More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12462 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_12462  cyclase  100 
 
 		 730 aa  1493    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0225  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  43.84 
 
 		 695 aa  583  1.0000000000000001e-165  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.590775  normal  0.132241 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1547  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  31.25 
 
 		 758 aa  357  5.999999999999999e-97  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.592629  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0559  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.12 
 
 		 773 aa  209  1e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3576  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.33 
 
 		 772 aa  191  4e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0207298 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0185  methyl-accepting chemotaxis protein  27.38 
 
 		 770 aa  182  1e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1055  diguanylate cyclase  24.46 
 
 		 598 aa  172  2e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1002  methyl-accepting chemotaxis protein-like protein  26.17 
 
 		 1100 aa  169  2e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3112  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.51 
 
 		 1029 aa  169  2e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0219  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.1 
 
 		 773 aa  167  9e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.952357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0230  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.96 
 
 		 963 aa  153  8.999999999999999e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0030  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.91 
 
 		 660 aa  147  7.0000000000000006e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.136855  normal  0.0162002 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2092  adenylate/guanylate cyclase  34.39 
 
 		 395 aa  146  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.498255  normal  0.305178 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3925  methyl-accepting chemotaxis protein  31.31 
 
 		 674 aa  145  3e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.903723  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0458  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.65 
 
 		 726 aa  138  3.0000000000000003e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.386076  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3993  adenylate/guanylate cyclase  32.13 
 
 		 1209 aa  137  5e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.787867  normal  0.246996 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6414  adenylate cyclase  34.43 
 
 		 395 aa  137  7.000000000000001e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0293466  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3999  adenylate/guanylate cyclase  34.5 
 
 		 351 aa  137  9.999999999999999e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.558191 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2417  adenylate/guanylate cyclase  32.18 
 
 		 1207 aa  131  3e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.239282 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3762  putative adenylate/guanylate cyclase  31.43 
 
 		 520 aa  130  1.0000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.978534  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1698  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.09 
 
 		 963 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1650  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.87 
 
 		 812 aa  129  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0150  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  23.93 
 
 		 1177 aa  129  3e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11641  membrane-anchored adenylyl cyclase cya  33.81 
 
 		 443 aa  127  6e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.512599 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2264  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.98 
 
 		 819 aa  127  7e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.636482  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22670  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.78 
 
 		 737 aa  126  1e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1571  adenylate/guanylate cyclase  32.02 
 
 		 426 aa  124  4e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.00000000352613  hitchhiker  0.00000380859 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2382  adenylate/guanylate cyclase  30.53 
 
 		 407 aa  124  6e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3414  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  31.36 
 
 		 431 aa  124  7e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.138432  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1562  adenylate/guanylate cyclase  29.22 
 
 		 435 aa  121  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.165048 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4286  hypothetical protein  25.66 
 
 		 687 aa  119  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1118  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.4 
 
 		 913 aa  118  3e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0533  adenylate/guanylate cyclase  30.59 
 
 		 422 aa  118  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.549362  normal  0.0209906 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1901  adenylate/guanylate cyclase  30.14 
 
 		 381 aa  118  3.9999999999999997e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.500403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3576  putative adenylate/guanylate cyclase  31.43 
 
 		 396 aa  118  5e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0204141 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0264  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.39 
 
 		 651 aa  117  6e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000238421 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3758  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.77 
 
 		 651 aa  117  7.999999999999999e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0605  adenylate/guanylate cyclase  29.26 
 
 		 355 aa  114  6e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.657653  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002587  chitin catabolic cascade sensor histidine kinase ChiS  25.07 
 
 		 1111 aa  113  1.0000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03422  hypothetical protein  22.13 
 
 		 1128 aa  112  2.0000000000000002e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2575  chitin degradation sensor protein  22.16 
 
 		 1127 aa  112  2.0000000000000002e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4466  methyl-accepting chemotaxis protein  29.82 
 
 		 651 aa  108  3e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0380  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.78 
 
 		 651 aa  108  3e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1556  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.96 
 
 		 1397 aa  107  7e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3084  adenylate cyclase  29.05 
 
 		 439 aa  107  9e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0535498  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3025  adenylate/guanylate cyclase  29.05 
 
 		 439 aa  107  9e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3041  adenylate cyclase  29.05 
 
 		 439 aa  107  1e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.14332  normal  0.182676 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1932  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.16 
 
 		 682 aa  105  2e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0274  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.78 
 
 		 651 aa  105  3e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0274  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.78 
 
 		 651 aa  105  3e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.292308  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0270  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.78 
 
 		 651 aa  105  3e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0266  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.78 
 
 		 651 aa  105  3e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1456  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  27.36 
 
 		 1212 aa  105  4e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.4231 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1839  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.15 
 
 		 687 aa  104  7e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0218  methyl accepting chemotaxis protein  33.15 
 
 		 687 aa  103  8e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2803  adenylate/guanylate cyclase  29.41 
 
 		 531 aa  103  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1027  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.43 
 
 		 795 aa  103  1e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.551962 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0156  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  30 
 
 		 1075 aa  102  3e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000640114  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2839  putative adenylate/guanylate cyclase  31.96 
 
 		 421 aa  99  3e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.344898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0022  GAF sensor hybrid histidine kinase  23.86 
 
 		 1356 aa  97.4  9e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2453  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.13 
 
 		 788 aa  97.1  1e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.925334  normal  0.122382 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4013  methyl-accepting chemotaxis protein  25 
 
 		 756 aa  94.7  6e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1986  adenylate cyclase, putative  26.1 
 
 		 636 aa  91.7  4e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000955851  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3209  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  23.59 
 
 		 782 aa  91.3  5e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.684679  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1561  adenylate/guanylate cyclase  25.71 
 
 		 417 aa  90.9  7e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.637281 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2488  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  22.03 
 
 		 1109 aa  89  3e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.876623  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0671  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  26.2 
 
 		 500 aa  80.9  0.00000000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0415363  normal  0.502054 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0558  adenylate/guanylate cyclase  28.57 
 
 		 665 aa  80.1  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.132478  normal  0.264577 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4189  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.45 
 
 		 699 aa  79  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6425  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  27.4 
 
 		 588 aa  77.4  0.0000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5280  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.56 
 
 		 699 aa  77.4  0.0000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0672  hypothetical protein  28.22 
 
 		 487 aa  76.6  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1648  histidine kinase  23.48 
 
 		 1374 aa  75.1  0.000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.102759  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1844  adenylate/guanylate cyclase  28.88 
 
 		 1153 aa  74.7  0.000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1280  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.73 
 
 		 800 aa  74.3  0.000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0433  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  23.42 
 
 		 776 aa  73.6  0.00000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1349  sensor protein  19.71 
 
 		 574 aa  72.4  0.00000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0628361 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2387  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  24.71 
 
 		 604 aa  72  0.00000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.179199  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3387  adenylate/guanylate cyclase  30.77 
 
 		 781 aa  70.1  0.0000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.323193 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1528  adenylate/guanylate cyclase  22.5 
 
 		 350 aa  69.7  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48354  predicted protein  28.83 
 
 		 868 aa  69.3  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.951648  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3641  adenylate/guanylate cyclase  27.78 
 
 		 1138 aa  69.3  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.595732  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1148  sensor histidine kinase  28.68 
 
 		 604 aa  68.9  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0385  adenylate/guanylate cyclase  25.57 
 
 		 1198 aa  68.9  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1512  multi-sensor hybrid histidine kinase  22.29 
 
 		 1480 aa  69.3  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0878697 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4191  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.06 
 
 		 476 aa  68.6  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000558631  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0215  adenylate/guanylate cyclase  22.5 
 
 		 351 aa  67.4  0.0000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.354021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2746  multi-sensor hybrid histidine kinase  22.48 
 
 		 1096 aa  67.4  0.0000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.455726  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3248  sensor histidine kinase  37.5 
 
 		 458 aa  66.6  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14320  periplasmic sensory histidine protein kinase  39.47 
 
 		 465 aa  66.2  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.951937  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1227  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  24.72 
 
 		 779 aa  65.9  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.148378 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1395  histidine kinase  30.6 
 
 		 581 aa  65.9  0.000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3271  sensor histidine kinase  37.5 
 
 		 458 aa  65.5  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0499416  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0078  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  27.02 
 
 		 585 aa  65.1  0.000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0981996 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0809  chemotaxis sensory transducer  24.85 
 
 		 717 aa  65.5  0.000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2002  sensor histidine kinase  37.5 
 
 		 458 aa  65.5  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3027  sensor histidine kinase  37.5 
 
 		 458 aa  65.1  0.000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2948  sensor histidine kinase  37.5 
 
 		 458 aa  65.1  0.000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.448702  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6166  adenylate/guanylate cyclase  26.4 
 
 		 1139 aa  65.1  0.000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3260  sensor histidine kinase  37.5 
 
 		 458 aa  65.1  0.000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>