40.58 
 
 
351 aa  103  6e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2442  response regulator PleD  42.86 
 
 
457 aa  102  7e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.696702  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2743  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  42 
 
 
395 aa  102  8e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3359  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  42 
 
 
395 aa  102  8e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.361398  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2108  multisensor signal transduction histidine kinase  40.28 
 
 
492 aa  102  9e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1218  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  31.53 
 
 
611 aa  102  1e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5293  adenylate/guanylate cyclase  30.12 
 
 
421 aa  102  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0545376  normal  0.227088 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0148  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  42.54 
 
 
1048 aa  102  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.872071 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3308  response regulator PleD  40.48 
 
 
457 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.268667  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0150  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  42.86 
 
 
1177 aa  102  1e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0702  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  41.27 
 
 
331 aa  102  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.140022  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1277  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  38.89 
 
 
454 aa  102  1e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.410696  normal  0.0388481 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4645  adenylate/guanylate cyclase  32.39 
 
 
546 aa  101  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.98897  normal  0.0884819 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5657  adenylate/guanylate cyclase  30.13 
 
 
421 aa  101  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.517681  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>