More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_C6414 on replicon NC_007336
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007336  Reut_C6414  adenylate cyclase  100 
 
 		 395 aa  803    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0293466  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2092  adenylate/guanylate cyclase  70.51 
 
 		 395 aa  553  1e-156  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.498255  normal  0.305178 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3999  adenylate/guanylate cyclase  43.72 
 
 		 351 aa  292  7e-78  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.558191 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3993  adenylate/guanylate cyclase  55.13 
 
 		 1209 aa  247  3e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.787867  normal  0.246996 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0605  adenylate/guanylate cyclase  40.53 
 
 		 355 aa  242  1e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.657653  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1901  adenylate/guanylate cyclase  39.43 
 
 		 381 aa  234  3e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.500403  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2803  adenylate/guanylate cyclase  38.56 
 
 		 531 aa  233  5e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2417  adenylate/guanylate cyclase  52.16 
 
 		 1207 aa  230  3e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.239282 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3762  putative adenylate/guanylate cyclase  36.41 
 
 		 520 aa  226  5.0000000000000005e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.978534  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1562  adenylate/guanylate cyclase  49.15 
 
 		 435 aa  218  1e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.165048 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3546  putative PAS/PAC sensor protein  60.92 
 
 		 282 aa  211  2e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.536601  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1861  putative PAS/PAC sensor protein  55.78 
 
 		 280 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.372386  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3576  putative adenylate/guanylate cyclase  47.69 
 
 		 396 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0204141 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11641  membrane-anchored adenylyl cyclase cya  48.66 
 
 		 443 aa  199  9e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.512599 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1860  diguanylate cyclase  65.73 
 
 		 312 aa  198  1.0000000000000001e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1561  adenylate/guanylate cyclase  48.85 
 
 		 417 aa  198  1.0000000000000001e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.637281 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3414  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  45.45 
 
 		 431 aa  197  3e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.138432  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3084  adenylate cyclase  46.08 
 
 		 439 aa  196  6e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0535498  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3025  adenylate/guanylate cyclase  46.08 
 
 		 439 aa  196  6e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3041  adenylate cyclase  46.08 
 
 		 439 aa  195  1e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.14332  normal  0.182676 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1917  response regulator receiver  51.44 
 
 		 303 aa  191  1e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1571  adenylate/guanylate cyclase  46.49 
 
 		 426 aa  191  2e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.00000000352613  hitchhiker  0.00000380859 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3547  diguanylate cyclase  64.38 
 
 		 314 aa  188  1e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.928319  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2382  adenylate/guanylate cyclase  43.89 
 
 		 407 aa  186  5e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2389  response regulator receiver domain-containing protein  60.14 
 
 		 159 aa  180  4e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.589748  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2839  putative adenylate/guanylate cyclase  46.45 
 
 		 421 aa  178  2e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.344898  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1020  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family protein  62.59 
 
 		 516 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1528  adenylate/guanylate cyclase  31.05 
 
 		 350 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1138  response regulator receiver /GGDEF/PAS/PAC domain-containing protein  50.91 
 
 		 756 aa  161  2e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0305477  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0215  adenylate/guanylate cyclase  31.18 
 
 		 351 aa  156  6e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.354021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0533  adenylate/guanylate cyclase  38.72 
 
 		 422 aa  143  4e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.549362  normal  0.0209906 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0225  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  33.48 
 
 		 695 aa  139  7e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.590775  normal  0.132241 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12462  cyclase  34.43 
 
 		 730 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48354  predicted protein  42 
 
 		 868 aa  137  5e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.951648  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50428  predicted protein  36.27 
 
 		 816 aa  133  5e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0156  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  33.33 
 
 		 1075 aa  133  6e-30  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000640114  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0045  adenylate/guanylate cyclase  31.03 
 
 		 382 aa  133  6e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1887  adenylate/guanylate cyclase  29.23 
 
 		 403 aa  133  6e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.522729 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47709  predicted protein  37.31 
 
 		 1196 aa  132  1.0000000000000001e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4196  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  50 
 
 		 350 aa  130  3e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_36270  predicted protein  40.91 
 
 		 1987 aa  130  5.0000000000000004e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3412  adenylate/guanylate cyclase  29.26 
 
 		 1207 aa  129  1.0000000000000001e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.210507 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48678  predicted protein  41.24 
 
 		 806 aa  126  6e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.26048  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48375  predicted protein  40.53 
 
 		 1169 aa  125  9e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3155  adenylate/guanylate cyclase  29.63 
 
 		 1172 aa  125  1e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.386213  hitchhiker  0.00095291 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_38549  predicted protein  38.5 
 
 		 1128 aa  124  2e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43826  predicted protein  38.04 
 
 		 1003 aa  124  4e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.911661  n/a   
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_50497  predicted protein  36.18 
 
 		 1165 aa  123  5e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48350  predicted protein  36.27 
 
 		 1773 aa  121  1.9999999999999998e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0719027  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49555  predicted protein  34.68 
 
 		 1198 aa  120  6e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0506  adenylate/guanylate cyclase  28.06 
 
 		 380 aa  119  7e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.149903  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0558  adenylate/guanylate cyclase  33.33 
 
 		 665 aa  117  3.9999999999999997e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.132478  normal  0.264577 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0187  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  41.67 
 
 		 354 aa  113  6e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0125166 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4185  response regulator receiver protein  45 
 
 		 159 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2099  response regulator receiver modulated diguanylate phosphodiesterase  40.96 
 
 		 402 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.316821 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2065  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  42.14 
 
 		 615 aa  110  4.0000000000000004e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.722895  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2338  GAF sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  27.16 
 
 		 1180 aa  108  1e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0263037  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1382  response regulator PleD  43.41 
 
 		 457 aa  108  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.390598 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2128  response regulator  43.65 
 
 		 154 aa  107  5e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1938  response regulator receiver  43.65 
 
 		 154 aa  106  6e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0328542  normal  0.732853 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0662  adenylate/guanylate cyclase  26.71 
 
 		 1130 aa  105  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1290  response regulator PleD  42.64 
 
 		 457 aa  105  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0138689  hitchhiker  0.00259394 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04606  two-component system regulatory protein  46.67 
 
 		 157 aa  102  8e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0533  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  41.88 
 
 		 597 aa  102  1e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.985347  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3285  response regulator receiver  43.88 
 
 		 362 aa  102  1e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1547  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  32.24 
 
 		 758 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.592629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1077  adenylate cyclase  33.16 
 
 		 513 aa  102  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0661  adenylate/guanylate cyclase  25.82 
 
 		 1133 aa  101  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2239  adenylate/guanylate cyclase  28.46 
 
 		 1156 aa  101  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.159061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1638  putative adenylate/guanylate cyclase  34.5 
 
 		 515 aa  101  3e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.739692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2796  adenylate/guanylate cyclase  30.33 
 
 		 447 aa  101  3e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5021  adenylate/guanylate cyclase  27.11 
 
 		 348 aa  99.8  7e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1750  response regulator PleD  39.23 
 
 		 457 aa  99  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.263569  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0931  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  41.22 
 
 		 457 aa  98.6  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.436852  normal  0.104843 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4588  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  34.15 
 
 		 1096 aa  98.6  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.537027  normal  0.92591 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2733  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  38.06 
 
 		 346 aa  98.6  2e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0967  diguanylate cyclase  41.22 
 
 		 457 aa  98.6  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.555277  normal  0.0207283 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2253  adenylate cyclase  34.87 
 
 		 518 aa  98.6  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0171825 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5293  adenylate/guanylate cyclase  29.86 
 
 		 421 aa  97.4  4e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0545376  normal  0.227088 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4645  adenylate/guanylate cyclase  32.16 
 
 		 546 aa  96.7  7e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.98897  normal  0.0884819 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7417  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  41.67 
 
 		 457 aa  95.5  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.196799  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3308  response regulator PleD  39.53 
 
 		 457 aa  95.5  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.268667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0926  response regulator PleD  39.53 
 
 		 455 aa  95.9  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.773886 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1846  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  44.68 
 
 		 588 aa  95.5  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.157265  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0907  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  39.69 
 
 		 457 aa  95.1  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.401363  normal  0.40647 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01717  putative response regulator  29.88 
 
 		 568 aa  95.1  2e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1864  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  39.53 
 
 		 457 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.831894  normal  0.121309 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1110  adenylate/guanylate cyclase  27.79 
 
 		 348 aa  94.7  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0224811  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4017  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  34.46 
 
 		 701 aa  94.7  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.556421 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2442  response regulator PleD  37.98 
 
 		 457 aa  94.4  3e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.696702  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6679  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  40.15 
 
 		 457 aa  94  4e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4085  adenylate/guanylate cyclase  37.93 
 
 		 746 aa  93.6  5e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.104935 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1432  response regulator PleD  39.53 
 
 		 457 aa  93.6  6e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3038  response regulator PleD  38.76 
 
 		 457 aa  93.2  6e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.372566  normal  0.319547 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5382  two-component system regulatory protein  42.52 
 
 		 158 aa  93.6  6e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.365131  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1218  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  29.33 
 
 		 611 aa  93.2  7e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2413  response regulator PleD  38.76 
 
 		 457 aa  93.2  7e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.592932  normal  0.173821 
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_4823  predicted protein  37.24 
 
 		 145 aa  93.2  8e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.121915  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0647  adenylate/guanylate cyclase  32.72 
 
 		 911 aa  92.8  9e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.707555  normal  0.864231 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0714  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  33.84 
 
 		 637 aa  92.8  9e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.17996  normal  0.926966 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>