More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_1901 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_1901  adenylate/guanylate cyclase  100 
 
 
381 aa  755    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.500403  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3999  adenylate/guanylate cyclase  45.92 
 
 
351 aa  303  4.0000000000000003e-81  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.558191 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0605  adenylate/guanylate cyclase  40.98 
 
 
355 aa  251  1e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.657653  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3993  adenylate/guanylate cyclase  51.33 
 
 
1209 aa  241  1e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.787867  normal  0.246996 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2092  adenylate/guanylate cyclase  40.89 
 
 
395 aa  239  9e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.498255  normal  0.305178 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6414  adenylate cyclase  39.43 
 
 
395 aa  234  3e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0293466  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2417  adenylate/guanylate cyclase  52.68 
 
 
1207 aa  225  9e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.239282 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1571  adenylate/guanylate cyclase  51.87 
 
 
426 aa  224  2e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.00000000352613  hitchhiker  0.00000380859 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3762  putative adenylate/guanylate cyclase  37.4 
 
 
520 aa  221  1.9999999999999999e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.978534  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2803  adenylate/guanylate cyclase  37.97 
 
 
531 aa  212  1e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11641  membrane-anchored adenylyl cyclase cya  49.76 
 
 
443 aa  211  2e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.512599 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3084  adenylate cyclase  47.83 
 
 
439 aa  205  1e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0535498  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3025  adenylate/guanylate cyclase  47.83 
 
 
439 aa  205  1e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3041  adenylate cyclase  47.83 
 
 
439 aa  204  2e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.14332  normal  0.182676 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1562  adenylate/guanylate cyclase  47.57 
 
 
435 aa  204  2e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.165048 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1561  adenylate/guanylate cyclase  52.15 
 
 
417 aa  202  7e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.637281 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3576  putative adenylate/guanylate cyclase  47.75 
 
 
396 aa  198  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0204141 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3414  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  46.64 
 
 
431 aa  196  4.0000000000000005e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.138432  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2839  putative adenylate/guanylate cyclase  48.64 
 
 
421 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.344898  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2382  adenylate/guanylate cyclase  39.83 
 
 
407 aa  169  1e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0533  adenylate/guanylate cyclase  39.91 
 
 
422 aa  155  8e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.549362  normal  0.0209906 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0156  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  33.19 
 
 
1075 aa  154  2.9999999999999998e-36  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000640114  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0215  adenylate/guanylate cyclase  31.13 
 
 
351 aa  150  2e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.354021  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1528  adenylate/guanylate cyclase  31.23 
 
 
350 aa  150  3e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48354  predicted protein  36.11 
 
 
868 aa  140  3.9999999999999997e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.951648  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47709  predicted protein  35.57 
 
 
1196 aa  135  9.999999999999999e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50428  predicted protein  35.79 
 
 
816 aa  135  1.9999999999999998e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_36270  predicted protein  33.76 
 
 
1987 aa  132  1.0000000000000001e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48375  predicted protein  36.92 
 
 
1169 aa  132  1.0000000000000001e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0225  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  33.73 
 
 
695 aa  129  7.000000000000001e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.590775  normal  0.132241 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49555  predicted protein  32.62 
 
 
1198 aa  128  1.0000000000000001e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5293  adenylate/guanylate cyclase  29.34 
 
 
421 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0545376  normal  0.227088 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48678  predicted protein  35.6 
 
 
806 aa  127  3e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.26048  n/a   
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_50497  predicted protein  36.32 
 
 
1165 aa  127  4.0000000000000003e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_38549  predicted protein  35.68 
 
 
1128 aa  126  6e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48350  predicted protein  34.05 
 
 
1773 aa  124  2e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0719027  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43826  predicted protein  35.71 
 
 
1003 aa  119  6e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.911661  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12462  cyclase  30.14 
 
 
730 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2796  adenylate/guanylate cyclase  29.22 
 
 
447 aa  117  5e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1547  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  28.77 
 
 
758 aa  109  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.592629  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3577  response regulator receiver protein  38.82 
 
 
393 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00266085  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3849  response regulator receiver (CheY) modulated Serine phosphatase  36.93 
 
 
412 aa  107  3e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.658628 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3155  adenylate/guanylate cyclase  28.34 
 
 
1172 aa  107  4e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.386213  hitchhiker  0.00095291 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2165  response regulator  38.24 
 
 
393 aa  106  7e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0249002  normal  0.813701 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1706  response regulator receiver modulated serine phosphatase  38.24 
 
 
393 aa  106  7e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000168842 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1682  response regulator receiver modulated serine phosphatase  38.24 
 
 
412 aa  106  8e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1077  adenylate cyclase  34.52 
 
 
513 aa  106  9e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1912  response regulator receiver:stage II sporulation E  40.28 
 
 
394 aa  104  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.432168  hitchhiker  0.00180426 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5657  adenylate/guanylate cyclase  28.02 
 
 
421 aa  105  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.517681  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1887  adenylate/guanylate cyclase  27.96 
 
 
403 aa  105  2e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.522729 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2117  response regulator  39.58 
 
 
394 aa  103  4e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0129975  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1419  signal transduction histidine kinase  38.07 
 
 
551 aa  103  6e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1908  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor and FHA domain  35.47 
 
 
518 aa  100  3e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.136997  normal  0.266082 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2359  putative two-component response regulator  36.9 
 
 
394 aa  100  4e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_4823  predicted protein  33.1 
 
 
145 aa  100  5e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.121915  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27940  putative two-component response regulator  37.5 
 
 
394 aa  100  6e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1929  response regulator receiver protein  35.87 
 
 
394 aa  99.8  7e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.310245 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3412  adenylate/guanylate cyclase  24.85 
 
 
1207 aa  99.8  7e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.210507 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2685  adenylate/guanylate cyclase  33.14 
 
 
1093 aa  97.1  5e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.111623 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45310  predicted protein  29.9 
 
 
780 aa  96.3  8e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2338  GAF sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  27.03 
 
 
1180 aa  96.3  8e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0263037  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4645  adenylate/guanylate cyclase  33.33 
 
 
546 aa  95.9  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.98897  normal  0.0884819 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0558  adenylate/guanylate cyclase  32.82 
 
 
665 aa  94  4e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.132478  normal  0.264577 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0080  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  36.18 
 
 
357 aa  93.6  5e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1110  adenylate/guanylate cyclase  24.07 
 
 
348 aa  93.2  6e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0224811  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0063  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  35.95 
 
 
357 aa  92.8  9e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.56416e-22 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2239  adenylate/guanylate cyclase  26.22 
 
 
1156 aa  92.4  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.159061  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2096  signal transduction histidine kinase  35.39 
 
 
526 aa  91.7  2e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0713574 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2253  adenylate cyclase  35.68 
 
 
518 aa  90.9  3e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0171825 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3755  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  32.96 
 
 
678 aa  90.1  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4571  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor and FHA domain protein  30.43 
 
 
546 aa  90.1  6e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.226096  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4465  adenylate/guanylate cyclase  25.97 
 
 
561 aa  89.4  9e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.419976 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1356  response regulator receiver  38.06 
 
 
386 aa  89.4  9e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.235342  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3621  putative adenylate/guanylate cyclase  31.07 
 
 
607 aa  89  1e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0331  putative adenylate/guanylate cyclase  28.78 
 
 
641 aa  89  1e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32720  Response regulator  36.02 
 
 
394 aa  89  1e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1100  putative adenylate/guanylate cyclase  32.95 
 
 
479 aa  88.2  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1112  response regulator receiver domain-containing protein  34.59 
 
 
399 aa  88.2  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2828  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  33.79 
 
 
410 aa  88.2  2e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1430  adenylate/guanylate cyclase  34.66 
 
 
1160 aa  87  4e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0380252  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4270  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  35.57 
 
 
361 aa  87  4e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1638  putative adenylate/guanylate cyclase  33.15 
 
 
515 aa  87  5e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.739692  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2526  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  31.25 
 
 
715 aa  86.7  7e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.263284  normal  0.0502692 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6438  putative two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  30.94 
 
 
394 aa  86.3  7e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00615091  normal  0.383003 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5302  putative adenylate cyclase  37.87 
 
 
431 aa  85.5  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0714229 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0913  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  31.18 
 
 
544 aa  85.9  0.000000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1658  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  31.9 
 
 
577 aa  85.1  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.791017  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4588  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  35.06 
 
 
1096 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.537027  normal  0.92591 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5021  adenylate/guanylate cyclase  23.26 
 
 
348 aa  84.3  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3074  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  36.05 
 
 
363 aa  84.3  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22620  hypothetical protein  30.05 
 
 
463 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.438633  hitchhiker  0.00108909 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1525  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  32.92 
 
 
316 aa  84.3  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.15223e-23 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2645  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  33.11 
 
 
364 aa  84  0.000000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3744  putative GAF sensor protein  27.23 
 
 
323 aa  84  0.000000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2715  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  32.92 
 
 
314 aa  83.6  0.000000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0015  putative adenylate/guanylate cyclase  30.69 
 
 
284 aa  83.6  0.000000000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.391867  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0668  putative adenylate/guanylate cyclase  33.16 
 
 
701 aa  83.2  0.000000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00673986  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1886  diguanylate cyclase  35.11 
 
 
462 aa  83.2  0.000000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0064  histidine kinase  37.25 
 
 
598 aa  83.2  0.000000000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1544  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  36.05 
 
 
739 aa  83.2  0.000000000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.498595 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>