More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_1528 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_1528  adenylate/guanylate cyclase  100 
 
 		 350 aa  703    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0215  adenylate/guanylate cyclase  88.18 
 
 		 351 aa  574  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.354021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3999  adenylate/guanylate cyclase  41.76 
 
 		 351 aa  279  5e-74  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.558191 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3762  putative adenylate/guanylate cyclase  42.6 
 
 		 520 aa  266  2.9999999999999995e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.978534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0605  adenylate/guanylate cyclase  39.47 
 
 		 355 aa  246  4.9999999999999997e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.657653  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2803  adenylate/guanylate cyclase  40 
 
 		 531 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6414  adenylate cyclase  31.3 
 
 		 395 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0293466  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2092  adenylate/guanylate cyclase  33.07 
 
 		 395 aa  168  1e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.498255  normal  0.305178 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1901  adenylate/guanylate cyclase  31.51 
 
 		 381 aa  160  2e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.500403  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2467  response regulator receiver modulated serine phosphatase  50 
 
 		 385 aa  152  8.999999999999999e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0749  response regulator receiver protein  54.14 
 
 		 406 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.893418  normal  0.0890519 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1815  response regulator receiver domain-containing protein  51.13 
 
 		 411 aa  148  2.0000000000000003e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.800608  normal  0.49797 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3412  adenylate/guanylate cyclase  32.06 
 
 		 1207 aa  140  3e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.210507 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0156  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  34.3 
 
 		 1075 aa  135  9.999999999999999e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000640114  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2417  adenylate/guanylate cyclase  34.15 
 
 		 1207 aa  134  1.9999999999999998e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.239282 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3309  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  48.59 
 
 		 900 aa  133  5e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.269875  normal  0.342346 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0045  adenylate/guanylate cyclase  34.15 
 
 		 382 aa  130  3e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3993  adenylate/guanylate cyclase  33.19 
 
 		 1209 aa  128  1.0000000000000001e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.787867  normal  0.246996 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0506  adenylate/guanylate cyclase  34.54 
 
 		 380 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.149903  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3136  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  46.62 
 
 		 919 aa  127  3e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1562  adenylate/guanylate cyclase  32.02 
 
 		 435 aa  125  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.165048 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1887  adenylate/guanylate cyclase  30.3 
 
 		 403 aa  123  5e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.522729 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11641  membrane-anchored adenylyl cyclase cya  35.91 
 
 		 443 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.512599 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3414  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  35.89 
 
 		 431 aa  120  4.9999999999999996e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.138432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2343  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  47.69 
 
 		 921 aa  117  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.762005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3084  adenylate cyclase  35.14 
 
 		 439 aa  115  8.999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0535498  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3025  adenylate/guanylate cyclase  35.14 
 
 		 439 aa  115  8.999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3041  adenylate cyclase  35.14 
 
 		 439 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.14332  normal  0.182676 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1571  adenylate/guanylate cyclase  34.74 
 
 		 426 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.00000000352613  hitchhiker  0.00000380859 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0662  adenylate/guanylate cyclase  30.75 
 
 		 1130 aa  115  1.0000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0661  adenylate/guanylate cyclase  30.46 
 
 		 1133 aa  114  2.0000000000000002e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1561  adenylate/guanylate cyclase  32.86 
 
 		 417 aa  108  1e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.637281 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0959  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  43.45 
 
 		 372 aa  107  4e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0878  response regulator receiver  40.27 
 
 		 302 aa  105  1e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0347  PAS  36.84 
 
 		 513 aa  105  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000072068 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3576  putative adenylate/guanylate cyclase  33.78 
 
 		 396 aa  105  2e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0204141 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0533  adenylate/guanylate cyclase  33.19 
 
 		 422 aa  104  3e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.549362  normal  0.0209906 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1115  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.22 
 
 		 243 aa  103  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0950226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18291  two-component response regulator  44.72 
 
 		 248 aa  103  5e-21  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.276613  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1712  two component transcriptional regulator  43.9 
 
 		 248 aa  102  9e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18111  two-component response regulator  43.9 
 
 		 248 aa  102  9e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18081  two-component response regulator  44.72 
 
 		 248 aa  101  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2382  adenylate/guanylate cyclase  32.04 
 
 		 407 aa  101  2e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2302  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.38 
 
 		 243 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2157  response regulator receiver protein  36 
 
 		 577 aa  100  3e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1382  response regulator PleD  40.51 
 
 		 457 aa  100  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.390598 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2353  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.38 
 
 		 243 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0794558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1277  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  45.6 
 
 		 454 aa  100  3e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.410696  normal  0.0388481 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2915  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.04 
 
 		 225 aa  100  4e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.892207  normal  0.300351 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2815  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  44 
 
 		 457 aa  100  4e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.631579  normal  0.0857187 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2729  adenylate/guanylate cyclase  28.2 
 
 		 1119 aa  100  4e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0163544 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4702  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  38.76 
 
 		 381 aa  100  5e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0901362  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4207  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.54 
 
 		 247 aa  99.8  6e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3109  response regulator receiver  36.67 
 
 		 285 aa  99.8  6e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0893452  normal  0.677049 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0789  response regulator receiver protein  40 
 
 		 278 aa  99.8  6e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0926  response regulator PleD  44.8 
 
 		 455 aa  99.8  6e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.773886 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0954  two component transcriptional regulator  44.54 
 
 		 243 aa  99.8  6e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0817018 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6397  response regulator receiver protein  36.41 
 
 		 237 aa  99.4  8e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.680662  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0695  response regulator receiver  41.32 
 
 		 170 aa  99.4  8e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.412637  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2978  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  39.38 
 
 		 369 aa  99.4  8e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.806511 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17451  two-component response regulator  46.67 
 
 		 269 aa  99.4  8e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0378  two component transcriptional regulator  40.88 
 
 		 234 aa  99.4  8e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01481  two-component response regulator  46.22 
 
 		 248 aa  98.6  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1432  response regulator PleD  44.8 
 
 		 457 aa  99  1e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1878  two component transcriptional regulator  43.7 
 
 		 242 aa  99  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.559477 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0581  winged helix family two component transcriptional regulator  43.7 
 
 		 242 aa  98.6  1e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.296955  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01831  two-component response regulator  45.83 
 
 		 290 aa  98.6  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5021  adenylate/guanylate cyclase  28.13 
 
 		 348 aa  98.2  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1290  response regulator PleD  39.29 
 
 		 457 aa  98.2  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0138689  hitchhiker  0.00259394 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2413  response regulator PleD  46.4 
 
 		 457 aa  98.2  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.592932  normal  0.173821 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2062  response regulator receiver protein  35.38 
 
 		 217 aa  98.2  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2032  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  37.89 
 
 		 310 aa  97.4  3e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1110  adenylate/guanylate cyclase  27.48 
 
 		 348 aa  97.1  4e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0224811  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1391  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  38.69 
 
 		 373 aa  97.1  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.540189  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2955  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  37.71 
 
 		 308 aa  97.1  4e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1750  response regulator PleD  42.97 
 
 		 457 aa  97.1  4e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.263569  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3308  response regulator PleD  44.8 
 
 		 457 aa  97.1  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.268667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1086  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  39.31 
 
 		 331 aa  97.1  4e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.226857  hitchhiker  0.0000000112469 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2442  response regulator PleD  44 
 
 		 457 aa  97.1  4e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.696702  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2575  chitin degradation sensor protein  38.97 
 
 		 1127 aa  97.1  4e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1044  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  33.73 
 
 		 377 aa  96.7  5e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0516082 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1453  two component transcriptional regulator  44.54 
 
 		 244 aa  97.1  5e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.952418  normal  0.0249242 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2360  response regulator receiver protein  41.67 
 
 		 523 aa  96.3  6e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2108  multisensor signal transduction histidine kinase  38.89 
 
 		 492 aa  96.3  8e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1196  two component transcriptional regulator  44.92 
 
 		 246 aa  95.9  9e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20711  two-component response regulator  44.92 
 
 		 246 aa  95.9  9e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1696  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.41 
 
 		 224 aa  95.9  9e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3210  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  35.16 
 
 		 337 aa  95.5  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.32327  normal  0.712325 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0044  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.74 
 
 		 224 aa  95.5  1e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1562  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  35.2 
 
 		 369 aa  95.9  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.847548  normal  0.236297 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2562  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  34.64 
 
 		 437 aa  95.5  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26531  two-component response regulator  44.92 
 
 		 248 aa  95.5  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3038  response regulator PleD  45.6 
 
 		 457 aa  95.5  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.372566  normal  0.319547 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0591  two component LuxR family transcriptional regulator  42.06 
 
 		 301 aa  95.1  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.477799  hitchhiker  0.00469436 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3541  response regulator PleD  44 
 
 		 457 aa  95.1  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0769  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.76 
 
 		 236 aa  94.7  2e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0136  two component transcriptional regulator  43.22 
 
 		 248 aa  94.7  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1463  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  42.07 
 
 		 364 aa  95.1  2e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.404054 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01511  two-component response regulator  43.22 
 
 		 248 aa  94.4  2e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3155  adenylate/guanylate cyclase  27.68 
 
 		 1172 aa  95.1  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.386213  hitchhiker  0.00095291 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>